Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | ebv-miR-BHRF1-2-5p | PANK3 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000996 | 79646 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | - |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | PANK3 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | PANK3 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | PANK3 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | ebv-miR-BHRF1-2-5p | |||
PANK3 |
Interactor1: ebv-miR-BHRF1-2-5p | Interactor2: PANK3 |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
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Prediction-Evidence | PARalyzer | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 22291592 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | We identified 7,827 miRNA-interaction sites in 3,492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7). |