Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | EBER1 | SSB |
miRBase Accession/Entrez ID |
EBER1 | 6741 |
Organism | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) | Homo sapiens |
Category | lncRNA | protein |
Alias | - | La//La/SSB//LARP3 |
Resource | Symbol | Editing Position | Change | Genetic Region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RADAR | SSB |
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Resource | Symbol | Editing Position | Change | SeqReg | exReg | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DARNED | SSB |
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Resource | Symbol | ModificationPosition | Type | Genomic Context | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RMBase | SSB |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID |
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RNALocate | EBER1 | |||
SSB |
Interactor1: EBER1 | Interactor2: SSB |
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Strong-Evidence | IP | |
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Support Database | ViRBase |
[1]PMID | 6262773 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | B95-8 cells//BJAB cells//BJAB-B1 cells//Cory cells//HR1K cells//MCUV cells//Raji cells | Interactor2 expression | None |
Description | Hybridization analyses indicate that EBER l and EBER 2 are encoded by the EcoRI-J fragment ofEBV (B95-8) DNA. In vivo both RNAs are associated with protein(s), allowing their specific precipitation by the systemic lupus erythematosus-associated antibody anti-La. The La antigen in uninfected mammalian cells consists of a heterogeneous class of small ribonucleoprotein particles, some of whose RNA components exhibit sequence homology with a highly repetitive, interspersed class ofhuman DNA designated the Alu family |
[2]PMID | 20719877 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | B95-8 cells//BJAB cells//BJAB-B1 cells//Cory cells//HR1K cells cells//MCUV cells//Raji cells | Interactor2 expression | None |
Description | Besides PKR, several other proteins are known to interact and form RNP complexes with the EBERs. The La protein, which assists in the correct folding of RNA Pol III transcripts (Wolin and Cedervall 2002), stably binds the 3'-U tails of both EBERs (Lerner et al. 1981a). |