Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00258442

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US4-3p:           UBE3C:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-US4-3p UBE3C
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0026628 9690
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - HECTH2

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR UBE3C
chr7:157050716(+) A-I      intronic
chr7:157039711(+) A-I      intronic
chr7:157039689(+) A-I      intronic
chr7:157030014(+) A-I      intronic
chr7:157030020(+) A-I      intronic
chr7:157030028(+) A-I      intronic
chr7:157030041(+) A-I      intronic
chr7:157030047(+) A-I      intronic
chr7:157039671(+) A-I      intronic
chr7:157053920(+) A-I      intronic
chr7:157039659(+) A-I      intronic
chr7:157036917(+) A-I      intronic
chr7:157036826(+) A-I      intronic
chr7:157036766(+) A-I      intronic
chr7:157035601(+) A-I      intronic
chr7:157035598(+) A-I      intronic
chr7:157035590(+) A-I      intronic
chr7:157035573(+) A-I      intronic
chr7:157035517(+) A-I      intronic
chr7:157053850(+) A-I      intronic
chr7:157053763(+) A-I      intronic
chr7:157051416(+) A-I      intronic
chr7:157056243(+) A-I      intronic
chr7:157057300(+) A-I      intronic
chr7:157057312(+) A-I      intronic
chr7:157057380(+) A-I      intronic
chr7:157058753(+) A-I      intronic
chr7:157058762(+) A-I      intronic
chr7:157058887(+) A-I      intronic
chr7:157059586(+) A-I      intronic
chr7:157059930(+) A-I      intronic
chr7:157059973(+) A-I      intronic
chr7:157051388(+) A-I      intronic
chr7:157051354(+) A-I      intronic
chr7:157051337(+) A-I      intronic
chr7:157035487(+) A-I      intronic
chr7:157030080(+) A-I      intronic
chr7:157030105(+) A-I      intronic
chr7:157030468(+) A-I      intronic
chr7:157016453(+) A-I      intronic
chr7:157016458(+) A-I      intronic
chr7:157016968(+) A-I      intronic
chr7:157027671(+) A-I      intronic
chr7:157016989(+) A-I      intronic
chr7:157022070(+) A-I      intronic
chr7:157030678(+) A-I      intronic
chr7:157030666(+) A-I      intronic
chr7:157030559(+) A-I      intronic
chr7:157030538(+) A-I      intronic
chr7:157030484(+) A-I      intronic
chr7:157044733(+) A-I      intronic
chr7:157051253(+) A-I      intronic
chr7:157051257(+) A-I      intronic
chr7:157051295(+) A-I      intronic
chr7:157055304(+) A-I      intronic
chr7:157055324(+) A-I      intronic
chr7:157030471(+) A-I      intronic
chr7:157051016(+) A-I      intronic
chr7:157056196(+) A-I      intronic
chr7:157056197(+) A-I      intronic
chr7:157056198(+) A-I      intronic
chr7:157056202(+) A-I      intronic
chr7:157022072(+) A-I      intronic
chr7:157022079(+) A-I      intronic
chr7:157022095(+) A-I      intronic
chr7:157022126(+) A-I      intronic
chr7:157022254(+) A-I      intronic
chr7:157022340(+) A-I      intronic
chr7:157022516(+) A-I      intronic
chr7:157047485(+) A-I      intronic
chr7:157047519(+) A-I      intronic
chr7:157047579(+) A-I      intronic
chr7:157010433(+) A-I      intronic
chr7:157047774(+) A-I      intronic
chr7:157010432(+) A-I      intronic
chr7:157005649(+) A-I      intronic
chr7:157005591(+) A-I      intronic
chr7:157050248(+) A-I      intronic
chr7:157049034(+) A-I      intronic
chr7:157022664(+) A-I      intronic
chr7:157047784(+) A-I      intronic
chr7:157047719(+) A-I      intronic
chr7:157022208(+) A-I      intronic
chr7:157044652(+) A-I      intronic
chr7:157048906(+) A-I      intronic
chr7:157025139(+) A-I      intronic
chr7:156999382(+) A-I      intronic
chr7:156991293(+) A-I      intronic
chr7:156949118(+) A-I      intronic
chr7:156938105(+) A-I      intronic
chr7:157002789(+) A-I      intronic
chr7:157002783(+) A-I      intronic
chr7:157049024(+) A-I      intronic
chr7:157022803(+) A-I      intronic
chr7:157002777(+) A-I      intronic
chr7:157002750(+) A-I      intronic
chr7:156995240(+) A-I      intronic
chr7:157022851(+) A-I      intronic
chr7:157022856(+) A-I      intronic
chr7:157022865(+) A-I      intronic
chr7:157022866(+) A-I      intronic
chr7:157022878(+) A-I      intronic
chr7:157023231(+) A-I      intronic
chr7:157025152(+) A-I      intronic
chr7:157025268(+) A-I      intronic
chr7:157025280(+) A-I      intronic
chr7:157026266(+) A-I      intronic
chr7:157026270(+) A-I      intronic
chr7:157027657(+) A-I      intronic
chr7:157027687(+) A-I      intronic
chr7:157027696(+) A-I      intronic
chr7:157027710(+) A-I      intronic
chr7:156993997(+) A-I      intronic
chr7:156993963(+) A-I      intronic
chr7:156993930(+) A-I      intronic
chr7:156993897(+) A-I      intronic
chr7:156993862(+) A-I      intronic
chr7:156993856(+) A-I      intronic
chr7:156993847(+) A-I      intronic
chr7:156993811(+) A-I      intronic
chr7:156993756(+) A-I      intronic
chr7:156993571(+) A-I      intronic
chr7:156993458(+) A-I      intronic
chr7:156993446(+) A-I      intronic
chr7:156991426(+) A-I      intronic
chr7:156991409(+) A-I      intronic
chr7:157040207(+) A-I      intronic
chr7:156991358(+) A-I      intronic
chr7:157044650(+) A-I      intronic
chr7:157044710(+) A-I      intronic
chr7:157027721(+) A-I      intronic
chr7:156991278(+) A-I      intronic
chr7:157059985(+) A-I      intronic
chr7:157059965(+) A-I      intronic
chr7:157056205(+) A-I      intronic
chr7:157056187(+) A-I      intronic
chr7:157056180(+) A-I      intronic
chr7:157056148(+) A-I      intronic
chr7:157053848(+) A-I      intronic
chr7:157053835(+) A-I      intronic
chr7:157053832(+) A-I      intronic
chr7:157053816(+) A-I      intronic
chr7:157053807(+) A-I      intronic
chr7:157047514(+) A-I      intronic
chr7:156984141(+) A-I      intronic
chr7:156984115(+) A-I      intronic
chr7:157039782(+) A-I      intronic
chr7:157055254(+) A-I      intronic
chr7:157053965(+) A-I      intronic
chr7:156984097(+) A-I      intronic
chr7:156984010(+) A-I      intronic
chr7:156984006(+) A-I      intronic
chr7:157044595(+) A-I      intronic
chr7:157040373(+) A-I      intronic
chr7:156969231(+) A-I      intronic
chr7:157039732(+) A-I      intronic
chr7:156962196(+) A-I      intronic
chr7:157039730(+) A-I      intronic
chr7:157025183(+) A-I      intronic
chr7:157016463(+) A-I      intronic
chr7:157016462(+) A-I      intronic
chr7:156993372(+) A-I      intronic
chr7:156962187(+) A-I      intronic
chr7:156960966(+) A-I      intronic
chr7:156960902(+) A-I      intronic
chr7:156960790(+) A-I      intronic
chr7:157040298(+) A-I      intronic
chr7:156954975(+) A-I      intronic
chr7:157039832(+) A-I      intronic
chr7:156959899(+) A-I      intronic
chr7:156959785(+) A-I      intronic
chr7:156959763(+) A-I      intronic
chr7:156959749(+) A-I      intronic
chr7:156959314(+) A-I      intronic
chr7:156959283(+) A-I      intronic
chr7:156958345(+) A-I      intronic
chr7:156958328(+) A-I      intronic
chr7:156938047(+) A-I      intronic
chr7:156938050(+) A-I      intronic
chr7:156938056(+) A-I      intronic
chr7:156938061(+) A-I      intronic
chr7:156938065(+) A-I      intronic
chr7:156939392(+) A-I      intronic
chr7:156940810(+) A-I      intronic
chr7:156940894(+) A-I      intronic
chr7:156940895(+) A-I      intronic
chr7:156941019(+) A-I      intronic
chr7:156941993(+) A-I      intronic
chr7:156942011(+) A-I      intronic
chr7:156942012(+) A-I      intronic
chr7:156946854(+) A-I      intronic
chr7:156946864(+) A-I      intronic
chr7:156946865(+) A-I      intronic
chr7:156946884(+) A-I      intronic
chr7:156946963(+) A-I      intronic
chr7:156946971(+) A-I      intronic
chr7:156950554(+) A-I      intronic
chr7:156950848(+) A-I      intronic
chr7:156952949(+) A-I      intronic
chr7:156952952(+) A-I      intronic
chr7:156953034(+) A-I      intronic
chr7:156954368(+) A-I      intronic
chr7:156954377(+) A-I      intronic
chr7:156954944(+) A-I      intronic
chr7:156954953(+) A-I      intronic
chr7:156954969(+) A-I      intronic
chr7:156958209(+) A-I      intronic
chr7:156958307(+) A-I      intronic
chr7:156942024(+) A-I      intronic
chr7:157027724(+) A-I      intronic
chr7:157027726(+) A-I      intronic
chr7:157027727(+) A-I      intronic
chr7:157027728(+) A-I      intronic
chr7:157027730(+) A-I      intronic
chr7:157027797(+) A-I      intronic
chr7:157027805(+) A-I      intronic
chr7:157029543(+) A-I      intronic
chr7:157029555(+) A-I      intronic
chr7:157029626(+) A-I      intronic
chr7:157029687(+) A-I      intronic
chr7:157029924(+) A-I      intronic
chr7:157029948(+) A-I      intronic
chr7:157029950(+) A-I      intronic
chr7:157029958(+) A-I      intronic
chr7:157029963(+) A-I      intronic
chr7:157029988(+) A-I      intronic
chr7:157039742(+) A-I      intronic
chr7:157025281(+) A-I      intronic
chr7:157005545(+) A-I      intronic
chr7:157050320(+) A-I      intronic
chr7:157059533(+) A-I      intronic
chr7:157010120(+) A-I      intronic
chr7:157059670(+) A-I      intronic
chr7:156959860(+) A-I      intronic
chr7:157036749(+) A-I      intronic
chr7:157059568(+) A-I      intronic
chr7:157016493(+) A-I      intronic
chr7:157049026(+) A-I      intronic
chr7:157040239(+) A-I      intronic
chr7:157025308(+) A-I      intronic
chr7:157055295(+) A-I      intronic
chr7:157022744(+) A-I      intronic
chr7:157023278(+) A-I      intronic
chr7:156993384(+) A-I      intronic
chr7:157047796(+) A-I      intronic
chr7:156942886(+) A-I      intronic
chr7:156991368(+) A-I      intronic
chr7:157058754(+) A-I      intronic
chr7:157060061(+) A-I      intronic
chr7:157005641(+) A-I      intronic
chr7:157025229(+) A-I      intronic
chr7:156954383(+) A-I      intronic
chr7:157029606(+) A-I      intronic
chr7:157048949(+) A-I      intronic
chr7:157044697(+) A-I      intronic
chr7:157057393(+) A-I      intronic
chr7:157050311(+) A-I      intronic
chr7:156993452(+) A-I      intronic
chr7:157025307(+) A-I      intronic
chr7:157059558(+) A-I      intronic
chr7:157047713(+) A-I      intronic
chr7:156993379(+) A-I      intronic
chr7:157053795(+) A-I      intronic
chr7:156993572(+) A-I      intronic
chr7:157059664(+) A-I      intronic
chr7:156952437(+) A-I      intronic
chr7:157051283(+) A-I      intronic
chr7:157027653(+) A-I      intronic
chr7:157010080(+) A-I      intronic
chr7:157036760(+) A-I      intronic
chr7:157023135(+) A-I      intronic
chr7:157010068(+) A-I      intronic
chr7:157023136(+) A-I      intronic
chr7:156954169(+) A-I      intronic
chr7:156949268(+) A-I      intronic
chr7:156993808(+) A-I      intronic
chr7:156965990(+) A-I      intronic
chr7:156994005(+) A-I      intronic
chr7:157047312(+) A-I      intronic
chr7:156959215(+) A-I      intronic
chr7:157025146(+) A-I      intronic
chr7:156936924(+) A-I      intronic
chr7:157029665(+) A-I      intronic
chr7:157005501(+) A-I      intronic
chr7:156960970(+) A-I      intronic
chr7:157027806(+) A-I      intronic
chr7:157051258(+) A-I      intronic
chr7:157011016(+) A-I      intronic
chr7:156991403(+) A-I      intronic
chr7:157055298(+) A-I      intronic
chr7:156959379(+) A-I      intronic
chr7:157053879(+) A-I      intronic
chr7:157051254(+) A-I      intronic
chr7:157016452(+) A-I      intronic
chr7:156993360(+) A-I      intronic
chr7:156953003(+) A-I      intronic
chr7:157050288(+) A-I      intronic
chr7:157025289(+) A-I      intronic
chr7:157047135(+) A-I      intronic
chr7:157056172(+) A-I      intronic
chr7:157057500(+) A-I      intronic
chr7:156993943(+) A-I      intronic
chr7:157010884(+) A-I      intronic
chr7:157051068(+) A-I      intronic
chr7:157025218(+) A-I      intronic
chr7:156949235(+) A-I      intronic
chr7:156954590(+) A-I      intronic
chr7:156949167(+) A-I      intronic
chr7:157025227(+) A-I      intronic
chr7:156942857(+) A-I      intronic
chr7:157016467(+) A-I      intronic
chr7:157043133(+) A-I      intronic
chr7:157029880(+) A-I      intronic
chr7:157016577(+) A-I      intronic
chr7:157005510(+) A-I      intronic
chr7:156993907(+) A-I      intronic
chr7:157057448(+) A-I      intronic
chr7:156993447(+) A-I      intronic
chr7:157056215(+) A-I      intronic
chr7:156942810(+) A-I      intronic
chr7:156952402(+) A-I      intronic
chr7:157056211(+) A-I      intronic
chr7:157027647(+) A-I      intronic
chr7:157047313(+) A-I      intronic
chr7:157058745(+) A-I      intronic
chr7:157017799(+) A-I      intronic
chr7:157038538(+) A-I      intronic
chr7:157025133(+) A-I      intronic
chr7:157047769(+) A-I      intronic
chr7:157026009(+) A-I      intronic
chr7:157059570(+) A-I      intronic
chr7:157026227(+) A-I      intronic
chr7:156993441(+) A-I      intronic
chr7:157043086(+) A-I      intronic
chr7:157026242(+) A-I      intronic
chr7:157047361(+) A-I      intronic
chr7:157051178(+) A-I      intronic
chr7:157059452(+) A-I      intronic
chr7:157060104(+) A-I      intronic
chr7:157023309(+) A-I      intronic
chr7:156954210(+) A-I      intronic
chr7:156954533(+) A-I      intronic
chr7:157047779(+) A-I      intronic
chr7:157043278(+) A-I      intronic
chr7:157057349(+) A-I      intronic
chr7:157044573(+) A-I      intronic
chr7:157059645(+) A-I      intronic
chr7:157022150(+) A-I      intronic
chr7:157029678(+) A-I      intronic
chr7:157043115(+) A-I      intronic
chr7:156959220(+) A-I      intronic
chr7:157022216(+) A-I      intronic
chr7:157040307(+) A-I      intronic
chr7:157053764(+) A-I      intronic
chr7:157050270(+) A-I      intronic
chr7:156954604(+) A-I      intronic
chr7:156967337(+) A-I      intronic
chr7:157039750(+) A-I      intronic
chr7:157059508(+) A-I      intronic
chr7:156939449(+) A-I      intronic
chr7:156991329(+) A-I      intronic
chr7:157059914(+) A-I      intronic
chr7:157026006(+) A-I      intronic
chr7:157059709(+) A-I      intronic
chr7:157025069(+) A-I      intronic
chr7:157025209(+) A-I      intronic
chr7:157023268(+) A-I      intronic
chr7:157025323(+) A-I      intronic
chr7:156991322(+) A-I      intronic
chr7:157043010(+) A-I      intronic
chr7:157022742(+) A-I      intronic
chr7:156950555(+) A-I      intronic
chr7:157027630(+) A-I      intronic
chr7:157010293(+) A-I      intronic
chr7:157010108(+) A-I      intronic
chr7:156938005(+) A-I      intronic
chr7:157051035(+) A-I      intronic
chr7:157056181(+) A-I      intronic
chr7:157027624(+) A-I      intronic
chr7:157029886(+) A-I      intronic
chr7:156993924(+) A-I      intronic
chr7:157047192(+) A-I      intronic
chr7:157027608(+) A-I      intronic
chr7:157050999(+) A-I      intronic
chr7:157040154(+) A-I      intronic
chr7:157022148(+) A-I      intronic
chr7:157025320(+) A-I      intronic
chr7:156959750(+) A-I      intronic
chr7:157047535(+) A-I      intronic
chr7:157022696(+) A-I      intronic
chr7:157016362(+) A-I      intronic
chr7:157010093(+) A-I      intronic
chr7:157056182(+) A-I      intronic
chr7:157036763(+) A-I      intronic
chr7:157040112(+) A-I      intronic
chr7:157022783(+) A-I      intronic
chr7:156952930(+) A-I      intronic
chr7:157047764(+) A-I      intronic
chr7:157025224(+) A-I      intronic
chr7:156989480(+) A-I      intronic
chr7:157051166(+) A-I      intronic
chr7:157059626(+) A-I      intronic
chr7:156959206(+) A-I      intronic
chr7:157056345(+) A-I      intronic
chr7:157029887(+) A-I      intronic
chr7:156965995(+) A-I      intronic
chr7:157022154(+) A-I      intronic
chr7:156940961(+) A-I      intronic
chr7:157050310(+) A-I      intronic
chr7:156994006(+) A-I      intronic
chr7:156939619(+) A-I      intronic
chr7:157012758(+) A-I      intronic
chr7:157026159(+) A-I      intronic
chr7:157051293(+) A-I      intronic
chr7:157059509(+) A-I      intronic
chr7:157050843(+) A-I      intronic
chr7:156937719(+) A-I      intronic
chr7:157040374(+) A-I      intronic
chr7:156993911(+) A-I      intronic
chr7:157057439(+) A-I      intronic
chr7:156967380(+) A-I      intronic
chr7:156993920(+) A-I      intronic
chr7:157016487(+) A-I      intronic
chr7:157051428(+) A-I      intronic
chr7:157057509(+) A-I      intronic
chr7:156960504(+) A-I      intronic
chr7:157030709(+) A-I      intronic
chr7:157023179(+) A-I      intronic
chr7:157029457(+) A-I      intronic
chr7:157059996(+) A-I      intronic
chr7:157012784(+) A-I      intronic
chr7:157050243(+) A-I      intronic
chr7:157039714(+) A-I      intronic
chr7:157016539(+) A-I      intronic
chr7:156993348(+) A-I      intronic
chr7:156993512(+) A-I      intronic
chr7:157012676(+) A-I      intronic
chr7:156993393(+) A-I      intronic
chr7:157047233(+) A-I      intronic
chr7:156941032(+) A-I      intronic
chr7:157059697(+) A-I      intronic
chr7:157005726(+) A-I      intronic
chr7:157057298(+) A-I      intronic
chr7:157018440(+) A-I      intronic
chr7:157055242(+) A-I      intronic
chr7:157010309(+) A-I      intronic
chr7:157012499(+) A-I      intronic
chr7:157059969(+) A-I      intronic
chr7:157010136(+) A-I      intronic
chr7:157057432(+) A-I      intronic
chr7:157040228(+) A-I      intronic
chr7:156950528(+) A-I      intronic
chr7:156966842(+) A-I      intronic
chr7:157022748(+) A-I      intronic
chr7:157059854(+) A-I      intronic
chr7:156942931(+) A-I      intronic
chr7:157005657(+) A-I      intronic
chr7:157059515(+) A-I      intronic
chr7:157030635(+) A-I      intronic
chr7:157022667(+) A-I      intronic
chr7:156993816(+) A-I      intronic
chr7:157059541(+) A-I      intronic
chr7:157016546(+) A-I      intronic
chr7:157047161(+) A-I      intronic
chr7:157047231(+) A-I      intronic
chr7:156991328(+) A-I      intronic
chr7:156939448(+) A-I      intronic
chr7:157040275(+) A-I      intronic
chr7:157057392(+) A-I      intronic
chr7:157022285(+) A-I      intronic
chr7:157056279(+) A-I      intronic
chr7:156954685(+) A-I      intronic
chr7:156940912(+) A-I      intronic
chr7:157047524(+) A-I      intronic
chr7:157030549(+) A-I      intronic
chr7:156952401(+) A-I      intronic
chr7:156963938(+) A-I      intronic
chr7:157005720(+) A-I      intronic
chr7:157027872(+) A-I      intronic
chr7:157029567(+) A-I      intronic
chr7:157010128(+) A-I      intronic
chr7:157040124(+) A-I      intronic
chr7:157059460(+) A-I      intronic
chr7:157029660(+) A-I      intronic
chr7:157047327(+) A-I      intronic
chr7:157048876(+) A-I      intronic
chr7:157022768(+) A-I      intronic
chr7:157042998(+) A-I      intronic
chr7:157059505(+) A-I      intronic
chr7:157040208(+) A-I      intronic
chr7:157039608(+) A-I      intronic
chr7:157036764(+) A-I      intronic
chr7:157053983(+) A-I      intronic
chr7:157044596(+) A-I      intronic
chr7:157048976(+) A-I      intronic
chr7:157042139(+) A-I      intronic
chr7:156993817(+) A-I      intronic
chr7:156966847(+) A-I      intronic
chr7:157047122(+) A-I      intronic
chr7:157025267(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED UBE3C
chr7:157014158(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014181(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014195(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014225(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014289(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014309(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014315(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014316(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014325(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014393(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014628(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014721(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014730(+) A-I intron -    15342557
chr7:157014830(+) A-I intron -    15342557
chr7:157015145(+) A-I intron -    15342557
chr7:157015169(+) A-I intron -    15342557
chr7:157015231(+) A-I intron -    15342557
chr7:157015310(+) A-I intron -    15342557
chr7:157015764(+) A-I intron -    15342557
chr7:157057349(+) A-I intron -    15342557
chr7:157057432(+) A-I intron -    15342557
chr7:157057448(+) A-I intron -    15342557
chr7:157057450(+) A-I intron -    15342557
chr7:157057500(+) A-I intron -    15342557
chr7:157057509(+) A-I intron -    15342557
chr7:156990422(+) A-I intron -    22327324
chr7:156990769(+) A-I intron -    22327324
chr7:156990890(+) A-I intron -    22327324
chr7:156990891(+) A-I intron -    22327324
chr7:157025224(+) A-I intron -    22327324
chr7:157047713(+) A-I intron -    22327324
chr7:157025139(+) A-I intron -    21960545
chr7:157025146(+) A-I intron -    21960545
chr7:157025152(+) A-I intron -    21960545
chr7:157025153(+) A-I intron -    21960545
chr7:157024611(+) G-T intron -    22484847
chr7:156940912(+) A-G intron -    22484847
chr7:156942810(+) A-G intron -    22484847
chr7:156942857(+) A-G intron -    22484847
chr7:156942886(+) A-G intron -    22484847
chr7:156942931(+) A-G intron -    22484847
chr7:156946514(+) T-A intron -    22484847
chr7:156950555(+) A-G intron -    22484847
chr7:156952930(+) A-G intron -    22484847
chr7:156954345(+) A-G intron -    22484847
chr7:156954533(+) A-G intron -    22484847
chr7:156959206(+) A-G intron -    22484847
chr7:156959215(+) A-G intron -    22484847
chr7:156959220(+) A-G intron -    22484847
chr7:156959291(+) A-G intron -    22484847
chr7:156959750(+) A-G intron -    22484847
chr7:156959860(+) A-G intron -    22484847
chr7:156959872(+) A-G intron -    22484847
chr7:156959877(+) A-G intron -    22484847
chr7:156967337(+) A-G intron -    22484847
chr7:156967380(+) A-G intron -    22484847
chr7:156989480(+) A-G intron -    22484847
chr7:156991238(+) A-T intron -    22484847
chr7:156991322(+) A-G intron -    22484847
chr7:156991328(+) A-G intron -    22484847
chr7:156991329(+) A-G intron -    22484847
chr7:156991368(+) A-G intron -    22484847
chr7:156991403(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993348(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993360(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993393(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993441(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993447(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993512(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993530(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993590(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993808(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993816(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993871(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993898(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993907(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993911(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993924(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993939(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993943(+) A-G intron -    22484847
chr7:156993968(+) A-G intron -    22484847
chr7:156994005(+) A-G intron -    22484847
chr7:157005609(+) A-G intron -    22484847
chr7:157005626(+) A-G intron -    22484847
chr7:157005641(+) A-G intron -    22484847
chr7:157005720(+) A-G intron -    22484847
chr7:157010068(+) A-G intron -    22484847
chr7:157010093(+) A-G intron -    22484847
chr7:157010267(+) A-G intron -    22484847
chr7:157010309(+) A-G intron -    22484847
chr7:157010350(+) G-A intron -    22484847
chr7:157014181(+) A-G intron -    22484847
chr7:157014195(+) A-G intron -    22484847
chr7:157014299(+) A-G intron -    22484847
chr7:157014588(+) A-G intron -    22484847
chr7:157014628(+) A-G intron -    22484847
chr7:157014643(+) A-G intron -    22484847
chr7:157014830(+) A-G intron -    22484847
chr7:157015169(+) A-G intron -    22484847
chr7:157015231(+) A-G intron -    22484847
chr7:157015253(+) A-G intron -    22484847
chr7:157015310(+) A-G intron -    22484847
chr7:157016362(+) A-G intron -    22484847
chr7:157016452(+) A-G intron -    22484847
chr7:157016467(+) A-G intron -    22484847
chr7:157016487(+) A-G intron -    22484847
chr7:157016539(+) A-G intron -    22484847
chr7:157016546(+) A-G intron -    22484847
chr7:157016899(+) A-T intron -    22484847
chr7:157016909(+) A-G intron -    22484847
chr7:157022148(+) A-G intron -    22484847
chr7:157022150(+) A-G intron -    22484847
chr7:157022154(+) A-G intron -    22484847
chr7:157022216(+) A-G intron -    22484847
chr7:157022667(+) A-G intron -    22484847
chr7:157022696(+) A-G intron -    22484847
chr7:157022748(+) A-G intron -    22484847
chr7:157023135(+) A-G intron -    22484847
chr7:157023136(+) A-G intron -    22484847
chr7:157023179(+) A-G intron -    22484847
chr7:157023268(+) A-G intron -    22484847
chr7:157023309(+) A-G intron -    22484847
chr7:157025224(+) A-G intron -    22484847
chr7:157025308(+) A-G intron -    22484847
chr7:157025320(+) A-G intron -    22484847
chr7:157025323(+) A-G intron -    22484847
chr7:157026242(+) A-G intron -    22484847
chr7:157027624(+) A-G intron -    22484847
chr7:157027647(+) A-G intron -    22484847
chr7:157027806(+) A-G intron -    22484847
chr7:157029457(+) A-G intron -    22484847
chr7:157029567(+) A-G intron -    22484847
chr7:157029606(+) A-G intron -    22484847
chr7:157029636(+) A-G intron -    22484847
chr7:157029660(+) A-G intron -    22484847
chr7:157029678(+) A-G intron -    22484847
chr7:157029688(+) A-G intron -    22484847
chr7:157029887(+) A-G intron -    22484847
chr7:157030549(+) A-G intron -    22484847
chr7:157036764(+) A-G intron -    22484847
chr7:157038538(+) A-G intron -    22484847
chr7:157039608(+) A-G intron -    22484847
chr7:157039685(+) A-G intron -    22484847
chr7:157039714(+) A-G intron -    22484847
chr7:157039724(+) A-G intron -    22484847
chr7:157039751(+) A-G intron -    22484847
chr7:157040124(+) A-G intron -    22484847
chr7:157040153(+) A-G intron -    22484847
chr7:157040154(+) A-G intron -    22484847
chr7:157040210(+) A-G intron -    22484847
chr7:157040239(+) A-G intron -    22484847
chr7:157040275(+) A-G intron -    22484847
chr7:157040307(+) A-G intron -    22484847
chr7:157040314(+) A-G intron -    22484847
chr7:157040374(+) A-G intron -    22484847
chr7:157042139(+) A-G intron -    22484847
chr7:157043086(+) A-G intron -    22484847
chr7:157043133(+) A-G intron -    22484847
chr7:157043269(+) A-G intron -    22484847
chr7:157043278(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047122(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047135(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047161(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047231(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047233(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047281(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047524(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047534(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047535(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047605(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047686(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047709(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047713(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047769(+) A-G intron -    22484847
chr7:157047779(+) A-G intron -    22484847
chr7:157053764(+) A-G intron -    22484847
chr7:157053795(+) A-G intron -    22484847
chr7:157055299(+) G-C intron -    22484847
chr7:157056237(+) A-G intron -    22484847
chr7:157057332(+) A-G intron -    22484847
chr7:157059505(+) A-G intron -    22484847
chr7:157059509(+) A-G intron -    22484847
chr7:157059570(+) A-G intron -    22484847
chr7:157059862(+) A-G intron -    22484847
chr7:157059863(+) A-G intron -    22484847
chr7:157059915(+) A-G intron -    22484847
chr7:157059996(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase UBE3C
chr7:156953732-156953733(+) Am intron       -
chr7:156974961-156974962(+) Am CDS       -
chr7:156985469-156985470(+) m6A intron       22608085
chr7:156985510-156985511(+) m6A intron       22608085
chr7:156985518-156985519(+) m6A intron       22608085
chr7:157000593-157000594(+) Cm CDS//exon       -
chr7:157023876-157023877(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942
chr7:157023919-157023920(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942
chr7:157023987-157023988(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942
chr7:157049430-157049431(+) Gm exon//intron       -
chr7:157060354-157060355(+) m6A CDS//exon       24981863//22575960
chr7:157060386-157060387(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//22575960//22608085
chr7:157060403-157060404(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//22575960//22608085
chr7:157060467-157060468(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chr7:157060480-157060481(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085
chr7:157060514-157060515(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085
chr7:157060638-157060639(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//22608085
chr7:157061034-157061035(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863
chr7:157061112-157061113(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863
chr7:157061239-157061240(+) m6A 3'UTR//exon       24981863
chr7:157061441-157061442(+) m6A 3'UTR//exon       22575960

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hcmv-miR-US4-3p
Exosome B cell line (Raji)|Primary dendritic cells|T cell line (J77)     21505438
UBE3C
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Membrane K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-US4-3p
Interactor2: UBE3C

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...