Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00281639

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6002

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BHRF1-2-5p:  MIMAT0000996          RIF1:  NM_001177664     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BHRF1-2-5p	RIF1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0000996	55183
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	RIF1	chr2:152277085(+) A-I      intronic chr2:152284615(+) A-I      intronic chr2:152277088(+) A-I      intronic chr2:152284619(+) A-I      intronic chr2:152323542(+) A-I      intronic chr2:152277097(+) A-I      intronic chr2:152275139(+) A-I      intronic chr2:152270656(+) A-I      intronic chr2:152272211(+) A-I      intronic chr2:152272212(+) A-I      intronic chr2:152272244(+) A-I      intronic chr2:152274858(+) A-I      intronic chr2:152275133(+) A-I      intronic chr2:152275134(+) A-I      intronic chr2:152284265(+) A-I      intronic chr2:152284215(+) A-I      intronic chr2:152283854(+) A-I      intronic chr2:152283757(+) A-I      intronic chr2:152283423(+) A-I      intronic chr2:152283302(+) A-I      intronic chr2:152275205(+) A-I      intronic chr2:152275273(+) A-I      intronic chr2:152275371(+) A-I      intronic chr2:152275966(+) A-I      intronic chr2:152275973(+) A-I      intronic chr2:152275979(+) A-I      intronic chr2:152275982(+) A-I      intronic chr2:152275997(+) A-I      intronic chr2:152276027(+) A-I      intronic chr2:152276029(+) A-I      intronic chr2:152276100(+) A-I      intronic chr2:152277136(+) A-I      intronic chr2:152277147(+) A-I      intronic chr2:152283265(+) A-I      intronic chr2:152279113(+) A-I      intronic chr2:152279194(+) A-I      intronic chr2:152279305(+) A-I      intronic chr2:152280642(+) A-I      intronic chr2:152280807(+) A-I      intronic chr2:152280810(+) A-I      intronic chr2:152280824(+) A-I      intronic chr2:152284411(+) A-I      intronic chr2:152284456(+) A-I      intronic chr2:152284492(+) A-I      intronic chr2:152279035(+) A-I      intronic chr2:152284639(+) A-I      intronic chr2:152284663(+) A-I      intronic chr2:152286674(+) A-I      intronic chr2:152287279(+) A-I      intronic chr2:152287294(+) A-I      intronic chr2:152287307(+) A-I      intronic chr2:152287430(+) A-I      intronic chr2:152323593(+) A-I      intronic chr2:152323636(+) A-I      intronic chr2:152323695(+) A-I      intronic chr2:152323985(+) A-I      intronic chr2:152323998(+) A-I      intronic chr2:152324024(+) A-I      intronic chr2:152324025(+) A-I      intronic chr2:152288053(+) A-I      intronic chr2:152324039(+) A-I      intronic chr2:152288122(+) A-I      intronic chr2:152290098(+) A-I      intronic chr2:152324049(+) A-I      intronic chr2:152290122(+) A-I      intronic chr2:152290430(+) A-I      intronic chr2:152290607(+) A-I      intronic chr2:152294716(+) A-I      intronic chr2:152297684(+) A-I      intronic chr2:152323582(+) A-I      intronic chr2:152323583(+) A-I      intronic chr2:152324056(+) A-I      intronic chr2:152329856(+) A-I      intronic chr2:152329858(+) A-I      intronic chr2:152284638(+) A-I      intronic chr2:152323587(+) A-I      intronic chr2:152284293(+) A-I      intronic chr2:152323591(+) A-I      intronic chr2:152278114(+) A-I      intronic chr2:152323988(+) A-I      intronic chr2:152288131(+) A-I      intronic chr2:152290232(+) A-I      intronic chr2:152284395(+) A-I      intronic chr2:152347649(+) A-I      intronic chr2:152278129(+) A-I      intronic chr2:152288207(+) A-I      intronic chr2:152280671(+) A-I      intronic chr2:152269726(+) A-I      intronic chr2:152324131(+) A-I      intronic chr2:152344387(+) A-I      intronic chr2:152280890(+) A-I      intronic chr2:152284297(+) A-I      intronic chr2:152284232(+) A-I      intronic chr2:152275156(+) A-I      intronic chr2:152284521(+) A-I      intronic chr2:152283395(+) A-I      intronic chr2:152290245(+) A-I      intronic chr2:152280877(+) A-I      intronic chr2:152280815(+) A-I      intronic chr2:152276997(+) A-I      intronic chr2:152284329(+) A-I      intronic chr2:152283341(+) A-I      intronic chr2:152284632(+) A-I      intronic chr2:152284323(+) A-I      intronic chr2:152274902(+) A-I      intronic chr2:152283297(+) A-I      intronic chr2:152284558(+) A-I      intronic chr2:152284609(+) A-I      intronic chr2:152284448(+) A-I      intronic chr2:152274876(+) A-I      intronic chr2:152276975(+) A-I      intronic chr2:152279107(+) A-I      intronic chr2:152280801(+) A-I      intronic chr2:152275867(+) A-I      intronic chr2:152345115(+) A-I      intronic chr2:152283260(+) A-I      intronic chr2:152287382(+) A-I      intronic chr2:152304207(+) A-I      intronic chr2:152290533(+) A-I      intronic chr2:152280878(+) A-I      intronic chr2:152283322(+) A-I      intronic chr2:152283261(+) A-I      intronic chr2:152283195(+) A-I      intronic chr2:152290124(+) A-I      intronic chr2:152283435(+) A-I      intronic chr2:152277101(+) A-I      intronic chr2:152284451(+) A-I      intronic chr2:152274908(+) A-I      intronic chr2:152270732(+) A-I      intronic chr2:152284460(+) A-I      intronic chr2:152345049(+) A-I      intronic chr2:152280717(+) A-I      intronic chr2:152271832(+) A-I      intronic chr2:152278126(+) A-I      intronic chr2:152283987(+) A-I      intronic chr2:152278134(+) A-I      intronic chr2:152323900(+) A-I      intronic chr2:152278124(+) A-I      intronic chr2:152277040(+) A-I      intronic chr2:152274812(+) A-I      intronic chr2:152284268(+) A-I      intronic chr2:152284623(+) A-I      intronic chr2:152284655(+) A-I      intronic chr2:152275268(+) A-I      intronic chr2:152268935(+) A-I      intronic chr2:152284179(+) A-I      intronic chr2:152345966(+) A-I      intronic chr2:152285956(+) A-I      intronic chr2:152277066(+) A-I      intronic chr2:152323596(+) A-I      intronic chr2:152292685(+) A-I      intronic chr2:152283864(+) A-I      intronic chr2:152281216(+) A-I      intronic chr2:152324004(+) A-I      intronic chr2:152283200(+) A-I      intronic chr2:152288099(+) A-I      intronic chr2:152280798(+) A-I      intronic chr2:152288044(+) A-I      intronic chr2:152274750(+) A-I      intronic chr2:152270685(+) A-I      intronic chr2:152283344(+) A-I      intronic chr2:152347674(+) A-I      intronic chr2:152346031(+) A-I      intronic chr2:152277068(+) A-I      intronic chr2:152275321(+) A-I      intronic chr2:152323622(+) A-I      intronic chr2:152282949(+) A-I      intronic chr2:152323459(+) A-I      intronic chr2:152279216(+) A-I      intronic chr2:152347638(+) A-I      intronic chr2:152270617(+) A-I      intronic chr2:152290095(+) A-I      intronic chr2:152282789(+) A-I      intronic chr2:152288106(+) A-I      intronic chr2:152279114(+) A-I      intronic chr2:152347645(+) A-I      intronic chr2:152288116(+) A-I      intronic chr2:152285722(+) A-I      intronic chr2:152288181(+) A-I      intronic chr2:152281445(+) A-I      intronic chr2:152274822(+) A-I      intronic chr2:152279069(+) A-I      intronic chr2:152283825(+) A-I      intronic chr2:152283196(+) A-I      intronic chr2:152288126(+) A-I      intronic chr2:152323958(+) A-I      intronic chr2:152280698(+) A-I      intronic chr2:152283358(+) A-I      intronic chr2:152288180(+) A-I      intronic chr2:152277104(+) A-I      intronic chr2:152346091(+) A-I      intronic chr2:152271767(+) A-I      intronic chr2:152304160(+) A-I      intronic chr2:152290243(+) A-I      intronic chr2:152270729(+) A-I      intronic chr2:152276979(+) A-I      intronic chr2:152284415(+) A-I      intronic chr2:152275341(+) A-I      intronic chr2:152323468(+) A-I      intronic chr2:152280783(+) A-I      intronic chr2:152323616(+) A-I      intronic chr2:152288118(+) A-I      intronic chr2:152283818(+) A-I      intronic chr2:152277130(+) A-I      intronic chr2:152294931(+) A-I      intronic chr2:152277100(+) A-I      intronic chr2:152276005(+) A-I      intronic chr2:152284622(+) A-I      intronic chr2:152284649(+) A-I      intronic chr2:152324000(+) A-I      intronic chr2:152279323(+) A-I      intronic chr2:152345936(+) A-I      intronic chr2:152288032(+) A-I      intronic chr2:152298849(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	RIF1	chr2:152277068(+) A-I intron -    22028664   //22327324 chr2:152277152(+) A-I intron -    22028664   //22327324 chr2:152283195(+) A-I intron -    22327324 chr2:152277100(+) A-I intron -    22028664 chr2:152277104(+) A-I intron -    22028664 chr2:152277149(+) A-I intron -    22028664 chr2:152280798(+) A-I intron -    22028664   //21960545 chr2:152280801(+) A-I intron -    22028664 chr2:152280877(+) A-I intron -    22028664 chr2:152280878(+) A-I intron -    22028664 chr2:152280890(+) A-I intron -    22028664 chr2:152269726(+) A-G intron -    22484847 chr2:152270617(+) A-G intron -    22484847 chr2:152272284(+) G-A intron -    22484847 chr2:152274812(+) A-G intron -    22484847 chr2:152274902(+) A-G intron -    22484847 chr2:152274908(+) A-G intron -    22484847 chr2:152275156(+) A-G intron -    22484847 chr2:152275218(+) A-G intron -    22484847 chr2:152275268(+) A-G intron -    22484847 chr2:152275321(+) A-G intron -    22484847 chr2:152275341(+) A-G intron -    22484847 chr2:152275867(+) A-G intron -    22484847 chr2:152275933(+) G-A intron -    22484847 chr2:152276979(+) A-G intron -    22484847 chr2:152276997(+) A-G intron -    22484847 chr2:152277068(+) A-G intron -    22484847 chr2:152277100(+) A-G intron -    22484847 chr2:152277101(+) A-G intron -    22484847 chr2:152277104(+) A-G intron -    22484847 chr2:152277152(+) A-G intron -    22484847 chr2:152278114(+) A-G intron -    22484847 chr2:152278126(+) A-G intron -    22484847 chr2:152278129(+) A-G intron -    22484847 chr2:152278534(+) T-C intron -    22484847 chr2:152279107(+) A-G intron -    22484847 chr2:152279114(+) A-G intron -    22484847 chr2:152279131(+) A-G intron -    22484847 chr2:152279146(+) A-G intron -    22484847 chr2:152279216(+) A-G intron -    22484847 chr2:152280671(+) A-G intron -    22484847 chr2:152280717(+) A-G intron -    22484847 chr2:152282197(+) G-T intron -    22484847 chr2:152282707(+) G-T intron -    22484847 chr2:152282789(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283195(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283196(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283200(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283234(+) C-T intron -    22484847 chr2:152283241(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283253(+) C-T intron -    22484847 chr2:152283260(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283261(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283290(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283300(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283322(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283341(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283344(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283357(+) T-C intron -    22484847 chr2:152283395(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283435(+) A-G intron -    22484847 chr2:152283824(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284220(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284225(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284232(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284266(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284297(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284323(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284324(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284329(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284385(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284448(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284450(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284460(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284490(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284491(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284558(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284565(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284609(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284622(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284623(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284655(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284658(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284668(+) A-G intron -    22484847 chr2:152284694(+) A-G intron -    22484847 chr2:152285722(+) A-G intron -    22484847 chr2:152286742(+) A-G intron -    22484847 chr2:152286843(+) C-T intron -    22484847 chr2:152286965(+) A-G intron -    22484847 chr2:152287025(+) A-G intron -    22484847 chr2:152287382(+) A-G intron -    22484847 chr2:152287403(+) A-G intron -    22484847 chr2:152287436(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288032(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288044(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288099(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288106(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288116(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288118(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288126(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288146(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288180(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288181(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288207(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288592(+) A-G intron -    22484847 chr2:152288704(+) A-G intron -    22484847 chr2:152290422(+) A-G intron -    22484847 chr2:152290555(+) A-G intron -    22484847 chr2:152304213(+) T-C intron -    22484847 chr2:152307108(+) C-T intron -    22484847 chr2:152307109(+) T-C intron -    22484847 chr2:152307148(+) C-A intron -    22484847 chr2:152313508(+) G-A intron -    22484847 chr2:152323459(+) A-G intron -    22484847 chr2:152323468(+) A-G intron -    22484847 chr2:152323473(+) A-G intron -    22484847 chr2:152323578(+) A-G intron -    22484847 chr2:152323590(+) A-G intron -    22484847 chr2:152323616(+) A-G intron -    22484847 chr2:152323900(+) A-G intron -    22484847 chr2:152323958(+) A-G intron -    22484847 chr2:152323959(+) A-G intron -    22484847 chr2:152324004(+) A-G intron -    22484847 chr2:152324015(+) A-G intron -    22484847 chr2:152324059(+) A-G intron -    22484847 chr2:152331096(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	RIF1	chr2:152266461-152266462(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr2:152266526-152266527(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       24981863 chr2:152266587-152266588(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr2:152311497-152311498(+) Y CDS       26075521 chr2:152316594-152316595(+) m6A CDS       24981863 chr2:152316620-152316621(+) m6A CDS       24981863 chr2:152317656-152317657(+) m6A CDS       24981863 chr2:152319661-152319662(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:152319677-152319678(+) Cm CDS       - chr2:152319691-152319692(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:152319732-152319733(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:152319796-152319797(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152319808-152319809(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152319844-152319845(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152319883-152319884(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152319918-152319919(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152320270-152320271(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr2:152320380-152320381(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:152320428-152320429(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152320434-152320435(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152320446-152320447(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152320498-152320499(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152320510-152320511(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152320528-152320529(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152320533-152320534(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152320553-152320554(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152320562-152320563(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152320592-152320593(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152320617-152320618(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152320633-152320634(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152320645-152320646(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152320685-152320686(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152320754-152320755(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:152320806-152320807(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:152320896-152320897(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr2:152320999-152321000(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152321059-152321060(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152321093-152321094(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152321167-152321168(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152321176-152321177(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152321317-152321318(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152321359-152321360(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:152321388-152321389(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:152321392-152321393(+) Y CDS       26075521 chr2:152321403-152321404(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:152321479-152321480(+) m6A CDS       24981863//26404942//22608085 chr2:152321495-152321496(+) m6A CDS       24981863//26404942//22608085 chr2:152321531-152321532(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr2:152321614-152321615(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:152321636-152321637(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:152321668-152321669(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:152321682-152321683(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152321692-152321693(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152321706-152321707(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152321779-152321780(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152321820-152321821(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152321830-152321831(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152321836-152321837(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152321897-152321898(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152321907-152321908(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:152321995-152321996(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:152322009-152322010(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:152322013-152322014(+) m6A CDS       27773535 chr2:152322027-152322028(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:152322130-152322131(+) m6A CDS       24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152322148-152322149(+) m6A CDS       24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152322175-152322176(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152322199-152322200(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152322224-152322225(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152322286-152322287(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152322292-152322293(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr2:152322399-152322400(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:152322424-152322425(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:152322452-152322453(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:152322474-152322475(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:152322483-152322484(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:152322532-152322533(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:152322588-152322589(+) m6A CDS       24981863//26404942//22608085 chr2:152326278-152326279(+) Y CDS       26075521 chr2:152330575-152330576(+) m6A CDS       24284625//22608085 chr2:152331412-152331413(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:152331506-152331507(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152331523-152331524(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085 chr2:152331616-152331617(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152331643-152331644(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:152331680-152331681(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:152331708-152331709(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:152331718-152331719(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:152331853-152331854(+) m6A 3'UTR//intron       22608085 chr2:152331865-152331866(+) m6A 3'UTR//intron       22608085 chr2:152331893-152331894(+) m6A 3'UTR//intron       22608085 chr2:152331914-152331915(+) m6A 3'UTR//intron       22608085 chr2:152334725-152334726(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:152334736-152334737(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:152334800-152334801(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:152334810-152334811(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:152335070-152335071(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:152335087-152335088(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:152335126-152335127(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:152342802-152342803(+) m6A exon//intron       - chr2:152342853-152342854(+) m6A exon//intron       25456834//22608085 chr2:152342867-152342868(+) m6A exon//intron       25456834//22608085 chr2:152342905-152342906(+) m6A exon//intron       25456834//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BHRF1-2-5p	Exosome B cell line (Raji)     21505438
	RIF1	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Colon cancer cells     24393600 Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BHRF1-2-5p
Interactor2: RIF1

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Prediction-Evidence	miRanda//PARalyzer//Targetscan
Support Database	ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	Downregulation
Description	We identified 7,827 miRNA-interaction sites in 3,492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7).