Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00238688

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US33-5p:  MIMAT0001584          ZDHHC18:  NM_032283     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US33-5p	ZDHHC18
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001584	84243
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	DHHC-18//DHHC18

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ZDHHC18	chr1:27169871(+) A-I      intronic chr1:27167098(+) A-I      intronic chr1:27167523(+) A-I      intronic chr1:27167568(+) A-I      intronic chr1:27167585(+) A-I      intronic chr1:27167625(+) A-I      intronic chr1:27167642(+) A-I      intronic chr1:27167651(+) A-I      intronic chr1:27168443(+) A-I      intronic chr1:27168479(+) A-I      intronic chr1:27168748(+) A-I      intronic chr1:27169652(+) A-I      intronic chr1:27169708(+) A-I      intronic chr1:27169737(+) A-I      intronic chr1:27169770(+) A-I      intronic chr1:27169783(+) A-I      intronic chr1:27169832(+) A-I      intronic chr1:27169884(+) A-I      intronic chr1:27169903(+) A-I      intronic chr1:27170167(+) A-I      intronic chr1:27170174(+) A-I      intronic chr1:27170202(+) A-I      intronic chr1:27170600(+) A-I      intronic chr1:27170630(+) A-I      intronic chr1:27170631(+) A-I      intronic chr1:27170635(+) A-I      intronic chr1:27170670(+) A-I      intronic chr1:27172276(+) A-I      intronic chr1:27170634(+) A-I      intronic chr1:27172332(+) A-I      intronic chr1:27173448(+) A-I      intronic chr1:27173486(+) A-I      intronic chr1:27173487(+) A-I      intronic chr1:27173562(+) A-I      intronic chr1:27174650(+) A-I      intronic chr1:27174688(+) A-I      intronic chr1:27169685(+) A-I      intronic chr1:27161939(+) A-I      intronic chr1:27162027(+) A-I      intronic chr1:27162033(+) A-I      intronic chr1:27162072(+) A-I      intronic chr1:27162137(+) A-I      intronic chr1:27163121(+) A-I      intronic chr1:27163124(+) A-I      intronic chr1:27163153(+) A-I      intronic chr1:27163164(+) A-I      intronic chr1:27163199(+) A-I      intronic chr1:27163508(+) A-I      intronic chr1:27164014(+) A-I      intronic chr1:27164027(+) A-I      intronic chr1:27164171(+) A-I      intronic chr1:27164223(+) A-I      intronic chr1:27164233(+) A-I      intronic chr1:27167018(+) A-I      intronic chr1:27169814(+) A-I      intronic chr1:27163468(+) A-I      intronic chr1:27168670(+) A-I      intronic chr1:27167665(+) A-I      intronic chr1:27167830(+) A-I      intronic chr1:27164071(+) A-I      intronic chr1:27174579(+) A-I      intronic chr1:27174273(+) A-I      intronic chr1:27162173(+) A-I      intronic chr1:27163311(+) A-I      intronic chr1:27164040(+) A-I      intronic chr1:27170587(+) A-I      intronic chr1:27167668(+) A-I      intronic chr1:27174786(+) A-I      intronic chr1:27163555(+) A-I      intronic chr1:27163551(+) A-I      intronic chr1:27168363(+) A-I      intronic chr1:27167387(+) A-I      intronic chr1:27172370(+) A-I      intronic chr1:27168729(+) A-I      intronic chr1:27174641(+) A-I      intronic chr1:27170115(+) A-I      intronic chr1:27170065(+) A-I      intronic chr1:27170119(+) A-I      intronic chr1:27172306(+) A-I      intronic chr1:27167713(+) A-I      intronic chr1:27168575(+) A-I      intronic chr1:27164180(+) A-I      intronic chr1:27174682(+) A-I      intronic chr1:27163335(+) A-I      intronic chr1:27168505(+) A-I      intronic chr1:27174724(+) A-I      intronic chr1:27179709(+) A-I      intronic chr1:27163552(+) A-I      intronic chr1:27164110(+) A-I      intronic chr1:27163320(+) A-I      intronic chr1:27170265(+) A-I      intronic chr1:27168506(+) A-I      intronic chr1:27163321(+) A-I      intronic chr1:27169865(+) A-I      intronic chr1:27174566(+) A-I      intronic chr1:27170025(+) A-I      intronic chr1:27174571(+) A-I      intronic chr1:27167437(+) A-I      intronic chr1:27172947(+) A-I      intronic chr1:27169733(+) A-I      intronic chr1:27171460(+) A-I      intronic chr1:27169829(+) A-I      intronic chr1:27171463(+) A-I      intronic chr1:27163623(+) A-I      intronic chr1:27168730(+) A-I      intronic chr1:27174638(+) A-I      intronic chr1:27167654(+) A-I      intronic chr1:27174617(+) A-I      intronic chr1:27170131(+) A-I      intronic chr1:27167006(+) A-I      intronic chr1:27174647(+) A-I      intronic chr1:27167753(+) A-I      intronic chr1:27174643(+) A-I      intronic chr1:27169906(+) A-I      intronic chr1:27173571(+) A-I      intronic chr1:27167744(+) A-I      intronic chr1:27162329(+) A-I      intronic chr1:27174656(+) A-I      intronic chr1:27174642(+) A-I      intronic chr1:27167877(+) A-I      intronic chr1:27169779(+) A-I      intronic chr1:27170765(+) A-I      intronic chr1:27169670(+) A-I      intronic chr1:27163664(+) A-I      intronic chr1:27168372(+) A-I      intronic chr1:27172356(+) A-I      intronic chr1:27169734(+) A-I      intronic chr1:27163129(+) A-I      intronic chr1:27168742(+) A-I      intronic chr1:27167752(+) A-I      intronic chr1:27162141(+) A-I      intronic chr1:27167078(+) A-I      intronic chr1:27167825(+) A-I      intronic chr1:27167846(+) A-I      intronic chr1:27173504(+) A-I      intronic chr1:27170024(+) A-I      intronic chr1:27169703(+) A-I      intronic chr1:27174723(+) A-I      intronic chr1:27171863(+) A-I      intronic chr1:27169738(+) A-I      intronic chr1:27167905(+) A-I      intronic chr1:27164200(+) A-I      intronic chr1:27169728(+) A-I      intronic chr1:27169300(+) A-I      intronic chr1:27172352(+) A-I      intronic chr1:27174312(+) A-I      intronic chr1:27167733(+) A-I      intronic chr1:27170201(+) A-I      intronic chr1:27169915(+) A-I      intronic chr1:27169817(+) A-I      intronic chr1:27163333(+) A-I      intronic chr1:27163629(+) A-I      intronic chr1:27170144(+) A-I      intronic chr1:27170118(+) A-I      intronic chr1:27174683(+) A-I      intronic chr1:27162142(+) A-I      intronic chr1:27174652(+) A-I      intronic chr1:27169751(+) A-I      intronic chr1:27172063(+) A-I      intronic chr1:27168371(+) A-I      intronic chr1:27169866(+) A-I      intronic chr1:27167607(+) A-I      intronic chr1:27168657(+) A-I      intronic chr1:27162687(+) A-I      intronic chr1:27168553(+) A-I      intronic chr1:27174759(+) A-I      intronic chr1:27174546(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ZDHHC18	chr1:27163129(+) A-G intron -    22484847 chr1:27163555(+) A-G intron -    22484847 chr1:27163623(+) A-G intron -    22484847 chr1:27163629(+) A-G intron -    22484847 chr1:27164040(+) A-G intron -    22484847 chr1:27164071(+) A-G intron -    22484847 chr1:27164110(+) A-G intron -    22484847 chr1:27164180(+) A-G intron -    22484847 chr1:27167006(+) A-G intron -    22484847 chr1:27167078(+) A-G intron -    22484847 chr1:27167668(+) A-G intron -    22484847 chr1:27167744(+) A-G intron -    22484847 chr1:27167905(+) A-G intron -    22484847 chr1:27168506(+) A-G intron -    22484847 chr1:27168657(+) A-G intron -    22484847 chr1:27169703(+) A-G intron -    22484847 chr1:27169733(+) A-G intron -    22484847 chr1:27169734(+) A-G intron -    22484847 chr1:27169738(+) A-G intron -    22484847 chr1:27169865(+) A-G intron -    22484847 chr1:27169866(+) A-G intron -    22484847 chr1:27169906(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170024(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170025(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170065(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170115(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170118(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170131(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170144(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170201(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170265(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170587(+) A-G intron -    22484847 chr1:27170765(+) A-G intron -    22484847 chr1:27171416(+) G-T intron -    22484847 chr1:27172352(+) A-G intron -    22484847 chr1:27173504(+) A-G intron -    22484847 chr1:27174546(+) A-G intron -    22484847 chr1:27174566(+) A-G intron -    22484847 chr1:27174638(+) A-G intron -    22484847 chr1:27174641(+) A-G intron -    22484847 chr1:27174642(+) A-G intron -    22484847 chr1:27174643(+) A-G intron -    22484847 chr1:27174647(+) A-G intron -    22484847 chr1:27174682(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ZDHHC18	chr1:27153302-27153303(+) m6A CDS       24209618//24981863 chr1:27177677-27177678(+) Y CDS//exon       26075521 chr1:27180393-27180394(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:27180423-27180424(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:27180433-27180434(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:27180481-27180482(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:27180485-27180486(+) Y 3'UTR//intron       26075521 chr1:27180513-27180514(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:27180570-27180571(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr1:27180598-27180599(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr1:27180652-27180653(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr1:27180681-27180682(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834 chr1:27180725-27180726(+) m6A 3'UTR//intron       25456834 chr1:27181451-27181452(+) m6A 3'UTR//intron       24284625 chr1:27181481-27181482(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834//24981863 chr1:27181536-27181537(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834//24981863 chr1:27181543-27181544(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834//24981863 chr1:27181560-27181561(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834//24981863 chr1:27181619-27181620(+) m6A 3'UTR//intron       25456834//24981863 chr1:27181629-27181630(+) m6A 3'UTR//intron       25456834//24981863 chr1:27181725-27181726(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834 chr1:27181747-27181748(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//25456834 chr1:27181771-27181772(+) m6A 3'UTR//intron       24284625 chr1:27182056-27182057(+) m6A 3'UTR//intron       24284625

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ZDHHC18	Chromatin K562 cells     - Cytosol K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US33-5p
Interactor2: ZDHHC18

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Rep//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg