Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00264792

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US22-3p:           GK5:      

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Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-US22-3p GK5
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0028166 256356
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR GK5
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RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
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RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate GK5
Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Exosome Blood     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Nucleus Colon cancer cells     24393600
Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-US22-3p
Interactor2: GK5

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA//Targetscan
Support Database VmiReg

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