Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00283038

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BHRF1-2-5p:  MIMAT0000996          CISD2:  NM_001008388     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BHRF1-2-5p	CISD2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0000996	493856
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ERIS//Miner1//NAF-1//WFS2//ZCD2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CISD2	chr4:103803165(+) A-I      intronic chr4:103803190(+) A-I      intronic chr4:103803202(+) A-I      intronic chr4:103807972(+) A-I      intronic chr4:103807986(+) A-I      intronic chr4:103808019(+) A-I      intronic chr4:103807859(+) A-I      intronic chr4:103801876(+) A-I      intronic chr4:103808046(+) A-I      intronic chr4:103804134(+) A-I      intronic chr4:103803947(+) A-I      intronic chr4:103808034(+) A-I      intronic chr4:103807969(+) A-I      intronic chr4:103801122(+) A-I      intronic chr4:103793365(+) A-I      intronic chr4:103797651(+) A-I      intronic chr4:103807834(+) A-I      intronic chr4:103807899(+) A-I      intronic chr4:103801917(+) A-I      intronic chr4:103801955(+) A-I      intronic chr4:103807898(+) A-I      intronic chr4:103807842(+) A-I      intronic chr4:103807847(+) A-I      intronic chr4:103811873(+) A-I      3'UTR chr4:103813420(+) A-I      3'UTR chr4:103813404(+) A-I      3'UTR chr4:103813398(+) A-I      3'UTR chr4:103813355(+) A-I      3'UTR chr4:103813345(+) A-I      3'UTR chr4:103813341(+) A-I      3'UTR chr4:103813315(+) A-I      3'UTR chr4:103813301(+) A-I      3'UTR chr4:103813295(+) A-I      3'UTR chr4:103813285(+) A-I      3'UTR chr4:103811947(+) A-I      3'UTR chr4:103811930(+) A-I      3'UTR chr4:103813290(+) A-I      3'UTR chr4:103811742(+) A-I      3'UTR chr4:103811743(+) A-I      3'UTR chr4:103811788(+) A-I      3'UTR chr4:103811835(+) A-I      3'UTR chr4:103811838(+) A-I      3'UTR chr4:103811839(+) A-I      3'UTR chr4:103811840(+) A-I      3'UTR chr4:103811841(+) A-I      3'UTR chr4:103811876(+) A-I      3'UTR chr4:103811905(+) A-I      3'UTR chr4:103811812(+) A-I      3'UTR chr4:103813450(+) A-I      3'UTR chr4:103811847(+) A-I      3'UTR chr4:103811862(+) A-I      3'UTR chr4:103794576(+) A-I      intronic chr4:103801336(+) A-I      intronic chr4:103804079(+) A-I      intronic chr4:103801744(+) A-I      intronic chr4:103804008(+) A-I      intronic chr4:103795027(+) A-I      intronic chr4:103799392(+) A-I      intronic chr4:103803298(+) A-I      intronic chr4:103803191(+) A-I      intronic chr4:103794529(+) A-I      intronic chr4:103803087(+) A-I      intronic chr4:103803965(+) A-I      intronic chr4:103804133(+) A-I      intronic chr4:103794558(+) A-I      intronic chr4:103794568(+) A-I      intronic chr4:103797709(+) A-I      intronic chr4:103804043(+) A-I      intronic chr4:103801284(+) A-I      intronic chr4:103794446(+) A-I      intronic chr4:103813397(+) A-I      3'UTR chr4:103799554(+) A-I      intronic chr4:103799324(+) A-I      intronic chr4:103793410(+) A-I      intronic chr4:103800782(+) A-I      intronic chr4:103797856(+) A-I      intronic chr4:103804155(+) A-I      intronic chr4:103794447(+) A-I      intronic chr4:103799468(+) A-I      intronic chr4:103803228(+) A-I      intronic chr4:103799393(+) A-I      intronic chr4:103795083(+) A-I      intronic chr4:103799471(+) A-I      intronic chr4:103793300(+) A-I      intronic chr4:103799428(+) A-I      intronic chr4:103804004(+) A-I      intronic chr4:103794863(+) A-I      intronic chr4:103804033(+) A-I      intronic chr4:103797727(+) A-I      intronic chr4:103803120(+) A-I      intronic chr4:103800835(+) A-I      intronic chr4:103803139(+) A-I      intronic chr4:103794615(+) A-I      intronic chr4:103800822(+) A-I      intronic chr4:103795149(+) A-I      intronic chr4:103803193(+) A-I      intronic chr4:103804088(+) A-I      intronic chr4:103801239(+) A-I      intronic chr4:103801169(+) A-I      intronic chr4:103807533(+) A-I      intronic chr4:103794570(+) A-I      intronic chr4:103803305(+) A-I      intronic chr4:103797673(+) A-I      intronic chr4:103795176(+) A-I      intronic chr4:103795154(+) A-I      intronic chr4:103801200(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CISD2	chr4:103797800(+) A-I intron -    22327324 chr4:103793410(+) A-G intron -    22484847 chr4:103794447(+) A-G intron -    22484847 chr4:103794568(+) A-G intron -    22484847 chr4:103794570(+) A-G intron -    22484847 chr4:103794665(+) T-C intron -    22484847 chr4:103794836(+) T-C intron -    22484847 chr4:103795027(+) A-G intron -    22484847 chr4:103795131(+) A-G intron -    22484847 chr4:103795132(+) A-G intron -    22484847 chr4:103795149(+) A-G intron -    22484847 chr4:103795154(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797629(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797666(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797673(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797674(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797709(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797727(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797749(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797760(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797800(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797856(+) A-G intron -    22484847 chr4:103797857(+) A-G intron -    22484847 chr4:103799392(+) A-G intron -    22484847 chr4:103799393(+) A-G intron -    22484847 chr4:103799554(+) A-G intron -    22484847 chr4:103800684(+) A-G intron -    22484847 chr4:103800685(+) A-G intron -    22484847 chr4:103800822(+) A-G intron -    22484847 chr4:103800833(+) G-A intron -    22484847 chr4:103801200(+) A-G intron -    22484847 chr4:103801284(+) A-G intron -    22484847 chr4:103801336(+) A-G intron -    22484847 chr4:103801375(+) A-G intron -    22484847 chr4:103801744(+) A-G intron -    22484847 chr4:103803075(+) A-G intron -    22484847 chr4:103803087(+) A-G intron -    22484847 chr4:103803120(+) A-G intron -    22484847 chr4:103803139(+) A-G intron -    22484847 chr4:103803266(+) T-C intron -    22484847 chr4:103803298(+) A-G intron -    22484847 chr4:103804004(+) A-G intron -    22484847 chr4:103804008(+) A-G intron -    22484847 chr4:103804033(+) A-G intron -    22484847 chr4:103804043(+) A-G intron -    22484847 chr4:103804088(+) A-G intron -    22484847 chr4:103804133(+) A-G intron -    22484847 chr4:103804155(+) A-G intron -    22484847

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BHRF1-2-5p	Exosome B cell line (Raji)     21505438
	CISD2	Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BHRF1-2-5p
Interactor2: CISD2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	VmiReg