Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00257038

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL112-5p:  MIMAT0026552          RPL7L1:  NR_134563     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-UL112-5p	RPL7L1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0026552	285855
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	dJ475N16.4

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	RPL7L1	chr6:42848992(+) A-I      intronic chr6:42850533(+) A-I      intronic chr6:42850319(+) A-I      intronic chr6:42850318(+) A-I      intronic chr6:42849148(+) A-I      intronic chr6:42850720(+) A-I      intronic chr6:42849438(+) A-I      intronic chr6:42849638(+) A-I      intronic chr6:42850075(+) A-I      intronic chr6:42849163(+) A-I      intronic chr6:42848527(+) A-I      intronic chr6:42850210(+) A-I      intronic chr6:42849173(+) A-I      intronic chr6:42850594(+) A-I      intronic chr6:42849207(+) A-I      intronic chr6:42849144(+) A-I      intronic chr6:42848948(+) A-I      intronic chr6:42850705(+) A-I      intronic chr6:42850115(+) A-I      intronic chr6:42856081(+) A-I      3'UTR chr6:42854576(+) A-I      3'UTR chr6:42856085(+) A-I      3'UTR chr6:42856096(+) A-I      3'UTR chr6:42856125(+) A-I      3'UTR chr6:42856130(+) A-I      3'UTR chr6:42856135(+) A-I      3'UTR chr6:42856141(+) A-I      3'UTR chr6:42856142(+) A-I      3'UTR chr6:42854692(+) A-I      3'UTR chr6:42855992(+) A-I      3'UTR chr6:42856182(+) A-I      3'UTR chr6:42856026(+) A-I      3'UTR chr6:42856950(+) A-I      3'UTR chr6:42857018(+) A-I      3'UTR chr6:42854573(+) A-I      3'UTR chr6:42857089(+) A-I      3'UTR chr6:42857098(+) A-I      3'UTR chr6:42854579(+) A-I      3'UTR chr6:42854581(+) A-I      3'UTR chr6:42854634(+) A-I      3'UTR chr6:42854697(+) A-I      3'UTR chr6:42854733(+) A-I      3'UTR chr6:42856035(+) A-I      3'UTR chr6:42856087(+) A-I      3'UTR chr6:42856915(+) A-I      3'UTR chr6:42856946(+) A-I      3'UTR chr6:42857001(+) A-I      3'UTR chr6:42857090(+) A-I      3'UTR chr6:42857134(+) A-I      3'UTR chr6:42857182(+) A-I      3'UTR chr6:42857197(+) A-I      3'UTR chr6:42857025(+) A-I      3'UTR chr6:42854644(+) A-I      3'UTR chr6:42854673(+) A-I      3'UTR chr6:42854479(+) A-I      3'UTR chr6:42854677(+) A-I      3'UTR chr6:42854533(+) A-I      3'UTR chr6:42857019(+) A-I      3'UTR chr6:42857085(+) A-I      3'UTR chr6:42849625(+) A-I      intronic chr6:42849109(+) A-I      intronic chr6:42849773(+) A-I      intronic chr6:42850564(+) A-I      intronic chr6:42849373(+) A-I      intronic chr6:42850128(+) A-I      intronic chr6:42850780(+) A-I      intronic chr6:42850766(+) A-I      intronic chr6:42849858(+) A-I      intronic chr6:42850432(+) A-I      intronic chr6:42850174(+) A-I      intronic chr6:42849131(+) A-I      intronic chr6:42850220(+) A-I      intronic chr6:42849699(+) A-I      intronic chr6:42849451(+) A-I      intronic chr6:42850252(+) A-I      intronic chr6:42849682(+) A-I      intronic chr6:42849088(+) A-I      intronic chr6:42848949(+) A-I      intronic chr6:42850211(+) A-I      intronic chr6:42850192(+) A-I      intronic chr6:42850177(+) A-I      intronic chr6:42856923(+) A-I      3'UTR chr6:42856045(+) A-I      3'UTR chr6:42855957(+) A-I      3'UTR chr6:42855979(+) A-I      3'UTR chr6:42856055(+) A-I      3'UTR chr6:42855954(+) A-I      3'UTR chr6:42856131(+) A-I      3'UTR chr6:42855914(+) A-I      3'UTR chr6:42856158(+) A-I      3'UTR chr6:42856157(+) A-I      3'UTR chr6:42857144(+) A-I      3'UTR chr6:42855948(+) A-I      3'UTR chr6:42856176(+) A-I      3'UTR chr6:42854664(+) A-I      3'UTR chr6:42856172(+) A-I      3'UTR chr6:42856905(+) A-I      3'UTR chr6:42857057(+) A-I      3'UTR chr6:42854681(+) A-I      3'UTR chr6:42854682(+) A-I      3'UTR chr6:42856156(+) A-I      3'UTR chr6:42857067(+) A-I      3'UTR chr6:42856989(+) A-I      3'UTR chr6:42856051(+) A-I      3'UTR chr6:42856959(+) A-I      3'UTR chr6:42856924(+) A-I      3'UTR chr6:42856139(+) A-I      3'UTR chr6:42855936(+) A-I      3'UTR chr6:42856954(+) A-I      3'UTR chr6:42856056(+) A-I      3'UTR chr6:42854633(+) A-I      3'UTR chr6:42857023(+) A-I      3'UTR chr6:42857014(+) A-I      3'UTR chr6:42856993(+) A-I      3'UTR chr6:42856964(+) A-I      3'UTR chr6:42854580(+) A-I      3'UTR chr6:42857058(+) A-I      3'UTR chr6:42856064(+) A-I      3'UTR chr6:42856917(+) A-I      3'UTR chr6:42857136(+) A-I      3'UTR chr6:42856117(+) A-I      3'UTR chr6:42857074(+) A-I      3'UTR chr6:42854621(+) A-I      3'UTR chr6:42856930(+) A-I      3'UTR chr6:42856029(+) A-I      3'UTR chr6:42856170(+) A-I      3'UTR chr6:42856105(+) A-I      3'UTR chr6:42857120(+) A-I      3'UTR chr6:42857031(+) A-I      3'UTR chr6:42856070(+) A-I      3'UTR chr6:42857037(+) A-I      3'UTR chr6:42857028(+) A-I      3'UTR chr6:42855993(+) A-I      3'UTR chr6:42857131(+) A-I      3'UTR chr6:42854531(+) A-I      3'UTR chr6:42857063(+) A-I      3'UTR chr6:42857026(+) A-I      3'UTR chr6:42855962(+) A-I      3'UTR chr6:42857183(+) A-I      3'UTR chr6:42856093(+) A-I      3'UTR chr6:42856999(+) A-I      3'UTR chr6:42857099(+) A-I      3'UTR chr6:42856937(+) A-I      3'UTR chr6:42857002(+) A-I      3'UTR chr6:42854742(+) A-I      3'UTR chr6:42857021(+) A-I      3'UTR chr6:42857027(+) A-I      3'UTR chr6:42856007(+) A-I      3'UTR chr6:42854585(+) A-I      3'UTR chr6:42849599(+) A-I      intronic chr6:42850221(+) A-I      intronic chr6:42849124(+) A-I      intronic chr6:42849152(+) A-I      intronic chr6:42849859(+) A-I      intronic chr6:42850168(+) A-I      intronic chr6:42849573(+) A-I      intronic chr6:42848430(+) A-I      intronic chr6:42849426(+) A-I      intronic chr6:42849372(+) A-I      intronic chr6:42850081(+) A-I      intronic chr6:42849409(+) A-I      intronic chr6:42849616(+) A-I      intronic chr6:42849641(+) A-I      intronic chr6:42850523(+) A-I      intronic chr6:42849183(+) A-I      intronic chr6:42849555(+) A-I      intronic chr6:42850165(+) A-I      intronic chr6:42850484(+) A-I      intronic chr6:42850074(+) A-I      intronic chr6:42850237(+) A-I      intronic chr6:42850710(+) A-I      intronic chr6:42850601(+) A-I      intronic chr6:42850120(+) A-I      intronic chr6:42850251(+) A-I      intronic chr6:42849448(+) A-I      intronic chr6:42850770(+) A-I      intronic chr6:42853195(+) A-I      intronic chr6:42850272(+) A-I      intronic chr6:42849679(+) A-I      intronic chr6:42849082(+) A-I      intronic chr6:42850565(+) A-I      intronic chr6:42849092(+) A-I      intronic chr6:42850599(+) A-I      intronic chr6:42849519(+) A-I      intronic chr6:42850417(+) A-I      intronic chr6:42850550(+) A-I      intronic chr6:42849408(+) A-I      intronic chr6:42850497(+) A-I      intronic chr6:42849664(+) A-I      intronic chr6:42849342(+) A-I      intronic chr6:42850259(+) A-I      intronic chr6:42849576(+) A-I      intronic chr6:42850159(+) A-I      intronic chr6:42849105(+) A-I      intronic chr6:42850377(+) A-I      intronic chr6:42850743(+) A-I      intronic chr6:42849123(+) A-I      intronic chr6:42849413(+) A-I      intronic chr6:42848525(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	RPL7L1	chr6:42849088(+) A-I intron -    15258596 chr6:42849123(+) A-I intron -    15258596 chr6:42849342(+) A-I intron -    15258596   //22327324 chr6:42849426(+) A-I intron -    15258596 chr6:42849442(+) A-I intron -    15258596 chr6:42850211(+) A-I intron -    15258596 chr6:42850252(+) A-I intron -    15258596 chr6:42849746(+) A-I intron -    22327324 chr6:42850689(+) A-I intron -    22327324 chr6:42850668(+) A-I intron -    21960545 chr6:42848525(+) A-G intron -    22484847 chr6:42848949(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849088(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849123(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849124(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849153(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849342(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849372(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849373(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849408(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849409(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849413(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849426(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849442(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849451(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849519(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849527(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849555(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849573(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849576(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849616(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849624(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849625(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849664(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849679(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849682(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849699(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849746(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849761(+) A-G intron -    22484847 chr6:42849773(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850081(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850120(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850128(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850159(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850165(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850168(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850174(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850184(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850211(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850220(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850251(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850252(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850259(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850272(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850377(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850413(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850417(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850484(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850523(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850524(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850550(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850585(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850599(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850645(+) G-A intron -    22484847 chr6:42850689(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850741(+) A-G intron -    22484847 chr6:42850758(+) A-G intron -    22484847 chr6:42852967(+) A-G intron -    22484847 chr6:42853189(+) A-G intron -    22484847 chr6:42853195(+) A-G intron -    22484847 chr6:42854531(+) A-G intron -    22484847 chr6:42854580(+) A-G intron -    22484847 chr6:42854633(+) A-G intron -    22484847 chr6:42854664(+) A-G intron -    22484847 chr6:42854681(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	RPL7L1	chr6:42847427-42847428(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr6:42847480-42847481(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr6:42847584-42847585(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr6:42847608-42847609(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr6:42848472-42848473(+) m6A exon//intron       24209618 chr6:42848717-42848718(+) m6A exon//intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:42854197-42854198(+) m6A CDS//exon       24284625//22608085 chr6:42854202-42854203(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//22608085 chr6:42854225-42854226(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:42854352-42854353(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:42854383-42854384(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:42854440-42854441(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:42854510-42854511(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24981863 chr6:42854532-42854533(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24209618//24981863//22608085 chr6:42854555-42854556(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24209618//24981863//22608085 chr6:42854652-42854653(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:42854720-42854721(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085 chr6:42854748-42854749(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085 chr6:42854814-42854815(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085 chr6:42854904-42854905(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:42855007-42855008(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085 chr6:42855029-42855030(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085 chr6:42855121-42855122(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:42855241-42855242(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:42855309-42855310(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:42855334-42855335(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085 chr6:42855532-42855533(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr6:42855561-42855562(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:42855605-42855606(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:42855915-42855916(+) m6A 3'UTR       24209618 chr6:42856082-42856083(+) m6A 3'UTR       24209618 chr6:42856117-42856118(+) m6A 3'UTR       24209618 chr6:42857482-42857483(+) m6A 3'UTR       27773535 chr6:42857487-42857488(+) m6A 3'UTR       27773535 chr6:42857519-42857520(+) m6A 3'UTR       27773535 chr6:42857539-42857540(+) m6A 3'UTR       27773535 chr6:42857569-42857570(+) m6A 3'UTR       27773535 chr6:42857579-42857580(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	RPL7L1	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-UL112-5p
Interactor2: RPL7L1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid
Support Database	VmiReg