Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00244477

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL70-5p:  MIMAT0003342          MFSD4B:  NM_153369     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-UL70-5p	MFSD4B
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003342	91749
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	KIAA1919//NaGLT1//SLC60A2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MFSD4B	chr6:111591890(+) A-I      3'UTR chr6:111591954(+) A-I      3'UTR chr6:111588837(+) A-I      3'UTR chr6:111591960(+) A-I      3'UTR chr6:111588813(+) A-I      3'UTR chr6:111591969(+) A-I      3'UTR chr6:111590663(+) A-I      3'UTR chr6:111591973(+) A-I      3'UTR chr6:111591993(+) A-I      3'UTR chr6:111592008(+) A-I      3'UTR chr6:111592353(+) A-I      3'UTR chr6:111591842(+) A-I      3'UTR chr6:111592321(+) A-I      3'UTR chr6:111591631(+) A-I      3'UTR chr6:111591644(+) A-I      3'UTR chr6:111591833(+) A-I      3'UTR chr6:111592320(+) A-I      3'UTR chr6:111591841(+) A-I      3'UTR chr6:111591998(+) A-I      3'UTR chr6:111588841(+) A-I      3'UTR chr6:111591882(+) A-I      3'UTR chr6:111591883(+) A-I      3'UTR chr6:111591679(+) A-I      3'UTR chr6:111591872(+) A-I      3'UTR chr6:111590548(+) A-I      3'UTR chr6:111591884(+) A-I      3'UTR chr6:111590586(+) A-I      3'UTR chr6:111590539(+) A-I      3'UTR chr6:111590483(+) A-I      3'UTR chr6:111590482(+) A-I      3'UTR chr6:111590467(+) A-I      3'UTR chr6:111588944(+) A-I      3'UTR chr6:111588936(+) A-I      3'UTR chr6:111588930(+) A-I      3'UTR chr6:111588926(+) A-I      3'UTR chr6:111588913(+) A-I      3'UTR chr6:111591751(+) A-I      3'UTR chr6:111590650(+) A-I      3'UTR chr6:111588903(+) A-I      3'UTR chr6:111591806(+) A-I      3'UTR chr6:111588877(+) A-I      3'UTR chr6:111588847(+) A-I      3'UTR chr6:111590472(+) A-I      3'UTR chr6:111588794(+) A-I      3'UTR chr6:111590655(+) A-I      3'UTR chr6:111591648(+) A-I      3'UTR chr6:111590608(+) A-I      3'UTR chr6:111590459(+) A-I      3'UTR chr6:111591933(+) A-I      3'UTR chr6:111591897(+) A-I      3'UTR chr6:111590623(+) A-I      3'UTR chr6:111591856(+) A-I      3'UTR chr6:111591704(+) A-I      3'UTR chr6:111591660(+) A-I      3'UTR chr6:111590664(+) A-I      3'UTR chr6:111591867(+) A-I      3'UTR chr6:111588805(+) A-I      3'UTR chr6:111591857(+) A-I      3'UTR chr6:111591795(+) A-I      3'UTR chr6:111591699(+) A-I      3'UTR chr6:111590603(+) A-I      3'UTR chr6:111588770(+) A-I      3'UTR chr6:111591607(+) A-I      3'UTR chr6:111592334(+) A-I      3'UTR chr6:111588762(+) A-I      3'UTR chr6:111588979(+) A-I      3'UTR chr6:111591937(+) A-I      3'UTR chr6:111590507(+) A-I      3'UTR chr6:111590532(+) A-I      3'UTR chr6:111590677(+) A-I      3'UTR chr6:111591624(+) A-I      3'UTR chr6:111590583(+) A-I      3'UTR chr6:111591610(+) A-I      3'UTR chr6:111591676(+) A-I      3'UTR chr6:111591630(+) A-I      3'UTR chr6:111590569(+) A-I      3'UTR chr6:111591866(+) A-I      3'UTR chr6:111591685(+) A-I      3'UTR chr6:111591828(+) A-I      3'UTR chr6:111591865(+) A-I      3'UTR chr6:111589006(+) A-I      3'UTR chr6:111590638(+) A-I      3'UTR chr6:111590434(+) A-I      3'UTR chr6:111588753(+) A-I      3'UTR chr6:111591671(+) A-I      3'UTR chr6:111592049(+) A-I      3'UTR chr6:111590568(+) A-I      3'UTR chr6:111590542(+) A-I      3'UTR chr6:111588945(+) A-I      3'UTR chr6:111590529(+) A-I      3'UTR chr6:111588761(+) A-I      3'UTR chr6:111591783(+) A-I      3'UTR chr6:111589014(+) A-I      3'UTR chr6:111591881(+) A-I      3'UTR chr6:111591894(+) A-I      3'UTR chr6:111590503(+) A-I      3'UTR

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	MFSD4B	Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-UL70-5p
Interactor2: MFSD4B

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//RNAHybrid
Support Database	RepTar//VmiReg