Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00281125

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BHRF1-2-5p:  MIMAT0000996          DDHD2:  NR_156417     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BHRF1-2-5p	DDHD2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0000996	23259
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	iPLA(1)gamma//iPLA1gamma//SAMWD1//SPG54

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	DDHD2	chr8:38111334(+) A-I      intronic chr8:38104266(+) A-I      intronic chr8:38104209(+) A-I      intronic chr8:38104207(+) A-I      intronic chr8:38104202(+) A-I      intronic chr8:38102878(+) A-I      intronic chr8:38102871(+) A-I      intronic chr8:38102800(+) A-I      intronic chr8:38102797(+) A-I      intronic chr8:38102796(+) A-I      intronic chr8:38102794(+) A-I      intronic chr8:38102788(+) A-I      intronic chr8:38102771(+) A-I      intronic chr8:38102735(+) A-I      intronic chr8:38102258(+) A-I      intronic chr8:38102035(+) A-I      intronic chr8:38101982(+) A-I      intronic chr8:38101946(+) A-I      intronic chr8:38101860(+) A-I      intronic chr8:38101820(+) A-I      intronic chr8:38101800(+) A-I      intronic chr8:38101423(+) A-I      intronic chr8:38101402(+) A-I      intronic chr8:38101225(+) A-I      intronic chr8:38101220(+) A-I      intronic chr8:38105826(+) A-I      intronic chr8:38101488(+) A-I      intronic chr8:38101426(+) A-I      intronic chr8:38101397(+) A-I      intronic chr8:38101392(+) A-I      intronic chr8:38099385(+) A-I      intronic chr8:38097503(+) A-I      intronic chr8:38099414(+) A-I      intronic chr8:38099393(+) A-I      intronic chr8:38099325(+) A-I      intronic chr8:38099080(+) A-I      intronic chr8:38099065(+) A-I      intronic chr8:38099004(+) A-I      intronic chr8:38098602(+) A-I      intronic chr8:38098387(+) A-I      intronic chr8:38097401(+) A-I      intronic chr8:38097380(+) A-I      intronic chr8:38096794(+) A-I      intronic chr8:38096706(+) A-I      intronic chr8:38096628(+) A-I      intronic chr8:38094266(+) A-I      intronic chr8:38094175(+) A-I      intronic chr8:38094163(+) A-I      intronic chr8:38093737(+) A-I      intronic chr8:38093309(+) A-I      intronic chr8:38093226(+) A-I      intronic chr8:38093225(+) A-I      intronic chr8:38093219(+) A-I      intronic chr8:38093145(+) A-I      intronic chr8:38093128(+) A-I      intronic chr8:38093075(+) A-I      intronic chr8:38092385(+) A-I      intronic chr8:38092366(+) A-I      intronic chr8:38099493(+) A-I      ncRNA chr8:38114063(+) A-I      intronic chr8:38114062(+) A-I      intronic chr8:38114061(+) A-I      intronic chr8:38114041(+) A-I      intronic chr8:38114038(+) A-I      intronic chr8:38114016(+) A-I      intronic chr8:38099478(+) A-I      intronic chr8:38099452(+) A-I      intronic chr8:38099421(+) A-I      intronic chr8:38099420(+) A-I      intronic chr8:38099388(+) A-I      intronic chr8:38099018(+) A-I      intronic chr8:38097039(+) A-I      intronic chr8:38096807(+) A-I      intronic chr8:38096781(+) A-I      intronic chr8:38096763(+) A-I      intronic chr8:38096761(+) A-I      intronic chr8:38096734(+) A-I      intronic chr8:38096733(+) A-I      intronic chr8:38096729(+) A-I      intronic chr8:38093119(+) A-I      intronic chr8:38093118(+) A-I      intronic chr8:38093110(+) A-I      intronic chr8:38093100(+) A-I      intronic chr8:38093064(+) A-I      intronic chr8:38099559(+) A-I      ncRNA chr8:38099517(+) A-I      ncRNA chr8:38101971(+) A-I      intronic chr8:38117306(+) A-I      intronic chr8:38116005(+) A-I      intronic chr8:38115239(+) A-I      intronic chr8:38115231(+) A-I      intronic chr8:38112634(+) A-I      intronic chr8:38111365(+) A-I      intronic chr8:38104329(+) A-I      5'UTR chr8:38096658(+) A-I      intronic chr8:38104096(+) A-I      intronic chr8:38106894(+) A-I      intronic chr8:38106770(+) A-I      intronic chr8:38102790(+) A-I      intronic chr8:38105736(+) A-I      intronic chr8:38101543(+) A-I      intronic chr8:38099104(+) A-I      intronic chr8:38112566(+) A-I      intronic chr8:38097361(+) A-I      intronic chr8:38101979(+) A-I      intronic chr8:38117312(+) A-I      intronic chr8:38099019(+) A-I      intronic chr8:38106287(+) A-I      intronic chr8:38096616(+) A-I      intronic chr8:38106286(+) A-I      intronic chr8:38099491(+) A-I      ncRNA chr8:38102889(+) A-I      intronic chr8:38106896(+) A-I      intronic chr8:38104150(+) A-I      intronic chr8:38104281(+) A-I      intronic chr8:38092791(+) A-I      intronic chr8:38114024(+) A-I      intronic chr8:38099008(+) A-I      intronic chr8:38096739(+) A-I      intronic chr8:38112026(+) A-I      intronic chr8:38106209(+) A-I      intronic chr8:38098335(+) A-I      intronic chr8:38097091(+) A-I      intronic chr8:38099441(+) A-I      intronic chr8:38112032(+) A-I      intronic chr8:38096716(+) A-I      intronic chr8:38099038(+) A-I      intronic chr8:38099386(+) A-I      intronic chr8:38099078(+) A-I      intronic chr8:38111522(+) A-I      intronic chr8:38097185(+) A-I      intronic chr8:38096636(+) A-I      intronic chr8:38101461(+) A-I      intronic chr8:38096753(+) A-I      intronic chr8:38096746(+) A-I      intronic chr8:38104153(+) A-I      intronic chr8:38102895(+) A-I      intronic chr8:38105853(+) A-I      intronic chr8:38104249(+) A-I      intronic chr8:38111978(+) A-I      intronic chr8:38112079(+) A-I      intronic chr8:38101920(+) A-I      intronic chr8:38096956(+) A-I      intronic chr8:38097084(+) A-I      intronic chr8:38112150(+) A-I      intronic chr8:38111551(+) A-I      intronic chr8:38102830(+) A-I      intronic chr8:38099457(+) A-I      intronic chr8:38115951(+) A-I      intronic chr8:38104240(+) A-I      intronic chr8:38101288(+) A-I      intronic chr8:38099416(+) A-I      intronic chr8:38101962(+) A-I      intronic chr8:38099119(+) A-I      intronic chr8:38112517(+) A-I      intronic chr8:38097026(+) A-I      intronic chr8:38097266(+) A-I      intronic chr8:38092336(+) A-I      intronic chr8:38104304(+) A-I      intronic chr8:38101885(+) A-I      intronic chr8:38112285(+) A-I      intronic chr8:38092984(+) A-I      intronic chr8:38104204(+) A-I      intronic chr8:38112090(+) A-I      intronic chr8:38112028(+) A-I      intronic chr8:38101246(+) A-I      intronic chr8:38102740(+) A-I      intronic chr8:38102785(+) A-I      intronic chr8:38096736(+) A-I      intronic chr8:38102920(+) A-I      intronic chr8:38106245(+) A-I      intronic chr8:38104159(+) A-I      intronic chr8:38102158(+) A-I      intronic chr8:38102248(+) A-I      intronic chr8:38097043(+) A-I      intronic chr8:38102343(+) A-I      intronic chr8:38099146(+) A-I      intronic chr8:38097383(+) A-I      intronic chr8:38111938(+) A-I      intronic chr8:38112520(+) A-I      intronic chr8:38112515(+) A-I      intronic chr8:38112326(+) A-I      intronic chr8:38096771(+) A-I      intronic chr8:38092976(+) A-I      intronic chr8:38105822(+) A-I      intronic chr8:38101403(+) A-I      intronic chr8:38097044(+) A-I      intronic chr8:38101676(+) A-I      intronic chr8:38097062(+) A-I      intronic chr8:38102803(+) A-I      intronic chr8:38099394(+) A-I      intronic chr8:38097124(+) A-I      intronic chr8:38099217(+) A-I      intronic chr8:38105790(+) A-I      intronic chr8:38102356(+) A-I      intronic chr8:38104213(+) A-I      intronic chr8:38101861(+) A-I      intronic chr8:38094366(+) A-I      intronic chr8:38102862(+) A-I      intronic chr8:38112029(+) A-I      intronic chr8:38104198(+) A-I      intronic chr8:38096659(+) A-I      intronic chr8:38097042(+) A-I      intronic chr8:38102334(+) A-I      intronic chr8:38104110(+) A-I      intronic chr8:38099180(+) A-I      intronic chr8:38111419(+) A-I      intronic chr8:38097440(+) A-I      intronic chr8:38111998(+) A-I      intronic chr8:38097336(+) A-I      intronic chr8:38102900(+) A-I      intronic chr8:38099316(+) A-I      intronic chr8:38111340(+) A-I      intronic chr8:38098357(+) A-I      intronic chr8:38096745(+) A-I      intronic chr8:38096732(+) A-I      intronic chr8:38092826(+) A-I      intronic chr8:38097048(+) A-I      intronic chr8:38111496(+) A-I      intronic chr8:38093092(+) A-I      intronic chr8:38099088(+) A-I      intronic chr8:38093305(+) A-I      intronic chr8:38093196(+) A-I      intronic chr8:38102344(+) A-I      intronic chr8:38111514(+) A-I      intronic chr8:38112413(+) A-I      intronic chr8:38112347(+) A-I      intronic chr8:38104105(+) A-I      intronic chr8:38098496(+) A-I      intronic chr8:38092774(+) A-I      intronic chr8:38102846(+) A-I      intronic chr8:38104189(+) A-I      intronic chr8:38106797(+) A-I      intronic chr8:38099396(+) A-I      intronic chr8:38112283(+) A-I      intronic chr8:38105747(+) A-I      intronic chr8:38111471(+) A-I      intronic chr8:38098508(+) A-I      intronic chr8:38102766(+) A-I      intronic chr8:38096834(+) A-I      intronic chr8:38099492(+) A-I      ncRNA chr8:38097090(+) A-I      intronic chr8:38112605(+) A-I      intronic chr8:38102240(+) A-I      intronic chr8:38097018(+) A-I      intronic chr8:38111960(+) A-I      intronic chr8:38099466(+) A-I      intronic chr8:38102882(+) A-I      intronic chr8:38105744(+) A-I      intronic chr8:38111922(+) A-I      intronic chr8:38094773(+) A-I      intronic chr8:38111999(+) A-I      intronic chr8:38099370(+) A-I      intronic chr8:38094002(+) A-I      intronic chr8:38102026(+) A-I      intronic chr8:38099039(+) A-I      intronic chr8:38094703(+) A-I      intronic chr8:38096623(+) A-I      intronic chr8:38102148(+) A-I      intronic chr8:38094774(+) A-I      intronic chr8:38097385(+) A-I      intronic chr8:38093146(+) A-I      intronic chr8:38101936(+) A-I      intronic chr8:38101922(+) A-I      intronic chr8:38102183(+) A-I      intronic chr8:38102147(+) A-I      intronic chr8:38112633(+) A-I      intronic chr8:38113895(+) A-I      intronic chr8:38099419(+) A-I      intronic chr8:38097343(+) A-I      intronic chr8:38099451(+) A-I      intronic chr8:38101984(+) A-I      intronic chr8:38115912(+) A-I      intronic chr8:38112162(+) A-I      intronic chr8:38106272(+) A-I      intronic chr8:38104199(+) A-I      intronic chr8:38102694(+) A-I      intronic chr8:38094417(+) A-I      intronic chr8:38102249(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	DDHD2	chr8:38096623(+) A-I intron -    15258596   //22327324 chr8:38096636(+) A-I intron -    15258596 chr8:38096745(+) A-I intron -    15258596 chr8:38096746(+) A-I intron -    15258596 chr8:38104751(+) A-I intron -    15342557 chr8:38104752(+) A-I intron -    15342557 chr8:38104805(+) A-I intron -    15342557   //22327324 chr8:38104814(+) A-I intron -    15342557 chr8:38104900(+) A-I intron -    15342557 chr8:38104912(+) A-I intron -    15342557   //21960545   //22327324 chr8:38099038(+) A-I intron -    22327324 chr8:38099492(+) A-I intron -    22327324 chr8:38101920(+) A-I intron -    22327324 chr8:38104813(+) A-I intron -    22327324 chr8:38091185(+) A-G intron -    22484847 chr8:38093146(+) A-G intron -    22484847 chr8:38093792(+) A-G intron -    22484847 chr8:38094002(+) A-G intron -    22484847 chr8:38094173(+) A-G intron -    22484847 chr8:38094703(+) A-G intron -    22484847 chr8:38096623(+) A-G intron -    22484847 chr8:38096637(+) A-G intron -    22484847 chr8:38096659(+) A-G intron -    22484847 chr8:38096746(+) A-G intron -    22484847 chr8:38096758(+) A-G intron -    22484847 chr8:38096771(+) A-G intron -    22484847 chr8:38097042(+) A-G intron -    22484847 chr8:38097084(+) A-G intron -    22484847 chr8:38097090(+) A-G intron -    22484847 chr8:38097091(+) A-G intron -    22484847 chr8:38097124(+) A-G intron -    22484847 chr8:38097343(+) A-G intron -    22484847 chr8:38097344(+) A-G intron -    22484847 chr8:38097515(+) A-G intron -    22484847 chr8:38098357(+) A-G intron -    22484847 chr8:38098362(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099008(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099019(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099038(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099039(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099078(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099104(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099122(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099211(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099310(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099316(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099317(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099322(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099370(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099386(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099416(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099425(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099441(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099466(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099491(+) A-G intron -    22484847 chr8:38099492(+) A-G intron -    22484847 chr8:38101461(+) A-G intron -    22484847 chr8:38101884(+) A-G intron -    22484847 chr8:38101885(+) A-G intron -    22484847 chr8:38101920(+) A-G intron -    22484847 chr8:38101922(+) A-G intron -    22484847 chr8:38101947(+) A-G intron -    22484847 chr8:38101955(+) A-G intron -    22484847 chr8:38101962(+) A-G intron -    22484847 chr8:38101984(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102026(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102147(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102183(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102248(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102249(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102264(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102334(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102344(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102703(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102721(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102740(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102785(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102790(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102791(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102882(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102889(+) A-G intron -    22484847 chr8:38102895(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104104(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104119(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104150(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104189(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104204(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104213(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104267(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104751(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104752(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104805(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104813(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104814(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104849(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104899(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104900(+) A-G intron -    22484847 chr8:38104912(+) A-G intron -    22484847 chr8:38105744(+) A-G intron -    22484847 chr8:38105747(+) A-G intron -    22484847 chr8:38106240(+) A-G intron -    22484847 chr8:38111416(+) A-G intron -    22484847 chr8:38111419(+) A-G intron -    22484847 chr8:38111471(+) A-G intron -    22484847 chr8:38111496(+) A-G intron -    22484847 chr8:38111514(+) A-G intron -    22484847 chr8:38111586(+) C-T intron -    22484847 chr8:38111960(+) A-G intron -    22484847 chr8:38111978(+) A-G intron -    22484847 chr8:38111998(+) A-G intron -    22484847 chr8:38111999(+) A-G intron -    22484847 chr8:38112032(+) A-G intron -    22484847 chr8:38112566(+) A-G intron -    22484847 chr8:38112633(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	DDHD2	chr8:38088926-38088927(+) m6A 5'UTR//intron       22608085 chr8:38088963-38088964(+) m6A 5'UTR//intron       24981863//22608085 chr8:38088991-38088992(+) m6A 5'UTR//intron       24981863//22608085 chr8:38089000-38089001(+) m6A 5'UTR//intron       24981863//22608085 chr8:38089018-38089019(+) m6A 5'UTR//intron       24981863//22608085 chr8:38089473-38089474(+) m6A 5'UTR//intron       - chr8:38090674-38090675(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       - chr8:38092005-38092006(+) m6A CDS//exon//intron       - chr8:38095651-38095652(+) Y 3'UTR//CDS//exon//intron       26075521 chr8:38118565-38118566(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr8:38118587-38118588(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr8:38132935-38132936(+) m6A exon       22608085 chr8:38132971-38132972(+) m6A exon       24981863//22608085 chr8:38132985-38132986(+) m6A exon       24981863//22608085 chr8:38132991-38132992(+) m6A exon       24981863//22608085 chr8:38132996-38132997(+) m6A exon       24981863//22608085 chr8:38133024-38133025(+) m6A exon       24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BHRF1-2-5p	Exosome B cell line (Raji)     21505438
	DDHD2	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Membrane K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BHRF1-2-5p
Interactor2: DDHD2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg