Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | ebv-miR-BHRF1-2-3p | ZNF451 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000997 | 26036 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | COASTER//dJ417I1.1 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | ZNF451 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | ZNF451 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | ZNF451 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | ebv-miR-BHRF1-2-3p | |||
ZNF451 |
Interactor1: ebv-miR-BHRF1-2-3p | Interactor2: ZNF451 |
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Strong-Evidence | Dual luciferase reporter assay | |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
Prediction-Evidence | PARalyzer | |
Support Database | ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg |
[1]PMID | 23170179 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | Downregulation |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | None |
Description | For each of them, direct interactions between 3'UTR and EBV miRNAs were confirmed by luciferase assay but no functional assay has been performed so far (Table 2).Table 2 Validated targets from high-throughput studies. Shown are cellular targets identified by photoactivatable ribonucleoside enhanced crosslinking and immunoprecipitation (PAR-CLIP), High-throughput sequencing of RNA isolated by crosslinking immunoprecipitation (HITS-CLIP) or RNA immunoprecipitation and microarray (RIP-Chip) techniques. Validation of these targets was done using luciferase reporter assays. |
[2]PMID | 22291592 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg | Interactor1 expression | Downregulation |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | None |
Description | For each of them, direct interactions between 3'UTR and EBV miRNAs were confirmed by luciferase assay but no functional assay has been performed so far (Table 2).Table 2 Validated targets from high-throughput studies. Shown are cellular targets identified by photoactivatable ribonucleoside enhanced crosslinking and immunoprecipitation (PAR-CLIP), High-throughput sequencing of RNA isolated by crosslinking immunoprecipitation (HITS-CLIP) or RNA immunoprecipitation and microarray (RIP-Chip) techniques. Validation of these targets was done using luciferase reporter assays. |