Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | ebv-miR-BART3-3p | INTS6 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0003411 | 26512 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | DBI-1//DDX26//DDX26A//DICE1//HDB//INT6//Notchl2 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | INTS6 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID |
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DARNED | INTS6 |
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | INTS6 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | INTS6 |
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Interactor1: ebv-miR-BART3-3p | Interactor2: INTS6 |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay//Northern blot//RT-PCR//Western blot | |
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Prediction-Evidence | cRep//miRanda//RNAHybrid | |
Support Database | RepTar//ViRBase//VmiReg |
PMID | 23280823 | Target region | 3'UTR |
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Source | RepTar//ViRBase//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | AGS/BX1 cells//HEK293 cells//HeLa cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | In this report, we characterized DICE1 tumor suppressor to be a cellular target of EBV miR-BART3* miRNA. miRBART3* was abundantly expressed in NPC cells. The target site of miR-BART3* located in the 3'-untranslated region of DICE1 transcript was identified and characterized. Enforced expression of miR-BART3* or its precursor pre-miR-BART3 led to downregulation of endogenous DICE1 expression. In this study, we identified and characterized DICE1/INTS6 to be a cellular target of EBV miR-BART3*, also known as miR-BART3-5p. |