Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00278103

  Virus:  

Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.8925

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      ebv-miR-BHRF1-1:           ARHGEF18:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol ebv-miR-BHRF1-1 ARHGEF18
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0000995 23370
Organism Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - P114-RhoGEF//p114RhoGEF//RP78//SA-RhoGEF

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ARHGEF18
chr19:7515386(+) A-I      intronic
chr19:7495570(+) A-I      intronic
chr19:7468749(+) A-I      intronic
chr19:7503559(+) A-I      intronic
chr19:7526736(+) A-I      intronic
chr19:7482398(+) A-I      intronic
chr19:7531547(+) A-I      intronic
chr19:7482428(+) A-I      intronic
chr19:7482431(+) A-I      intronic
chr19:7510580(+) A-I      intronic
chr19:7485305(+) A-I      intronic
chr19:7486496(+) A-I      intronic
chr19:7486497(+) A-I      intronic
chr19:7468563(+) A-I      intronic
chr19:7488453(+) A-I      intronic
chr19:7495576(+) A-I      intronic
chr19:7467074(+) A-I      intronic
chr19:7467060(+) A-I      intronic
chr19:7498762(+) A-I      intronic
chr19:7470717(+) A-I      intronic
chr19:7510569(+) A-I      intronic
chr19:7503571(+) A-I      intronic
chr19:7498766(+) A-I      intronic
chr19:7464728(+) A-I      intronic
chr19:7503531(+) A-I      intronic
chr19:7464745(+) A-I      intronic
chr19:7462215(+) A-I      intronic
chr19:7468773(+) A-I      intronic
chr19:7468774(+) A-I      intronic
chr19:7468789(+) A-I      intronic
chr19:7498730(+) A-I      intronic
chr19:7526659(+) A-I      intronic
chr19:7498750(+) A-I      intronic
chr19:7531596(+) A-I      intronic
chr19:7515443(+) A-I      intronic
chr19:7464695(+) A-I      intronic
chr19:7468790(+) A-I      intronic
chr19:7531579(+) A-I      intronic
chr19:7503558(+) A-I      intronic
chr19:7468795(+) A-I      intronic
chr19:7468800(+) A-I      intronic
chr19:7468801(+) A-I      intronic
chr19:7482397(+) A-I      intronic
chr19:7531570(+) A-I      intronic
chr19:7485220(+) A-I      intronic
chr19:7485238(+) A-I      intronic
chr19:7485319(+) A-I      intronic
chr19:7485373(+) A-I      intronic
chr19:7485386(+) A-I      intronic
chr19:7486385(+) A-I      intronic
chr19:7486432(+) A-I      intronic
chr19:7486471(+) A-I      intronic
chr19:7486509(+) A-I      intronic
chr19:7487708(+) A-I      intronic
chr19:7523160(+) A-I      intronic
chr19:7522349(+) A-I      intronic
chr19:7487750(+) A-I      intronic
chr19:7487770(+) A-I      intronic
chr19:7487805(+) A-I      intronic
chr19:7487867(+) A-I      intronic
chr19:7487879(+) A-I      intronic
chr19:7488502(+) A-I      intronic
chr19:7488523(+) A-I      intronic
chr19:7488532(+) A-I      intronic
chr19:7489042(+) A-I      intronic
chr19:7489052(+) A-I      intronic
chr19:7489164(+) A-I      intronic
chr19:7489721(+) A-I      intronic
chr19:7489741(+) A-I      intronic
chr19:7489759(+) A-I      intronic
chr19:7489760(+) A-I      intronic
chr19:7489769(+) A-I      intronic
chr19:7489801(+) A-I      intronic
chr19:7489887(+) A-I      intronic
chr19:7492446(+) A-I      intronic
chr19:7524236(+) A-I      intronic
chr19:7516808(+) A-I      intronic
chr19:7492456(+) A-I      intronic
chr19:7494368(+) A-I      intronic
chr19:7463392(+) A-I      intronic
chr19:7461441(+) A-I      intronic
chr19:7461454(+) A-I      intronic
chr19:7461490(+) A-I      intronic
chr19:7462216(+) A-I      intronic
chr19:7462253(+) A-I      intronic
chr19:7462255(+) A-I      intronic
chr19:7462278(+) A-I      intronic
chr19:7462293(+) A-I      intronic
chr19:7462498(+) A-I      intronic
chr19:7462521(+) A-I      intronic
chr19:7462604(+) A-I      intronic
chr19:7463014(+) A-I      intronic
chr19:7463226(+) A-I      intronic
chr19:7463366(+) A-I      intronic
chr19:7524144(+) A-I      intronic
chr19:7463415(+) A-I      intronic
chr19:7494385(+) A-I      intronic
chr19:7494401(+) A-I      intronic
chr19:7494410(+) A-I      intronic
chr19:7494446(+) A-I      intronic
chr19:7463417(+) A-I      intronic
chr19:7463418(+) A-I      intronic
chr19:7463430(+) A-I      intronic
chr19:7463518(+) A-I      intronic
chr19:7464762(+) A-I      intronic
chr19:7464891(+) A-I      intronic
chr19:7465221(+) A-I      intronic
chr19:7465273(+) A-I      intronic
chr19:7465316(+) A-I      intronic
chr19:7465447(+) A-I      intronic
chr19:7495173(+) A-I      intronic
chr19:7495187(+) A-I      intronic
chr19:7495205(+) A-I      intronic
chr19:7495341(+) A-I      intronic
chr19:7495435(+) A-I      intronic
chr19:7465490(+) A-I      intronic
chr19:7465499(+) A-I      intronic
chr19:7465509(+) A-I      intronic
chr19:7465591(+) A-I      intronic
chr19:7465605(+) A-I      intronic
chr19:7465629(+) A-I      intronic
chr19:7495616(+) A-I      intronic
chr19:7496224(+) A-I      intronic
chr19:7496282(+) A-I      intronic
chr19:7496430(+) A-I      intronic
chr19:7496628(+) A-I      intronic
chr19:7498091(+) A-I      intronic
chr19:7498098(+) A-I      intronic
chr19:7498274(+) A-I      intronic
chr19:7498278(+) A-I      intronic
chr19:7498666(+) A-I      intronic
chr19:7498686(+) A-I      intronic
chr19:7498785(+) A-I      intronic
chr19:7499068(+) A-I      intronic
chr19:7499122(+) A-I      intronic
chr19:7500026(+) A-I      intronic
chr19:7500859(+) A-I      intronic
chr19:7500907(+) A-I      intronic
chr19:7501186(+) A-I      intronic
chr19:7501194(+) A-I      intronic
chr19:7465673(+) A-I      intronic
chr19:7466246(+) A-I      intronic
chr19:7466257(+) A-I      intronic
chr19:7466375(+) A-I      intronic
chr19:7466414(+) A-I      intronic
chr19:7466436(+) A-I      intronic
chr19:7467087(+) A-I      intronic
chr19:7467118(+) A-I      intronic
chr19:7501292(+) A-I      intronic
chr19:7501353(+) A-I      intronic
chr19:7501400(+) A-I      intronic
chr19:7501407(+) A-I      intronic
chr19:7501425(+) A-I      intronic
chr19:7502068(+) A-I      intronic
chr19:7502101(+) A-I      intronic
chr19:7502240(+) A-I      intronic
chr19:7467119(+) A-I      intronic
chr19:7467207(+) A-I      intronic
chr19:7502691(+) A-I      intronic
chr19:7467231(+) A-I      intronic
chr19:7467246(+) A-I      intronic
chr19:7523155(+) A-I      intronic
chr19:7523088(+) A-I      intronic
chr19:7522944(+) A-I      intronic
chr19:7522510(+) A-I      intronic
chr19:7522449(+) A-I      intronic
chr19:7522429(+) A-I      intronic
chr19:7517896(+) A-I      intronic
chr19:7467250(+) A-I      intronic
chr19:7467257(+) A-I      intronic
chr19:7467270(+) A-I      intronic
chr19:7502712(+) A-I      intronic
chr19:7467926(+) A-I      intronic
chr19:7467974(+) A-I      intronic
chr19:7468003(+) A-I      intronic
chr19:7468017(+) A-I      intronic
chr19:7517900(+) A-I      intronic
chr19:7517920(+) A-I      intronic
chr19:7517965(+) A-I      intronic
chr19:7521802(+) A-I      intronic
chr19:7522278(+) A-I      intronic
chr19:7502714(+) A-I      intronic
chr19:7503397(+) A-I      intronic
chr19:7503398(+) A-I      intronic
chr19:7503427(+) A-I      intronic
chr19:7503544(+) A-I      intronic
chr19:7503859(+) A-I      intronic
chr19:7504031(+) A-I      intronic
chr19:7504141(+) A-I      intronic
chr19:7504238(+) A-I      intronic
chr19:7509472(+) A-I      intronic
chr19:7509522(+) A-I      intronic
chr19:7509563(+) A-I      intronic
chr19:7510227(+) A-I      intronic
chr19:7510249(+) A-I      intronic
chr19:7510268(+) A-I      intronic
chr19:7510527(+) A-I      intronic
chr19:7510599(+) A-I      intronic
chr19:7511520(+) A-I      intronic
chr19:7511640(+) A-I      intronic
chr19:7514725(+) A-I      intronic
chr19:7514747(+) A-I      intronic
chr19:7514799(+) A-I      intronic
chr19:7516708(+) A-I      intronic
chr19:7516737(+) A-I      intronic
chr19:7516791(+) A-I      intronic
chr19:7531379(+) A-I      intronic
chr19:7531184(+) A-I      intronic
chr19:7531050(+) A-I      intronic
chr19:7522328(+) A-I      intronic
chr19:7522348(+) A-I      intronic
chr19:7468025(+) A-I      intronic
chr19:7468063(+) A-I      intronic
chr19:7468455(+) A-I      intronic
chr19:7468613(+) A-I      intronic
chr19:7531041(+) A-I      intronic
chr19:7531032(+) A-I      intronic
chr19:7531015(+) A-I      intronic
chr19:7530895(+) A-I      intronic
chr19:7530774(+) A-I      intronic
chr19:7530733(+) A-I      intronic
chr19:7530433(+) A-I      intronic
chr19:7530398(+) A-I      intronic
chr19:7468844(+) A-I      intronic
chr19:7468853(+) A-I      intronic
chr19:7469365(+) A-I      intronic
chr19:7469475(+) A-I      intronic
chr19:7469476(+) A-I      intronic
chr19:7469485(+) A-I      intronic
chr19:7469487(+) A-I      intronic
chr19:7469905(+) A-I      intronic
chr19:7470025(+) A-I      intronic
chr19:7470065(+) A-I      intronic
chr19:7470097(+) A-I      intronic
chr19:7470107(+) A-I      intronic
chr19:7470119(+) A-I      intronic
chr19:7471752(+) A-I      intronic
chr19:7471753(+) A-I      intronic
chr19:7471836(+) A-I      intronic
chr19:7472072(+) A-I      intronic
chr19:7472078(+) A-I      intronic
chr19:7472159(+) A-I      intronic
chr19:7472160(+) A-I      intronic
chr19:7530397(+) A-I      intronic
chr19:7530326(+) A-I      intronic
chr19:7526120(+) A-I      intronic
chr19:7525792(+) A-I      intronic
chr19:7481255(+) A-I      intronic
chr19:7481249(+) A-I      intronic
chr19:7479788(+) A-I      intronic
chr19:7479761(+) A-I      intronic
chr19:7477549(+) A-I      intronic
chr19:7477548(+) A-I      intronic
chr19:7477530(+) A-I      intronic
chr19:7477521(+) A-I      intronic
chr19:7477508(+) A-I      intronic
chr19:7477507(+) A-I      intronic
chr19:7477467(+) A-I      intronic
chr19:7477444(+) A-I      intronic
chr19:7477442(+) A-I      intronic
chr19:7477421(+) A-I      intronic
chr19:7477351(+) A-I      intronic
chr19:7477022(+) A-I      intronic
chr19:7477001(+) A-I      intronic
chr19:7476455(+) A-I      intronic
chr19:7476390(+) A-I      intronic
chr19:7476359(+) A-I      intronic
chr19:7476310(+) A-I      intronic
chr19:7476292(+) A-I      intronic
chr19:7476286(+) A-I      intronic
chr19:7476279(+) A-I      intronic
chr19:7476216(+) A-I      intronic
chr19:7475534(+) A-I      intronic
chr19:7475525(+) A-I      intronic
chr19:7475517(+) A-I      intronic
chr19:7474455(+) A-I      intronic
chr19:7474377(+) A-I      intronic
chr19:7474085(+) A-I      intronic
chr19:7474072(+) A-I      intronic
chr19:7474071(+) A-I      intronic
chr19:7474020(+) A-I      intronic
chr19:7473931(+) A-I      intronic
chr19:7473891(+) A-I      intronic
chr19:7473742(+) A-I      intronic
chr19:7473729(+) A-I      intronic
chr19:7473673(+) A-I      intronic
chr19:7473085(+) A-I      intronic
chr19:7473076(+) A-I      intronic
chr19:7473073(+) A-I      intronic
chr19:7473042(+) A-I      intronic
chr19:7521883(+) A-I      intronic
chr19:7472205(+) A-I      intronic
chr19:7472201(+) A-I      intronic
chr19:7472192(+) A-I      intronic
chr19:7472185(+) A-I      intronic
chr19:7472165(+) A-I      intronic
chr19:7524272(+) A-I      intronic
chr19:7524246(+) A-I      intronic
chr19:7524243(+) A-I      intronic
chr19:7481741(+) A-I      intronic
chr19:7481945(+) A-I      intronic
chr19:7481985(+) A-I      intronic
chr19:7482082(+) A-I      intronic
chr19:7482089(+) A-I      intronic
chr19:7482200(+) A-I      intronic
chr19:7482253(+) A-I      intronic
chr19:7461431(+) A-I      intronic
chr19:7481618(+) A-I      intronic
chr19:7481625(+) A-I      intronic
chr19:7481654(+) A-I      intronic
chr19:7482312(+) A-I      intronic
chr19:7482328(+) A-I      intronic
chr19:7482329(+) A-I      intronic
chr19:7482350(+) A-I      intronic
chr19:7482351(+) A-I      intronic
chr19:7482359(+) A-I      intronic
chr19:7482405(+) A-I      intronic
chr19:7482406(+) A-I      intronic
chr19:7482413(+) A-I      intronic
chr19:7482425(+) A-I      intronic
chr19:7483245(+) A-I      intronic
chr19:7483307(+) A-I      intronic
chr19:7485130(+) A-I      intronic
chr19:7472253(+) A-I      intronic
chr19:7477079(+) A-I      intronic
chr19:7482225(+) A-I      intronic
chr19:7530478(+) A-I      intronic
chr19:7497479(+) A-I      intronic
chr19:7501424(+) A-I      intronic
chr19:7494369(+) A-I      intronic
chr19:7468589(+) A-I      intronic
chr19:7477163(+) A-I      intronic
chr19:7467953(+) A-I      intronic
chr19:7500906(+) A-I      intronic
chr19:7482540(+) A-I      intronic
chr19:7464904(+) A-I      intronic
chr19:7498642(+) A-I      intronic
chr19:7461341(+) A-I      intronic
chr19:7487825(+) A-I      intronic
chr19:7488404(+) A-I      intronic
chr19:7481896(+) A-I      intronic
chr19:7470017(+) A-I      intronic
chr19:7475441(+) A-I      intronic
chr19:7481064(+) A-I      intronic
chr19:7481696(+) A-I      intronic
chr19:7495181(+) A-I      intronic
chr19:7485278(+) A-I      intronic
chr19:7501325(+) A-I      intronic
chr19:7468553(+) A-I      intronic
chr19:7495227(+) A-I      intronic
chr19:7462210(+) A-I      intronic
chr19:7468689(+) A-I      intronic
chr19:7488476(+) A-I      intronic
chr19:7469846(+) A-I      intronic
chr19:7461349(+) A-I      intronic
chr19:7499968(+) A-I      intronic
chr19:7468493(+) A-I      intronic
chr19:7476332(+) A-I      intronic
chr19:7463456(+) A-I      intronic
chr19:7467255(+) A-I      intronic
chr19:7486483(+) A-I      intronic
chr19:7477355(+) A-I      intronic
chr19:7513468(+) A-I      intronic
chr19:7465220(+) A-I      intronic
chr19:7469005(+) A-I      intronic
chr19:7465253(+) A-I      intronic
chr19:7531434(+) A-I      intronic
chr19:7530423(+) A-I      intronic
chr19:7468857(+) A-I      intronic
chr19:7487746(+) A-I      intronic
chr19:7526728(+) A-I      intronic
chr19:7467051(+) A-I      intronic
chr19:7498784(+) A-I      intronic
chr19:7464919(+) A-I      intronic
chr19:7503897(+) A-I      intronic
chr19:7504281(+) A-I      intronic
chr19:7510191(+) A-I      intronic
chr19:7530492(+) A-I      intronic
chr19:7467999(+) A-I      intronic
chr19:7473825(+) A-I      intronic
chr19:7477553(+) A-I      intronic
chr19:7465537(+) A-I      intronic
chr19:7492779(+) A-I      intronic
chr19:7495917(+) A-I      intronic
chr19:7476296(+) A-I      intronic
chr19:7511065(+) A-I      intronic
chr19:7468831(+) A-I      intronic
chr19:7493343(+) A-I      intronic
chr19:7475622(+) A-I      intronic
chr19:7479584(+) A-I      intronic
chr19:7488339(+) A-I      intronic
chr19:7516669(+) A-I      intronic
chr19:7490990(+) A-I      intronic
chr19:7497413(+) A-I      intronic
chr19:7494346(+) A-I      intronic
chr19:7486472(+) A-I      intronic
chr19:7462297(+) A-I      intronic
chr19:7499110(+) A-I      intronic
chr19:7468772(+) A-I      intronic
chr19:7488458(+) A-I      intronic
chr19:7497840(+) A-I      intronic
chr19:7486473(+) A-I      intronic
chr19:7489737(+) A-I      intronic
chr19:7511070(+) A-I      intronic
chr19:7498735(+) A-I      intronic
chr19:7501447(+) A-I      intronic
chr19:7510283(+) A-I      intronic
chr19:7464720(+) A-I      intronic
chr19:7475481(+) A-I      intronic
chr19:7483271(+) A-I      intronic
chr19:7467309(+) A-I      intronic
chr19:7483270(+) A-I      intronic
chr19:7467939(+) A-I      intronic
chr19:7467226(+) A-I      intronic
chr19:7488421(+) A-I      intronic
chr19:7473746(+) A-I      intronic
chr19:7476996(+) A-I      intronic
chr19:7489821(+) A-I      intronic
chr19:7497462(+) A-I      intronic
chr19:7521760(+) A-I      intronic
chr19:7470028(+) A-I      intronic
chr19:7499127(+) A-I      intronic
chr19:7466271(+) A-I      intronic
chr19:7530605(+) A-I      intronic
chr19:7463095(+) A-I      intronic
chr19:7482060(+) A-I      intronic
chr19:7463320(+) A-I      intronic
chr19:7500845(+) A-I      intronic
chr19:7493489(+) A-I      intronic
chr19:7526180(+) A-I      intronic
chr19:7472238(+) A-I      intronic
chr19:7504285(+) A-I      intronic
chr19:7485917(+) A-I      intronic
chr19:7497940(+) A-I      intronic
chr19:7475489(+) A-I      intronic
chr19:7510537(+) A-I      intronic
chr19:7465541(+) A-I      intronic
chr19:7467052(+) A-I      intronic
chr19:7481532(+) A-I      intronic
chr19:7468614(+) A-I      intronic
chr19:7477102(+) A-I      intronic
chr19:7477468(+) A-I      intronic
chr19:7465517(+) A-I      intronic
chr19:7479410(+) A-I      intronic
chr19:7489174(+) A-I      intronic
chr19:7501399(+) A-I      intronic
chr19:7482322(+) A-I      intronic
chr19:7473823(+) A-I      intronic
chr19:7486527(+) A-I      intronic
chr19:7473099(+) A-I      intronic
chr19:7475617(+) A-I      intronic
chr19:7463195(+) A-I      intronic
chr19:7498729(+) A-I      intronic
chr19:7486630(+) A-I      intronic
chr19:7495965(+) A-I      intronic
chr19:7486632(+) A-I      intronic
chr19:7497814(+) A-I      intronic
chr19:7468798(+) A-I      intronic
chr19:7522366(+) A-I      intronic
chr19:7500819(+) A-I      intronic
chr19:7509562(+) A-I      intronic
chr19:7489673(+) A-I      intronic
chr19:7486563(+) A-I      intronic
chr19:7509739(+) A-I      intronic
chr19:7487691(+) A-I      intronic
chr19:7463427(+) A-I      intronic
chr19:7468590(+) A-I      intronic
chr19:7473812(+) A-I      intronic
chr19:7504043(+) A-I      intronic
chr19:7463411(+) A-I      intronic
chr19:7495350(+) A-I      intronic
chr19:7485268(+) A-I      intronic
chr19:7516661(+) A-I      intronic
chr19:7500823(+) A-I      intronic
chr19:7513144(+) A-I      intronic
chr19:7530467(+) A-I      intronic
chr19:7476322(+) A-I      intronic
chr19:7466319(+) A-I      intronic
chr19:7461467(+) A-I      intronic
chr19:7467948(+) A-I      intronic
chr19:7511731(+) A-I      intronic
chr19:7463140(+) A-I      intronic
chr19:7486413(+) A-I      intronic
chr19:7510645(+) A-I      intronic
chr19:7474130(+) A-I      intronic
chr19:7530411(+) A-I      intronic
chr19:7503222(+) A-I      intronic
chr19:7477449(+) A-I      intronic
chr19:7525872(+) A-I      intronic
chr19:7470590(+) A-I      intronic
chr19:7463421(+) A-I      intronic
chr19:7482407(+) A-I      intronic
chr19:7499149(+) A-I      intronic
chr19:7468090(+) A-I      intronic
chr19:7478089(+) A-I      intronic
chr19:7498022(+) A-I      intronic
chr19:7476376(+) A-I      intronic
chr19:7467211(+) A-I      intronic
chr19:7493542(+) A-I      intronic
chr19:7489749(+) A-I      intronic
chr19:7487704(+) A-I      intronic
chr19:7531322(+) A-I      intronic
chr19:7474602(+) A-I      intronic
chr19:7491212(+) A-I      intronic
chr19:7487705(+) A-I      intronic
chr19:7487779(+) A-I      intronic
chr19:7509786(+) A-I      intronic
chr19:7462472(+) A-I      intronic
chr19:7510267(+) A-I      intronic
chr19:7468089(+) A-I      intronic
chr19:7500865(+) A-I      intronic
chr19:7530393(+) A-I      intronic
chr19:7465628(+) A-I      intronic
chr19:7530818(+) A-I      intronic
chr19:7482472(+) A-I      intronic
chr19:7465655(+) A-I      intronic
chr19:7464856(+) A-I      intronic
chr19:7530364(+) A-I      intronic
chr19:7464736(+) A-I      intronic
chr19:7474503(+) A-I      intronic
chr19:7464792(+) A-I      intronic
chr19:7525726(+) A-I      intronic
chr19:7495309(+) A-I      intronic
chr19:7487840(+) A-I      intronic
chr19:7530871(+) A-I      intronic
chr19:7473866(+) A-I      intronic
chr19:7492780(+) A-I      intronic
chr19:7473674(+) A-I      intronic
chr19:7495635(+) A-I      intronic
chr19:7486437(+) A-I      intronic
chr19:7495560(+) A-I      intronic
chr19:7481750(+) A-I      intronic
chr19:7530891(+) A-I      intronic
chr19:7477470(+) A-I      intronic
chr19:7469974(+) A-I      intronic
chr19:7478178(+) A-I      intronic
chr19:7501324(+) A-I      intronic
chr19:7477373(+) A-I      intronic
chr19:7531336(+) A-I      intronic
chr19:7497393(+) A-I      intronic
chr19:7464877(+) A-I      intronic
chr19:7503833(+) A-I      intronic
chr19:7495113(+) A-I      intronic
chr19:7486427(+) A-I      intronic
chr19:7481889(+) A-I      intronic
chr19:7463604(+) A-I      intronic
chr19:7514784(+) A-I      intronic
chr19:7463231(+) A-I      intronic
chr19:7496347(+) A-I      intronic
chr19:7481181(+) A-I      intronic
chr19:7498651(+) A-I      intronic
chr19:7478085(+) A-I      intronic
chr19:7468792(+) A-I      intronic
chr19:7474523(+) A-I      intronic
chr19:7504219(+) A-I      intronic
chr19:7478063(+) A-I      intronic
chr19:7477472(+) A-I      intronic
chr19:7485172(+) A-I      intronic
chr19:7503778(+) A-I      intronic
chr19:7482462(+) A-I      intronic
chr19:7496541(+) A-I      intronic
chr19:7473045(+) A-I      intronic
chr19:7500820(+) A-I      intronic
chr19:7479607(+) A-I      intronic
chr19:7462229(+) A-I      intronic
chr19:7474760(+) A-I      intronic
chr19:7473054(+) A-I      intronic
chr19:7488969(+) A-I      intronic
chr19:7482206(+) A-I      intronic
chr19:7477175(+) A-I      intronic
chr19:7514340(+) A-I      intronic
chr19:7503255(+) A-I      intronic
chr19:7463414(+) A-I      intronic
chr19:7481751(+) A-I      intronic
chr19:7500797(+) A-I      intronic
chr19:7487844(+) A-I      intronic
chr19:7482419(+) A-I      intronic
chr19:7468804(+) A-I      intronic
chr19:7472989(+) A-I      intronic
chr19:7463237(+) A-I      intronic
chr19:7497415(+) A-I      intronic
chr19:7530319(+) A-I      intronic
chr19:7497461(+) A-I      intronic
chr19:7497926(+) A-I      intronic
chr19:7493323(+) A-I      intronic
chr19:7481688(+) A-I      intronic
chr19:7472257(+) A-I      intronic
chr19:7481055(+) A-I      intronic
chr19:7511084(+) A-I      intronic
chr19:7481029(+) A-I      intronic
chr19:7486422(+) A-I      intronic
chr19:7530459(+) A-I      intronic
chr19:7487744(+) A-I      intronic
chr19:7530428(+) A-I      intronic
chr19:7473657(+) A-I      intronic
chr19:7482463(+) A-I      intronic
chr19:7463036(+) A-I      intronic
chr19:7475628(+) A-I      intronic
chr19:7475471(+) A-I      intronic
chr19:7472033(+) A-I      intronic
chr19:7463073(+) A-I      intronic
chr19:7489812(+) A-I      intronic
chr19:7462540(+) A-I      intronic
chr19:7469014(+) A-I      intronic
chr19:7503763(+) A-I      intronic
chr19:7531148(+) A-I      intronic
chr19:7482518(+) A-I      intronic
chr19:7486573(+) A-I      intronic
chr19:7464752(+) A-I      intronic
chr19:7504233(+) A-I      intronic
chr19:7468736(+) A-I      intronic
chr19:7473694(+) A-I      intronic
chr19:7493508(+) A-I      intronic
chr19:7465640(+) A-I      intronic
chr19:7511688(+) A-I      intronic
chr19:7486569(+) A-I      intronic
chr19:7526774(+) A-I      intronic
chr19:7503839(+) A-I      intronic
chr19:7493545(+) A-I      intronic
chr19:7463166(+) A-I      intronic
chr19:7483346(+) A-I      intronic
chr19:7463326(+) A-I      intronic
chr19:7530843(+) A-I      intronic
chr19:7495588(+) A-I      intronic
chr19:7463593(+) A-I      intronic
chr19:7530495(+) A-I      intronic
chr19:7489627(+) A-I      intronic
chr19:7465272(+) A-I      intronic
chr19:7471804(+) A-I      intronic
chr19:7463327(+) A-I      intronic
chr19:7504319(+) A-I      intronic
chr19:7501438(+) A-I      intronic
chr19:7462208(+) A-I      intronic
chr19:7512296(+) A-I      intronic
chr19:7473070(+) A-I      intronic
chr19:7522501(+) A-I      intronic
chr19:7493348(+) A-I      intronic
chr19:7471686(+) A-I      intronic
chr19:7486528(+) A-I      intronic
chr19:7500824(+) A-I      intronic
chr19:7481026(+) A-I      intronic
chr19:7486628(+) A-I      intronic
chr19:7474375(+) A-I      intronic
chr19:7466313(+) A-I      intronic
chr19:7469943(+) A-I      intronic
chr19:7468840(+) A-I      intronic
chr19:7498302(+) A-I      intronic
chr19:7510213(+) A-I      intronic
chr19:7516741(+) A-I      intronic
chr19:7486038(+) A-I      intronic
chr19:7526803(+) A-I      intronic
chr19:7467931(+) A-I      intronic
chr19:7472979(+) A-I      intronic
chr19:7481220(+) A-I      intronic
chr19:7468000(+) A-I      intronic
chr19:7487698(+) A-I      intronic
chr19:7468119(+) A-I      intronic
chr19:7482441(+) A-I      intronic
chr19:7465463(+) A-I      intronic
chr19:7526613(+) A-I      intronic
chr19:7482498(+) A-I      intronic
chr19:7465624(+) A-I      intronic
chr19:7468933(+) A-I      intronic
chr19:7467184(+) A-I      intronic
chr19:7485023(+) A-I      intronic
chr19:7474443(+) A-I      intronic
chr19:7470050(+) A-I      intronic
chr19:7482408(+) A-I      intronic
chr19:7468510(+) A-I      intronic
chr19:7514662(+) A-I      intronic
chr19:7489704(+) A-I      intronic
chr19:7530863(+) A-I      intronic
chr19:7496580(+) A-I      intronic
chr19:7486451(+) A-I      intronic
chr19:7471110(+) A-I      intronic
chr19:7483274(+) A-I      intronic
chr19:7510150(+) A-I      intronic
chr19:7530820(+) A-I      intronic
chr19:7475486(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ARHGEF18
chr19:7468000(+) A-I intron -    22327324
chr19:7465130(+) A-I intron -    21960545
chr19:7467866(+) A-I intron -    21960545
chr19:7500859(+) A-I intron -    21960545
chr19:7465130(+) A-G intron -    22484847
chr19:7468225(+) A-G intron -    22484847
chr19:7464736(+) A-G intron -    22484847
chr19:7466272(+) A-G intron -    22484847
chr19:7466319(+) A-G intron -    22484847
chr19:7467051(+) A-G intron -    22484847
chr19:7467284(+) A-G intron -    22484847
chr19:7467999(+) A-G intron -    22484847
chr19:7468000(+) A-G intron -    22484847
chr19:7468527(+) A-G intron -    22484847
chr19:7468804(+) A-G intron -    22484847
chr19:7468840(+) A-G intron -    22484847
chr19:7472689(+) A-G intron -    22484847
chr19:7473823(+) A-G intron -    22484847
chr19:7473825(+) A-G intron -    22484847
chr19:7477449(+) A-G intron -    22484847
chr19:7477553(+) A-G intron -    22484847
chr19:7481026(+) A-G intron -    22484847
chr19:7481696(+) A-G intron -    22484847
chr19:7482463(+) A-G intron -    22484847
chr19:7485242(+) A-G intron -    22484847
chr19:7485256(+) A-G intron -    22484847
chr19:7485278(+) A-G intron -    22484847
chr19:7485311(+) A-G intron -    22484847
chr19:7486483(+) A-G intron -    22484847
chr19:7486630(+) A-G intron -    22484847
chr19:7487788(+) A-G intron -    22484847
chr19:7487840(+) A-G intron -    22484847
chr19:7487844(+) A-G intron -    22484847
chr19:7488421(+) A-G intron -    22484847
chr19:7488424(+) A-G intron -    22484847
chr19:7491305(+) A-G intron -    22484847
chr19:7495188(+) A-G intron -    22484847
chr19:7495434(+) A-G intron -    22484847
chr19:7495560(+) A-G intron -    22484847
chr19:7495588(+) A-G intron -    22484847
chr19:7497788(+) A-G intron -    22484847
chr19:7497808(+) A-G intron -    22484847
chr19:7498022(+) A-G intron -    22484847
chr19:7498642(+) A-G intron -    22484847
chr19:7499149(+) A-G intron -    22484847
chr19:7500819(+) A-G intron -    22484847
chr19:7500820(+) A-G intron -    22484847
chr19:7503778(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ARHGEF18
chr19:7504575-7504576(+) m6A 5'UTR//intron       24209618//25456834//24981863
chr19:7523533-7523534(+) m6A CDS       -
chr19:7524863-7524864(+) m6A CDS       24284625
chr19:7524871-7524872(+) m6A CDS       24284625
chr19:7527055-7527056(+) m6A CDS       24284625
chr19:7527086-7527087(+) m6A CDS       24284625
chr19:7527130-7527131(+) m6A CDS       24284625
chr19:7527166-7527167(+) m6A CDS       24284625
chr19:7527177-7527178(+) m6A CDS       24284625
chr19:7527216-7527217(+) Gm CDS       -
chr19:7528801-7528802(+) m6A CDS       24284625
chr19:7528826-7528827(+) m6A CDS       24284625
chr19:7529493-7529494(+) m6A CDS       24284625
chr19:7529511-7529512(+) m6A CDS       24284625
chr19:7529520-7529521(+) m6A CDS       24284625
chr19:7531974-7531975(+) m6A CDS       24284625
chr19:7532193-7532194(+) m6A CDS       24209618
chr19:7532529-7532530(+) m6A CDS       24209618
chr19:7533831-7533832(+) m6A CDS       -
chr19:7533849-7533850(+) m6A CDS       -
chr19:7533972-7533973(+) m6A CDS       24284625
chr19:7534858-7534859(+) m6A CDS       24284625
chr19:7534892-7534893(+) m6A CDS       24284625
chr19:7535247-7535248(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863
chr19:7535451-7535452(+) m6A 3'UTR       24284625
chr19:7535456-7535457(+) m6A 3'UTR       24284625
chr19:7535567-7535568(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863
chr19:7535572-7535573(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863
chr19:7535719-7535720(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618
chr19:7535746-7535747(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618
chr19:7535820-7535821(+) m6A 3'UTR       24209618
chr19:7535930-7535931(+) m6A 3'UTR       24284625
chr19:7536104-7536105(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr19:7536168-7536169(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr19:7536278-7536279(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr19:7536373-7536374(+) m6A 3'UTR       27773536
chr19:7536449-7536450(+) m6A 3'UTR       24209618
chr19:7536465-7536466(+) m6A 3'UTR       24209618//25456834//24981863
chr19:7536541-7536542(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr19:7536547-7536548(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr19:7536566-7536567(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr19:7536590-7536591(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr19:7536681-7536682(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//22608085
chr19:7536728-7536729(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834
chr19:7536933-7536934(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863
chr19:7536943-7536944(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863
chr19:7537052-7537053(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ebv-miR-BHRF1-1
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
ARHGEF18
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: ebv-miR-BHRF1-1
Interactor2: ARHGEF18

Evidence Support:


Strong-Evidence Luciferase reporter assay
Weak-Evidence PAR-CLIP
Prediction-Evidence miRanda//PARalyzer//Targetscan
Support Database ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg

References:


PMID 22291592 Target region 3'UTR
Source ViRBase//VIRmiRNA//VmiReg Interactor1 expression None
Tissue or cell line EF3D-AGO2 cells//LCL35 cells//LCL-BAC cells//LCL-BAC-D1 cells//LCL-BAC-D3 cells Interactor2 expression Downregulation
Description We identified 7,827 miRNA-interaction sites in 3,492 cellular 3'UTRs. 531 of these sites contained seed matches to viral miRNAs.Table S6: High confidence miRNA-interaction sites in 3'UTRs.We identified an additional 2,972 CDS miRNA-interaction sites present in at least two libraries, 89.7% of which could be assigned to a miRNA (Table S7).

Starting a new search, please wait ...