Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00303703

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART3-3p:  MIMAT0003411          TMEM164:  NM_001353851     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART3-3p	TMEM164
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003411	84187
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	bB360B22.3

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TMEM164	chrX:109259984(+) A-I      intronic chrX:109314850(+) A-I      intronic chrX:109273918(+) A-I      intronic chrX:109273785(+) A-I      intronic chrX:109273546(+) A-I      intronic chrX:109267740(+) A-I      intronic chrX:109260046(+) A-I      intronic chrX:109315328(+) A-I      intronic chrX:109315343(+) A-I      intronic chrX:109321817(+) A-I      intronic chrX:109321860(+) A-I      intronic chrX:109321881(+) A-I      intronic chrX:109321896(+) A-I      intronic chrX:109321940(+) A-I      intronic chrX:109332555(+) A-I      intronic chrX:109332565(+) A-I      intronic chrX:109361241(+) A-I      intronic chrX:109274579(+) A-I      intronic chrX:109361351(+) A-I      intronic chrX:109376435(+) A-I      intronic chrX:109376448(+) A-I      intronic chrX:109376478(+) A-I      intronic chrX:109376479(+) A-I      intronic chrX:109377600(+) A-I      intronic chrX:109394746(+) A-I      intronic chrX:109394833(+) A-I      intronic chrX:109394847(+) A-I      intronic chrX:109394917(+) A-I      intronic chrX:109260030(+) A-I      intronic chrX:109394923(+) A-I      intronic chrX:109260024(+) A-I      intronic chrX:109274584(+) A-I      intronic chrX:109274606(+) A-I      intronic chrX:109274687(+) A-I      intronic chrX:109278746(+) A-I      intronic chrX:109312907(+) A-I      intronic chrX:109313280(+) A-I      intronic chrX:109313437(+) A-I      intronic chrX:109313441(+) A-I      intronic chrX:109313858(+) A-I      intronic chrX:109315274(+) A-I      intronic chrX:109259985(+) A-I      intronic chrX:109315008(+) A-I      intronic chrX:109273538(+) A-I      intronic chrX:109273919(+) A-I      intronic chrX:109260050(+) A-I      intronic chrX:109273628(+) A-I      intronic chrX:109313270(+) A-I      intronic chrX:109404210(+) A-I      intronic chrX:109377553(+) A-I      intronic chrX:109315444(+) A-I      intronic chrX:109313857(+) A-I      intronic chrX:109273466(+) A-I      intronic chrX:109273475(+) A-I      intronic chrX:109314852(+) A-I      intronic chrX:109327503(+) A-I      intronic chrX:109267684(+) A-I      intronic chrX:109273868(+) A-I      intronic chrX:109351090(+) A-I      intronic chrX:109273931(+) A-I      intronic chrX:109376581(+) A-I      intronic chrX:109377594(+) A-I      intronic chrX:109273874(+) A-I      intronic chrX:109315414(+) A-I      intronic chrX:109350946(+) A-I      intronic chrX:109314882(+) A-I      intronic chrX:109314902(+) A-I      intronic chrX:109313288(+) A-I      intronic chrX:109345447(+) A-I      intronic chrX:109377563(+) A-I      intronic chrX:109287692(+) A-I      intronic chrX:109314465(+) A-I      intronic chrX:109260026(+) A-I      intronic chrX:109349743(+) A-I      intronic chrX:109314853(+) A-I      intronic chrX:109260094(+) A-I      intronic chrX:109315382(+) A-I      intronic chrX:109315423(+) A-I      intronic chrX:109312908(+) A-I      intronic chrX:109344920(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TMEM164	chrX:109420753(+) T-G intron -    21725310 chrX:109346978(+) A-G intron -    22484847 chrX:109347033(+) A-G intron -    22484847 chrX:109347663(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TMEM164	chrX:109246797-109246798(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625 chrX:109246991-109246992(+) m6A 5'UTR//intron       - chrX:109247033-109247034(+) m6A CDS//intron       - chrX:109247054-109247055(+) m6A CDS//intron       - chrX:109417146-109417147(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109417212-109417213(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109417217-109417218(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109417260-109417261(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109417415-109417416(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chrX:109417448-109417449(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chrX:109417484-109417485(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chrX:109418872-109418873(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109418946-109418947(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109419041-109419042(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109419103-109419104(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109420641-109420642(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109420662-109420663(+) m6A 3'UTR//intron       - chrX:109420688-109420689(+) m6A 3'UTR//intron       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	TMEM164	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART3-3p
Interactor2: TMEM164

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA
Support Database	VmiReg