Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00280315

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BHRF1-2-5p:  MIMAT0000996          SH3BGRL:  NM_003022     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	ebv-miR-BHRF1-2-5p	SH3BGRL
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0000996	6451
Organism	Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	HEL-S-115//SH3BGR

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SH3BGRL	chrX:80549337(+) A-I      intronic chrX:80549316(+) A-I      intronic chrX:80549315(+) A-I      intronic chrX:80549314(+) A-I      intronic chrX:80549313(+) A-I      intronic chrX:80549281(+) A-I      intronic chrX:80546755(+) A-I      intronic chrX:80546754(+) A-I      intronic chrX:80546723(+) A-I      intronic chrX:80546722(+) A-I      intronic chrX:80463492(+) A-I      intronic chrX:80463682(+) A-I      intronic chrX:80464526(+) A-I      intronic chrX:80464681(+) A-I      intronic chrX:80527575(+) A-I      intronic chrX:80527711(+) A-I      intronic chrX:80528205(+) A-I      intronic chrX:80530872(+) A-I      intronic chrX:80551160(+) A-I      intronic chrX:80551169(+) A-I      intronic chrX:80551166(+) A-I      intronic chrX:80551139(+) A-I      intronic chrX:80549340(+) A-I      intronic chrX:80549339(+) A-I      intronic chrX:80463500(+) A-I      intronic chrX:80464636(+) A-I      intronic chrX:80464633(+) A-I      intronic chrX:80527505(+) A-I      intronic chrX:80463501(+) A-I      intronic chrX:80463506(+) A-I      intronic chrX:80464781(+) A-I      intronic chrX:80463640(+) A-I      intronic chrX:80463570(+) A-I      intronic chrX:80464625(+) A-I      intronic chrX:80464600(+) A-I      intronic chrX:80464525(+) A-I      intronic chrX:80464607(+) A-I      intronic chrX:80464696(+) A-I      intronic chrX:80464704(+) A-I      intronic chrX:80463509(+) A-I      intronic chrX:80463576(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SH3BGRL	chrX:80546745(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chrX:80551574(+) A-I intron -    22327324 chrX:80548711(+) A-I intron -    21960545 chrX:80551234(+) A-I intron -    21960545 chrX:80551481(+) A-I intron -    21960545 chrX:80546745(+) A-G intron -    22484847 chrX:80546746(+) A-G intron -    22484847 chrX:80546969(+) A-G intron -    22484847 chrX:80551001(+) A-G intron -    22484847 chrX:80551481(+) A-G intron -    22484847 chrX:80551574(+) A-G intron -    22484847 chrX:80463762(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SH3BGRL	chrX:80457478-80457479(+) m6A 5'UTR       24981863 chrX:80457510-80457511(+) m6A 5'UTR       24981863 chrX:80457669-80457670(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chrX:80457675-80457676(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chrX:80552859-80552860(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//26404942 chrX:80552891-80552892(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//26404942 chrX:80553804-80553805(+) m6A 3'UTR       26404942 chrX:80553816-80553817(+) m6A 3'UTR       26404942 chrX:80553823-80553824(+) m6A 3'UTR       26404942

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ebv-miR-BHRF1-2-5p	Exosome B cell line (Raji)     21505438
	SH3BGRL	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: ebv-miR-BHRF1-2-5p
Interactor2: SH3BGRL

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg