Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00280839

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6002

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BHRF1-2-5p:  MIMAT0000996          HIPK3:  NM_001048200     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BHRF1-2-5p	HIPK3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0000996	10114
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	DYRK6//FIST3//PKY//YAK1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	HIPK3	chr11:33287136(+) A-I      intronic chr11:33371957(+) A-I      intronic chr11:33371951(+) A-I      intronic chr11:33363497(+) A-I      intronic chr11:33289224(+) A-I      intronic chr11:33289586(+) A-I      intronic chr11:33289595(+) A-I      intronic chr11:33289596(+) A-I      intronic chr11:33288094(+) A-I      intronic chr11:33288804(+) A-I      intronic chr11:33288749(+) A-I      intronic chr11:33288114(+) A-I      intronic chr11:33292911(+) A-I      intronic chr11:33363475(+) A-I      intronic chr11:33363487(+) A-I      intronic chr11:33292952(+) A-I      intronic chr11:33289603(+) A-I      intronic chr11:33300665(+) A-I      intronic chr11:33292953(+) A-I      intronic chr11:33289605(+) A-I      intronic chr11:33290107(+) A-I      intronic chr11:33290116(+) A-I      intronic chr11:33371958(+) A-I      intronic chr11:33289316(+) A-I      intronic chr11:33289303(+) A-I      intronic chr11:33287162(+) A-I      intronic chr11:33289325(+) A-I      intronic chr11:33290125(+) A-I      intronic chr11:33289302(+) A-I      intronic chr11:33289304(+) A-I      intronic chr11:33287167(+) A-I      intronic chr11:33363495(+) A-I      intronic chr11:33287168(+) A-I      intronic chr11:33287118(+) A-I      intronic chr11:33363484(+) A-I      intronic chr11:33320492(+) A-I      intronic chr11:33289570(+) A-I      intronic chr11:33364201(+) A-I      intronic chr11:33323210(+) A-I      intronic chr11:33304422(+) A-I      intronic chr11:33318827(+) A-I      intronic chr11:33318823(+) A-I      intronic chr11:33364326(+) A-I      intronic chr11:33303851(+) A-I      intronic chr11:33289135(+) A-I      intronic chr11:33284991(+) A-I      intronic chr11:33285019(+) A-I      intronic chr11:33318820(+) A-I      intronic chr11:33318805(+) A-I      intronic chr11:33285027(+) A-I      intronic chr11:33290046(+) A-I      intronic chr11:33298352(+) A-I      intronic chr11:33304676(+) A-I      intronic chr11:33285028(+) A-I      intronic chr11:33371545(+) A-I      intronic chr11:33285042(+) A-I      intronic chr11:33285045(+) A-I      intronic chr11:33285109(+) A-I      intronic chr11:33285141(+) A-I      intronic chr11:33287064(+) A-I      intronic chr11:33287155(+) A-I      intronic chr11:33287158(+) A-I      intronic chr11:33287164(+) A-I      intronic chr11:33287420(+) A-I      intronic chr11:33288769(+) A-I      intronic chr11:33314535(+) A-I      intronic chr11:33287480(+) A-I      intronic chr11:33287483(+) A-I      intronic chr11:33307589(+) A-I      intronic chr11:33287503(+) A-I      intronic chr11:33287526(+) A-I      intronic chr11:33288043(+) A-I      intronic chr11:33288110(+) A-I      intronic chr11:33288124(+) A-I      intronic chr11:33288269(+) A-I      intronic chr11:33288273(+) A-I      intronic chr11:33288748(+) A-I      intronic chr11:33288768(+) A-I      intronic chr11:33288920(+) A-I      intronic chr11:33325956(+) A-I      intronic chr11:33288921(+) A-I      intronic chr11:33289085(+) A-I      intronic chr11:33325857(+) A-I      intronic chr11:33289479(+) A-I      intronic chr11:33302745(+) A-I      intronic chr11:33310930(+) A-I      intronic chr11:33289518(+) A-I      intronic chr11:33289677(+) A-I      intronic chr11:33289717(+) A-I      intronic chr11:33289727(+) A-I      intronic chr11:33303691(+) A-I      intronic chr11:33325854(+) A-I      intronic chr11:33289886(+) A-I      intronic chr11:33289918(+) A-I      intronic chr11:33289939(+) A-I      intronic chr11:33289969(+) A-I      intronic chr11:33289978(+) A-I      intronic chr11:33290026(+) A-I      intronic chr11:33291548(+) A-I      intronic chr11:33291579(+) A-I      intronic chr11:33364978(+) A-I      intronic chr11:33325759(+) A-I      intronic chr11:33291650(+) A-I      intronic chr11:33291653(+) A-I      intronic chr11:33315526(+) A-I      intronic chr11:33290016(+) A-I      intronic chr11:33291660(+) A-I      intronic chr11:33291745(+) A-I      intronic chr11:33291929(+) A-I      intronic chr11:33291959(+) A-I      intronic chr11:33292246(+) A-I      intronic chr11:33292252(+) A-I      intronic chr11:33292255(+) A-I      intronic chr11:33292886(+) A-I      intronic chr11:33304796(+) A-I      intronic chr11:33315650(+) A-I      intronic chr11:33304082(+) A-I      intronic chr11:33325746(+) A-I      intronic chr11:33292955(+) A-I      intronic chr11:33371414(+) A-I      intronic chr11:33364146(+) A-I      intronic chr11:33325732(+) A-I      intronic chr11:33310897(+) A-I      intronic chr11:33330935(+) A-I      intronic chr11:33310893(+) A-I      intronic chr11:33364885(+) A-I      intronic chr11:33371046(+) A-I      intronic chr11:33344117(+) A-I      intronic chr11:33314482(+) A-I      intronic chr11:33292962(+) A-I      intronic chr11:33363390(+) A-I      intronic chr11:33293741(+) A-I      intronic chr11:33304799(+) A-I      intronic chr11:33371038(+) A-I      intronic chr11:33371056(+) A-I      intronic chr11:33293748(+) A-I      intronic chr11:33325653(+) A-I      intronic chr11:33371206(+) A-I      intronic chr11:33293760(+) A-I      intronic chr11:33300806(+) A-I      intronic chr11:33293793(+) A-I      intronic chr11:33304822(+) A-I      intronic chr11:33325612(+) A-I      intronic chr11:33371439(+) A-I      intronic chr11:33364197(+) A-I      intronic chr11:33294506(+) A-I      intronic chr11:33303675(+) A-I      intronic chr11:33294533(+) A-I      intronic chr11:33324071(+) A-I      intronic chr11:33294826(+) A-I      intronic chr11:33304180(+) A-I      intronic chr11:33324057(+) A-I      intronic chr11:33294839(+) A-I      intronic chr11:33294893(+) A-I      intronic chr11:33304823(+) A-I      intronic chr11:33294989(+) A-I      intronic chr11:33323209(+) A-I      intronic chr11:33295082(+) A-I      intronic chr11:33291604(+) A-I      intronic chr11:33304863(+) A-I      intronic chr11:33287239(+) A-I      intronic chr11:33296685(+) A-I      intronic chr11:33296722(+) A-I      intronic chr11:33298283(+) A-I      intronic chr11:33363508(+) A-I      intronic chr11:33309797(+) A-I      intronic chr11:33363578(+) A-I      intronic chr11:33290062(+) A-I      intronic chr11:33291911(+) A-I      intronic chr11:33291747(+) A-I      intronic chr11:33322448(+) A-I      intronic chr11:33304903(+) A-I      intronic chr11:33298369(+) A-I      intronic chr11:33304917(+) A-I      intronic chr11:33304918(+) A-I      intronic chr11:33298381(+) A-I      intronic chr11:33322316(+) A-I      intronic chr11:33291800(+) A-I      intronic chr11:33321356(+) A-I      intronic chr11:33364353(+) A-I      intronic chr11:33333298(+) A-I      intronic chr11:33310885(+) A-I      intronic chr11:33344110(+) A-I      intronic chr11:33305274(+) A-I      intronic chr11:33293004(+) A-I      intronic chr11:33305301(+) A-I      intronic chr11:33289181(+) A-I      intronic chr11:33305321(+) A-I      intronic chr11:33298473(+) A-I      intronic chr11:33289984(+) A-I      intronic chr11:33300231(+) A-I      intronic chr11:33305442(+) A-I      intronic chr11:33306076(+) A-I      intronic chr11:33306082(+) A-I      intronic chr11:33306090(+) A-I      intronic chr11:33300269(+) A-I      intronic chr11:33307381(+) A-I      intronic chr11:33307392(+) A-I      intronic chr11:33307397(+) A-I      intronic chr11:33371998(+) A-I      intronic chr11:33307417(+) A-I      intronic chr11:33309840(+) A-I      intronic chr11:33314557(+) A-I      intronic chr11:33307447(+) A-I      intronic chr11:33307457(+) A-I      intronic chr11:33300279(+) A-I      intronic chr11:33307459(+) A-I      intronic chr11:33307467(+) A-I      intronic chr11:33310870(+) A-I      intronic chr11:33300286(+) A-I      intronic chr11:33372177(+) A-I      intronic chr11:33300296(+) A-I      intronic chr11:33300302(+) A-I      intronic chr11:33300310(+) A-I      intronic chr11:33289229(+) A-I      intronic chr11:33300605(+) A-I      intronic chr11:33300689(+) A-I      intronic chr11:33294848(+) A-I      intronic chr11:33333658(+) A-I      intronic chr11:33307479(+) A-I      intronic chr11:33300700(+) A-I      intronic chr11:33300710(+) A-I      intronic chr11:33307483(+) A-I      intronic chr11:33300713(+) A-I      intronic chr11:33307484(+) A-I      intronic chr11:33307518(+) A-I      intronic chr11:33300717(+) A-I      intronic chr11:33307530(+) A-I      intronic chr11:33300731(+) A-I      intronic chr11:33291711(+) A-I      intronic chr11:33321676(+) A-I      intronic chr11:33363413(+) A-I      intronic chr11:33300745(+) A-I      intronic chr11:33321418(+) A-I      intronic chr11:33300749(+) A-I      intronic chr11:33302690(+) A-I      intronic chr11:33302696(+) A-I      intronic chr11:33302733(+) A-I      intronic chr11:33294520(+) A-I      intronic chr11:33321408(+) A-I      intronic chr11:33302757(+) A-I      intronic chr11:33303696(+) A-I      intronic chr11:33320593(+) A-I      intronic chr11:33325728(+) A-I      intronic chr11:33303747(+) A-I      intronic chr11:33303749(+) A-I      intronic chr11:33364241(+) A-I      intronic chr11:33288202(+) A-I      intronic chr11:33363450(+) A-I      intronic chr11:33363439(+) A-I      intronic chr11:33289601(+) A-I      intronic chr11:33364151(+) A-I      intronic chr11:33321812(+) A-I      intronic chr11:33364137(+) A-I      intronic chr11:33363436(+) A-I      intronic chr11:33363426(+) A-I      intronic chr11:33344998(+) A-I      intronic chr11:33303754(+) A-I      intronic chr11:33309907(+) A-I      intronic chr11:33326028(+) A-I      intronic chr11:33307418(+) A-I      intronic chr11:33344947(+) A-I      intronic chr11:33323333(+) A-I      intronic chr11:33303777(+) A-I      intronic chr11:33303779(+) A-I      intronic chr11:33303910(+) A-I      intronic chr11:33364145(+) A-I      intronic chr11:33304075(+) A-I      intronic chr11:33344931(+) A-I      intronic chr11:33293908(+) A-I      intronic chr11:33344916(+) A-I      intronic chr11:33343610(+) A-I      intronic chr11:33372188(+) A-I      intronic chr11:33344812(+) A-I      intronic chr11:33344354(+) A-I      intronic chr11:33344293(+) A-I      intronic chr11:33289637(+) A-I      intronic chr11:33303800(+) A-I      intronic chr11:33300645(+) A-I      intronic chr11:33344265(+) A-I      intronic chr11:33343647(+) A-I      intronic chr11:33340823(+) A-I      intronic chr11:33304098(+) A-I      intronic chr11:33309815(+) A-I      intronic chr11:33304109(+) A-I      intronic chr11:33338747(+) A-I      intronic chr11:33338697(+) A-I      intronic chr11:33338646(+) A-I      intronic chr11:33338644(+) A-I      intronic chr11:33338597(+) A-I      intronic chr11:33338551(+) A-I      intronic chr11:33338213(+) A-I      intronic chr11:33338107(+) A-I      intronic chr11:33336970(+) A-I      intronic chr11:33336956(+) A-I      intronic chr11:33304150(+) A-I      intronic chr11:33336953(+) A-I      intronic chr11:33304157(+) A-I      intronic chr11:33336890(+) A-I      intronic chr11:33336798(+) A-I      intronic chr11:33336122(+) A-I      intronic chr11:33336071(+) A-I      intronic chr11:33333347(+) A-I      intronic chr11:33287475(+) A-I      intronic chr11:33289241(+) A-I      intronic chr11:33304184(+) A-I      intronic chr11:33298275(+) A-I      intronic chr11:33372003(+) A-I      intronic chr11:33288240(+) A-I      intronic chr11:33320973(+) A-I      intronic chr11:33320559(+) A-I      intronic chr11:33333304(+) A-I      intronic chr11:33292865(+) A-I      intronic chr11:33320558(+) A-I      intronic chr11:33290057(+) A-I      intronic chr11:33363490(+) A-I      intronic chr11:33320519(+) A-I      intronic chr11:33289561(+) A-I      intronic chr11:33294440(+) A-I      intronic chr11:33294465(+) A-I      intronic chr11:33371369(+) A-I      intronic chr11:33320497(+) A-I      intronic chr11:33372200(+) A-I      intronic chr11:33289990(+) A-I      intronic chr11:33339096(+) A-I      intronic chr11:33363488(+) A-I      intronic chr11:33291577(+) A-I      intronic chr11:33289532(+) A-I      intronic chr11:33363570(+) A-I      intronic chr11:33289067(+) A-I      intronic chr11:33289480(+) A-I      intronic chr11:33333591(+) A-I      intronic chr11:33291722(+) A-I      intronic chr11:33304041(+) A-I      intronic chr11:33363470(+) A-I      intronic chr11:33321813(+) A-I      intronic chr11:33292260(+) A-I      intronic chr11:33300802(+) A-I      intronic chr11:33287119(+) A-I      intronic chr11:33300781(+) A-I      intronic chr11:33300702(+) A-I      intronic chr11:33288173(+) A-I      intronic chr11:33294507(+) A-I      intronic chr11:33314300(+) A-I      intronic chr11:33348357(+) A-I      intronic chr11:33288242(+) A-I      intronic chr11:33290047(+) A-I      intronic chr11:33307560(+) A-I      intronic chr11:33371979(+) A-I      intronic chr11:33292247(+) A-I      intronic chr11:33304347(+) A-I      intronic chr11:33333299(+) A-I      intronic chr11:33364846(+) A-I      intronic chr11:33321745(+) A-I      intronic chr11:33289494(+) A-I      intronic chr11:33320765(+) A-I      intronic chr11:33289571(+) A-I      intronic chr11:33372004(+) A-I      intronic chr11:33292984(+) A-I      intronic chr11:33292244(+) A-I      intronic chr11:33303773(+) A-I      intronic chr11:33304108(+) A-I      intronic chr11:33303856(+) A-I      intronic chr11:33289636(+) A-I      intronic chr11:33324040(+) A-I      intronic chr11:33322320(+) A-I      intronic chr11:33323987(+) A-I      intronic chr11:33289580(+) A-I      intronic chr11:33364275(+) A-I      intronic chr11:33294898(+) A-I      intronic chr11:33289696(+) A-I      intronic chr11:33325580(+) A-I      intronic chr11:33363493(+) A-I      intronic chr11:33338141(+) A-I      intronic chr11:33287377(+) A-I      intronic chr11:33294510(+) A-I      intronic chr11:33289706(+) A-I      intronic chr11:33336912(+) A-I      intronic chr11:33291543(+) A-I      intronic chr11:33333370(+) A-I      intronic chr11:33287260(+) A-I      intronic chr11:33364154(+) A-I      intronic chr11:33372099(+) A-I      intronic chr11:33288084(+) A-I      intronic chr11:33336021(+) A-I      intronic chr11:33371495(+) A-I      intronic chr11:33292959(+) A-I      intronic chr11:33300739(+) A-I      intronic chr11:33307398(+) A-I      intronic chr11:33294494(+) A-I      intronic chr11:33289171(+) A-I      intronic chr11:33316251(+) A-I      intronic chr11:33287105(+) A-I      intronic chr11:33289495(+) A-I      intronic chr11:33289249(+) A-I      intronic chr11:33304013(+) A-I      intronic chr11:33289598(+) A-I      intronic chr11:33289610(+) A-I      intronic chr11:33372113(+) A-I      intronic chr11:33291864(+) A-I      intronic chr11:33292233(+) A-I      intronic chr11:33320856(+) A-I      intronic chr11:33291641(+) A-I      intronic chr11:33303804(+) A-I      intronic chr11:33289899(+) A-I      intronic chr11:33372135(+) A-I      intronic chr11:33364951(+) A-I      intronic chr11:33290052(+) A-I      intronic chr11:33303781(+) A-I      intronic chr11:33322340(+) A-I      intronic chr11:33333292(+) A-I      intronic chr11:33307573(+) A-I      intronic chr11:33305354(+) A-I      intronic chr11:33291708(+) A-I      intronic chr11:33294975(+) A-I      intronic chr11:33338214(+) A-I      intronic chr11:33371431(+) A-I      intronic chr11:33320871(+) A-I      intronic chr11:33336799(+) A-I      intronic chr11:33289579(+) A-I      intronic chr11:33325983(+) A-I      intronic chr11:33300775(+) A-I      intronic chr11:33321448(+) A-I      intronic chr11:33364196(+) A-I      intronic chr11:33336020(+) A-I      intronic chr11:33290082(+) A-I      intronic chr11:33325982(+) A-I      intronic chr11:33298351(+) A-I      intronic chr11:33363500(+) A-I      intronic chr11:33364335(+) A-I      intronic chr11:33287551(+) A-I      intronic chr11:33368681(+) A-I      intronic chr11:33300816(+) A-I      intronic chr11:33298471(+) A-I      intronic chr11:33315517(+) A-I      intronic chr11:33363526(+) A-I      intronic chr11:33314490(+) A-I      intronic chr11:33338105(+) A-I      intronic chr11:33288919(+) A-I      intronic chr11:33306179(+) A-I      intronic chr11:33304018(+) A-I      intronic chr11:33289227(+) A-I      intronic chr11:33302715(+) A-I      intronic chr11:33323283(+) A-I      intronic chr11:33303674(+) A-I      intronic chr11:33300695(+) A-I      intronic chr11:33372161(+) A-I      intronic chr11:33292966(+) A-I      intronic chr11:33289958(+) A-I      intronic chr11:33300740(+) A-I      intronic chr11:33302716(+) A-I      intronic chr11:33287134(+) A-I      intronic chr11:33289707(+) A-I      intronic chr11:33290094(+) A-I      intronic chr11:33304044(+) A-I      intronic chr11:33293798(+) A-I      intronic chr11:33333288(+) A-I      intronic chr11:33288101(+) A-I      intronic chr11:33325849(+) A-I      intronic chr11:33320518(+) A-I      intronic chr11:33288717(+) A-I      intronic chr11:33364281(+) A-I      intronic chr11:33307498(+) A-I      intronic chr11:33294944(+) A-I      intronic chr11:33289909(+) A-I      intronic chr11:33300650(+) A-I      intronic chr11:33287519(+) A-I      intronic chr11:33287199(+) A-I      intronic chr11:33363619(+) A-I      intronic chr11:33285082(+) A-I      intronic chr11:33296686(+) A-I      intronic chr11:33300654(+) A-I      intronic chr11:33289945(+) A-I      intronic chr11:33289678(+) A-I      intronic chr11:33293125(+) A-I      intronic chr11:33291730(+) A-I      intronic chr11:33293834(+) A-I      intronic chr11:33320522(+) A-I      intronic chr11:33289516(+) A-I      intronic chr11:33344964(+) A-I      intronic chr11:33293015(+) A-I      intronic chr11:33321630(+) A-I      intronic chr11:33300179(+) A-I      intronic chr11:33321772(+) A-I      intronic chr11:33303875(+) A-I      intronic chr11:33338700(+) A-I      intronic chr11:33288102(+) A-I      intronic chr11:33343626(+) A-I      intronic chr11:33306085(+) A-I      intronic chr11:33304069(+) A-I      intronic chr11:33290010(+) A-I      intronic chr11:33289663(+) A-I      intronic chr11:33309854(+) A-I      intronic chr11:33289682(+) A-I      intronic chr11:33323232(+) A-I      intronic chr11:33336899(+) A-I      intronic chr11:33371018(+) A-I      intronic chr11:33304181(+) A-I      intronic chr11:33300737(+) A-I      intronic chr11:33303784(+) A-I      intronic chr11:33289581(+) A-I      intronic chr11:33344915(+) A-I      intronic chr11:33288798(+) A-I      intronic chr11:33320903(+) A-I      intronic chr11:33325920(+) A-I      intronic chr11:33287536(+) A-I      intronic chr11:33294934(+) A-I      intronic chr11:33315649(+) A-I      intronic chr11:33292992(+) A-I      intronic chr11:33363536(+) A-I      intronic chr11:33290069(+) A-I      intronic chr11:33320532(+) A-I      intronic chr11:33321592(+) A-I      intronic chr11:33333367(+) A-I      intronic chr11:33322312(+) A-I      intronic chr11:33340832(+) A-I      intronic chr11:33290078(+) A-I      intronic chr11:33292965(+) A-I      intronic chr11:33307382(+) A-I      intronic chr11:33288198(+) A-I      intronic chr11:33306120(+) A-I      intronic chr11:33303680(+) A-I      intronic chr11:33290071(+) A-I      intronic chr11:33364366(+) A-I      intronic chr11:33289122(+) A-I      intronic chr11:33294906(+) A-I      intronic chr11:33300704(+) A-I      intronic chr11:33321422(+) A-I      intronic chr11:33307495(+) A-I      intronic chr11:33292306(+) A-I      intronic chr11:33320576(+) A-I      intronic chr11:33289927(+) A-I      intronic chr11:33322394(+) A-I      intronic chr11:33289740(+) A-I      intronic chr11:33336023(+) A-I      intronic chr11:33288106(+) A-I      intronic chr11:33331983(+) A-I      intronic chr11:33338610(+) A-I      intronic chr11:33321756(+) A-I      intronic chr11:33364965(+) A-I      intronic chr11:33363369(+) A-I      intronic chr11:33336796(+) A-I      intronic chr11:33291910(+) A-I      intronic chr11:33371095(+) A-I      intronic chr11:33364888(+) A-I      intronic chr11:33304786(+) A-I      intronic chr11:33323219(+) A-I      intronic chr11:33325626(+) A-I      intronic chr11:33303866(+) A-I      intronic chr11:33298434(+) A-I      intronic chr11:33338248(+) A-I      intronic chr11:33296715(+) A-I      intronic chr11:33315582(+) A-I      intronic chr11:33309878(+) A-I      intronic chr11:33372215(+) A-I      intronic chr11:33293046(+) A-I      intronic chr11:33289878(+) A-I      intronic chr11:33325747(+) A-I      intronic chr11:33372109(+) A-I      intronic chr11:33298431(+) A-I      intronic chr11:33290058(+) A-I      intronic chr11:33300612(+) A-I      intronic chr11:33291568(+) A-I      intronic chr11:33300174(+) A-I      intronic chr11:33305320(+) A-I      intronic chr11:33307411(+) A-I      intronic chr11:33371259(+) A-I      intronic chr11:33293838(+) A-I      intronic chr11:33296625(+) A-I      intronic chr11:33289555(+) A-I      intronic chr11:33363445(+) A-I      intronic chr11:33287509(+) A-I      intronic chr11:33288095(+) A-I      intronic chr11:33364875(+) A-I      intronic chr11:33289869(+) A-I      intronic chr11:33287376(+) A-I      intronic chr11:33293021(+) A-I      intronic chr11:33322466(+) A-I      intronic chr11:33336902(+) A-I      intronic chr11:33344130(+) A-I      intronic chr11:33289556(+) A-I      intronic chr11:33306124(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	HIPK3	chr11:33288198(+) A-I intron -    21960545 chr11:33290046(+) A-I intron -    21960545 chr11:33292269(+) A-I intron -    21960545 chr11:33292934(+) A-I intron -    21960545 chr11:33289516(+) A-G intron -    22484847 chr11:33292233(+) A-G intron -    22484847 chr11:33321813(+) A-G intron -    22484847 chr11:33364146(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	HIPK3	chr11:33279275-33279276(+) m6A 5'UTR//intron       24209618 chr11:33279381-33279382(+) m6A 5'UTR//intron       24209618 chr11:33279889-33279890(+) m6A 5'UTR//intron       24209618 chr11:33308002-33308003(+) m6A CDS       24284625//24981863//22575960//22608085 chr11:33308034-33308035(+) m6A CDS       24284625//24981863//22575960//22608085 chr11:33308075-33308076(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr11:33308086-33308087(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr11:33308105-33308106(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr11:33308149-33308150(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr11:33308169-33308170(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr11:33308178-33308179(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr11:33308197-33308198(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr11:33308219-33308220(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr11:33308300-33308301(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085 chr11:33308425-33308426(+) m6A CDS       24209618//24981863//22608085 chr11:33308475-33308476(+) m6A CDS       24209618//24981863//22608085 chr11:33308614-33308615(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085 chr11:33308796-33308797(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr11:33308801-33308802(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr11:33308820-33308821(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr11:33308990-33308991(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr11:33309019-33309020(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr11:33370164-33370165(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr11:33370171-33370172(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr11:33370180-33370181(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr11:33370212-33370213(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr11:33370223-33370224(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr11:33370228-33370229(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr11:33370249-33370250(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr11:33370263-33370264(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr11:33373260-33373261(+) m6A CDS       - chr11:33373272-33373273(+) m6A CDS       - chr11:33373304-33373305(+) m6A CDS       - chr11:33373800-33373801(+) m6A CDS       24209618//24981863 chr11:33374677-33374678(+) m6A CDS       24209618//24981863 chr11:33374693-33374694(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863 chr11:33374807-33374808(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr11:33374897-33374898(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr11:33375006-33375007(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr11:33375017-33375018(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr11:33375089-33375090(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr11:33375117-33375118(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr11:33375147-33375148(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr11:33375167-33375168(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BHRF1-2-5p	Exosome B cell line (Raji)     21505438
	HIPK3	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Fibroblast cell line (Hs68)     23249747 Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BHRF1-2-5p
Interactor2: HIPK3

Evidence Support:

Weak-Evidence	PAR-CLIP
Prediction-Evidence	miRanda//PARalyzer//Targetscan
Support Database	ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg

References:

PMID	22291592	Target region	3'UTR
Source	ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells	Interactor2 expression	Downregulation
Description	We identified 7,827 miRNA-interaction sites in 3,492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7).