Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00274339

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL69:  MIMAT0029123          TNKS:  NM_003747     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-UL69	TNKS
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0029123	8658
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ARTD5//PARP-5a//PARP5A//PARPL//pART5//TIN1//TINF1//TNKS1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TNKS	chr8:9588745(+) A-I      intronic chr8:9588891(+) A-I      intronic chr8:9625348(+) A-I      intronic chr8:9588960(+) A-I      intronic chr8:9560412(+) A-I      intronic chr8:9625322(+) A-I      intronic chr8:9625319(+) A-I      intronic chr8:9625312(+) A-I      intronic chr8:9560446(+) A-I      intronic chr8:9583669(+) A-I      intronic chr8:9587316(+) A-I      intronic chr8:9587332(+) A-I      intronic chr8:9587333(+) A-I      intronic chr8:9531019(+) A-I      intronic chr8:9531029(+) A-I      intronic chr8:9423144(+) A-I      intronic chr8:9423145(+) A-I      intronic chr8:9423178(+) A-I      intronic chr8:9428999(+) A-I      intronic chr8:9440566(+) A-I      intronic chr8:9440570(+) A-I      intronic chr8:9441128(+) A-I      intronic chr8:9451631(+) A-I      intronic chr8:9453507(+) A-I      intronic chr8:9453517(+) A-I      intronic chr8:9455695(+) A-I      intronic chr8:9531035(+) A-I      intronic chr8:9531048(+) A-I      intronic chr8:9531058(+) A-I      intronic chr8:9484626(+) A-I      intronic chr8:9546385(+) A-I      intronic chr8:9624061(+) A-I      intronic chr8:9624036(+) A-I      intronic chr8:9465672(+) A-I      intronic chr8:9465679(+) A-I      intronic chr8:9531024(+) A-I      intronic chr8:9490304(+) A-I      intronic chr8:9490320(+) A-I      intronic chr8:9490369(+) A-I      intronic chr8:9490379(+) A-I      intronic chr8:9492490(+) A-I      intronic chr8:9492520(+) A-I      intronic chr8:9507622(+) A-I      intronic chr8:9507649(+) A-I      intronic chr8:9507664(+) A-I      intronic chr8:9546284(+) A-I      intronic chr8:9589479(+) A-I      intronic chr8:9589473(+) A-I      intronic chr8:9589437(+) A-I      intronic chr8:9588966(+) A-I      intronic chr8:9546412(+) A-I      intronic chr8:9546413(+) A-I      intronic chr8:9558609(+) A-I      intronic chr8:9558709(+) A-I      intronic chr8:9560387(+) A-I      intronic chr8:9588890(+) A-I      intronic chr8:9624157(+) A-I      intronic chr8:9624160(+) A-I      intronic chr8:9624257(+) A-I      intronic chr8:9625281(+) A-I      intronic chr8:9625282(+) A-I      intronic chr8:9625284(+) A-I      intronic chr8:9625292(+) A-I      intronic chr8:9634377(+) A-I      3'UTR chr8:9481492(+) A-I      intronic chr8:9441039(+) A-I      intronic chr8:9624206(+) A-I      intronic chr8:9593144(+) A-I      intronic chr8:9548142(+) A-I      intronic chr8:9610355(+) A-I      intronic chr8:9588811(+) A-I      intronic chr8:9552151(+) A-I      intronic chr8:9558583(+) A-I      intronic chr8:9588760(+) A-I      intronic chr8:9481336(+) A-I      intronic chr8:9625354(+) A-I      intronic chr8:9589504(+) A-I      intronic chr8:9600090(+) A-I      intronic chr8:9589321(+) A-I      intronic chr8:9451640(+) A-I      intronic chr8:9456055(+) A-I      intronic chr8:9492630(+) A-I      intronic chr8:9441099(+) A-I      intronic chr8:9546416(+) A-I      intronic chr8:9456095(+) A-I      intronic chr8:9441594(+) A-I      intronic chr8:9492559(+) A-I      intronic chr8:9548015(+) A-I      intronic chr8:9560405(+) A-I      intronic chr8:9441160(+) A-I      intronic chr8:9492433(+) A-I      intronic chr8:9481326(+) A-I      intronic chr8:9558601(+) A-I      intronic chr8:9440452(+) A-I      intronic chr8:9453464(+) A-I      intronic chr8:9587416(+) A-I      intronic chr8:9423173(+) A-I      intronic chr8:9441619(+) A-I      intronic chr8:9624196(+) A-I      intronic chr8:9429166(+) A-I      intronic chr8:9492600(+) A-I      intronic chr8:9440632(+) A-I      intronic chr8:9593772(+) A-I      intronic chr8:9610458(+) A-I      intronic chr8:9624058(+) A-I      intronic chr8:9625208(+) A-I      intronic chr8:9610282(+) A-I      intronic chr8:9558654(+) A-I      intronic chr8:9624125(+) A-I      intronic chr8:9440491(+) A-I      intronic chr8:9492533(+) A-I      intronic chr8:9441249(+) A-I      intronic chr8:9625214(+) A-I      intronic chr8:9440583(+) A-I      intronic chr8:9546279(+) A-I      intronic chr8:9602978(+) A-I      intronic chr8:9490309(+) A-I      intronic chr8:9588714(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TNKS	chr8:9639522(+) A-G intron -    22484847 chr8:9423173(+) A-G intron -    22484847 chr8:9440491(+) A-G intron -    22484847 chr8:9440583(+) A-G intron -    22484847 chr8:9441039(+) A-G intron -    22484847 chr8:9452651(+) A-G intron -    22484847 chr8:9479004(+) T-C intron -    22484847 chr8:9481326(+) A-G intron -    22484847 chr8:9481336(+) A-G intron -    22484847 chr8:9481392(+) A-G intron -    22484847 chr8:9490271(+) A-G intron -    22484847 chr8:9490309(+) A-G intron -    22484847 chr8:9546279(+) A-G intron -    22484847 chr8:9546416(+) A-G intron -    22484847 chr8:9548015(+) A-G intron -    22484847 chr8:9558583(+) A-G intron -    22484847 chr8:9558601(+) A-G intron -    22484847 chr8:9558654(+) A-G intron -    22484847 chr8:9560406(+) A-G intron -    22484847 chr8:9589321(+) A-G intron -    22484847 chr8:9589323(+) A-G intron -    22484847 chr8:9589504(+) A-G intron -    22484847 chr8:9593069(+) A-G intron -    22484847 chr8:9593144(+) A-G intron -    22484847 chr8:9598330(+) C-T intron -    22484847 chr8:9600089(+) T-C intron -    22484847 chr8:9600090(+) A-G intron -    22484847 chr8:9603103(+) T-C intron -    22484847 chr8:9606981(+) C-T intron -    22484847 chr8:9607150(+) A-T intron -    22484847 chr8:9614517(+) A-T intron -    22484847 chr8:9624058(+) A-G intron -    22484847 chr8:9624125(+) A-G intron -    22484847 chr8:9624196(+) A-G intron -    22484847 chr8:9624206(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TNKS	chr8:9413575-9413576(+) m6A CDS       24284625 chr8:9413693-9413694(+) m6A CDS       24284625 chr8:9413961-9413962(+) m6A CDS       24284625//27371828 chr8:9413968-9413969(+) m6A CDS       24284625 chr8:9414003-9414004(+) m6A CDS       24284625//24981863 chr8:9414080-9414081(+) m6A CDS       24284625//24981863 chr8:9414129-9414130(+) m6A CDS//intron       - chr8:9605672-9605673(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr8:9605687-9605688(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr8:9627717-9627718(+) m6A CDS       - chr8:9627768-9627769(+) m6A CDS       - chr8:9634216-9634217(+) m6A 3'UTR//CDS       24209618//24981863//22575960//22608085 chr8:9634240-9634241(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr8:9634288-9634289(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chr8:9634965-9634966(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085 chr8:9635063-9635064(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085 chr8:9635113-9635114(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr8:9637075-9637076(+) m6A 3'UTR       24981863 chr8:9639364-9639365(+) Y 3'UTR       26075521

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	TNKS	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-UL69
Interactor2: TNKS

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	VmiReg