Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00244142

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL70-5p:  MIMAT0003342          PIGX:  NM_001166304     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-UL70-5p	PIGX
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0003342	54965
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	PIG-X

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	PIGX	chr3:196441109(+) A-I      intronic chr3:196441086(+) A-I      intronic chr3:196440601(+) A-I      intronic chr3:196440446(+) A-I      intronic chr3:196460412(+) A-I      intronic chr3:196456821(+) A-I      intronic chr3:196456791(+) A-I      intronic chr3:196456782(+) A-I      intronic chr3:196456779(+) A-I      intronic chr3:196456776(+) A-I      intronic chr3:196456765(+) A-I      intronic chr3:196441063(+) A-I      intronic chr3:196460449(+) A-I      intronic chr3:196460435(+) A-I      intronic chr3:196460363(+) A-I      intronic chr3:196460356(+) A-I      intronic chr3:196460351(+) A-I      intronic chr3:196460343(+) A-I      intronic chr3:196456929(+) A-I      intronic chr3:196456928(+) A-I      intronic chr3:196456425(+) A-I      intronic chr3:196450953(+) A-I      intronic chr3:196450052(+) A-I      intronic chr3:196448579(+) A-I      intronic chr3:196445113(+) A-I      intronic chr3:196445061(+) A-I      intronic chr3:196445038(+) A-I      intronic chr3:196445034(+) A-I      intronic chr3:196445027(+) A-I      intronic chr3:196444057(+) A-I      intronic chr3:196444051(+) A-I      intronic chr3:196444049(+) A-I      intronic chr3:196444023(+) A-I      intronic chr3:196441791(+) A-I      intronic chr3:196441782(+) A-I      intronic chr3:196441518(+) A-I      intronic chr3:196441516(+) A-I      intronic chr3:196441269(+) A-I      intronic chr3:196441192(+) A-I      intronic chr3:196441184(+) A-I      intronic chr3:196461278(+) A-I      3'UTR chr3:196461313(+) A-I      3'UTR chr3:196461319(+) A-I      3'UTR chr3:196461258(+) A-I      3'UTR chr3:196461269(+) A-I      3'UTR chr3:196461273(+) A-I      3'UTR chr3:196461282(+) A-I      3'UTR chr3:196461272(+) A-I      3'UTR chr3:196461181(+) A-I      3'UTR chr3:196461204(+) A-I      3'UTR chr3:196461226(+) A-I      3'UTR chr3:196461233(+) A-I      3'UTR chr3:196461274(+) A-I      3'UTR chr3:196461275(+) A-I      3'UTR chr3:196448828(+) A-I      intronic chr3:196440299(+) A-I      intronic chr3:196456443(+) A-I      intronic chr3:196441177(+) A-I      intronic chr3:196446761(+) A-I      intronic chr3:196453087(+) A-I      intronic chr3:196442908(+) A-I      intronic chr3:196441215(+) A-I      intronic chr3:196441459(+) A-I      intronic chr3:196456750(+) A-I      intronic chr3:196458269(+) A-I      intronic chr3:196448393(+) A-I      intronic chr3:196441472(+) A-I      intronic chr3:196441553(+) A-I      intronic chr3:196457418(+) A-I      intronic chr3:196460440(+) A-I      intronic chr3:196450952(+) A-I      intronic chr3:196457498(+) A-I      intronic chr3:196448419(+) A-I      intronic chr3:196441212(+) A-I      intronic chr3:196448408(+) A-I      intronic chr3:196450007(+) A-I      intronic chr3:196462027(+) A-I      3'UTR chr3:196461234(+) A-I      3'UTR chr3:196461391(+) A-I      3'UTR chr3:196461228(+) A-I      3'UTR chr3:196461276(+) A-I      3'UTR chr3:196461355(+) A-I      3'UTR chr3:196461283(+) A-I      3'UTR chr3:196441605(+) A-I      intronic chr3:196456341(+) A-I      intronic chr3:196441085(+) A-I      intronic chr3:196456679(+) A-I      intronic chr3:196441800(+) A-I      intronic chr3:196441794(+) A-I      intronic chr3:196456083(+) A-I      intronic chr3:196442580(+) A-I      intronic chr3:196456474(+) A-I      intronic chr3:196440291(+) A-I      intronic chr3:196451083(+) A-I      intronic chr3:196448813(+) A-I      intronic chr3:196441592(+) A-I      intronic chr3:196460493(+) A-I      intronic chr3:196456057(+) A-I      intronic chr3:196457417(+) A-I      intronic chr3:196450091(+) A-I      intronic chr3:196441176(+) A-I      intronic chr3:196460422(+) A-I      intronic chr3:196460448(+) A-I      intronic chr3:196446760(+) A-I      intronic chr3:196441383(+) A-I      intronic chr3:196450013(+) A-I      intronic chr3:196440268(+) A-I      intronic chr3:196441433(+) A-I      intronic chr3:196440303(+) A-I      intronic chr3:196457468(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	PIGX	chr3:196461169(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr3:196461234(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545 chr3:196461283(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr3:196441073(+) A-G intron -    22484847 chr3:196441433(+) A-G intron -    22484847 chr3:196441459(+) A-G intron -    22484847 chr3:196441472(+) A-G intron -    22484847 chr3:196441517(+) A-G intron -    22484847 chr3:196441694(+) A-G intron -    22484847 chr3:196441715(+) A-G intron -    22484847 chr3:196442953(+) A-G intron -    22484847 chr3:196446760(+) A-G intron -    22484847 chr3:196446761(+) A-G intron -    22484847 chr3:196448419(+) A-G intron -    22484847 chr3:196450007(+) A-G intron -    22484847 chr3:196450013(+) A-G intron -    22484847 chr3:196450048(+) A-G intron -    22484847 chr3:196450053(+) A-G intron -    22484847 chr3:196450091(+) A-G intron -    22484847 chr3:196450144(+) G-A intron -    22484847 chr3:196450952(+) A-G intron -    22484847 chr3:196456750(+) A-G intron -    22484847 chr3:196461283(+) A-G intron -    22484847 chr3:196461355(+) A-G intron -    22484847 chr3:196461391(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	PIGX	chr3:196381471-196381472(+) m6A 5'UTR       - chr3:196381482-196381483(+) m6A 5'UTR       - chr3:196386724-196386725(+) m6A intron       - chr3:196386854-196386855(+) m6A intron       25456834 chr3:196386872-196386873(+) m6A intron       25456834 chr3:196386926-196386927(+) m6A intron       25456834 chr3:196386953-196386954(+) m6A intron       25456834 chr3:196386977-196386978(+) m6A intron       25456834 chr3:196387013-196387014(+) m6A intron       25456834 chr3:196387085-196387086(+) m6A intron       - chr3:196387178-196387179(+) m6A intron       - chr3:196387280-196387281(+) m6A intron       25456834 chr3:196387339-196387340(+) m6A intron       - chr3:196387379-196387380(+) m6A intron       - chr3:196387514-196387515(+) m6A intron       - chr3:196387526-196387527(+) m6A intron       25456834 chr3:196387586-196387587(+) m6A intron       25456834 chr3:196387658-196387659(+) m6A intron       25456834 chr3:196387793-196387794(+) m6A intron       25456834 chr3:196387856-196387857(+) m6A intron       25456834 chr3:196387949-196387950(+) m6A intron       25456834//24981863 chr3:196387966-196387967(+) m6A intron       25456834//24981863 chr3:196387985-196387986(+) m6A intron       25456834//24981863 chr3:196388072-196388073(+) m6A intron       25456834 chr3:196388105-196388106(+) m6A intron       25456834 chr3:196388132-196388133(+) m6A intron       25456834 chr3:196388197-196388198(+) m6A intron       25456834 chr3:196388216-196388217(+) m6A intron       25456834 chr3:196388275-196388276(+) m6A intron       25456834 chr3:196388432-196388433(+) m6A intron       25456834 chr3:196388453-196388454(+) m6A intron       25456834 chr3:196388610-196388611(+) m6A intron       - chr3:196388638-196388639(+) m6A intron       - chr3:196439255-196439256(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr3:196439887-196439888(+) m6A 5'UTR//exon//intron       - chr3:196439899-196439900(+) m6A 5'UTR//exon//intron       - chr3:196439911-196439912(+) m6A 5'UTR//exon//intron       - chr3:196461354-196461355(+) m6A 3'UTR       24981863 chr3:196461423-196461424(+) m6A 3'UTR       24981863 chr3:196461443-196461444(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	PIGX	Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-UL70-5p
Interactor2: PIGX

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep
Support Database	RepTar//VmiReg