Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00280462

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6002

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BHRF1-2-5p:           UBE2E2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol ebv-miR-BHRF1-2-5p UBE2E2
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0000996 7325
Organism Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - UBCH8

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR UBE2E2
chr3:23421890(+) A-I      intronic
chr3:23413462(+) A-I      intronic
chr3:23413459(+) A-I      intronic
chr3:23302191(+) A-I      intronic
chr3:23302126(+) A-I      intronic
chr3:23302117(+) A-I      intronic
chr3:23300368(+) A-I      intronic
chr3:23300273(+) A-I      intronic
chr3:23300269(+) A-I      intronic
chr3:23300263(+) A-I      intronic
chr3:23300237(+) A-I      intronic
chr3:23300221(+) A-I      intronic
chr3:23300205(+) A-I      intronic
chr3:23300204(+) A-I      intronic
chr3:23299114(+) A-I      intronic
chr3:23413375(+) A-I      intronic
chr3:23412686(+) A-I      intronic
chr3:23412662(+) A-I      intronic
chr3:23412647(+) A-I      intronic
chr3:23297380(+) A-I      intronic
chr3:23297376(+) A-I      intronic
chr3:23316053(+) A-I      intronic
chr3:23296714(+) A-I      intronic
chr3:23296692(+) A-I      intronic
chr3:23334417(+) A-I      intronic
chr3:23296642(+) A-I      intronic
chr3:23292466(+) A-I      intronic
chr3:23292449(+) A-I      intronic
chr3:23292448(+) A-I      intronic
chr3:23334423(+) A-I      intronic
chr3:23292429(+) A-I      intronic
chr3:23333313(+) A-I      intronic
chr3:23333291(+) A-I      intronic
chr3:23333273(+) A-I      intronic
chr3:23291430(+) A-I      intronic
chr3:23291423(+) A-I      intronic
chr3:23291409(+) A-I      intronic
chr3:23291363(+) A-I      intronic
chr3:23291304(+) A-I      intronic
chr3:23334453(+) A-I      intronic
chr3:23334485(+) A-I      intronic
chr3:23334509(+) A-I      intronic
chr3:23334513(+) A-I      intronic
chr3:23334521(+) A-I      intronic
chr3:23334534(+) A-I      intronic
chr3:23334543(+) A-I      intronic
chr3:23334547(+) A-I      intronic
chr3:23334554(+) A-I      intronic
chr3:23347274(+) A-I      intronic
chr3:23352120(+) A-I      intronic
chr3:23352160(+) A-I      intronic
chr3:23370208(+) A-I      intronic
chr3:23370248(+) A-I      intronic
chr3:23370253(+) A-I      intronic
chr3:23370388(+) A-I      intronic
chr3:23370427(+) A-I      intronic
chr3:23370433(+) A-I      intronic
chr3:23377053(+) A-I      intronic
chr3:23377083(+) A-I      intronic
chr3:23377105(+) A-I      intronic
chr3:23377126(+) A-I      intronic
chr3:23377138(+) A-I      intronic
chr3:23377143(+) A-I      intronic
chr3:23377155(+) A-I      intronic
chr3:23377171(+) A-I      intronic
chr3:23377259(+) A-I      intronic
chr3:23377260(+) A-I      intronic
chr3:23377287(+) A-I      intronic
chr3:23377299(+) A-I      intronic
chr3:23378381(+) A-I      intronic
chr3:23378394(+) A-I      intronic
chr3:23378411(+) A-I      intronic
chr3:23378499(+) A-I      intronic
chr3:23332392(+) A-I      intronic
chr3:23332391(+) A-I      intronic
chr3:23378533(+) A-I      intronic
chr3:23378560(+) A-I      intronic
chr3:23378567(+) A-I      intronic
chr3:23378586(+) A-I      intronic
chr3:23332387(+) A-I      intronic
chr3:23323023(+) A-I      intronic
chr3:23316013(+) A-I      intronic
chr3:23316012(+) A-I      intronic
chr3:23314947(+) A-I      intronic
chr3:23314911(+) A-I      intronic
chr3:23314859(+) A-I      intronic
chr3:23314776(+) A-I      intronic
chr3:23322972(+) A-I      intronic
chr3:23322962(+) A-I      intronic
chr3:23316119(+) A-I      intronic
chr3:23303898(+) A-I      intronic
chr3:23303851(+) A-I      intronic
chr3:23383740(+) A-I      intronic
chr3:23399391(+) A-I      intronic
chr3:23425599(+) A-I      intronic
chr3:23399439(+) A-I      intronic
chr3:23399492(+) A-I      intronic
chr3:23333548(+) A-I      intronic
chr3:23333489(+) A-I      intronic
chr3:23333479(+) A-I      intronic
chr3:23333411(+) A-I      intronic
chr3:23291286(+) A-I      intronic
chr3:23291227(+) A-I      intronic
chr3:23291221(+) A-I      intronic
chr3:23290704(+) A-I      intronic
chr3:23290547(+) A-I      intronic
chr3:23289054(+) A-I      intronic
chr3:23289026(+) A-I      intronic
chr3:23289001(+) A-I      intronic
chr3:23288982(+) A-I      intronic
chr3:23288972(+) A-I      intronic
chr3:23288963(+) A-I      intronic
chr3:23288907(+) A-I      intronic
chr3:23288902(+) A-I      intronic
chr3:23288901(+) A-I      intronic
chr3:23288868(+) A-I      intronic
chr3:23288598(+) A-I      intronic
chr3:23288470(+) A-I      intronic
chr3:23288440(+) A-I      intronic
chr3:23288113(+) A-I      intronic
chr3:23288110(+) A-I      intronic
chr3:23302536(+) A-I      intronic
chr3:23302419(+) A-I      intronic
chr3:23302351(+) A-I      intronic
chr3:23383695(+) A-I      intronic
chr3:23500155(+) A-I      intronic
chr3:23500130(+) A-I      intronic
chr3:23497107(+) A-I      intronic
chr3:23497028(+) A-I      intronic
chr3:23497007(+) A-I      intronic
chr3:23496954(+) A-I      intronic
chr3:23496932(+) A-I      intronic
chr3:23481846(+) A-I      intronic
chr3:23481837(+) A-I      intronic
chr3:23472250(+) A-I      intronic
chr3:23445136(+) A-I      intronic
chr3:23443619(+) A-I      intronic
chr3:23443605(+) A-I      intronic
chr3:23443312(+) A-I      intronic
chr3:23443252(+) A-I      intronic
chr3:23443251(+) A-I      intronic
chr3:23439549(+) A-I      intronic
chr3:23430442(+) A-I      intronic
chr3:23430414(+) A-I      intronic
chr3:23430346(+) A-I      intronic
chr3:23430345(+) A-I      intronic
chr3:23629993(+) A-I      intronic
chr3:23629951(+) A-I      intronic
chr3:23626827(+) A-I      intronic
chr3:23612910(+) A-I      intronic
chr3:23302196(+) A-I      intronic
chr3:23600351(+) A-I      intronic
chr3:23600325(+) A-I      intronic
chr3:23600322(+) A-I      intronic
chr3:23600280(+) A-I      intronic
chr3:23597729(+) A-I      intronic
chr3:23593793(+) A-I      intronic
chr3:23591449(+) A-I      intronic
chr3:23591284(+) A-I      intronic
chr3:23582013(+) A-I      intronic
chr3:23581952(+) A-I      intronic
chr3:23554315(+) A-I      intronic
chr3:23548194(+) A-I      intronic
chr3:23545225(+) A-I      intronic
chr3:23544871(+) A-I      intronic
chr3:23544781(+) A-I      intronic
chr3:23544780(+) A-I      intronic
chr3:23544742(+) A-I      intronic
chr3:23544725(+) A-I      intronic
chr3:23518080(+) A-I      intronic
chr3:23514346(+) A-I      intronic
chr3:23288109(+) A-I      intronic
chr3:23288095(+) A-I      intronic
chr3:23288057(+) A-I      intronic
chr3:23287694(+) A-I      intronic
chr3:23287688(+) A-I      intronic
chr3:23287686(+) A-I      intronic
chr3:23287647(+) A-I      intronic
chr3:23287580(+) A-I      intronic
chr3:23283685(+) A-I      intronic
chr3:23283650(+) A-I      intronic
chr3:23283567(+) A-I      intronic
chr3:23283540(+) A-I      intronic
chr3:23283465(+) A-I      intronic
chr3:23283451(+) A-I      intronic
chr3:23283434(+) A-I      intronic
chr3:23272234(+) A-I      intronic
chr3:23272227(+) A-I      intronic
chr3:23272218(+) A-I      intronic
chr3:23272192(+) A-I      intronic
chr3:23290578(+) A-I      intronic
chr3:23290601(+) A-I      intronic
chr3:23290603(+) A-I      intronic
chr3:23290609(+) A-I      intronic
chr3:23290631(+) A-I      intronic
chr3:23425591(+) A-I      intronic
chr3:23425612(+) A-I      intronic
chr3:23425626(+) A-I      intronic
chr3:23425632(+) A-I      intronic
chr3:23562267(+) A-I      intronic
chr3:23562273(+) A-I      intronic
chr3:23562275(+) A-I      intronic
chr3:23562317(+) A-I      intronic
chr3:23562323(+) A-I      intronic
chr3:23430331(+) A-I      intronic
chr3:23430320(+) A-I      intronic
chr3:23430295(+) A-I      intronic
chr3:23430256(+) A-I      intronic
chr3:23272020(+) A-I      intronic
chr3:23272012(+) A-I      intronic
chr3:23272004(+) A-I      intronic
chr3:23249576(+) A-I      intronic
chr3:23333703(+) A-I      intronic
chr3:23615744(+) A-I      intronic
chr3:23615743(+) A-I      intronic
chr3:23615735(+) A-I      intronic
chr3:23615733(+) A-I      intronic
chr3:23519253(+) A-I      intronic
chr3:23457355(+) A-I      intronic
chr3:23334387(+) A-I      intronic
chr3:23334414(+) A-I      intronic
chr3:23412769(+) A-I      intronic
chr3:23426579(+) A-I      intronic
chr3:23426521(+) A-I      intronic
chr3:23426502(+) A-I      intronic
chr3:23514277(+) A-I      intronic
chr3:23514275(+) A-I      intronic
chr3:23514253(+) A-I      intronic
chr3:23514179(+) A-I      intronic
chr3:23332266(+) A-I      intronic
chr3:23272179(+) A-I      intronic
chr3:23412660(+) A-I      intronic
chr3:23263302(+) A-I      intronic
chr3:23334444(+) A-I      intronic
chr3:23302173(+) A-I      intronic
chr3:23300329(+) A-I      intronic
chr3:23629959(+) A-I      intronic
chr3:23626760(+) A-I      intronic
chr3:23445040(+) A-I      intronic
chr3:23470210(+) A-I      intronic
chr3:23272127(+) A-I      intronic
chr3:23314875(+) A-I      intronic
chr3:23291166(+) A-I      intronic
chr3:23383737(+) A-I      intronic
chr3:23582340(+) A-I      intronic
chr3:23430243(+) A-I      intronic
chr3:23283590(+) A-I      intronic
chr3:23289047(+) A-I      intronic
chr3:23316036(+) A-I      intronic
chr3:23316120(+) A-I      intronic
chr3:23413408(+) A-I      intronic
chr3:23332462(+) A-I      intronic
chr3:23284457(+) A-I      intronic
chr3:23272157(+) A-I      intronic
chr3:23626742(+) A-I      intronic
chr3:23332406(+) A-I      intronic
chr3:23283518(+) A-I      intronic
chr3:23302156(+) A-I      intronic
chr3:23299090(+) A-I      intronic
chr3:23443191(+) A-I      intronic
chr3:23333706(+) A-I      intronic
chr3:23383755(+) A-I      intronic
chr3:23468754(+) A-I      intronic
chr3:23290584(+) A-I      intronic
chr3:23377173(+) A-I      intronic
chr3:23303895(+) A-I      intronic
chr3:23470233(+) A-I      intronic
chr3:23283542(+) A-I      intronic
chr3:23545174(+) A-I      intronic
chr3:23267500(+) A-I      intronic
chr3:23290506(+) A-I      intronic
chr3:23551945(+) A-I      intronic
chr3:23302127(+) A-I      intronic
chr3:23290611(+) A-I      intronic
chr3:23373692(+) A-I      intronic
chr3:23481622(+) A-I      intronic
chr3:23377192(+) A-I      intronic
chr3:23290726(+) A-I      intronic
chr3:23554321(+) A-I      intronic
chr3:23296609(+) A-I      intronic
chr3:23333611(+) A-I      intronic
chr3:23413353(+) A-I      intronic
chr3:23287673(+) A-I      intronic
chr3:23430372(+) A-I      intronic
chr3:23300296(+) A-I      intronic
chr3:23373746(+) A-I      intronic
chr3:23290633(+) A-I      intronic
chr3:23288535(+) A-I      intronic
chr3:23294178(+) A-I      intronic
chr3:23596507(+) A-I      intronic
chr3:23272198(+) A-I      intronic
chr3:23460723(+) A-I      intronic
chr3:23553998(+) A-I      intronic
chr3:23288458(+) A-I      intronic
chr3:23290600(+) A-I      intronic
chr3:23443475(+) A-I      intronic
chr3:23626098(+) A-I      intronic
chr3:23471511(+) A-I      intronic
chr3:23272021(+) A-I      intronic
chr3:23314759(+) A-I      intronic
chr3:23291346(+) A-I      intronic
chr3:23412704(+) A-I      intronic
chr3:23626803(+) A-I      intronic
chr3:23426446(+) A-I      intronic
chr3:23303902(+) A-I      intronic
chr3:23384828(+) A-I      intronic
chr3:23413444(+) A-I      intronic
chr3:23300127(+) A-I      intronic
chr3:23302054(+) A-I      intronic
chr3:23430386(+) A-I      intronic
chr3:23333274(+) A-I      intronic
chr3:23445194(+) A-I      intronic
chr3:23621016(+) A-I      intronic
chr3:23445069(+) A-I      intronic
chr3:23292570(+) A-I      intronic
chr3:23378453(+) A-I      intronic
chr3:23596467(+) A-I      intronic
chr3:23582025(+) A-I      intronic
chr3:23284419(+) A-I      intronic
chr3:23443538(+) A-I      intronic
chr3:23496937(+) A-I      intronic
chr3:23468849(+) A-I      intronic
chr3:23468817(+) A-I      intronic
chr3:23287572(+) A-I      intronic
chr3:23284391(+) A-I      intronic
chr3:23545146(+) A-I      intronic
chr3:23378484(+) A-I      intronic
chr3:23284412(+) A-I      intronic
chr3:23377165(+) A-I      intronic
chr3:23290698(+) A-I      intronic
chr3:23468698(+) A-I      intronic
chr3:23412693(+) A-I      intronic
chr3:23553854(+) A-I      intronic
chr3:23283527(+) A-I      intronic
chr3:23272092(+) A-I      intronic
chr3:23544761(+) A-I      intronic
chr3:23421831(+) A-I      intronic
chr3:23439738(+) A-I      intronic
chr3:23545238(+) A-I      intronic
chr3:23468836(+) A-I      intronic
chr3:23629994(+) A-I      intronic
chr3:23283505(+) A-I      intronic
chr3:23333742(+) A-I      intronic
chr3:23384886(+) A-I      intronic
chr3:23481860(+) A-I      intronic
chr3:23378376(+) A-I      intronic
chr3:23333303(+) A-I      intronic
chr3:23289107(+) A-I      intronic
chr3:23272018(+) A-I      intronic
chr3:23283535(+) A-I      intronic
chr3:23412796(+) A-I      intronic
chr3:23284498(+) A-I      intronic
chr3:23412694(+) A-I      intronic
chr3:23302341(+) A-I      intronic
chr3:23291323(+) A-I      intronic
chr3:23263257(+) A-I      intronic
chr3:23291329(+) A-I      intronic
chr3:23283659(+) A-I      intronic
chr3:23472212(+) A-I      intronic
chr3:23334378(+) A-I      intronic
chr3:23296601(+) A-I      intronic
chr3:23303792(+) A-I      intronic
chr3:23284415(+) A-I      intronic
chr3:23302342(+) A-I      intronic
chr3:23332439(+) A-I      intronic
chr3:23292539(+) A-I      intronic
chr3:23544838(+) A-I      intronic
chr3:23267536(+) A-I      intronic
chr3:23626660(+) A-I      intronic
chr3:23302125(+) A-I      intronic
chr3:23290641(+) A-I      intronic
chr3:23443246(+) A-I      intronic
chr3:23296859(+) A-I      intronic
chr3:23361293(+) A-I      intronic
chr3:23378398(+) A-I      intronic
chr3:23302122(+) A-I      intronic
chr3:23291202(+) A-I      intronic
chr3:23334293(+) A-I      intronic
chr3:23288574(+) A-I      intronic
chr3:23626634(+) A-I      intronic
chr3:23291264(+) A-I      intronic
chr3:23284479(+) A-I      intronic
chr3:23334309(+) A-I      intronic
chr3:23284315(+) A-I      intronic
chr3:23302491(+) A-I      intronic
chr3:23445157(+) A-I      intronic
chr3:23284489(+) A-I      intronic
chr3:23334389(+) A-I      intronic
chr3:23630869(+) A-I      intronic
chr3:23430373(+) A-I      intronic
chr3:23596511(+) A-I      intronic
chr3:23300334(+) A-I      intronic
chr3:23296716(+) A-I      intronic
chr3:23413448(+) A-I      intronic
chr3:23377286(+) A-I      intronic
chr3:23296675(+) A-I      intronic
chr3:23302057(+) A-I      intronic
chr3:23288435(+) A-I      intronic
chr3:23378375(+) A-I      intronic
chr3:23300290(+) A-I      intronic
chr3:23426491(+) A-I      intronic
chr3:23302094(+) A-I      intronic
chr3:23496959(+) A-I      intronic
chr3:23283456(+) A-I      intronic
chr3:23626157(+) A-I      intronic
chr3:23302483(+) A-I      intronic
chr3:23626664(+) A-I      intronic
chr3:23267983(+) A-I      intronic
chr3:23332289(+) A-I      intronic
chr3:23413376(+) A-I      intronic
chr3:23468800(+) A-I      intronic
chr3:23288085(+) A-I      intronic
chr3:23416339(+) A-I      intronic
chr3:23584571(+) A-I      intronic
chr3:23630681(+) A-I      intronic
chr3:23302228(+) A-I      intronic
chr3:23554181(+) A-I      intronic
chr3:23441935(+) A-I      intronic
chr3:23297344(+) A-I      intronic
chr3:23517995(+) A-I      intronic
chr3:23314901(+) A-I      intronic
chr3:23288111(+) A-I      intronic
chr3:23290602(+) A-I      intronic
chr3:23284421(+) A-I      intronic
chr3:23377066(+) A-I      intronic
chr3:23445162(+) A-I      intronic
chr3:23302385(+) A-I      intronic
chr3:23591468(+) A-I      intronic
chr3:23468778(+) A-I      intronic
chr3:23290612(+) A-I      intronic
chr3:23383803(+) A-I      intronic
chr3:23412756(+) A-I      intronic
chr3:23591362(+) A-I      intronic
chr3:23544916(+) A-I      intronic
chr3:23554186(+) A-I      intronic
chr3:23482828(+) A-I      intronic
chr3:23288529(+) A-I      intronic
chr3:23272156(+) A-I      intronic
chr3:23481834(+) A-I      intronic
chr3:23284483(+) A-I      intronic
chr3:23316034(+) A-I      intronic
chr3:23443534(+) A-I      intronic
chr3:23378384(+) A-I      intronic
chr3:23290490(+) A-I      intronic
chr3:23373698(+) A-I      intronic
chr3:23472195(+) A-I      intronic
chr3:23302187(+) A-I      intronic
chr3:23302479(+) A-I      intronic
chr3:23413458(+) A-I      intronic
chr3:23422012(+) A-I      intronic
chr3:23302089(+) A-I      intronic
chr3:23445038(+) A-I      intronic
chr3:23443607(+) A-I      intronic
chr3:23283462(+) A-I      intronic
chr3:23545135(+) A-I      intronic
chr3:23386259(+) A-I      intronic
chr3:23630012(+) A-I      intronic
chr3:23300305(+) A-I      intronic
chr3:23482796(+) A-I      intronic
chr3:23545224(+) A-I      intronic
chr3:23290647(+) A-I      intronic
chr3:23626611(+) A-I      intronic
chr3:23283501(+) A-I      intronic
chr3:23333690(+) A-I      intronic
chr3:23481507(+) A-I      intronic
chr3:23314858(+) A-I      intronic
chr3:23300207(+) A-I      intronic
chr3:23481799(+) A-I      intronic
chr3:23378454(+) A-I      intronic
chr3:23378551(+) A-I      intronic
chr3:23283703(+) A-I      intronic
chr3:23514378(+) A-I      intronic
chr3:23302447(+) A-I      intronic
chr3:23289002(+) A-I      intronic
chr3:23425620(+) A-I      intronic
chr3:23290507(+) A-I      intronic
chr3:23468703(+) A-I      intronic
chr3:23470209(+) A-I      intronic
chr3:23460018(+) A-I      intronic
chr3:23332449(+) A-I      intronic
chr3:23412784(+) A-I      intronic
chr3:23468712(+) A-I      intronic
chr3:23426522(+) A-I      intronic
chr3:23283530(+) A-I      intronic
chr3:23445186(+) A-I      intronic
chr3:23263176(+) A-I      intronic
chr3:23561358(+) A-I      intronic
chr3:23481873(+) A-I      intronic
chr3:23472059(+) A-I      intronic
chr3:23302118(+) A-I      intronic
chr3:23284376(+) A-I      intronic
chr3:23303869(+) A-I      intronic
chr3:23443545(+) A-I      intronic
chr3:23332470(+) A-I      intronic
chr3:23267605(+) A-I      intronic
chr3:23290606(+) A-I      intronic
chr3:23290747(+) A-I      intronic
chr3:23296658(+) A-I      intronic
chr3:23472221(+) A-I      intronic
chr3:23553848(+) A-I      intronic
chr3:23470215(+) A-I      intronic
chr3:23287767(+) A-I      intronic
chr3:23430408(+) A-I      intronic
chr3:23290521(+) A-I      intronic
chr3:23272100(+) A-I      intronic
chr3:23582070(+) A-I      intronic
chr3:23384987(+) A-I      intronic
chr3:23352174(+) A-I      intronic
chr3:23333254(+) A-I      intronic
chr3:23297334(+) A-I      intronic
chr3:23299109(+) A-I      intronic
chr3:23284430(+) A-I      intronic
chr3:23630804(+) A-I      intronic
chr3:23314907(+) A-I      intronic
chr3:23296700(+) A-I      intronic
chr3:23272061(+) A-I      intronic
chr3:23545095(+) A-I      intronic
chr3:23412646(+) A-I      intronic
chr3:23508262(+) A-I      intronic
chr3:23443557(+) A-I      intronic
chr3:23300199(+) A-I      intronic
chr3:23302103(+) A-I      intronic
chr3:23333653(+) A-I      intronic
chr3:23283427(+) A-I      intronic
chr3:23421889(+) A-I      intronic
chr3:23287676(+) A-I      intronic
chr3:23626783(+) A-I      intronic
chr3:23378538(+) A-I      intronic
chr3:23378501(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED UBE2E2
chr3:23284315(+) A-I intron -    15342557
chr3:23284376(+) A-I intron -    15342557
chr3:23284401(+) A-I intron -    15342557
chr3:23284412(+) A-I intron -    15342557
chr3:23284415(+) A-I intron -    15342557
chr3:23284419(+) A-I intron -    15342557
chr3:23284421(+) A-I intron -    15342557
chr3:23284466(+) A-I intron -    15342557
chr3:23284483(+) A-I intron -    15342557
chr3:23284498(+) A-I intron -    15342557
chr3:23290490(+) A-I intron -    22327324
chr3:23290506(+) A-I intron -    22327324
chr3:23302491(+) A-I intron -    22327324
chr3:23303992(+) A-I intron -    22327324
chr3:23353721(+) A-G intron -    22484847
chr3:23360152(+) A-G intron -    22484847
chr3:23263132(+) C-T intron -    22484847
chr3:23263176(+) A-G intron -    22484847
chr3:23264843(+) T-C intron -    22484847
chr3:23264872(+) T-C intron -    22484847
chr3:23267377(+) G-T intron -    22484847
chr3:23267605(+) A-G intron -    22484847
chr3:23268020(+) T-C intron -    22484847
chr3:23272018(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272021(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272061(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272092(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272100(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272114(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272120(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272156(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272157(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272179(+) A-G intron -    22484847
chr3:23272198(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283427(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283444(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283456(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283462(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283500(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283501(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283518(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283527(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283535(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283542(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283590(+) A-G intron -    22484847
chr3:23283592(+) A-G intron -    22484847
chr3:23284315(+) A-G intron -    22484847
chr3:23284391(+) A-G intron -    22484847
chr3:23284401(+) A-G intron -    22484847
chr3:23284412(+) A-G intron -    22484847
chr3:23284430(+) A-G intron -    22484847
chr3:23284457(+) A-G intron -    22484847
chr3:23284466(+) A-G intron -    22484847
chr3:23284479(+) A-G intron -    22484847
chr3:23284491(+) T-G intron -    22484847
chr3:23284498(+) A-G intron -    22484847
chr3:23287572(+) A-G intron -    22484847
chr3:23287673(+) A-G intron -    22484847
chr3:23287676(+) A-G intron -    22484847
chr3:23287755(+) A-G intron -    22484847
chr3:23287767(+) A-G intron -    22484847
chr3:23288085(+) A-G intron -    22484847
chr3:23288111(+) A-G intron -    22484847
chr3:23288975(+) A-G intron -    22484847
chr3:23288985(+) A-G intron -    22484847
chr3:23289047(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290490(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290506(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290507(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290521(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290552(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290561(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290563(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290584(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290586(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290600(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290602(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290606(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290611(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290612(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290633(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290641(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290647(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290651(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290683(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290698(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290708(+) A-G intron -    22484847
chr3:23290747(+) A-G intron -    22484847
chr3:23291166(+) A-G intron -    22484847
chr3:23291202(+) A-G intron -    22484847
chr3:23291264(+) A-G intron -    22484847
chr3:23291273(+) A-G intron -    22484847
chr3:23291323(+) A-G intron -    22484847
chr3:23291329(+) A-G intron -    22484847
chr3:23291346(+) A-G intron -    22484847
chr3:23291354(+) A-G intron -    22484847
chr3:23294178(+) A-G intron -    22484847
chr3:23296601(+) A-G intron -    22484847
chr3:23296609(+) A-G intron -    22484847
chr3:23296612(+) A-G intron -    22484847
chr3:23296658(+) A-G intron -    22484847
chr3:23296700(+) A-G intron -    22484847
chr3:23296787(+) A-G intron -    22484847
chr3:23296804(+) C-T intron -    22484847
chr3:23297328(+) A-G intron -    22484847
chr3:23297334(+) A-G intron -    22484847
chr3:23297344(+) A-G intron -    22484847
chr3:23297361(+) A-G intron -    22484847
chr3:23299090(+) A-G intron -    22484847
chr3:23300127(+) A-G intron -    22484847
chr3:23300199(+) A-G intron -    22484847
chr3:23300207(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302057(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302094(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302102(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302103(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302118(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302122(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302125(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302127(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302156(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302341(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302342(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302473(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302479(+) A-G intron -    22484847
chr3:23302491(+) A-G intron -    22484847
chr3:23303792(+) A-G intron -    22484847
chr3:23303869(+) A-G intron -    22484847
chr3:23303895(+) A-G intron -    22484847
chr3:23303902(+) A-G intron -    22484847
chr3:23303992(+) A-G intron -    22484847
chr3:23314759(+) A-G intron -    22484847
chr3:23314858(+) A-G intron -    22484847
chr3:23314875(+) A-G intron -    22484847
chr3:23314901(+) A-G intron -    22484847
chr3:23314907(+) A-G intron -    22484847
chr3:23315959(+) A-G intron -    22484847
chr3:23332266(+) A-G intron -    22484847
chr3:23332307(+) A-G intron -    22484847
chr3:23332470(+) A-G intron -    22484847
chr3:23332488(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333199(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333274(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333277(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333278(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333303(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333304(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333556(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333611(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333706(+) A-G intron -    22484847
chr3:23333720(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334293(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334309(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334310(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334315(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334378(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334379(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334388(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334389(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334444(+) A-G intron -    22484847
chr3:23334488(+) T-C intron -    22484847
chr3:23347321(+) A-G intron -    22484847
chr3:23347341(+) T-C intron -    22484847
chr3:23352104(+) A-G intron -    22484847
chr3:23352174(+) A-G intron -    22484847
chr3:23355063(+) T-A intron -    22484847
chr3:23367813(+) T-C intron -    22484847
chr3:23373776(+) A-G intron -    22484847
chr3:23373885(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase UBE2E2
chr3:23244662-23244663(+) m6A 5'UTR       24209618//24981863
chr3:23244847-23244848(+) m6A 5'UTR//intron       24209618//24981863
chr3:23244940-23244941(+) m6A 5'UTR//intron       24981863
chr3:23250279-23250280(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr3:23250291-23250292(+) m6A CDS       24981863//27773535
chr3:23250334-23250335(+) m6A CDS       24981863
chr3:23631884-23631885(+) m6A 3'UTR       27773535
chr3:23631923-23631924(+) m6A 3'UTR       27773535
chr3:23631936-23631937(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ebv-miR-BHRF1-2-5p
Exosome B cell line (Raji)     21505438
UBE2E2
Chromatin K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: ebv-miR-BHRF1-2-5p
Interactor2: UBE2E2

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Prediction-Evidence miRanda//PARalyzer//Targetscan
Support Database ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg

References:


PMID 22291592 Target region 3'UTR
Source ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression Downregulation
Description We identified 7,827 miRNA-interaction sites in 3,492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7).

Starting a new search, please wait ...