Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00288229

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BHRF1-3:           USP45:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol ebv-miR-BHRF1-3 USP45
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0000998 85015
Organism Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - LCA19

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR USP45
chr6:99907178(-) A-I      intronic
chr6:99921452(-) A-I      intronic
chr6:99926616(-) A-I      intronic
chr6:99921172(-) A-I      intronic
chr6:99921593(-) A-I      intronic
chr6:99923352(-) A-I      intronic
chr6:99910728(-) A-I      intronic
chr6:99892032(-) A-I      intronic
chr6:99892056(-) A-I      intronic
chr6:99892095(-) A-I      intronic
chr6:99892158(-) A-I      intronic
chr6:99906129(-) A-I      intronic
chr6:99892170(-) A-I      intronic
chr6:99893193(-) A-I      intronic
chr6:99942597(-) A-I      intronic
chr6:99942602(-) A-I      intronic
chr6:99893215(-) A-I      intronic
chr6:99938161(-) A-I      intronic
chr6:99938222(-) A-I      intronic
chr6:99941466(-) A-I      intronic
chr6:99893227(-) A-I      intronic
chr6:99893312(-) A-I      intronic
chr6:99954865(-) A-I      intronic
chr6:99954983(-) A-I      intronic
chr6:99959149(-) A-I      intronic
chr6:99884967(-) A-I      intronic
chr6:99893109(-) A-I      intronic
chr6:99914090(-) A-I      intronic
chr6:99942607(-) A-I      intronic
chr6:99942632(-) A-I      intronic
chr6:99893357(-) A-I      intronic
chr6:99942687(-) A-I      intronic
chr6:99942718(-) A-I      intronic
chr6:99942726(-) A-I      intronic
chr6:99954349(-) A-I      intronic
chr6:99922273(-) A-I      intronic
chr6:99928335(-) A-I      intronic
chr6:99894799(-) A-I      intronic
chr6:99906033(-) A-I      intronic
chr6:99906168(-) A-I      intronic
chr6:99941591(-) A-I      intronic
chr6:99941476(-) A-I      intronic
chr6:99906162(-) A-I      intronic
chr6:99942526(-) A-I      intronic
chr6:99906075(-) A-I      intronic
chr6:99928480(-) A-I      intronic
chr6:99921555(-) A-I      intronic
chr6:99923793(-) A-I      intronic
chr6:99942658(-) A-I      intronic
chr6:99937789(-) A-I      intronic
chr6:99937813(-) A-I      intronic
chr6:99938136(-) A-I      intronic
chr6:99923320(-) A-I      intronic
chr6:99923356(-) A-I      intronic
chr6:99923367(-) A-I      intronic
chr6:99923369(-) A-I      intronic
chr6:99923370(-) A-I      intronic
chr6:99923371(-) A-I      intronic
chr6:99923458(-) A-I      intronic
chr6:99906034(-) A-I      intronic
chr6:99921549(-) A-I      intronic
chr6:99921548(-) A-I      intronic
chr6:99921341(-) A-I      intronic
chr6:99921198(-) A-I      intronic
chr6:99921195(-) A-I      intronic
chr6:99921194(-) A-I      intronic
chr6:99931470(-) A-I      intronic
chr6:99880965(-) A-I      3'UTR
chr6:99880941(-) A-I      3'UTR
chr6:99882215(-) A-I      3'UTR
chr6:99880972(-) A-I      3'UTR
chr6:99881009(-) A-I      3'UTR
chr6:99952243(-) A-I      intronic
chr6:99941040(-) A-I      intronic
chr6:99922165(-) A-I      intronic
chr6:99938178(-) A-I      intronic
chr6:99905969(-) A-I      intronic
chr6:99938137(-) A-I      intronic
chr6:99892180(-) A-I      intronic
chr6:99922325(-) A-I      intronic
chr6:99942686(-) A-I      intronic
chr6:99884429(-) A-I      intronic
chr6:99894875(-) A-I      intronic
chr6:99922211(-) A-I      intronic
chr6:99931930(-) A-I      intronic
chr6:99928429(-) A-I      intronic
chr6:99893296(-) A-I      intronic
chr6:99892109(-) A-I      intronic
chr6:99894748(-) A-I      intronic
chr6:99937557(-) A-I      intronic
chr6:99948066(-) A-I      intronic
chr6:99954445(-) A-I      intronic
chr6:99885631(-) A-I      intronic
chr6:99923465(-) A-I      intronic
chr6:99921386(-) A-I      intronic
chr6:99932528(-) A-I      intronic
chr6:99894823(-) A-I      intronic
chr6:99891956(-) A-I      intronic
chr6:99942641(-) A-I      intronic
chr6:99892026(-) A-I      intronic
chr6:99892134(-) A-I      intronic
chr6:99923329(-) A-I      intronic
chr6:99923839(-) A-I      intronic
chr6:99894828(-) A-I      intronic
chr6:99880951(-) A-I      3'UTR
chr6:99880940(-) A-I      3'UTR
chr6:99894798(-) A-I      intronic
chr6:99894802(-) A-I      intronic
chr6:99940643(-) A-I      intronic
chr6:99893297(-) A-I      intronic
chr6:99921323(-) A-I      intronic
chr6:99884369(-) A-I      intronic
chr6:99922324(-) A-I      intronic
chr6:99937727(-) A-I      intronic
chr6:99892163(-) A-I      intronic
chr6:99932106(-) A-I      intronic
chr6:99894847(-) A-I      intronic
chr6:99921301(-) A-I      intronic
chr6:99884895(-) A-I      intronic
chr6:99932207(-) A-I      intronic
chr6:99921361(-) A-I      intronic
chr6:99893276(-) A-I      intronic
chr6:99921475(-) A-I      intronic
chr6:99932226(-) A-I      intronic
chr6:99921488(-) A-I      intronic
chr6:99921224(-) A-I      intronic
chr6:99885729(-) A-I      intronic
chr6:99920216(-) A-I      intronic
chr6:99920365(-) A-I      intronic
chr6:99937745(-) A-I      intronic
chr6:99921313(-) A-I      intronic
chr6:99884821(-) A-I      intronic
chr6:99937734(-) A-I      intronic
chr6:99923442(-) A-I      intronic
chr6:99903861(-) A-I      intronic
chr6:99894746(-) A-I      intronic
chr6:99914032(-) A-I      intronic
chr6:99923901(-) A-I      intronic
chr6:99894839(-) A-I      intronic
chr6:99921497(-) A-I      intronic
chr6:99923865(-) A-I      intronic
chr6:99892164(-) A-I      intronic
chr6:99894711(-) A-I      intronic
chr6:99920316(-) A-I      intronic
chr6:99892157(-) A-I      intronic
chr6:99937744(-) A-I      intronic
chr6:99894784(-) A-I      intronic
chr6:99942648(-) A-I      intronic
chr6:99884349(-) A-I      intronic
chr6:99906085(-) A-I      intronic
chr6:99891950(-) A-I      intronic
chr6:99892090(-) A-I      intronic
chr6:99938148(-) A-I      intronic
chr6:99893247(-) A-I      intronic
chr6:99920285(-) A-I      intronic
chr6:99942688(-) A-I      intronic
chr6:99923260(-) A-I      intronic
chr6:99903829(-) A-I      intronic
chr6:99917415(-) A-I      intronic
chr6:99931975(-) A-I      intronic
chr6:99923258(-) A-I      intronic
chr6:99921250(-) A-I      intronic
chr6:99891966(-) A-I      intronic
chr6:99927252(-) A-I      intronic
chr6:99894672(-) A-I      intronic
chr6:99894722(-) A-I      intronic
chr6:99894758(-) A-I      intronic
chr6:99893104(-) A-I      intronic
chr6:99932052(-) A-I      intronic
chr6:99941067(-) A-I      intronic
chr6:99923330(-) A-I      intronic
chr6:99942604(-) A-I      intronic
chr6:99894795(-) A-I      intronic
chr6:99932581(-) A-I      intronic
chr6:99941511(-) A-I      intronic
chr6:99921253(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED USP45
chr6:99880940(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr6:99880952(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr6:99880960(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr6:99880974(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr6:99881639(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr6:99881857(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr6:99892090(-) A-I intron -    22327324
chr6:99894758(-) A-I intron -    22327324
chr6:99894875(-) A-I intron -    22327324
chr6:99902527(-) A-G intron -    22484847
chr6:99880920(-) T-C exon 3'UTR    22484847
chr6:99880936(-) T-C exon 3'UTR    22484847
chr6:99884237(-) T-C intron -    22484847
chr6:99884285(-) T-C intron -    22484847
chr6:99884714(-) T-C intron -    22484847
chr6:99884827(-) T-C intron -    22484847
chr6:99884830(-) T-C intron -    22484847
chr6:99884843(-) T-C intron -    22484847
chr6:99885590(-) T-C intron -    22484847
chr6:99885627(-) T-C intron -    22484847
chr6:99885633(-) T-C intron -    22484847
chr6:99885634(-) T-C intron -    22484847
chr6:99885686(-) T-C intron -    22484847
chr6:99885720(-) T-C intron -    22484847
chr6:99885816(-) T-C intron -    22484847
chr6:99890459(-) T-C intron -    22484847
chr6:99891927(-) T-C intron -    22484847
chr6:99891950(-) A-G intron -    22484847
chr6:99891966(-) A-G intron -    22484847
chr6:99891991(-) T-C intron -    22484847
chr6:99892090(-) A-G intron -    22484847
chr6:99892126(-) T-C intron -    22484847
chr6:99892134(-) A-G intron -    22484847
chr6:99892157(-) A-G intron -    22484847
chr6:99892163(-) A-G intron -    22484847
chr6:99892164(-) A-G intron -    22484847
chr6:99893237(-) A-G intron -    22484847
chr6:99893259(-) A-G intron -    22484847
chr6:99893276(-) A-G intron -    22484847
chr6:99893296(-) A-G intron -    22484847
chr6:99893297(-) A-G intron -    22484847
chr6:99893323(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894668(-) T-C intron -    22484847
chr6:99894711(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894720(-) T-C intron -    22484847
chr6:99894722(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894746(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894748(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894758(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894784(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894798(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894802(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894809(-) T-C intron -    22484847
chr6:99894810(-) T-C intron -    22484847
chr6:99894823(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894827(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894828(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894839(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894847(-) A-G intron -    22484847
chr6:99894875(-) A-G intron -    22484847
chr6:99903821(-) A-G intron -    22484847
chr6:99903826(-) T-C intron -    22484847
chr6:99903829(-) A-G intron -    22484847
chr6:99903888(-) T-C intron -    22484847
chr6:99905969(-) A-G intron -    22484847
chr6:99906015(-) T-C intron -    22484847
chr6:99906061(-) T-C intron -    22484847
chr6:99906085(-) A-G intron -    22484847
chr6:99906087(-) T-C intron -    22484847
chr6:99906102(-) T-C intron -    22484847
chr6:99910738(-) A-G intron -    22484847
chr6:99910751(-) A-G intron -    22484847
chr6:99910777(-) A-G intron -    22484847
chr6:99912157(-) T-C intron -    22484847
chr6:99914052(-) A-G intron -    22484847
chr6:99917481(-) T-C intron -    22484847
chr6:99917611(-) T-C intron -    22484847
chr6:99917676(-) G-A intron -    22484847
chr6:99920225(-) T-C intron -    22484847
chr6:99920302(-) T-C intron -    22484847
chr6:99920344(-) T-C intron -    22484847
chr6:99920365(-) A-G intron -    22484847
chr6:99921386(-) A-G intron -    22484847
chr6:99922165(-) A-G intron -    22484847
chr6:99922211(-) A-G intron -    22484847
chr6:99922324(-) A-G intron -    22484847
chr6:99923329(-) A-G intron -    22484847
chr6:99923465(-) A-G intron -    22484847
chr6:99923487(-) A-G intron -    22484847
chr6:99923717(-) T-C intron -    22484847
chr6:99923721(-) T-C intron -    22484847
chr6:99923901(-) A-G intron -    22484847
chr6:99923913(-) T-C intron -    22484847
chr6:99927225(-) T-C intron -    22484847
chr6:99931973(-) T-C intron -    22484847
chr6:99937726(-) A-G intron -    22484847
chr6:99937727(-) A-G intron -    22484847
chr6:99937734(-) A-G intron -    22484847
chr6:99937744(-) A-G intron -    22484847
chr6:99937745(-) A-G intron -    22484847
chr6:99938165(-) T-C intron -    22484847
chr6:99941040(-) A-G intron -    22484847
chr6:99941067(-) A-G intron -    22484847
chr6:99941511(-) A-G intron -    22484847
chr6:99942604(-) A-G intron -    22484847
chr6:99942641(-) A-G intron -    22484847
chr6:99942648(-) A-G intron -    22484847
chr6:99942686(-) A-G intron -    22484847
chr6:99952170(-) A-G intron -    22484847
chr6:99952243(-) A-G intron -    22484847
chr6:99954323(-) A-G intron -    22484847
chr6:99954362(-) A-G intron -    22484847
chr6:99954445(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase USP45
chr6:99893831-99893832(-) m6A 3'UTR//CDS       27773535
chr6:99893964-99893965(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:99894005-99894006(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr6:99894024-99894025(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr6:99894051-99894052(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr6:99894098-99894099(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr6:99894262-99894263(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//22608085
chr6:99894287-99894288(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       22608085
chr6:99912568-99912569(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535
chr6:99912614-99912615(-) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       27773535
chr6:99912679-99912680(-) m6A exon//intron       27773535
chr6:99962806-99962807(-) m6A 5'UTR//intron       25456834
chr6:99962850-99962851(-) m6A 5'UTR//intron       25456834
chr6:99968993-99968994(-) m6A 5'UTR       24209618//24981863
chr6:99969001-99969002(-) m6A 5'UTR       24284625//24209618//24981863
chr6:99969036-99969037(-) m6A 5'UTR       24284625//24209618//24981863
chr6:99969539-99969540(-) m6A 5'UTR       24284625//24209618//24981863
chr6:99969556-99969557(-) m6A 5'UTR       24284625//24209618//24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate USP45
Cytosol K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm K562 cells     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: ebv-miR-BHRF1-3
Interactor2: USP45

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...