Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00244520

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL70-5p:           AGAP1:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-UL70-5p AGAP1
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0003342 116987
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - AGAP-1//CENTG2//cnt-g2//GGAP1

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR AGAP1
chr2:236798996(+) A-I      intronic
chr2:236798950(+) A-I      intronic
chr2:236511693(+) A-I      intronic
chr2:236546050(+) A-I      intronic
chr2:236559568(+) A-I      intronic
chr2:236496697(+) A-I      intronic
chr2:236496698(+) A-I      intronic
chr2:236496709(+) A-I      intronic
chr2:236534891(+) A-I      intronic
chr2:236496712(+) A-I      intronic
chr2:236559560(+) A-I      intronic
chr2:236498711(+) A-I      intronic
chr2:236498708(+) A-I      intronic
chr2:236496759(+) A-I      intronic
chr2:236798976(+) A-I      intronic
chr2:236559566(+) A-I      intronic
chr2:236878699(+) A-I      intronic
chr2:236878715(+) A-I      intronic
chr2:236510027(+) A-I      intronic
chr2:236878725(+) A-I      intronic
chr2:236878735(+) A-I      intronic
chr2:236878740(+) A-I      intronic
chr2:236511694(+) A-I      intronic
chr2:236878771(+) A-I      intronic
chr2:236510030(+) A-I      intronic
chr2:236510031(+) A-I      intronic
chr2:236510060(+) A-I      intronic
chr2:236510069(+) A-I      intronic
chr2:236510074(+) A-I      intronic
chr2:236510223(+) A-I      intronic
chr2:236510235(+) A-I      intronic
chr2:236510240(+) A-I      intronic
chr2:236510245(+) A-I      intronic
chr2:236510255(+) A-I      intronic
chr2:236510261(+) A-I      intronic
chr2:236510262(+) A-I      intronic
chr2:236510268(+) A-I      intronic
chr2:236510271(+) A-I      intronic
chr2:236798988(+) A-I      intronic
chr2:236511692(+) A-I      intronic
chr2:236511688(+) A-I      intronic
chr2:236510305(+) A-I      intronic
chr2:236510066(+) A-I      intronic
chr2:236558115(+) A-I      intronic
chr2:236557446(+) A-I      intronic
chr2:236556149(+) A-I      intronic
chr2:236554718(+) A-I      intronic
chr2:236554709(+) A-I      intronic
chr2:236554704(+) A-I      intronic
chr2:236554688(+) A-I      intronic
chr2:236553759(+) A-I      intronic
chr2:236553749(+) A-I      intronic
chr2:236553740(+) A-I      intronic
chr2:236553723(+) A-I      intronic
chr2:236553692(+) A-I      intronic
chr2:236669253(+) A-I      intronic
chr2:236553579(+) A-I      intronic
chr2:236552020(+) A-I      intronic
chr2:236551928(+) A-I      intronic
chr2:236551889(+) A-I      intronic
chr2:236551879(+) A-I      intronic
chr2:236545931(+) A-I      intronic
chr2:236538312(+) A-I      intronic
chr2:236538279(+) A-I      intronic
chr2:236538251(+) A-I      intronic
chr2:236534922(+) A-I      intronic
chr2:236503357(+) A-I      intronic
chr2:236502361(+) A-I      intronic
chr2:236498760(+) A-I      intronic
chr2:236498589(+) A-I      intronic
chr2:236490313(+) A-I      intronic
chr2:236483557(+) A-I      intronic
chr2:236481773(+) A-I      intronic
chr2:236474446(+) A-I      intronic
chr2:236474441(+) A-I      intronic
chr2:236457203(+) A-I      intronic
chr2:236457176(+) A-I      intronic
chr2:236457154(+) A-I      intronic
chr2:236428566(+) A-I      intronic
chr2:236426510(+) A-I      intronic
chr2:236426356(+) A-I      intronic
chr2:236420963(+) A-I      intronic
chr2:236534908(+) A-I      intronic
chr2:236515442(+) A-I      intronic
chr2:236515436(+) A-I      intronic
chr2:236515434(+) A-I      intronic
chr2:236513072(+) A-I      intronic
chr2:236513070(+) A-I      intronic
chr2:236513069(+) A-I      intronic
chr2:236553669(+) A-I      intronic
chr2:236978207(+) A-I      intronic
chr2:237020356(+) A-I      intronic
chr2:237009380(+) A-I      intronic
chr2:237009207(+) A-I      intronic
chr2:237007487(+) A-I      intronic
chr2:237003500(+) A-I      intronic
chr2:237003231(+) A-I      intronic
chr2:237003186(+) A-I      intronic
chr2:237001179(+) A-I      intronic
chr2:237000266(+) A-I      intronic
chr2:237000261(+) A-I      intronic
chr2:237000258(+) A-I      intronic
chr2:237000257(+) A-I      intronic
chr2:236993675(+) A-I      intronic
chr2:236993671(+) A-I      intronic
chr2:236993670(+) A-I      intronic
chr2:236983623(+) A-I      intronic
chr2:236980874(+) A-I      intronic
chr2:236980836(+) A-I      intronic
chr2:236978194(+) A-I      intronic
chr2:236977595(+) A-I      intronic
chr2:236977594(+) A-I      intronic
chr2:236513005(+) A-I      intronic
chr2:236511485(+) A-I      intronic
chr2:236977575(+) A-I      intronic
chr2:236977190(+) A-I      intronic
chr2:236976732(+) A-I      intronic
chr2:236976682(+) A-I      intronic
chr2:236955522(+) A-I      intronic
chr2:236905895(+) A-I      intronic
chr2:236905864(+) A-I      intronic
chr2:236903525(+) A-I      intronic
chr2:236903524(+) A-I      intronic
chr2:236903491(+) A-I      intronic
chr2:236778125(+) A-I      intronic
chr2:236778114(+) A-I      intronic
chr2:236746742(+) A-I      intronic
chr2:236746737(+) A-I      intronic
chr2:236725315(+) A-I      intronic
chr2:236668775(+) A-I      intronic
chr2:236668770(+) A-I      intronic
chr2:236668769(+) A-I      intronic
chr2:236668763(+) A-I      intronic
chr2:236662200(+) A-I      intronic
chr2:236662189(+) A-I      intronic
chr2:236662184(+) A-I      intronic
chr2:236662102(+) A-I      intronic
chr2:236662077(+) A-I      intronic
chr2:236651652(+) A-I      intronic
chr2:236651646(+) A-I      intronic
chr2:236650604(+) A-I      intronic
chr2:236609359(+) A-I      intronic
chr2:236605481(+) A-I      intronic
chr2:236605446(+) A-I      intronic
chr2:236592899(+) A-I      intronic
chr2:236592895(+) A-I      intronic
chr2:236592875(+) A-I      intronic
chr2:236592873(+) A-I      intronic
chr2:236591789(+) A-I      intronic
chr2:236591786(+) A-I      intronic
chr2:236573810(+) A-I      intronic
chr2:236559775(+) A-I      intronic
chr2:236559751(+) A-I      intronic
chr2:236559746(+) A-I      intronic
chr2:236559614(+) A-I      intronic
chr2:236558951(+) A-I      intronic
chr2:236558911(+) A-I      intronic
chr2:236558866(+) A-I      intronic
chr2:236558772(+) A-I      intronic
chr2:236558756(+) A-I      intronic
chr2:236558288(+) A-I      intronic
chr2:236558130(+) A-I      intronic
chr2:236554679(+) A-I      intronic
chr2:236727292(+) A-I      intronic
chr2:236558054(+) A-I      intronic
chr2:236727351(+) A-I      intronic
chr2:236421096(+) A-I      intronic
chr2:236457182(+) A-I      intronic
chr2:236938406(+) A-I      intronic
chr2:236779150(+) A-I      intronic
chr2:236661020(+) A-I      intronic
chr2:236660987(+) A-I      intronic
chr2:236929554(+) A-I      intronic
chr2:237005380(+) A-I      intronic
chr2:236557514(+) A-I      intronic
chr2:236603307(+) A-I      intronic
chr2:236467679(+) A-I      intronic
chr2:236986092(+) A-I      intronic
chr2:236496715(+) A-I      intronic
chr2:236955612(+) A-I      intronic
chr2:236556215(+) A-I      intronic
chr2:237012313(+) A-I      intronic
chr2:236980875(+) A-I      intronic
chr2:236554769(+) A-I      intronic
chr2:236977621(+) A-I      intronic
chr2:236483636(+) A-I      intronic
chr2:236930623(+) A-I      intronic
chr2:237013347(+) A-I      intronic
chr2:236651691(+) A-I      intronic
chr2:236613169(+) A-I      intronic
chr2:236993401(+) A-I      intronic
chr2:236956373(+) A-I      intronic
chr2:237010668(+) A-I      intronic
chr2:236554711(+) A-I      intronic
chr2:236931253(+) A-I      intronic
chr2:237003792(+) A-I      intronic
chr2:236956369(+) A-I      intronic
chr2:236971944(+) A-I      intronic
chr2:236727187(+) A-I      intronic
chr2:236558921(+) A-I      intronic
chr2:236800677(+) A-I      intronic
chr2:237011112(+) A-I      intronic
chr2:236798898(+) A-I      intronic
chr2:236903527(+) A-I      intronic
chr2:236852268(+) A-I      intronic
chr2:236952206(+) A-I      intronic
chr2:236497906(+) A-I      intronic
chr2:236459640(+) A-I      intronic
chr2:236810412(+) A-I      intronic
chr2:237025044(+) A-I      intronic
chr2:236483644(+) A-I      intronic
chr2:236513793(+) A-I      intronic
chr2:236609378(+) A-I      intronic
chr2:236930478(+) A-I      intronic
chr2:236971199(+) A-I      intronic
chr2:236556171(+) A-I      intronic
chr2:237007014(+) A-I      intronic
chr2:236852168(+) A-I      intronic
chr2:236725414(+) A-I      intronic
chr2:237011237(+) A-I      intronic
chr2:237024544(+) A-I      intronic
chr2:236651547(+) A-I      intronic
chr2:236502353(+) A-I      intronic
chr2:236421115(+) A-I      intronic
chr2:237004962(+) A-I      intronic
chr2:236952184(+) A-I      intronic
chr2:236685928(+) A-I      intronic
chr2:236421163(+) A-I      intronic
chr2:236551954(+) A-I      intronic
chr2:236779275(+) A-I      intronic
chr2:236426487(+) A-I      intronic
chr2:236490409(+) A-I      intronic
chr2:236498664(+) A-I      intronic
chr2:236727135(+) A-I      intronic
chr2:236421040(+) A-I      intronic
chr2:237005031(+) A-I      intronic
chr2:237007369(+) A-I      intronic
chr2:236538433(+) A-I      intronic
chr2:236660925(+) A-I      intronic
chr2:236554799(+) A-I      intronic
chr2:236546161(+) A-I      intronic
chr2:236498690(+) A-I      intronic
chr2:236556204(+) A-I      intronic
chr2:236499760(+) A-I      intronic
chr2:237003785(+) A-I      intronic
chr2:236489831(+) A-I      intronic
chr2:236559745(+) A-I      intronic
chr2:236492173(+) A-I      intronic
chr2:237006149(+) A-I      intronic
chr2:236498125(+) A-I      intronic
chr2:236903456(+) A-I      intronic
chr2:236503355(+) A-I      intronic
chr2:236474417(+) A-I      intronic
chr2:236986063(+) A-I      intronic
chr2:236700398(+) A-I      intronic
chr2:236971445(+) A-I      intronic
chr2:236903449(+) A-I      intronic
chr2:236427786(+) A-I      intronic
chr2:236457088(+) A-I      intronic
chr2:236538334(+) A-I      intronic
chr2:236983576(+) A-I      intronic
chr2:236662187(+) A-I      intronic
chr2:236651549(+) A-I      intronic
chr2:236558049(+) A-I      intronic
chr2:236670606(+) A-I      intronic
chr2:236727348(+) A-I      intronic
chr2:236931308(+) A-I      intronic
chr2:236955634(+) A-I      intronic
chr2:236573139(+) A-I      intronic
chr2:237012471(+) A-I      intronic
chr2:237006237(+) A-I      intronic
chr2:236498625(+) A-I      intronic
chr2:236603172(+) A-I      intronic
chr2:237003538(+) A-I      intronic
chr2:237014515(+) A-I      intronic
chr2:236852160(+) A-I      intronic
chr2:236538311(+) A-I      intronic
chr2:236546178(+) A-I      intronic
chr2:236903569(+) A-I      intronic
chr2:236553640(+) A-I      intronic
chr2:236534934(+) A-I      intronic
chr2:236515482(+) A-I      intronic
chr2:236590633(+) A-I      intronic
chr2:236422042(+) A-I      intronic
chr2:236870390(+) A-I      intronic
chr2:236904006(+) A-I      intronic
chr2:236941689(+) A-I      intronic
chr2:236538914(+) A-I      intronic
chr2:236552058(+) A-I      intronic
chr2:236558236(+) A-I      intronic
chr2:236556294(+) A-I      intronic
chr2:236976902(+) A-I      intronic
chr2:237024724(+) A-I      intronic
chr2:236793592(+) A-I      intronic
chr2:236941801(+) A-I      intronic
chr2:236650475(+) A-I      intronic
chr2:236558884(+) A-I      intronic
chr2:236558820(+) A-I      intronic
chr2:236511608(+) A-I      intronic
chr2:236952277(+) A-I      intronic
chr2:236558079(+) A-I      intronic
chr2:236426434(+) A-I      intronic
chr2:236538429(+) A-I      intronic
chr2:236535969(+) A-I      intronic
chr2:236985028(+) A-I      intronic
chr2:236986062(+) A-I      intronic
chr2:237007529(+) A-I      intronic
chr2:236546200(+) A-I      intronic
chr2:236421201(+) A-I      intronic
chr2:236662251(+) A-I      intronic
chr2:236427850(+) A-I      intronic
chr2:236613104(+) A-I      intronic
chr2:237007933(+) A-I      intronic
chr2:236503427(+) A-I      intronic
chr2:237006996(+) A-I      intronic
chr2:236480470(+) A-I      intronic
chr2:236457083(+) A-I      intronic
chr2:236925747(+) A-I      intronic
chr2:236502474(+) A-I      intronic
chr2:237008585(+) A-I      intronic
chr2:236414979(+) A-I      intronic
chr2:236969632(+) A-I      intronic
chr2:236538883(+) A-I      intronic
chr2:236481778(+) A-I      intronic
chr2:236661091(+) A-I      intronic
chr2:236931340(+) A-I      intronic
chr2:236513796(+) A-I      intronic
chr2:236669359(+) A-I      intronic
chr2:237001141(+) A-I      intronic
chr2:237007338(+) A-I      intronic
chr2:236986037(+) A-I      intronic
chr2:236534811(+) A-I      intronic
chr2:236428483(+) A-I      intronic
chr2:236903455(+) A-I      intronic
chr2:236498604(+) A-I      intronic
chr2:236483512(+) A-I      intronic
chr2:237003455(+) A-I      intronic
chr2:236952286(+) A-I      intronic
chr2:236727402(+) A-I      intronic
chr2:236662223(+) A-I      intronic
chr2:236554768(+) A-I      intronic
chr2:237009319(+) A-I      intronic
chr2:236983443(+) A-I      intronic
chr2:236932814(+) A-I      intronic
chr2:237007519(+) A-I      intronic
chr2:237001137(+) A-I      intronic
chr2:236595472(+) A-I      intronic
chr2:236537585(+) A-I      intronic
chr2:236952116(+) A-I      intronic
chr2:236726334(+) A-I      intronic
chr2:236426425(+) A-I      intronic
chr2:237005414(+) A-I      intronic
chr2:236670674(+) A-I      intronic
chr2:236667651(+) A-I      intronic
chr2:236660848(+) A-I      intronic
chr2:236558152(+) A-I      intronic
chr2:236984972(+) A-I      intronic
chr2:236591744(+) A-I      intronic
chr2:236993740(+) A-I      intronic
chr2:236498594(+) A-I      intronic
chr2:236483724(+) A-I      intronic
chr2:237009313(+) A-I      intronic
chr2:236573623(+) A-I      intronic
chr2:236669363(+) A-I      intronic
chr2:236573601(+) A-I      intronic
chr2:236502352(+) A-I      intronic
chr2:236426461(+) A-I      intronic
chr2:236426422(+) A-I      intronic
chr2:236492400(+) A-I      intronic
chr2:236670659(+) A-I      intronic
chr2:236503401(+) A-I      intronic
chr2:236669467(+) A-I      intronic
chr2:236985494(+) A-I      intronic
chr2:236558885(+) A-I      intronic
chr2:236502457(+) A-I      intronic
chr2:236725415(+) A-I      intronic
chr2:236502492(+) A-I      intronic
chr2:236440539(+) A-I      intronic
chr2:236422007(+) A-I      intronic
chr2:236973119(+) A-I      intronic
chr2:236538882(+) A-I      intronic
chr2:236536130(+) A-I      intronic
chr2:236422044(+) A-I      intronic
chr2:237006966(+) A-I      intronic
chr2:236726280(+) A-I      intronic
chr2:236938431(+) A-I      intronic
chr2:237003076(+) A-I      intronic
chr2:236545986(+) A-I      intronic
chr2:236573136(+) A-I      intronic
chr2:236977691(+) A-I      intronic
chr2:236538465(+) A-I      intronic
chr2:237010994(+) A-I      intronic
chr2:237006220(+) A-I      intronic
chr2:236534881(+) A-I      intronic
chr2:236545996(+) A-I      intronic
chr2:236426420(+) A-I      intronic
chr2:236981372(+) A-I      intronic
chr2:236903600(+) A-I      intronic
chr2:236511567(+) A-I      intronic
chr2:236481949(+) A-I      intronic
chr2:236481790(+) A-I      intronic
chr2:236971831(+) A-I      intronic
chr2:236558840(+) A-I      intronic
chr2:236502426(+) A-I      intronic
chr2:236538331(+) A-I      intronic
chr2:236457287(+) A-I      intronic
chr2:236983534(+) A-I      intronic
chr2:237006176(+) A-I      intronic
chr2:236414996(+) A-I      intronic
chr2:236554659(+) A-I      intronic
chr2:236492546(+) A-I      intronic
chr2:236999566(+) A-I      intronic
chr2:236977624(+) A-I      intronic
chr2:236552025(+) A-I      intronic
chr2:236534764(+) A-I      intronic
chr2:236503418(+) A-I      intronic
chr2:236556295(+) A-I      intronic
chr2:236993409(+) A-I      intronic
chr2:236983606(+) A-I      intronic
chr2:237012314(+) A-I      intronic
chr2:236852094(+) A-I      intronic
chr2:236490377(+) A-I      intronic
chr2:236426466(+) A-I      intronic
chr2:236414704(+) A-I      intronic
chr2:236502552(+) A-I      intronic
chr2:236426419(+) A-I      intronic
chr2:236512942(+) A-I      intronic
chr2:236779181(+) A-I      intronic
chr2:236426527(+) A-I      intronic
chr2:237005408(+) A-I      intronic
chr2:236667700(+) A-I      intronic
chr2:236551824(+) A-I      intronic
chr2:236492266(+) A-I      intronic
chr2:236538257(+) A-I      intronic
chr2:236725432(+) A-I      intronic
chr2:236573655(+) A-I      intronic
chr2:237003509(+) A-I      intronic
chr2:236554712(+) A-I      intronic
chr2:236558268(+) A-I      intronic
chr2:237003658(+) A-I      intronic
chr2:236726376(+) A-I      intronic
chr2:237010740(+) A-I      intronic
chr2:236557384(+) A-I      intronic
chr2:236534957(+) A-I      intronic
chr2:236474434(+) A-I      intronic
chr2:236415042(+) A-I      intronic
chr2:236499764(+) A-I      intronic
chr2:236971943(+) A-I      intronic
chr2:237003865(+) A-I      intronic
chr2:236559617(+) A-I      intronic
chr2:237003842(+) A-I      intronic
chr2:236544636(+) A-I      intronic
chr2:236496353(+) A-I      intronic
chr2:236554831(+) A-I      intronic
chr2:236983435(+) A-I      intronic
chr2:236538304(+) A-I      intronic
chr2:236969245(+) A-I      intronic
chr2:236426423(+) A-I      intronic
chr2:237019177(+) A-I      intronic
chr2:236978315(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED AGAP1
chr2:236638895(+) A-I intron -    19478186
chr2:236898806(+) A-I intron -    15342557
chr2:236899896(+) A-I intron -    15342557
chr2:236903455(+) A-I intron -    15342557
chr2:236903456(+) A-I intron -    15342557
chr2:236903527(+) A-I intron -    15342557
chr2:236903569(+) A-I intron -    15342557
chr2:236903580(+) A-I intron -    15342557
chr2:236903600(+) A-I intron -    15342557
chr2:236903618(+) A-I intron -    15342557
chr2:236413999(+) A-I intron -    21960545
chr2:236414947(+) A-I intron -    21960545
chr2:236420992(+) A-I intron -    21960545
chr2:236427740(+) A-I intron -    21960545
chr2:236428609(+) A-I intron -    21960545
chr2:236445332(+) A-I intron -    21960545
chr2:236463480(+) A-I intron -    21960545
chr2:236474434(+) A-I intron -    21960545
chr2:236483524(+) A-I intron -    21960545
chr2:236483576(+) A-I intron -    21960545
chr2:236490303(+) A-I intron -    21960545
chr2:236492534(+) A-I intron -    21960545
chr2:236493786(+) A-I intron -    21960545
chr2:236498690(+) A-I intron -    21960545
chr2:236502353(+) A-I intron -    21960545
chr2:236502492(+) A-I intron -    21960545
chr2:236510112(+) A-I intron -    21960545
chr2:236510196(+) A-I intron -    21960545
chr2:236510223(+) A-I intron -    21960545
chr2:236510245(+) A-I intron -    21960545
chr2:236510305(+) A-I intron -    21960545
chr2:236510310(+) A-I intron -    21960545
chr2:236510358(+) A-I intron -    21960545
chr2:236512003(+) A-I intron -    21960545
chr2:236515367(+) A-I intron -    21960545
chr2:236534729(+) A-I intron -    21960545
chr2:236534783(+) A-I intron -    21960545
chr2:236535969(+) A-I intron -    21960545
chr2:236538279(+) A-I intron -    21960545
chr2:236538938(+) A-I intron -    21960545
chr2:236538996(+) A-I intron -    21960545
chr2:236544487(+) A-I intron -    21960545
chr2:236545970(+) A-I intron -    21960545
chr2:236554798(+) A-I intron -    21960545
chr2:236554799(+) A-I intron -    21960545
chr2:236554804(+) A-I intron -    21960545
chr2:236556204(+) A-I intron -    21960545
chr2:236556215(+) A-I intron -    21960545
chr2:236556231(+) A-I intron -    21960545
chr2:236557392(+) A-I intron -    21960545
chr2:236558049(+) A-I intron -    21960545
chr2:236558268(+) A-I intron -    21960545
chr2:236558742(+) A-I intron -    21960545
chr2:236558751(+) A-I intron -    21960545
chr2:236558772(+) A-I intron -    21960545
chr2:236558866(+) A-I intron -    21960545
chr2:236559560(+) A-I intron -    21960545
chr2:236572682(+) A-I intron -    21960545
chr2:236607290(+) A-I intron -    21960545
chr2:236660853(+) A-I intron -    21960545
chr2:236669253(+) A-I intron -    21960545
chr2:236669359(+) A-I intron -    21960545
chr2:236669369(+) A-I intron -    21960545
chr2:236793626(+) A-I intron -    21960545
chr2:236815994(+) A-I intron -    21960545
chr2:236931308(+) A-I intron -    21960545
chr2:236953552(+) A-I intron -    21960545
chr2:236965870(+) A-I intron -    21960545
chr2:236969069(+) A-I intron -    21960545
chr2:236969187(+) A-I intron -    21960545
chr2:236971233(+) A-I intron -    21960545
chr2:236981222(+) A-I intron -    21960545
chr2:236983443(+) A-I intron -    21960545
chr2:236983539(+) A-I intron -    21960545
chr2:236983576(+) A-I intron -    21960545
chr2:236983590(+) A-I intron -    21960545
chr2:236983617(+) A-I intron -    21960545
chr2:237002857(+) A-I intron -    21960545
chr2:237002859(+) A-I intron -    21960545
chr2:237002860(+) A-I intron -    21960545
chr2:237003125(+) A-I intron -    21960545
chr2:237003231(+) A-I intron -    21960545
chr2:237003538(+) A-I intron -    21960545
chr2:237006958(+) A-I intron -    21960545
chr2:237007488(+) A-I intron -    21960545
chr2:237008420(+) A-I intron -    21960545
chr2:237008422(+) A-I intron -    21960545
chr2:236492266(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase AGAP1
chr2:236403334-236403335(+) m6A CDS       24284625
chr2:236403460-236403461(+) m6A CDS       24284625
chr2:236415942-236415943(+) m6A intron       25456834
chr2:236416031-236416032(+) m6A intron       25456834
chr2:236432983-236432984(+) m6A 5'UTR//intron       24284625
chr2:236578821-236578822(+) m6A CDS//intron       25456834//22608085
chr2:236578891-236578892(+) m6A CDS//intron       25456834//22608085
chr2:236578985-236578986(+) m6A CDS//intron       22608085
chr2:236579054-236579055(+) m6A CDS//intron       22608085
chr2:236579090-236579091(+) m6A CDS//intron       22608085
chr2:236579244-236579245(+) m6A CDS//intron       -
chr2:236579319-236579320(+) m6A CDS//intron       24209618//25456834//22608085
chr2:236579416-236579417(+) m6A CDS//intron       25456834//22608085
chr2:236579449-236579450(+) m6A CDS//intron       25456834//22608085
chr2:236579461-236579462(+) m6A CDS//intron       25456834//22608085
chr2:236817426-236817427(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr2:236817498-236817499(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr2:236817517-236817518(+) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr2:236839549-236839550(+) m6A CDS//intron       24284625//24981863
chr2:236923467-236923468(+) m6A CDS//intron       -
chr2:236923472-236923473(+) m6A CDS//intron       -
chr2:236945354-236945355(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625
chr2:236949258-236949259(+) m6A exon//intron       24284625
chr2:236957904-236957905(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       -
chr2:236957915-236957916(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       -
chr2:236957931-236957932(+) m6A exon//intron       -
chr2:237028951-237028952(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22575960
chr2:237029007-237029008(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625
chr2:237032599-237032600(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618
chr2:237032719-237032720(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:237032731-237032732(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:237032769-237032770(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:237032913-237032914(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237032926-237032927(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237032932-237032933(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237032965-237032966(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237032991-237032992(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237033001-237033002(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237033059-237033060(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr2:237033114-237033115(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237033184-237033185(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237033490-237033491(+) m6A 3'UTR//exon       24284625
chr2:237033621-237033622(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:237033656-237033657(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:237033668-237033669(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:237033712-237033713(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:237033807-237033808(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//22608085
chr2:237033915-237033916(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:237033947-237033948(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:237033958-237033959(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:237034030-237034031(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr2:237034128-237034129(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr2:237034193-237034194(+) Tm 3'UTR       -
chr2:237034223-237034224(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237034231-237034232(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237034266-237034267(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr2:237034312-237034313(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr2:237034326-237034327(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr2:237034456-237034457(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863
chr2:237034556-237034557(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863
chr2:237034563-237034564(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863
chr2:237034580-237034581(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//25456834//24981863
chr2:237034638-237034639(+) m6A 3'UTR       25456834
chr2:237039226-237039227(+) m6A 3'UTR       24981863
chr2:237039233-237039234(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate AGAP1
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-UL70-5p
Interactor2: AGAP1

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//RNAHybrid
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...