Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | ebv-miR-BHBF1-2-5p | MALT1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000996 | 10892 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | IMD12//MLT//MLT1//PCASP1 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | MALT1 |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | MALT1 |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | MALT1 |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | ebv-miR-BHBF1-2-5p | |||
MALT1 |
Interactor1: ebv-miR-BHBF1-2-5p | Interactor2: MALT1 |
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Strong-Evidence | 3'UTR indicator assay//Luciferase reporter assay | |
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Weak-Evidence | PAR-CLIP | |
Prediction-Evidence | miRanda//PARalyzer//Targetscan | |
Support Database | ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg |
[1]PMID | 30615681 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | 293T cells | Interactor2 expression | None |
Description | Luciferase knockdown was observed for 12 out of 15 PAR-CLIP-identified miRNA interactions, confirming these cellular 3'UTRs as targets of the EBV miRNAs (Fig 3A-3C). |
[2]PMID | 22291592 | Target region | 3'UTR |
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Source | ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | We identified 7,827 miRNA-interaction sites in 3,492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7). |