Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | ebv-miR-BART3-3p | DICER1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0003411 | 23405 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | DCR1//Dicer//Dicer1e//GLOW//HERNA//K12H4.8-LIKE//MNG1//RMSE2 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | DICER1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID |
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DARNED | DICER1 |
Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | DICER1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | DICER1 |
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Interactor1: ebv-miR-BART3-3p | Interactor2: DICER1 |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay | |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
Prediction-Evidence | PARalyzer | |
Support Database | ViRBase |
[1]PMID | 23342366 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | None |
Description | EBV-encoded BART miRNAs target the 3'-UTRs of viral genes, such as LMP1, BALF5, and LMP2A genes, and negatively regulate expression of these viral genes.On the other hand, EBV miRNAs repress cellular proteins, which include p53 up-regulated modulator of apoptosis(PUMA), DICER1, and BIM. Table 2 EBV-derived miRNAs and their target genes. |
[2]PMID | 22291592 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | None |
Description | We identified 7,827 miRNA-interaction sites in 3,492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7). |