Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | ebv-miR-BART1-5p | JADE1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000999 | 79960 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | PHF17 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | JADE1 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | JADE1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | JADE1 |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
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RNAactDrug | ebv-miR-BART1-5p |
Interactor1: ebv-miR-BART1-5p | Interactor2: JADE1 |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
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Prediction-Evidence | cRep//miRanda//PARalyzer//PITA//Targetscan | |
Support Database | RepTar//ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg |
PMID | 22291592 | Target region | CDS |
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Source | RepTar//ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | None |
Description | We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7). |