Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00259573

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US4-3p:           DAGLB:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-US4-3p DAGLB
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0026628 221955
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - DAGLBETA//KCCR13L

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR DAGLB
chr7:6463192(-) A-I      intronic
chr7:6463166(-) A-I      intronic
chr7:6463163(-) A-I      intronic
chr7:6462759(-) A-I      intronic
chr7:6462734(-) A-I      intronic
chr7:6462648(-) A-I      intronic
chr7:6460659(-) A-I      intronic
chr7:6457639(-) A-I      intronic
chr7:6457626(-) A-I      intronic
chr7:6457598(-) A-I      intronic
chr7:6457594(-) A-I      intronic
chr7:6453862(-) A-I      intronic
chr7:6453846(-) A-I      intronic
chr7:6453825(-) A-I      intronic
chr7:6453811(-) A-I      intronic
chr7:6453806(-) A-I      intronic
chr7:6453780(-) A-I      intronic
chr7:6453753(-) A-I      intronic
chr7:6472107(-) A-I      intronic
chr7:6450872(-) A-I      intronic
chr7:6450841(-) A-I      intronic
chr7:6485361(-) A-I      ncRNA
chr7:6485366(-) A-I      ncRNA
chr7:6450648(-) A-I      intronic
chr7:6468416(-) A-I      intronic
chr7:6472124(-) A-I      intronic
chr7:6454036(-) A-I      intronic
chr7:6485930(-) A-I      intronic
chr7:6482501(-) A-I      intronic
chr7:6482439(-) A-I      intronic
chr7:6481125(-) A-I      intronic
chr7:6481089(-) A-I      intronic
chr7:6480351(-) A-I      intronic
chr7:6480327(-) A-I      intronic
chr7:6480284(-) A-I      intronic
chr7:6480269(-) A-I      intronic
chr7:6476754(-) A-I      intronic
chr7:6476702(-) A-I      intronic
chr7:6476615(-) A-I      intronic
chr7:6476519(-) A-I      intronic
chr7:6472179(-) A-I      intronic
chr7:6471259(-) A-I      intronic
chr7:6471246(-) A-I      intronic
chr7:6470464(-) A-I      intronic
chr7:6469575(-) A-I      intronic
chr7:6469527(-) A-I      intronic
chr7:6469383(-) A-I      intronic
chr7:6462761(-) A-I      intronic
chr7:6469382(-) A-I      intronic
chr7:6469366(-) A-I      intronic
chr7:6469349(-) A-I      intronic
chr7:6469227(-) A-I      intronic
chr7:6469190(-) A-I      intronic
chr7:6469175(-) A-I      intronic
chr7:6468716(-) A-I      intronic
chr7:6468714(-) A-I      intronic
chr7:6468680(-) A-I      intronic
chr7:6468631(-) A-I      intronic
chr7:6468623(-) A-I      intronic
chr7:6468568(-) A-I      intronic
chr7:6468407(-) A-I      intronic
chr7:6468399(-) A-I      intronic
chr7:6468391(-) A-I      intronic
chr7:6468390(-) A-I      intronic
chr7:6468337(-) A-I      intronic
chr7:6468334(-) A-I      intronic
chr7:6468296(-) A-I      intronic
chr7:6467865(-) A-I      intronic
chr7:6467837(-) A-I      intronic
chr7:6468215(-) A-I      intronic
chr7:6467819(-) A-I      intronic
chr7:6467818(-) A-I      intronic
chr7:6454065(-) A-I      intronic
chr7:6454059(-) A-I      intronic
chr7:6468119(-) A-I      intronic
chr7:6454055(-) A-I      intronic
chr7:6467877(-) A-I      intronic
chr7:6451226(-) A-I      intronic
chr7:6467161(-) A-I      intronic
chr7:6466559(-) A-I      intronic
chr7:6466547(-) A-I      intronic
chr7:6466152(-) A-I      intronic
chr7:6451214(-) A-I      intronic
chr7:6451146(-) A-I      intronic
chr7:6451049(-) A-I      intronic
chr7:6451009(-) A-I      intronic
chr7:6450996(-) A-I      intronic
chr7:6463321(-) A-I      intronic
chr7:6463315(-) A-I      intronic
chr7:6463193(-) A-I      intronic
chr7:6469760(-) A-I      intronic
chr7:6479833(-) A-I      intronic
chr7:6457767(-) A-I      intronic
chr7:6454117(-) A-I      intronic
chr7:6455225(-) A-I      intronic
chr7:6471816(-) A-I      intronic
chr7:6463152(-) A-I      intronic
chr7:6463383(-) A-I      intronic
chr7:6466025(-) A-I      intronic
chr7:6468282(-) A-I      intronic
chr7:6468707(-) A-I      intronic
chr7:6467384(-) A-I      intronic
chr7:6459702(-) A-I      intronic
chr7:6469612(-) A-I      intronic
chr7:6481187(-) A-I      intronic
chr7:6471761(-) A-I      intronic
chr7:6468574(-) A-I      intronic
chr7:6477117(-) A-I      intronic
chr7:6481321(-) A-I      intronic
chr7:6468466(-) A-I      intronic
chr7:6468672(-) A-I      intronic
chr7:6471240(-) A-I      intronic
chr7:6454549(-) A-I      intronic
chr7:6467810(-) A-I      intronic
chr7:6466176(-) A-I      intronic
chr7:6481154(-) A-I      intronic
chr7:6459656(-) A-I      intronic
chr7:6471185(-) A-I      intronic
chr7:6467734(-) A-I      intronic
chr7:6451182(-) A-I      intronic
chr7:6454011(-) A-I      intronic
chr7:6450912(-) A-I      intronic
chr7:6453094(-) A-I      intronic
chr7:6470545(-) A-I      intronic
chr7:6451008(-) A-I      intronic
chr7:6451105(-) A-I      intronic
chr7:6466656(-) A-I      intronic
chr7:6468148(-) A-I      intronic
chr7:6451163(-) A-I      intronic
chr7:6486519(-) A-I      intronic
chr7:6450408(-) A-I      intronic
chr7:6479763(-) A-I      intronic
chr7:6450442(-) A-I      intronic
chr7:6468118(-) A-I      intronic
chr7:6481320(-) A-I      intronic
chr7:6478601(-) A-I      intronic
chr7:6459683(-) A-I      intronic
chr7:6466151(-) A-I      intronic
chr7:6468300(-) A-I      intronic
chr7:6454652(-) A-I      intronic
chr7:6467042(-) A-I      intronic
chr7:6468512(-) A-I      intronic
chr7:6456012(-) A-I      3'UTR
chr7:6456052(-) A-I      3'UTR
chr7:6456074(-) A-I      3'UTR
chr7:6468630(-) A-I      intronic
chr7:6463469(-) A-I      intronic
chr7:6467332(-) A-I      intronic
chr7:6457779(-) A-I      intronic
chr7:6454746(-) A-I      intronic
chr7:6468160(-) A-I      intronic
chr7:6468214(-) A-I      intronic
chr7:6467331(-) A-I      intronic
chr7:6464945(-) A-I      intronic
chr7:6476665(-) A-I      intronic
chr7:6462801(-) A-I      intronic
chr7:6472169(-) A-I      intronic
chr7:6480265(-) A-I      intronic
chr7:6477165(-) A-I      intronic
chr7:6467386(-) A-I      intronic
chr7:6477098(-) A-I      intronic
chr7:6458777(-) A-I      intronic
chr7:6469188(-) A-I      intronic
chr7:6458781(-) A-I      intronic
chr7:6469158(-) A-I      intronic
chr7:6467055(-) A-I      intronic
chr7:6450621(-) A-I      intronic
chr7:6454778(-) A-I      intronic
chr7:6468708(-) A-I      intronic
chr7:6470423(-) A-I      intronic
chr7:6454164(-) A-I      intronic
chr7:6468465(-) A-I      intronic
chr7:6469753(-) A-I      intronic
chr7:6451131(-) A-I      intronic
chr7:6464981(-) A-I      intronic
chr7:6483038(-) A-I      intronic
chr7:6467194(-) A-I      intronic
chr7:6470571(-) A-I      intronic
chr7:6469714(-) A-I      intronic
chr7:6467284(-) A-I      intronic
chr7:6481268(-) A-I      intronic
chr7:6468223(-) A-I      intronic
chr7:6458841(-) A-I      intronic
chr7:6451061(-) A-I      intronic
chr7:6462837(-) A-I      intronic
chr7:6466483(-) A-I      intronic
chr7:6467345(-) A-I      intronic
chr7:6471896(-) A-I      intronic
chr7:6468180(-) A-I      intronic
chr7:6468256(-) A-I      intronic
chr7:6463490(-) A-I      intronic
chr7:6471760(-) A-I      intronic
chr7:6462711(-) A-I      intronic
chr7:6466573(-) A-I      intronic
chr7:6462800(-) A-I      intronic
chr7:6480448(-) A-I      intronic
chr7:6480378(-) A-I      intronic
chr7:6466174(-) A-I      intronic
chr7:6468355(-) A-I      intronic
chr7:6469486(-) A-I      intronic
chr7:6468297(-) A-I      intronic
chr7:6462855(-) A-I      intronic
chr7:6467721(-) A-I      intronic
chr7:6480417(-) A-I      intronic
chr7:6468255(-) A-I      intronic
chr7:6486720(-) A-I      intronic
chr7:6469736(-) A-I      intronic
chr7:6468211(-) A-I      intronic
chr7:6465041(-) A-I      intronic
chr7:6468194(-) A-I      intronic
chr7:6463151(-) A-I      intronic
chr7:6454582(-) A-I      intronic
chr7:6467829(-) A-I      intronic
chr7:6458916(-) A-I      intronic
chr7:6466038(-) A-I      intronic
chr7:6467894(-) A-I      intronic
chr7:6451657(-) A-I      intronic
chr7:6451181(-) A-I      intronic
chr7:6460677(-) A-I      intronic
chr7:6463133(-) A-I      intronic
chr7:6468321(-) A-I      intronic
chr7:6468293(-) A-I      intronic
chr7:6467391(-) A-I      intronic
chr7:6483647(-) A-I      intronic
chr7:6482936(-) A-I      intronic
chr7:6467292(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED DAGLB
chr7:6450447(-) A-G intron -    22484847
chr7:6450991(-) T-C intron -    22484847
chr7:6451230(-) A-G intron -    22484847
chr7:6451605(-) T-C intron -    22484847
chr7:6453140(-) T-C intron -    22484847
chr7:6454085(-) T-C intron -    22484847
chr7:6454089(-) T-C intron -    22484847
chr7:6457767(-) A-G intron -    22484847
chr7:6457872(-) A-G intron -    22484847
chr7:6457890(-) A-G intron -    22484847
chr7:6462801(-) A-G intron -    22484847
chr7:6463151(-) A-G intron -    22484847
chr7:6463152(-) A-G intron -    22484847
chr7:6463383(-) A-G intron -    22484847
chr7:6463446(-) A-G intron -    22484847
chr7:6466174(-) A-G intron -    22484847
chr7:6466176(-) A-G intron -    22484847
chr7:6467042(-) A-G intron -    22484847
chr7:6467391(-) A-G intron -    22484847
chr7:6468160(-) A-G intron -    22484847
chr7:6468194(-) A-G intron -    22484847
chr7:6468214(-) A-G intron -    22484847
chr7:6468255(-) A-G intron -    22484847
chr7:6468256(-) A-G intron -    22484847
chr7:6468574(-) A-G intron -    22484847
chr7:6469486(-) A-G intron -    22484847
chr7:6470671(-) A-G intron -    22484847
chr7:6471240(-) A-G intron -    22484847
chr7:6472099(-) A-G intron -    22484847
chr7:6472169(-) A-G intron -    22484847
chr7:6480448(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase DAGLB
chr7:6448781-6448782(-) m6A 3'UTR//exon       27773535
chr7:6448940-6448941(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr7:6449022-6449023(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6449049-6449050(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6449124-6449125(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr7:6449131-6449132(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr7:6449171-6449172(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr7:6449221-6449222(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr7:6449238-6449239(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr7:6449341-6449342(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6449375-6449376(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6449412-6449413(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6449432-6449433(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr7:6449451-6449452(-) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr7:6449540-6449541(-) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr7:6449561-6449562(-) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//27773536//22575960//22608085
chr7:6449835-6449836(-) m6A CDS//exon       24284625//22575960
chr7:6449964-6449965(-) m6A CDS//exon       27773535
chr7:6449978-6449979(-) m6A CDS//exon       27773535
chr7:6452287-6452288(-) m6A exon//intron       27773535
chr7:6472516-6472517(-) m6A CDS//intron       27773535
chr7:6472528-6472529(-) m6A CDS//intron       27773535
chr7:6500801-6500802(-) m6A intron       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6500830-6500831(-) m6A intron       24284625//25456834//24981863//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6500865-6500866(-) m6A intron       24284625//25456834//24981863//26404942//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6501872-6501873(-) m6A intron       26404942
chr7:6501946-6501947(-) m6A intron       26404942
chr7:6502549-6502550(-) Y intron       25219674
chr7:6502674-6502675(-) m6A intron       24284625//24981863//26404942//27371828//22575960//22608085
chr7:6502727-6502728(-) m6A intron       24284625//24981863//26404942//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6502761-6502762(-) m6A intron       24284625//24981863//26404942//27773535//27371828//22575960//22608085
chr7:6505743-6505744(-) m6A intron       24284625//27773535
chr7:6505869-6505870(-) m6A intron       27773535
chr7:6505884-6505885(-) m6A intron       27773535
chr7:6505944-6505945(-) m6A intron       27773535
chr7:6509550-6509551(-) m6A intron       27773535
chr7:6509555-6509556(-) m6A intron       27773535
chr7:6509596-6509597(-) m6A intron       27773535
chr7:6509687-6509688(-) m6A intron       27773535
chr7:6509694-6509695(-) m6A intron       27773535
chr7:6509701-6509702(-) m6A intron       27773535
chr7:6523624-6523625(-) Am 5'UTR       -
chr7:6523662-6523663(-) m6A 5'UTR       24209618//25456834//22575960
chr7:6523683-6523684(-) m6A 5'UTR       24209618//25456834//24981863//27773536//22575960

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hcmv-miR-US4-3p
Exosome B cell line (Raji)|Primary dendritic cells|T cell line (J77)     21505438
DAGLB
Chromatin K562 cells     -
Cytosol K562 cells     -
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-US4-3p
Interactor2: DAGLB

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//RNAHybrid//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...