Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00279947

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.6002

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BHRF1-2-5p:           INPP5D:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol ebv-miR-BHRF1-2-5p INPP5D
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0000996 3635
Organism Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - hp51CN//p150Ship//SHIP//SHIP-1//SHIP1//SIP-145

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR INPP5D
chr2:233963923(+) A-I      intronic
chr2:234081744(+) A-I      intronic
chr2:234083641(+) A-I      intronic
chr2:234001042(+) A-I      intronic
chr2:234001101(+) A-I      intronic
chr2:234001114(+) A-I      intronic
chr2:234001028(+) A-I      intronic
chr2:234001074(+) A-I      intronic
chr2:234062981(+) A-I      intronic
chr2:234065036(+) A-I      intronic
chr2:234065040(+) A-I      intronic
chr2:234065072(+) A-I      intronic
chr2:234065161(+) A-I      intronic
chr2:234065175(+) A-I      intronic
chr2:234065193(+) A-I      intronic
chr2:234067450(+) A-I      intronic
chr2:234067475(+) A-I      intronic
chr2:234067511(+) A-I      intronic
chr2:234067576(+) A-I      intronic
chr2:234067650(+) A-I      intronic
chr2:234067690(+) A-I      intronic
chr2:234068274(+) A-I      intronic
chr2:234068281(+) A-I      intronic
chr2:234068285(+) A-I      intronic
chr2:234082420(+) A-I      intronic
chr2:234082436(+) A-I      intronic
chr2:234082442(+) A-I      intronic
chr2:234082513(+) A-I      intronic
chr2:234083190(+) A-I      intronic
chr2:234083223(+) A-I      intronic
chr2:234083273(+) A-I      intronic
chr2:234083368(+) A-I      intronic
chr2:234083615(+) A-I      intronic
chr2:234083618(+) A-I      intronic
chr2:234083644(+) A-I      intronic
chr2:234083653(+) A-I      intronic
chr2:234083672(+) A-I      intronic
chr2:234083743(+) A-I      intronic
chr2:234083744(+) A-I      intronic
chr2:234083749(+) A-I      intronic
chr2:234083760(+) A-I      intronic
chr2:234083785(+) A-I      intronic
chr2:234084365(+) A-I      intronic
chr2:234084393(+) A-I      intronic
chr2:234084495(+) A-I      intronic
chr2:234084528(+) A-I      intronic
chr2:234095266(+) A-I      intronic
chr2:234095636(+) A-I      intronic
chr2:234095642(+) A-I      intronic
chr2:234095764(+) A-I      intronic
chr2:234113838(+) A-I      intronic
chr2:234113844(+) A-I      intronic
chr2:234114125(+) A-I      intronic
chr2:234114144(+) A-I      intronic
chr2:234114153(+) A-I      intronic
chr2:234114182(+) A-I      intronic
chr2:234114188(+) A-I      intronic
chr2:234114191(+) A-I      intronic
chr2:234114270(+) A-I      intronic
chr2:234114505(+) A-I      intronic
chr2:234114534(+) A-I      intronic
chr2:234114564(+) A-I      intronic
chr2:234114575(+) A-I      intronic
chr2:234114605(+) A-I      intronic
chr2:233932749(+) A-I      intronic
chr2:233932776(+) A-I      intronic
chr2:233932794(+) A-I      intronic
chr2:233932795(+) A-I      intronic
chr2:233932820(+) A-I      intronic
chr2:233932884(+) A-I      intronic
chr2:233932901(+) A-I      intronic
chr2:233932947(+) A-I      intronic
chr2:233935172(+) A-I      intronic
chr2:233935326(+) A-I      intronic
chr2:233935710(+) A-I      intronic
chr2:233935729(+) A-I      intronic
chr2:233930461(+) A-I      intronic
chr2:233930616(+) A-I      intronic
chr2:233930617(+) A-I      intronic
chr2:233961210(+) A-I      intronic
chr2:233961211(+) A-I      intronic
chr2:233961212(+) A-I      intronic
chr2:233992419(+) A-I      intronic
chr2:233935911(+) A-I      intronic
chr2:233943493(+) A-I      intronic
chr2:233943580(+) A-I      intronic
chr2:233943643(+) A-I      intronic
chr2:233943665(+) A-I      intronic
chr2:233944733(+) A-I      intronic
chr2:233944779(+) A-I      intronic
chr2:233944781(+) A-I      intronic
chr2:233944860(+) A-I      intronic
chr2:233944887(+) A-I      intronic
chr2:233948820(+) A-I      intronic
chr2:233948863(+) A-I      intronic
chr2:233948868(+) A-I      intronic
chr2:233948890(+) A-I      intronic
chr2:233949824(+) A-I      intronic
chr2:233949867(+) A-I      intronic
chr2:233949886(+) A-I      intronic
chr2:233949936(+) A-I      intronic
chr2:233949981(+) A-I      intronic
chr2:233949985(+) A-I      intronic
chr2:233950005(+) A-I      intronic
chr2:233950016(+) A-I      intronic
chr2:233950083(+) A-I      intronic
chr2:233952154(+) A-I      intronic
chr2:233961215(+) A-I      intronic
chr2:233961219(+) A-I      intronic
chr2:233962628(+) A-I      intronic
chr2:233962689(+) A-I      intronic
chr2:233962700(+) A-I      intronic
chr2:233963870(+) A-I      intronic
chr2:233963883(+) A-I      intronic
chr2:233963895(+) A-I      intronic
chr2:233952237(+) A-I      intronic
chr2:233952331(+) A-I      intronic
chr2:233952707(+) A-I      intronic
chr2:233952742(+) A-I      intronic
chr2:233952878(+) A-I      intronic
chr2:233952946(+) A-I      intronic
chr2:233955404(+) A-I      intronic
chr2:233955453(+) A-I      intronic
chr2:233955458(+) A-I      intronic
chr2:233955472(+) A-I      intronic
chr2:233955482(+) A-I      intronic
chr2:233955491(+) A-I      intronic
chr2:233955492(+) A-I      intronic
chr2:233955547(+) A-I      intronic
chr2:233955552(+) A-I      intronic
chr2:233958181(+) A-I      intronic
chr2:233958267(+) A-I      intronic
chr2:233958283(+) A-I      intronic
chr2:233958291(+) A-I      intronic
chr2:233958989(+) A-I      intronic
chr2:233958990(+) A-I      intronic
chr2:233958994(+) A-I      intronic
chr2:233958998(+) A-I      intronic
chr2:233959013(+) A-I      intronic
chr2:233959155(+) A-I      intronic
chr2:233959157(+) A-I      intronic
chr2:233960011(+) A-I      intronic
chr2:233960151(+) A-I      intronic
chr2:233960153(+) A-I      intronic
chr2:233961122(+) A-I      intronic
chr2:233961127(+) A-I      intronic
chr2:233961161(+) A-I      intronic
chr2:233961192(+) A-I      intronic
chr2:233961209(+) A-I      intronic
chr2:233963908(+) A-I      intronic
chr2:233967375(+) A-I      intronic
chr2:233967439(+) A-I      intronic
chr2:233967449(+) A-I      intronic
chr2:233967466(+) A-I      intronic
chr2:233967481(+) A-I      intronic
chr2:233967489(+) A-I      intronic
chr2:233968784(+) A-I      intronic
chr2:233968785(+) A-I      intronic
chr2:233968814(+) A-I      intronic
chr2:233968821(+) A-I      intronic
chr2:233968878(+) A-I      intronic
chr2:233968904(+) A-I      intronic
chr2:233968913(+) A-I      intronic
chr2:233974353(+) A-I      intronic
chr2:233974382(+) A-I      intronic
chr2:233974418(+) A-I      intronic
chr2:233974495(+) A-I      intronic
chr2:233974498(+) A-I      intronic
chr2:233974785(+) A-I      intronic
chr2:233992423(+) A-I      intronic
chr2:233992444(+) A-I      intronic
chr2:233992445(+) A-I      intronic
chr2:233992448(+) A-I      intronic
chr2:233992498(+) A-I      intronic
chr2:233974841(+) A-I      intronic
chr2:233974891(+) A-I      intronic
chr2:233974954(+) A-I      intronic
chr2:233975000(+) A-I      intronic
chr2:233975091(+) A-I      intronic
chr2:233992527(+) A-I      intronic
chr2:233993209(+) A-I      intronic
chr2:233993241(+) A-I      intronic
chr2:233975172(+) A-I      intronic
chr2:233975422(+) A-I      intronic
chr2:233993243(+) A-I      intronic
chr2:233993274(+) A-I      intronic
chr2:233993305(+) A-I      intronic
chr2:233974345(+) A-I      intronic
chr2:233993314(+) A-I      intronic
chr2:233993317(+) A-I      intronic
chr2:233993371(+) A-I      intronic
chr2:233993627(+) A-I      intronic
chr2:233931416(+) A-I      intronic
chr2:233931446(+) A-I      intronic
chr2:233931456(+) A-I      intronic
chr2:233931482(+) A-I      intronic
chr2:233932732(+) A-I      intronic
chr2:233993644(+) A-I      intronic
chr2:233993698(+) A-I      intronic
chr2:233993715(+) A-I      intronic
chr2:233935852(+) A-I      intronic
chr2:233993765(+) A-I      intronic
chr2:233994668(+) A-I      intronic
chr2:233994711(+) A-I      intronic
chr2:233994712(+) A-I      intronic
chr2:233994737(+) A-I      intronic
chr2:233994757(+) A-I      intronic
chr2:233975537(+) A-I      intronic
chr2:233976499(+) A-I      intronic
chr2:233976534(+) A-I      intronic
chr2:233994778(+) A-I      intronic
chr2:233994844(+) A-I      intronic
chr2:233994865(+) A-I      intronic
chr2:233994866(+) A-I      intronic
chr2:233932746(+) A-I      intronic
chr2:233994888(+) A-I      intronic
chr2:233996263(+) A-I      intronic
chr2:233997685(+) A-I      intronic
chr2:233997699(+) A-I      intronic
chr2:233997711(+) A-I      intronic
chr2:233997779(+) A-I      intronic
chr2:233997784(+) A-I      intronic
chr2:234000929(+) A-I      intronic
chr2:234000938(+) A-I      intronic
chr2:234000989(+) A-I      intronic
chr2:234001095(+) A-I      intronic
chr2:234002866(+) A-I      intronic
chr2:234002882(+) A-I      intronic
chr2:234002883(+) A-I      intronic
chr2:234003585(+) A-I      intronic
chr2:234003591(+) A-I      intronic
chr2:234003595(+) A-I      intronic
chr2:234003663(+) A-I      intronic
chr2:234062940(+) A-I      intronic
chr2:233976594(+) A-I      intronic
chr2:233976609(+) A-I      intronic
chr2:233977437(+) A-I      intronic
chr2:233977486(+) A-I      intronic
chr2:233977499(+) A-I      intronic
chr2:233977508(+) A-I      intronic
chr2:233985047(+) A-I      intronic
chr2:233985114(+) A-I      intronic
chr2:233992380(+) A-I      intronic
chr2:233992418(+) A-I      intronic
chr2:234000978(+) A-I      intronic
chr2:233948999(+) A-I      intronic
chr2:233960206(+) A-I      intronic
chr2:234068219(+) A-I      intronic
chr2:233975555(+) A-I      intronic
chr2:234097392(+) A-I      intronic
chr2:233961152(+) A-I      intronic
chr2:234113792(+) A-I      intronic
chr2:233994867(+) A-I      intronic
chr2:234001062(+) A-I      intronic
chr2:233977557(+) A-I      intronic
chr2:233952870(+) A-I      intronic
chr2:233942449(+) A-I      intronic
chr2:233991405(+) A-I      intronic
chr2:234081690(+) A-I      intronic
chr2:234113834(+) A-I      intronic
chr2:233952297(+) A-I      intronic
chr2:234095709(+) A-I      intronic
chr2:233952748(+) A-I      intronic
chr2:234114107(+) A-I      intronic
chr2:234062864(+) A-I      intronic
chr2:233975446(+) A-I      intronic
chr2:234090580(+) A-I      intronic
chr2:233960180(+) A-I      intronic
chr2:233933043(+) A-I      intronic
chr2:233993791(+) A-I      intronic
chr2:234114650(+) A-I      intronic
chr2:234065209(+) A-I      intronic
chr2:233993720(+) A-I      intronic
chr2:233930147(+) A-I      intronic
chr2:234068260(+) A-I      intronic
chr2:233935333(+) A-I      intronic
chr2:233976729(+) A-I      intronic
chr2:234064193(+) A-I      intronic
chr2:234062992(+) A-I      intronic
chr2:233996152(+) A-I      intronic
chr2:233993733(+) A-I      intronic
chr2:234000174(+) A-I      intronic
chr2:234083674(+) A-I      intronic
chr2:234095750(+) A-I      intronic
chr2:233935722(+) A-I      intronic
chr2:233993377(+) A-I      intronic
chr2:234084474(+) A-I      intronic
chr2:233961255(+) A-I      intronic
chr2:234062894(+) A-I      intronic
chr2:233949943(+) A-I      intronic
chr2:233962779(+) A-I      intronic
chr2:234002939(+) A-I      intronic
chr2:233950041(+) A-I      intronic
chr2:233958190(+) A-I      intronic
chr2:233955507(+) A-I      intronic
chr2:233996360(+) A-I      intronic
chr2:233943467(+) A-I      intronic
chr2:233952947(+) A-I      intronic
chr2:233996316(+) A-I      intronic
chr2:234001004(+) A-I      intronic
chr2:233958189(+) A-I      intronic
chr2:234063029(+) A-I      intronic
chr2:234095744(+) A-I      intronic
chr2:234065029(+) A-I      intronic
chr2:234001011(+) A-I      intronic
chr2:234065138(+) A-I      intronic
chr2:233976592(+) A-I      intronic
chr2:233952747(+) A-I      intronic
chr2:234002283(+) A-I      intronic
chr2:233997668(+) A-I      intronic
chr2:234107958(+) A-I      intronic
chr2:234095745(+) A-I      intronic
chr2:233997622(+) A-I      intronic
chr2:233975556(+) A-I      intronic
chr2:233985942(+) A-I      intronic
chr2:234063644(+) A-I      intronic
chr2:234095215(+) A-I      intronic
chr2:233994738(+) A-I      intronic
chr2:233961084(+) A-I      intronic
chr2:234095596(+) A-I      intronic
chr2:233981198(+) A-I      intronic
chr2:234065077(+) A-I      intronic
chr2:234000916(+) A-I      intronic
chr2:234067569(+) A-I      intronic
chr2:234097288(+) A-I      intronic
chr2:233960003(+) A-I      intronic
chr2:233930496(+) A-I      intronic
chr2:233949931(+) A-I      intronic
chr2:233942248(+) A-I      intronic
chr2:233952220(+) A-I      intronic
chr2:233997917(+) A-I      intronic
chr2:234083379(+) A-I      intronic
chr2:233948948(+) A-I      intronic
chr2:234068188(+) A-I      intronic
chr2:234068289(+) A-I      intronic
chr2:233944849(+) A-I      intronic
chr2:233948867(+) A-I      intronic
chr2:234114282(+) A-I      intronic
chr2:234087209(+) A-I      intronic
chr2:233993782(+) A-I      intronic
chr2:234083209(+) A-I      intronic
chr2:234001082(+) A-I      intronic
chr2:233959143(+) A-I      intronic
chr2:234095394(+) A-I      intronic
chr2:234113870(+) A-I      intronic
chr2:234114470(+) A-I      intronic
chr2:233944840(+) A-I      intronic
chr2:234095549(+) A-I      intronic
chr2:233997877(+) A-I      intronic
chr2:233993330(+) A-I      intronic
chr2:233952226(+) A-I      intronic
chr2:233949975(+) A-I      intronic
chr2:233976561(+) A-I      intronic
chr2:234067463(+) A-I      intronic
chr2:233944806(+) A-I      intronic
chr2:233993353(+) A-I      intronic
chr2:233948839(+) A-I      intronic
chr2:233974793(+) A-I      intronic
chr2:233993287(+) A-I      intronic
chr2:234067504(+) A-I      intronic
chr2:233997852(+) A-I      intronic
chr2:234000987(+) A-I      intronic
chr2:233933072(+) A-I      intronic
chr2:233952825(+) A-I      intronic
chr2:234081705(+) A-I      intronic
chr2:234095602(+) A-I      intronic
chr2:234003597(+) A-I      intronic
chr2:234068209(+) A-I      intronic
chr2:234114058(+) A-I      intronic
chr2:233950988(+) A-I      intronic
chr2:234065130(+) A-I      intronic
chr2:233952812(+) A-I      intronic
chr2:233974862(+) A-I      intronic
chr2:233994777(+) A-I      intronic
chr2:233981129(+) A-I      intronic
chr2:233984984(+) A-I      intronic
chr2:233975376(+) A-I      intronic
chr2:233932916(+) A-I      intronic
chr2:233943456(+) A-I      intronic
chr2:233930847(+) A-I      intronic
chr2:233930415(+) A-I      intronic
chr2:234002363(+) A-I      intronic
chr2:233993462(+) A-I      intronic
chr2:233963844(+) A-I      intronic
chr2:234097233(+) A-I      intronic
chr2:233949935(+) A-I      intronic
chr2:234000108(+) A-I      intronic
chr2:233955546(+) A-I      intronic
chr2:233992501(+) A-I      intronic
chr2:233997788(+) A-I      intronic
chr2:233993207(+) A-I      intronic
chr2:234064968(+) A-I      intronic
chr2:233992388(+) A-I      intronic
chr2:233977565(+) A-I      intronic
chr2:233955490(+) A-I      intronic
chr2:233935878(+) A-I      intronic
chr2:233933049(+) A-I      intronic
chr2:233935888(+) A-I      intronic
chr2:234068193(+) A-I      intronic
chr2:233962699(+) A-I      intronic
chr2:233949841(+) A-I      intronic
chr2:233996158(+) A-I      intronic
chr2:233950028(+) A-I      intronic
chr2:234067494(+) A-I      intronic
chr2:233976652(+) A-I      intronic
chr2:233967413(+) A-I      intronic
chr2:233952811(+) A-I      intronic
chr2:234113776(+) A-I      intronic
chr2:233949840(+) A-I      intronic
chr2:234095774(+) A-I      intronic
chr2:234083175(+) A-I      intronic
chr2:234059853(+) A-I      intronic
chr2:234083663(+) A-I      intronic
chr2:233975394(+) A-I      intronic
chr2:233993292(+) A-I      intronic
chr2:233996154(+) A-I      intronic
chr2:233948931(+) A-I      intronic
chr2:233935924(+) A-I      intronic
chr2:233985935(+) A-I      intronic
chr2:233958310(+) A-I      intronic
chr2:234001068(+) A-I      intronic
chr2:234114469(+) A-I      intronic
chr2:233932848(+) A-I      intronic
chr2:233993697(+) A-I      intronic
chr2:233997878(+) A-I      intronic
chr2:233930474(+) A-I      intronic
chr2:233975587(+) A-I      intronic
chr2:233935293(+) A-I      intronic
chr2:233932927(+) A-I      intronic
chr2:234084458(+) A-I      intronic
chr2:233975417(+) A-I      intronic
chr2:234068186(+) A-I      intronic
chr2:233993239(+) A-I      intronic
chr2:234084455(+) A-I      intronic
chr2:233961241(+) A-I      intronic
chr2:234064962(+) A-I      intronic
chr2:233977485(+) A-I      intronic
chr2:234081796(+) A-I      intronic
chr2:233952234(+) A-I      intronic
chr2:234076404(+) A-I      intronic
chr2:233996389(+) A-I      intronic
chr2:234064958(+) A-I      intronic
chr2:234083327(+) A-I      intronic
chr2:234090603(+) A-I      intronic
chr2:233993331(+) A-I      intronic
chr2:234062825(+) A-I      intronic
chr2:233961106(+) A-I      intronic
chr2:233930130(+) A-I      intronic
chr2:234114563(+) A-I      intronic
chr2:233951018(+) A-I      intronic
chr2:233961206(+) A-I      intronic
chr2:234083213(+) A-I      intronic
chr2:233935802(+) A-I      intronic
chr2:234002876(+) A-I      intronic
chr2:234095206(+) A-I      intronic
chr2:234064189(+) A-I      intronic
chr2:233958195(+) A-I      intronic
chr2:233961154(+) A-I      intronic
chr2:233994713(+) A-I      intronic
chr2:233993670(+) A-I      intronic
chr2:234064013(+) A-I      intronic
chr2:234001069(+) A-I      intronic
chr2:234000992(+) A-I      intronic
chr2:233955489(+) A-I      intronic
chr2:233994879(+) A-I      intronic
chr2:233955520(+) A-I      intronic
chr2:233935745(+) A-I      intronic
chr2:233993232(+) A-I      intronic
chr2:233949934(+) A-I      intronic
chr2:233935876(+) A-I      intronic
chr2:234000131(+) A-I      intronic
chr2:234000113(+) A-I      intronic
chr2:234113830(+) A-I      intronic
chr2:234068190(+) A-I      intronic
chr2:234064200(+) A-I      intronic
chr2:234114464(+) A-I      intronic
chr2:234095392(+) A-I      intronic
chr2:233993288(+) A-I      intronic
chr2:233955560(+) A-I      intronic
chr2:233991477(+) A-I      intronic
chr2:233942301(+) A-I      intronic
chr2:234114056(+) A-I      intronic
chr2:234095469(+) A-I      intronic
chr2:233932834(+) A-I      intronic
chr2:233950989(+) A-I      intronic
chr2:233975377(+) A-I      intronic
chr2:233952136(+) A-I      intronic
chr2:234084468(+) A-I      intronic
chr2:234083228(+) A-I      intronic
chr2:233986007(+) A-I      intronic
chr2:233975039(+) A-I      intronic
chr2:233975093(+) A-I      intronic
chr2:233949949(+) A-I      intronic
chr2:234083291(+) A-I      intronic
chr2:233935425(+) A-I      intronic
chr2:234095552(+) A-I      intronic
chr2:233960183(+) A-I      intronic
chr2:234095601(+) A-I      intronic
chr2:234083334(+) A-I      intronic
chr2:234090540(+) A-I      intronic
chr2:234065124(+) A-I      intronic
chr2:234002824(+) A-I      intronic
chr2:234002807(+) A-I      intronic
chr2:234114565(+) A-I      intronic
chr2:233948905(+) A-I      intronic
chr2:233955600(+) A-I      intronic
chr2:233992339(+) A-I      intronic
chr2:234064217(+) A-I      intronic
chr2:233974342(+) A-I      intronic
chr2:233993629(+) A-I      intronic
chr2:233974855(+) A-I      intronic
chr2:233930457(+) A-I      intronic
chr2:233949910(+) A-I      intronic
chr2:234084508(+) A-I      intronic
chr2:233952064(+) A-I      intronic
chr2:233986110(+) A-I      intronic
chr2:233949000(+) A-I      intronic
chr2:234095214(+) A-I      intronic
chr2:234113893(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED INPP5D
chr2:233935802(+) A-I intron -    22327324
chr2:234057687(+) A-G intron -    22484847
chr2:233930130(+) A-G intron -    22484847
chr2:233930147(+) A-G intron -    22484847
chr2:233930184(+) A-T intron -    22484847
chr2:233930415(+) A-G intron -    22484847
chr2:233930443(+) A-G intron -    22484847
chr2:233930457(+) A-G intron -    22484847
chr2:233930474(+) A-G intron -    22484847
chr2:233930496(+) A-G intron -    22484847
chr2:233930847(+) A-G intron -    22484847
chr2:233932923(+) A-G intron -    22484847
chr2:233932927(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935170(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935271(+) T-C intron -    22484847
chr2:233935333(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935336(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935355(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935425(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935722(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935745(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935798(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935802(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935876(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935878(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935924(+) A-G intron -    22484847
chr2:233935931(+) A-G intron -    22484847
chr2:233943425(+) A-G intron -    22484847
chr2:233943456(+) A-G intron -    22484847
chr2:233943467(+) A-G intron -    22484847
chr2:233944840(+) A-G intron -    22484847
chr2:233944849(+) A-G intron -    22484847
chr2:233944853(+) T-C intron -    22484847
chr2:233948788(+) A-G intron -    22484847
chr2:233948839(+) A-G intron -    22484847
chr2:233948845(+) A-G intron -    22484847
chr2:233948864(+) A-G intron -    22484847
chr2:233948867(+) A-G intron -    22484847
chr2:233948905(+) A-G intron -    22484847
chr2:233948931(+) A-G intron -    22484847
chr2:233948948(+) A-G intron -    22484847
chr2:233948954(+) A-G intron -    22484847
chr2:233948999(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949000(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949832(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949840(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949841(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949910(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949931(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949934(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949935(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949943(+) A-G intron -    22484847
chr2:233949975(+) A-G intron -    22484847
chr2:233950017(+) A-G intron -    22484847
chr2:233950022(+) A-G intron -    22484847
chr2:233950082(+) A-G intron -    22484847
chr2:233950988(+) A-G intron -    22484847
chr2:233950989(+) A-G intron -    22484847
chr2:233951006(+) A-G intron -    22484847
chr2:233951018(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952064(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952136(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952220(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952226(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952234(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952297(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952709(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952747(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952748(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952766(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952811(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952812(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952815(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952825(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952870(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952884(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952937(+) A-G intron -    22484847
chr2:233952947(+) A-G intron -    22484847
chr2:233955439(+) A-G intron -    22484847
chr2:233955489(+) A-G intron -    22484847
chr2:233955490(+) A-G intron -    22484847
chr2:233955506(+) A-G intron -    22484847
chr2:233955507(+) A-G intron -    22484847
chr2:233955520(+) A-G intron -    22484847
chr2:233955560(+) A-G intron -    22484847
chr2:233955600(+) A-G intron -    22484847
chr2:233959222(+) C-A intron -    22484847
chr2:233960003(+) A-G intron -    22484847
chr2:233960369(+) A-G intron -    22484847
chr2:233961084(+) A-G intron -    22484847
chr2:233961104(+) A-G intron -    22484847
chr2:233961106(+) A-G intron -    22484847
chr2:233961152(+) A-G intron -    22484847
chr2:233961154(+) A-G intron -    22484847
chr2:233961241(+) A-G intron -    22484847
chr2:233961255(+) A-G intron -    22484847
chr2:233961277(+) A-G intron -    22484847
chr2:233963800(+) A-G intron -    22484847
chr2:233974315(+) A-G intron -    22484847
chr2:233974342(+) A-G intron -    22484847
chr2:233974855(+) A-G intron -    22484847
chr2:233974862(+) A-G intron -    22484847
chr2:233975039(+) A-G intron -    22484847
chr2:233975093(+) A-G intron -    22484847
chr2:233975394(+) A-G intron -    22484847
chr2:233975417(+) A-G intron -    22484847
chr2:233975532(+) A-G intron -    22484847
chr2:233975587(+) A-G intron -    22484847
chr2:233976507(+) A-G intron -    22484847
chr2:233977485(+) A-G intron -    22484847
chr2:233977557(+) A-G intron -    22484847
chr2:233977565(+) A-G intron -    22484847
chr2:233979609(+) C-T intron -    22484847
chr2:233981117(+) A-G intron -    22484847
chr2:233984984(+) A-G intron -    22484847
chr2:233985842(+) T-C intron -    22484847
chr2:233985843(+) T-C intron -    22484847
chr2:233985935(+) A-G intron -    22484847
chr2:233985942(+) A-G intron -    22484847
chr2:233986006(+) T-C intron -    22484847
chr2:233986007(+) A-G intron -    22484847
chr2:233986083(+) A-G intron -    22484847
chr2:233988098(+) A-T intron -    22484847
chr2:233991405(+) A-G intron -    22484847
chr2:233991464(+) C-T intron -    22484847
chr2:233991477(+) A-G intron -    22484847
chr2:233991483(+) A-G intron -    22484847
chr2:233991535(+) G-T intron -    22484847
chr2:233991536(+) A-G intron -    22484847
chr2:233991544(+) A-G intron -    22484847
chr2:233992375(+) A-G intron -    22484847
chr2:233992376(+) A-G intron -    22484847
chr2:233992388(+) A-G intron -    22484847
chr2:233992412(+) G-A intron -    22484847
chr2:233992501(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993207(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993232(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993239(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993287(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993288(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993291(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993292(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993330(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993331(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993353(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993368(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993377(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993462(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993629(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993697(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993729(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993733(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993745(+) A-G intron -    22484847
chr2:233993791(+) A-G intron -    22484847
chr2:233994702(+) T-C intron -    22484847
chr2:233994713(+) A-G intron -    22484847
chr2:233994716(+) A-G intron -    22484847
chr2:233994738(+) A-G intron -    22484847
chr2:233994746(+) A-G intron -    22484847
chr2:233994769(+) A-G intron -    22484847
chr2:233994777(+) A-G intron -    22484847
chr2:233994833(+) A-G intron -    22484847
chr2:233994867(+) A-G intron -    22484847
chr2:233994879(+) A-G intron -    22484847
chr2:233996151(+) A-G intron -    22484847
chr2:233996152(+) A-G intron -    22484847
chr2:233996158(+) A-G intron -    22484847
chr2:233996223(+) A-G intron -    22484847
chr2:233996283(+) A-G intron -    22484847
chr2:233996360(+) A-G intron -    22484847
chr2:233996389(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997618(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997622(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997668(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997673(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997684(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997788(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997852(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997871(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997877(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997882(+) A-G intron -    22484847
chr2:233997917(+) A-G intron -    22484847
chr2:233999999(+) A-G intron -    22484847
chr2:234000045(+) A-G intron -    22484847
chr2:234000051(+) A-G intron -    22484847
chr2:234000113(+) A-G intron -    22484847
chr2:234000131(+) A-G intron -    22484847
chr2:234000932(+) A-G intron -    22484847
chr2:234000933(+) A-G intron -    22484847
chr2:234000987(+) A-G intron -    22484847
chr2:234001062(+) A-G intron -    22484847
chr2:234001069(+) A-G intron -    22484847
chr2:234001082(+) A-G intron -    22484847
chr2:234002363(+) A-G intron -    22484847
chr2:234002824(+) A-G intron -    22484847
chr2:234002876(+) A-G intron -    22484847
chr2:234003592(+) A-G intron -    22484847
chr2:234062825(+) A-G intron -    22484847
chr2:234062864(+) A-G intron -    22484847
chr2:234062894(+) A-G intron -    22484847
chr2:234062992(+) A-G intron -    22484847
chr2:234063029(+) A-G intron -    22484847
chr2:234064013(+) A-G intron -    22484847
chr2:234064958(+) A-G intron -    22484847
chr2:234065029(+) A-G intron -    22484847
chr2:234065077(+) A-G intron -    22484847
chr2:234065124(+) A-G intron -    22484847
chr2:234065130(+) A-G intron -    22484847
chr2:234065209(+) A-G intron -    22484847
chr2:234067494(+) A-G intron -    22484847
chr2:234067504(+) A-G intron -    22484847
chr2:234067569(+) A-G intron -    22484847
chr2:234067595(+) A-G intron -    22484847
chr2:234068135(+) A-G intron -    22484847
chr2:234068219(+) A-G intron -    22484847
chr2:234069897(+) T-C intron -    22484847
chr2:234083276(+) G-A intron -    22484847
chr2:234083663(+) A-G intron -    22484847
chr2:234083674(+) A-G intron -    22484847
chr2:234084398(+) A-G intron -    22484847
chr2:234084429(+) A-G intron -    22484847
chr2:234084455(+) A-G intron -    22484847
chr2:234084458(+) A-G intron -    22484847
chr2:234084468(+) A-G intron -    22484847
chr2:234090540(+) A-G intron -    22484847
chr2:234090580(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095206(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095210(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095214(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095215(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095383(+) T-A intron -    22484847
chr2:234095400(+) G-T intron -    22484847
chr2:234095469(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095549(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095552(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095596(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095601(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095602(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095745(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095750(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095755(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095774(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095824(+) T-C intron -    22484847
chr2:234095829(+) C-T intron -    22484847
chr2:234097288(+) A-G intron -    22484847
chr2:234097308(+) A-G intron -    22484847
chr2:234103343(+) C-G intron -    22484847
chr2:234107734(+) G-A intron -    22484847
chr2:234107806(+) C-T intron -    22484847
chr2:234107821(+) T-C intron -    22484847
chr2:234107958(+) A-G intron -    22484847
chr2:234109532(+) G-A intron -    22484847
chr2:234112606(+) G-A intron -    22484847
chr2:234113826(+) A-G intron -    22484847
chr2:234113829(+) A-G intron -    22484847
chr2:234113830(+) A-G intron -    22484847
chr2:234113834(+) A-G intron -    22484847
chr2:234113893(+) A-G intron -    22484847
chr2:234113923(+) A-G intron -    22484847
chr2:234114056(+) A-G intron -    22484847
chr2:234114058(+) A-G intron -    22484847
chr2:234114107(+) A-G intron -    22484847
chr2:234114469(+) A-G intron -    22484847
chr2:234114470(+) A-G intron -    22484847
chr2:234114563(+) A-G intron -    22484847
chr2:234114565(+) A-G intron -    22484847
chr2:234114650(+) A-G intron -    22484847
chr2:234095156(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase INPP5D
chr2:233925037-233925038(+) m6A 5'UTR       -
chr2:233925204-233925205(+) m6A CDS//exon       -
chr2:233986856-233986857(+) m6A CDS//exon       -
chr2:233986886-233986887(+) m6A CDS//exon       -
chr2:233986937-233986938(+) m6A CDS//exon       -
chr2:233986961-233986962(+) m6A CDS//exon       -
chr2:233990493-233990494(+) m6A CDS//exon       -
chr2:233990567-233990568(+) m6A CDS//exon       -
chr2:233990591-233990592(+) m6A CDS//exon       -
chr2:233990619-233990620(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234070409-234070410(+) m6A CDS       -
chr2:234070466-234070467(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234072430-234072431(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234072472-234072473(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234072509-234072510(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234072546-234072547(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234072974-234072975(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234073013-234073014(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234073048-234073049(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234073061-234073062(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234077498-234077499(+) m6A exon//intron       -
chr2:234079150-234079151(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234079187-234079188(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234079752-234079753(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234079763-234079764(+) m6A CDS//exon       -
chr2:234098532-234098533(+) m6A CDS       -
chr2:234102573-234102574(+) m6A CDS       -
chr2:234104085-234104086(+) m6A CDS       -
chr2:234106840-234106841(+) m6A CDS       -
chr2:234106895-234106896(+) m6A CDS       -
chr2:234106988-234106989(+) m6A CDS       -
chr2:234107008-234107009(+) m6A CDS       -
chr2:234112800-234112801(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234112818-234112819(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234112851-234112852(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234112902-234112903(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234112933-234112934(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234112951-234112952(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234113094-234113095(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234113117-234113118(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234113192-234113193(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234113351-234113352(+) m6A CDS//intron       -
chr2:234115412-234115413(+) m6A 3'UTR       -
chr2:234115425-234115426(+) m6A 3'UTR       -
chr2:234115526-234115527(+) m6A 3'UTR       25456834//22608085
chr2:234115580-234115581(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr2:234115616-234115617(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr2:234115656-234115657(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr2:234115729-234115730(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr2:234115770-234115771(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr2:234115821-234115822(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//22608085
chr2:234115834-234115835(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//22608085
chr2:234115907-234115908(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ebv-miR-BHRF1-2-5p
Exosome B cell line (Raji)     21505438
INPP5D
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Exosome Blood     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: ebv-miR-BHRF1-2-5p
Interactor2: INPP5D

Evidence Support:


Weak-Evidence PAR-CLIP
Prediction-Evidence miRanda//PARalyzer//Targetscan
Support Database ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg

References:


PMID 22291592 Target region CDS
Source ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression Downregulation
Description We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7).

Starting a new search, please wait ...