Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00298343

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BART1-3p:  MIMAT0003390          CPEB3:  NM_014912     

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Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BART1-3p	CPEB3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003390	22849
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
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RNA Modification:

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RMBase	CPEB3	chr10:93999694-93999695(-) m6A CDS       24284625//27773535//27371828 chr10:93999710-93999711(-) m6A CDS       24284625//27773535//27371828 chr10:93999745-93999746(-) m6A CDS       24284625//27773535//27371828 chr10:93999958-93999959(-) m6A CDS       27371828 chr10:93999977-93999978(-) m6A CDS       24284625//27371828 chr10:94000073-94000074(-) m6A CDS       24284625//27773535//27371828 chr10:94000084-94000085(-) m6A CDS       24284625//27773535//27371828 chr10:94000109-94000110(-) m6A 5'UTR       24284625//27773535//27371828 chr10:94002934-94002935(-) m6A 5'UTR//intron       24284625//27773535//27371828 chr10:94002939-94002940(-) m6A 5'UTR//intron       24284625//27773535//27371828

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	CPEB3	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BART1-3p
Interactor2: CPEB3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg