Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00244627

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL70-5p:           UBXN2A:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-UL70-5p UBXN2A
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0003342 165324
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - UBXD4

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR UBXN2A
chr2:24224998(+) A-I      3'UTR
chr2:24224970(+) A-I      3'UTR
chr2:24224968(+) A-I      3'UTR
chr2:24224961(+) A-I      3'UTR
chr2:24184949(+) A-I      intronic
chr2:24224016(+) A-I      3'UTR
chr2:24225117(+) A-I      3'UTR
chr2:24218895(+) A-I      intronic
chr2:24204612(+) A-I      intronic
chr2:24204611(+) A-I      intronic
chr2:24204610(+) A-I      intronic
chr2:24218852(+) A-I      intronic
chr2:24202568(+) A-I      intronic
chr2:24225003(+) A-I      3'UTR
chr2:24209712(+) A-I      intronic
chr2:24184535(+) A-I      intronic
chr2:24184954(+) A-I      intronic
chr2:24204617(+) A-I      intronic
chr2:24184953(+) A-I      intronic
chr2:24225110(+) A-I      3'UTR
chr2:24218898(+) A-I      intronic
chr2:24184992(+) A-I      intronic
chr2:24223462(+) A-I      3'UTR
chr2:24223140(+) A-I      3'UTR
chr2:24184962(+) A-I      intronic
chr2:24227340(+) A-I      3'UTR
chr2:24227338(+) A-I      3'UTR
chr2:24223961(+) A-I      3'UTR
chr2:24224002(+) A-I      3'UTR
chr2:24223297(+) A-I      3'UTR
chr2:24223211(+) A-I      3'UTR
chr2:24223197(+) A-I      3'UTR
chr2:24225011(+) A-I      3'UTR
chr2:24223495(+) A-I      3'UTR
chr2:24225020(+) A-I      3'UTR
chr2:24227347(+) A-I      3'UTR
chr2:24227374(+) A-I      3'UTR
chr2:24225076(+) A-I      3'UTR
chr2:24225097(+) A-I      3'UTR
chr2:24225102(+) A-I      3'UTR
chr2:24223978(+) A-I      3'UTR
chr2:24225123(+) A-I      3'UTR
chr2:24225060(+) A-I      3'UTR
chr2:24225042(+) A-I      3'UTR
chr2:24184990(+) A-I      intronic
chr2:24184996(+) A-I      intronic
chr2:24186131(+) A-I      intronic
chr2:24186132(+) A-I      intronic
chr2:24186743(+) A-I      intronic
chr2:24186770(+) A-I      intronic
chr2:24186875(+) A-I      intronic
chr2:24186891(+) A-I      intronic
chr2:24187198(+) A-I      intronic
chr2:24194822(+) A-I      intronic
chr2:24195516(+) A-I      intronic
chr2:24208293(+) A-I      intronic
chr2:24208342(+) A-I      intronic
chr2:24208611(+) A-I      intronic
chr2:24208616(+) A-I      intronic
chr2:24208632(+) A-I      intronic
chr2:24208633(+) A-I      intronic
chr2:24208722(+) A-I      intronic
chr2:24208815(+) A-I      intronic
chr2:24208932(+) A-I      intronic
chr2:24208991(+) A-I      intronic
chr2:24208993(+) A-I      intronic
chr2:24209012(+) A-I      intronic
chr2:24209059(+) A-I      intronic
chr2:24209547(+) A-I      intronic
chr2:24209558(+) A-I      intronic
chr2:24209607(+) A-I      intronic
chr2:24209698(+) A-I      intronic
chr2:24209947(+) A-I      intronic
chr2:24209950(+) A-I      intronic
chr2:24210421(+) A-I      intronic
chr2:24210476(+) A-I      intronic
chr2:24210491(+) A-I      intronic
chr2:24210527(+) A-I      intronic
chr2:24210878(+) A-I      intronic
chr2:24210886(+) A-I      intronic
chr2:24210958(+) A-I      intronic
chr2:24210963(+) A-I      intronic
chr2:24212358(+) A-I      intronic
chr2:24212384(+) A-I      intronic
chr2:24212385(+) A-I      intronic
chr2:24212495(+) A-I      intronic
chr2:24212517(+) A-I      intronic
chr2:24202525(+) A-I      intronic
chr2:24202524(+) A-I      intronic
chr2:24202147(+) A-I      intronic
chr2:24212523(+) A-I      intronic
chr2:24195536(+) A-I      intronic
chr2:24195946(+) A-I      intronic
chr2:24213481(+) A-I      intronic
chr2:24212308(+) A-I      intronic
chr2:24202107(+) A-I      intronic
chr2:24201739(+) A-I      intronic
chr2:24213482(+) A-I      intronic
chr2:24218452(+) A-I      intronic
chr2:24213494(+) A-I      intronic
chr2:24200932(+) A-I      intronic
chr2:24200776(+) A-I      intronic
chr2:24200757(+) A-I      intronic
chr2:24213497(+) A-I      intronic
chr2:24213523(+) A-I      intronic
chr2:24200365(+) A-I      intronic
chr2:24200357(+) A-I      intronic
chr2:24200317(+) A-I      intronic
chr2:24199689(+) A-I      intronic
chr2:24199679(+) A-I      intronic
chr2:24198626(+) A-I      intronic
chr2:24213626(+) A-I      intronic
chr2:24214418(+) A-I      intronic
chr2:24214432(+) A-I      intronic
chr2:24214470(+) A-I      intronic
chr2:24197742(+) A-I      intronic
chr2:24197646(+) A-I      intronic
chr2:24214551(+) A-I      intronic
chr2:24214686(+) A-I      intronic
chr2:24214693(+) A-I      intronic
chr2:24164785(+) A-I      intronic
chr2:24164850(+) A-I      intronic
chr2:24164868(+) A-I      intronic
chr2:24165532(+) A-I      intronic
chr2:24165549(+) A-I      intronic
chr2:24165565(+) A-I      intronic
chr2:24214717(+) A-I      intronic
chr2:24214959(+) A-I      intronic
chr2:24215027(+) A-I      intronic
chr2:24215042(+) A-I      intronic
chr2:24215101(+) A-I      intronic
chr2:24218350(+) A-I      intronic
chr2:24218469(+) A-I      intronic
chr2:24218512(+) A-I      intronic
chr2:24218805(+) A-I      intronic
chr2:24218862(+) A-I      intronic
chr2:24218910(+) A-I      intronic
chr2:24197592(+) A-I      intronic
chr2:24219076(+) A-I      intronic
chr2:24219975(+) A-I      intronic
chr2:24220415(+) A-I      intronic
chr2:24221459(+) A-I      intronic
chr2:24221479(+) A-I      intronic
chr2:24221532(+) A-I      intronic
chr2:24221540(+) A-I      intronic
chr2:24221546(+) A-I      intronic
chr2:24221661(+) A-I      intronic
chr2:24197490(+) A-I      intronic
chr2:24197398(+) A-I      intronic
chr2:24197296(+) A-I      intronic
chr2:24197295(+) A-I      intronic
chr2:24196430(+) A-I      intronic
chr2:24196393(+) A-I      intronic
chr2:24196351(+) A-I      intronic
chr2:24196348(+) A-I      intronic
chr2:24196113(+) A-I      intronic
chr2:24196017(+) A-I      intronic
chr2:24195990(+) A-I      intronic
chr2:24195970(+) A-I      intronic
chr2:24195964(+) A-I      intronic
chr2:24206256(+) A-I      intronic
chr2:24206234(+) A-I      intronic
chr2:24205130(+) A-I      intronic
chr2:24205122(+) A-I      intronic
chr2:24205116(+) A-I      intronic
chr2:24205042(+) A-I      intronic
chr2:24204678(+) A-I      intronic
chr2:24204651(+) A-I      intronic
chr2:24204544(+) A-I      intronic
chr2:24204274(+) A-I      intronic
chr2:24206808(+) A-I      intronic
chr2:24204268(+) A-I      intronic
chr2:24204133(+) A-I      intronic
chr2:24204110(+) A-I      intronic
chr2:24204105(+) A-I      intronic
chr2:24204067(+) A-I      intronic
chr2:24207789(+) A-I      intronic
chr2:24203706(+) A-I      intronic
chr2:24202715(+) A-I      intronic
chr2:24202661(+) A-I      intronic
chr2:24202650(+) A-I      intronic
chr2:24202631(+) A-I      intronic
chr2:24202624(+) A-I      intronic
chr2:24202578(+) A-I      intronic
chr2:24165927(+) A-I      intronic
chr2:24166458(+) A-I      intronic
chr2:24187301(+) A-I      intronic
chr2:24169853(+) A-I      intronic
chr2:24169923(+) A-I      intronic
chr2:24169924(+) A-I      intronic
chr2:24169993(+) A-I      intronic
chr2:24170908(+) A-I      intronic
chr2:24171223(+) A-I      intronic
chr2:24171357(+) A-I      intronic
chr2:24171911(+) A-I      intronic
chr2:24172094(+) A-I      intronic
chr2:24172186(+) A-I      intronic
chr2:24172225(+) A-I      intronic
chr2:24172254(+) A-I      intronic
chr2:24172262(+) A-I      intronic
chr2:24176939(+) A-I      intronic
chr2:24180116(+) A-I      intronic
chr2:24180161(+) A-I      intronic
chr2:24180300(+) A-I      intronic
chr2:24207884(+) A-I      intronic
chr2:24192257(+) A-I      intronic
chr2:24192891(+) A-I      intronic
chr2:24192906(+) A-I      intronic
chr2:24193033(+) A-I      intronic
chr2:24194797(+) A-I      intronic
chr2:24184856(+) A-I      intronic
chr2:24184967(+) A-I      intronic
chr2:24193057(+) A-I      intronic
chr2:24193064(+) A-I      intronic
chr2:24193106(+) A-I      intronic
chr2:24194378(+) A-I      intronic
chr2:24194459(+) A-I      intronic
chr2:24207994(+) A-I      intronic
chr2:24202564(+) A-I      intronic
chr2:24208188(+) A-I      intronic
chr2:24208212(+) A-I      intronic
chr2:24180312(+) A-I      intronic
chr2:24180544(+) A-I      intronic
chr2:24181938(+) A-I      intronic
chr2:24181955(+) A-I      intronic
chr2:24182106(+) A-I      intronic
chr2:24182107(+) A-I      intronic
chr2:24182133(+) A-I      intronic
chr2:24182152(+) A-I      intronic
chr2:24182241(+) A-I      intronic
chr2:24182851(+) A-I      intronic
chr2:24183086(+) A-I      intronic
chr2:24183522(+) A-I      intronic
chr2:24183607(+) A-I      intronic
chr2:24183620(+) A-I      intronic
chr2:24183705(+) A-I      intronic
chr2:24183707(+) A-I      intronic
chr2:24200753(+) A-I      intronic
chr2:24224601(+) A-I      3'UTR
chr2:24224681(+) A-I      3'UTR
chr2:24224752(+) A-I      3'UTR
chr2:24224765(+) A-I      3'UTR
chr2:24224772(+) A-I      3'UTR
chr2:24224897(+) A-I      3'UTR
chr2:24224918(+) A-I      3'UTR
chr2:24225025(+) A-I      3'UTR
chr2:24225028(+) A-I      3'UTR
chr2:24225038(+) A-I      3'UTR
chr2:24225154(+) A-I      3'UTR
chr2:24225164(+) A-I      3'UTR
chr2:24225203(+) A-I      3'UTR
chr2:24225207(+) A-I      3'UTR
chr2:24225235(+) A-I      3'UTR
chr2:24225254(+) A-I      3'UTR
chr2:24225255(+) A-I      3'UTR
chr2:24225397(+) A-I      3'UTR
chr2:24225421(+) A-I      3'UTR
chr2:24225432(+) A-I      3'UTR
chr2:24225446(+) A-I      3'UTR
chr2:24227252(+) A-I      3'UTR
chr2:24227270(+) A-I      3'UTR
chr2:24227276(+) A-I      3'UTR
chr2:24227306(+) A-I      3'UTR
chr2:24227314(+) A-I      3'UTR
chr2:24227323(+) A-I      3'UTR
chr2:24227364(+) A-I      3'UTR
chr2:24227365(+) A-I      3'UTR
chr2:24227368(+) A-I      3'UTR
chr2:24227413(+) A-I      3'UTR
chr2:24227456(+) A-I      3'UTR
chr2:24227465(+) A-I      3'UTR
chr2:24227469(+) A-I      3'UTR
chr2:24227474(+) A-I      3'UTR
chr2:24227494(+) A-I      3'UTR
chr2:24227504(+) A-I      3'UTR
chr2:24227531(+) A-I      3'UTR
chr2:24224591(+) A-I      3'UTR
chr2:24223185(+) A-I      3'UTR
chr2:24223235(+) A-I      3'UTR
chr2:24223261(+) A-I      3'UTR
chr2:24223372(+) A-I      3'UTR
chr2:24223395(+) A-I      3'UTR
chr2:24223399(+) A-I      3'UTR
chr2:24223479(+) A-I      3'UTR
chr2:24223484(+) A-I      3'UTR
chr2:24223535(+) A-I      3'UTR
chr2:24223925(+) A-I      3'UTR
chr2:24223926(+) A-I      3'UTR
chr2:24223964(+) A-I      3'UTR
chr2:24224069(+) A-I      3'UTR
chr2:24224082(+) A-I      3'UTR
chr2:24224094(+) A-I      3'UTR
chr2:24224552(+) A-I      3'UTR
chr2:24216743(+) A-I      intronic
chr2:24221470(+) A-I      intronic
chr2:24186943(+) A-I      intronic
chr2:24209878(+) A-I      intronic
chr2:24198608(+) A-I      intronic
chr2:24180409(+) A-I      intronic
chr2:24194543(+) A-I      intronic
chr2:24171834(+) A-I      intronic
chr2:24190905(+) A-I      intronic
chr2:24204974(+) A-I      intronic
chr2:24214564(+) A-I      intronic
chr2:24187342(+) A-I      intronic
chr2:24209717(+) A-I      intronic
chr2:24214616(+) A-I      intronic
chr2:24221427(+) A-I      intronic
chr2:24206626(+) A-I      intronic
chr2:24208779(+) A-I      intronic
chr2:24206807(+) A-I      intronic
chr2:24212391(+) A-I      intronic
chr2:24206707(+) A-I      intronic
chr2:24218374(+) A-I      intronic
chr2:24212248(+) A-I      intronic
chr2:24218829(+) A-I      intronic
chr2:24172689(+) A-I      intronic
chr2:24180354(+) A-I      intronic
chr2:24187354(+) A-I      intronic
chr2:24207820(+) A-I      intronic
chr2:24220865(+) A-I      intronic
chr2:24185659(+) A-I      intronic
chr2:24194439(+) A-I      intronic
chr2:24220782(+) A-I      intronic
chr2:24210501(+) A-I      intronic
chr2:24184443(+) A-I      intronic
chr2:24212553(+) A-I      intronic
chr2:24171928(+) A-I      intronic
chr2:24203771(+) A-I      intronic
chr2:24186264(+) A-I      intronic
chr2:24200781(+) A-I      intronic
chr2:24194428(+) A-I      intronic
chr2:24186115(+) A-I      intronic
chr2:24212719(+) A-I      intronic
chr2:24219408(+) A-I      intronic
chr2:24212345(+) A-I      intronic
chr2:24180266(+) A-I      intronic
chr2:24208060(+) A-I      intronic
chr2:24221467(+) A-I      intronic
chr2:24206309(+) A-I      intronic
chr2:24185615(+) A-I      intronic
chr2:24212205(+) A-I      intronic
chr2:24165926(+) A-I      intronic
chr2:24219364(+) A-I      intronic
chr2:24183642(+) A-I      intronic
chr2:24207910(+) A-I      intronic
chr2:24208727(+) A-I      intronic
chr2:24209528(+) A-I      intronic
chr2:24221335(+) A-I      intronic
chr2:24207798(+) A-I      intronic
chr2:24195506(+) A-I      intronic
chr2:24221424(+) A-I      intronic
chr2:24202551(+) A-I      intronic
chr2:24172331(+) A-I      intronic
chr2:24204245(+) A-I      intronic
chr2:24200898(+) A-I      intronic
chr2:24221349(+) A-I      intronic
chr2:24208821(+) A-I      intronic
chr2:24197662(+) A-I      intronic
chr2:24194383(+) A-I      intronic
chr2:24180345(+) A-I      intronic
chr2:24221648(+) A-I      intronic
chr2:24212295(+) A-I      intronic
chr2:24221653(+) A-I      intronic
chr2:24223463(+) A-I      3'UTR
chr2:24224720(+) A-I      3'UTR
chr2:24224134(+) A-I      3'UTR
chr2:24225541(+) A-I      3'UTR
chr2:24225406(+) A-I      3'UTR
chr2:24224137(+) A-I      3'UTR
chr2:24225329(+) A-I      3'UTR
chr2:24224883(+) A-I      3'UTR
chr2:24224574(+) A-I      3'UTR
chr2:24225128(+) A-I      3'UTR
chr2:24225181(+) A-I      3'UTR
chr2:24224642(+) A-I      3'UTR
chr2:24227271(+) A-I      3'UTR
chr2:24225445(+) A-I      3'UTR
chr2:24223252(+) A-I      3'UTR
chr2:24223236(+) A-I      3'UTR
chr2:24224040(+) A-I      3'UTR
chr2:24225554(+) A-I      3'UTR
chr2:24225043(+) A-I      3'UTR
chr2:24223324(+) A-I      3'UTR
chr2:24225006(+) A-I      3'UTR
chr2:24224136(+) A-I      3'UTR
chr2:24225177(+) A-I      3'UTR
chr2:24224700(+) A-I      3'UTR
chr2:24223318(+) A-I      3'UTR
chr2:24225337(+) A-I      3'UTR
chr2:24227279(+) A-I      3'UTR
chr2:24224900(+) A-I      3'UTR
chr2:24223159(+) A-I      3'UTR
chr2:24225460(+) A-I      3'UTR
chr2:24225467(+) A-I      3'UTR
chr2:24223301(+) A-I      3'UTR
chr2:24225435(+) A-I      3'UTR
chr2:24225125(+) A-I      3'UTR
chr2:24225098(+) A-I      3'UTR
chr2:24225099(+) A-I      3'UTR
chr2:24224969(+) A-I      3'UTR
chr2:24224026(+) A-I      3'UTR
chr2:24224111(+) A-I      3'UTR
chr2:24225324(+) A-I      3'UTR
chr2:24224667(+) A-I      3'UTR
chr2:24225171(+) A-I      3'UTR
chr2:24225119(+) A-I      3'UTR
chr2:24223382(+) A-I      3'UTR
chr2:24225116(+) A-I      3'UTR
chr2:24225013(+) A-I      3'UTR
chr2:24227403(+) A-I      3'UTR
chr2:24223247(+) A-I      3'UTR
chr2:24225331(+) A-I      3'UTR
chr2:24224839(+) A-I      3'UTR
chr2:24223189(+) A-I      3'UTR
chr2:24225115(+) A-I      3'UTR
chr2:24223254(+) A-I      3'UTR
chr2:24224971(+) A-I      3'UTR
chr2:24225355(+) A-I      3'UTR
chr2:24223158(+) A-I      3'UTR
chr2:24223167(+) A-I      3'UTR
chr2:24223142(+) A-I      3'UTR
chr2:24223368(+) A-I      3'UTR
chr2:24223905(+) A-I      3'UTR
chr2:24224801(+) A-I      3'UTR
chr2:24224618(+) A-I      3'UTR
chr2:24223939(+) A-I      3'UTR
chr2:24225501(+) A-I      3'UTR
chr2:24225144(+) A-I      3'UTR
chr2:24227377(+) A-I      3'UTR
chr2:24225409(+) A-I      3'UTR
chr2:24223225(+) A-I      3'UTR
chr2:24225336(+) A-I      3'UTR
chr2:24224043(+) A-I      3'UTR
chr2:24224034(+) A-I      3'UTR
chr2:24225122(+) A-I      3'UTR
chr2:24224057(+) A-I      3'UTR
chr2:24225502(+) A-I      3'UTR
chr2:24227373(+) A-I      3'UTR
chr2:24224871(+) A-I      3'UTR
chr2:24224144(+) A-I      3'UTR
chr2:24227387(+) A-I      3'UTR
chr2:24224580(+) A-I      3'UTR
chr2:24223251(+) A-I      3'UTR
chr2:24224737(+) A-I      3'UTR
chr2:24225050(+) A-I      3'UTR
chr2:24225124(+) A-I      3'UTR
chr2:24224776(+) A-I      3'UTR
chr2:24225509(+) A-I      3'UTR
chr2:24223213(+) A-I      3'UTR
chr2:24224781(+) A-I      3'UTR
chr2:24223241(+) A-I      3'UTR
chr2:24223990(+) A-I      3'UTR
chr2:24224892(+) A-I      3'UTR
chr2:24225380(+) A-I      3'UTR
chr2:24225200(+) A-I      3'UTR
chr2:24224684(+) A-I      3'UTR
chr2:24225540(+) A-I      3'UTR
chr2:24227348(+) A-I      3'UTR
chr2:24225542(+) A-I      3'UTR
chr2:24223256(+) A-I      3'UTR
chr2:24223962(+) A-I      3'UTR
chr2:24225514(+) A-I      3'UTR
chr2:24225113(+) A-I      3'UTR
chr2:24225361(+) A-I      3'UTR
chr2:24223314(+) A-I      3'UTR
chr2:24223250(+) A-I      3'UTR
chr2:24225563(+) A-I      3'UTR
chr2:24224619(+) A-I      3'UTR
chr2:24224122(+) A-I      3'UTR
chr2:24224566(+) A-I      3'UTR
chr2:24224783(+) A-I      3'UTR
chr2:24227535(+) A-I      3'UTR
chr2:24202621(+) A-I      intronic
chr2:24181971(+) A-I      intronic
chr2:24180273(+) A-I      intronic
chr2:24202586(+) A-I      intronic
chr2:24200802(+) A-I      intronic
chr2:24208260(+) A-I      intronic
chr2:24207904(+) A-I      intronic
chr2:24195989(+) A-I      intronic
chr2:24209923(+) A-I      intronic
chr2:24212306(+) A-I      intronic
chr2:24206257(+) A-I      intronic
chr2:24180253(+) A-I      intronic
chr2:24172487(+) A-I      intronic
chr2:24165454(+) A-I      intronic
chr2:24200461(+) A-I      intronic
chr2:24164800(+) A-I      intronic
chr2:24207875(+) A-I      intronic
chr2:24204539(+) A-I      intronic
chr2:24200426(+) A-I      intronic
chr2:24209752(+) A-I      intronic
chr2:24166099(+) A-I      intronic
chr2:24201765(+) A-I      intronic
chr2:24164836(+) A-I      intronic
chr2:24194727(+) A-I      intronic
chr2:24215114(+) A-I      intronic
chr2:24206289(+) A-I      intronic
chr2:24172264(+) A-I      intronic
chr2:24214625(+) A-I      intronic
chr2:24204568(+) A-I      intronic
chr2:24218376(+) A-I      intronic
chr2:24200286(+) A-I      intronic
chr2:24204061(+) A-I      intronic
chr2:24196007(+) A-I      intronic
chr2:24218869(+) A-I      intronic
chr2:24221316(+) A-I      intronic
chr2:24208029(+) A-I      intronic
chr2:24219139(+) A-I      intronic
chr2:24207876(+) A-I      intronic
chr2:24196019(+) A-I      intronic
chr2:24180584(+) A-I      intronic
chr2:24184984(+) A-I      intronic
chr2:24186265(+) A-I      intronic
chr2:24196029(+) A-I      intronic
chr2:24182312(+) A-I      intronic
chr2:24164787(+) A-I      intronic
chr2:24221410(+) A-I      intronic
chr2:24182231(+) A-I      intronic
chr2:24172702(+) A-I      intronic
chr2:24188027(+) A-I      intronic
chr2:24220866(+) A-I      intronic
chr2:24208384(+) A-I      intronic
chr2:24207822(+) A-I      intronic
chr2:24221643(+) A-I      intronic
chr2:24204683(+) A-I      intronic
chr2:24197851(+) A-I      intronic
chr2:24200431(+) A-I      intronic
chr2:24210846(+) A-I      intronic
chr2:24209578(+) A-I      intronic
chr2:24218409(+) A-I      intronic
chr2:24197702(+) A-I      intronic
chr2:24206663(+) A-I      intronic
chr2:24164782(+) A-I      intronic
chr2:24221696(+) A-I      intronic
chr2:24190888(+) A-I      intronic
chr2:24221328(+) A-I      intronic
chr2:24200391(+) A-I      intronic
chr2:24208357(+) A-I      intronic
chr2:24209912(+) A-I      intronic
chr2:24222370(+) A-I      intronic
chr2:24221389(+) A-I      intronic
chr2:24200494(+) A-I      intronic
chr2:24192963(+) A-I      intronic
chr2:24201363(+) A-I      intronic
chr2:24205063(+) A-I      intronic
chr2:24194808(+) A-I      intronic
chr2:24200296(+) A-I      intronic
chr2:24172192(+) A-I      intronic
chr2:24171864(+) A-I      intronic
chr2:24212343(+) A-I      intronic
chr2:24202566(+) A-I      intronic
chr2:24186881(+) A-I      intronic
chr2:24220461(+) A-I      intronic
chr2:24180549(+) A-I      intronic
chr2:24208923(+) A-I      intronic
chr2:24200755(+) A-I      intronic
chr2:24165890(+) A-I      intronic
chr2:24212397(+) A-I      intronic
chr2:24206649(+) A-I      intronic
chr2:24221593(+) A-I      intronic
chr2:24207912(+) A-I      intronic
chr2:24204136(+) A-I      intronic
chr2:24171936(+) A-I      intronic
chr2:24173386(+) A-I      intronic
chr2:24169986(+) A-I      intronic
chr2:24184511(+) A-I      intronic
chr2:24221669(+) A-I      intronic
chr2:24200933(+) A-I      intronic
chr2:24194462(+) A-I      intronic
chr2:24203697(+) A-I      intronic
chr2:24219994(+) A-I      intronic
chr2:24187181(+) A-I      intronic
chr2:24198588(+) A-I      intronic
chr2:24172230(+) A-I      intronic
chr2:24197729(+) A-I      intronic
chr2:24197693(+) A-I      intronic
chr2:24221438(+) A-I      intronic
chr2:24166072(+) A-I      intronic
chr2:24208030(+) A-I      intronic
chr2:24180242(+) A-I      intronic
chr2:24171859(+) A-I      intronic
chr2:24218551(+) A-I      intronic
chr2:24186817(+) A-I      intronic
chr2:24203598(+) A-I      intronic
chr2:24166414(+) A-I      intronic
chr2:24166010(+) A-I      intronic
chr2:24219981(+) A-I      intronic
chr2:24218830(+) A-I      intronic
chr2:24192169(+) A-I      intronic
chr2:24212511(+) A-I      intronic
chr2:24218404(+) A-I      intronic
chr2:24195490(+) A-I      intronic
chr2:24188024(+) A-I      intronic
chr2:24207833(+) A-I      intronic
chr2:24212573(+) A-I      intronic
chr2:24206298(+) A-I      intronic
chr2:24208664(+) A-I      intronic
chr2:24184652(+) A-I      intronic
chr2:24200501(+) A-I      intronic
chr2:24212235(+) A-I      intronic
chr2:24203719(+) A-I      intronic
chr2:24186927(+) A-I      intronic
chr2:24192928(+) A-I      intronic
chr2:24164791(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED UBXN2A
chr2:24223251(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324
chr2:24223253(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr2:24223254(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr2:24223256(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324
chr2:24223314(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr2:24223353(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr2:24223368(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr2:24223382(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr2:24223159(+) A-I intron -    22327324
chr2:24223265(+) A-I intron -    22327324
chr2:24223341(+) A-I intron -    21960545
chr2:24223256(+) A-G intron -    21725310   //22484847
chr2:24164791(+) A-G intron -    22484847
chr2:24165890(+) A-G intron -    22484847
chr2:24165926(+) A-G intron -    22484847
chr2:24165951(+) G-A intron -    22484847
chr2:24166086(+) A-G intron -    22484847
chr2:24166414(+) A-G intron -    22484847
chr2:24166502(+) T-C intron -    22484847
chr2:24171834(+) A-G intron -    22484847
chr2:24171864(+) A-G intron -    22484847
chr2:24171928(+) A-G intron -    22484847
chr2:24171936(+) A-G intron -    22484847
chr2:24172192(+) A-G intron -    22484847
chr2:24172264(+) A-G intron -    22484847
chr2:24172689(+) A-G intron -    22484847
chr2:24172702(+) A-G intron -    22484847
chr2:24180242(+) A-G intron -    22484847
chr2:24180266(+) A-G intron -    22484847
chr2:24180273(+) A-G intron -    22484847
chr2:24180303(+) A-G intron -    22484847
chr2:24180409(+) A-G intron -    22484847
chr2:24180584(+) A-G intron -    22484847
chr2:24182231(+) A-G intron -    22484847
chr2:24182868(+) A-G intron -    22484847
chr2:24183524(+) A-G intron -    22484847
chr2:24183637(+) A-G intron -    22484847
chr2:24184511(+) A-G intron -    22484847
chr2:24184984(+) A-G intron -    22484847
chr2:24185615(+) A-G intron -    22484847
chr2:24185656(+) A-G intron -    22484847
chr2:24185756(+) A-G intron -    22484847
chr2:24187181(+) A-G intron -    22484847
chr2:24187342(+) A-G intron -    22484847
chr2:24187354(+) A-G intron -    22484847
chr2:24188024(+) A-G intron -    22484847
chr2:24190888(+) A-G intron -    22484847
chr2:24190896(+) A-G intron -    22484847
chr2:24192169(+) A-G intron -    22484847
chr2:24192350(+) A-G intron -    22484847
chr2:24194383(+) A-G intron -    22484847
chr2:24194428(+) A-G intron -    22484847
chr2:24194543(+) A-G intron -    22484847
chr2:24194727(+) A-G intron -    22484847
chr2:24194740(+) A-G intron -    22484847
chr2:24195490(+) A-G intron -    22484847
chr2:24195506(+) A-G intron -    22484847
chr2:24195545(+) A-G intron -    22484847
chr2:24195951(+) A-G intron -    22484847
chr2:24197729(+) A-G intron -    22484847
chr2:24200460(+) A-G intron -    22484847
chr2:24200494(+) A-G intron -    22484847
chr2:24200501(+) A-G intron -    22484847
chr2:24200755(+) A-G intron -    22484847
chr2:24200819(+) A-G intron -    22484847
chr2:24200841(+) A-G intron -    22484847
chr2:24200898(+) A-G intron -    22484847
chr2:24200933(+) A-G intron -    22484847
chr2:24202646(+) A-G intron -    22484847
chr2:24206649(+) A-G intron -    22484847
chr2:24206685(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207791(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207795(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207820(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207841(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207851(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207872(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207875(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207876(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207904(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207910(+) A-G intron -    22484847
chr2:24207912(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208060(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208260(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208390(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208595(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208664(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208727(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208728(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208779(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208923(+) A-G intron -    22484847
chr2:24208924(+) A-G intron -    22484847
chr2:24209577(+) A-G intron -    22484847
chr2:24209923(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212220(+) T-C intron -    22484847
chr2:24212235(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212295(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212306(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212391(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212397(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212511(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212553(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212573(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212717(+) A-G intron -    22484847
chr2:24212719(+) A-G intron -    22484847
chr2:24213373(+) A-G intron -    22484847
chr2:24214526(+) A-G intron -    22484847
chr2:24214564(+) A-G intron -    22484847
chr2:24214762(+) A-G intron -    22484847
chr2:24218336(+) C-G intron -    22484847
chr2:24218345(+) A-G intron -    22484847
chr2:24218374(+) A-G intron -    22484847
chr2:24218376(+) A-G intron -    22484847
chr2:24218382(+) A-G intron -    22484847
chr2:24218416(+) A-G intron -    22484847
chr2:24218442(+) A-G intron -    22484847
chr2:24218869(+) A-G intron -    22484847
chr2:24218998(+) A-G intron -    22484847
chr2:24219395(+) G-A intron -    22484847
chr2:24219408(+) A-G intron -    22484847
chr2:24219994(+) A-G intron -    22484847
chr2:24220027(+) A-G intron -    22484847
chr2:24220422(+) A-G intron -    22484847
chr2:24220501(+) A-G intron -    22484847
chr2:24220865(+) A-G intron -    22484847
chr2:24220866(+) A-G intron -    22484847
chr2:24221349(+) A-G intron -    22484847
chr2:24221424(+) A-G intron -    22484847
chr2:24221470(+) A-G intron -    22484847
chr2:24221648(+) A-G intron -    22484847
chr2:24221653(+) A-G intron -    22484847
chr2:24221669(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223142(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223159(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223166(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223167(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223189(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223225(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223241(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223247(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223250(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223251(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223252(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223278(+) G-T intron -    22484847
chr2:24223353(+) A-G intron -    22484847
chr2:24223463(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase UBXN2A
chr2:24150196-24150197(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863
chr2:24150268-24150269(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22608085
chr2:24150392-24150393(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863//22608085
chr2:24150399-24150400(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863//22608085
chr2:24150480-24150481(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863//22608085
chr2:24199929-24199930(+) m6A CDS//exon       -
chr2:24199979-24199980(+) m6A exon//intron       -
chr2:24199986-24199987(+) m6A exon//intron       -
chr2:24222558-24222559(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960//22608085
chr2:24222644-24222645(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:24222694-24222695(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr2:24222704-24222705(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr2:24222721-24222722(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr2:24222747-24222748(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr2:24222788-24222789(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr2:24222796-24222797(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085
chr2:24222823-24222824(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr2:24222832-24222833(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr2:24222855-24222856(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr2:24222918-24222919(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24222946-24222947(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:24222963-24222964(+) m6A 3'UTR//exon       24209618//24981863//22608085
chr2:24223182-24223183(+) m6A 3'UTR//exon       -
chr2:24223212-24223213(+) m6A 3'UTR//exon       -
chr2:24223225-24223226(+) m6A 3'UTR//exon       -
chr2:24223235-24223236(+) m6A 3'UTR//exon       -
chr2:24223332-24223333(+) m6A 3'UTR//exon       24981863
chr2:24223400-24223401(+) m6A 3'UTR//exon       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate UBXN2A
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-UL70-5p
Interactor2: UBXN2A

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//RNAHybrid
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...