Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00238650

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US33-5p:  MIMAT0001584          TCF7L1:  NM_031283     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US33-5p	TCF7L1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001584	83439
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	TCF-3//TCF3

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TCF7L1	chr2:85456969(+) A-I      intronic chr2:85457008(+) A-I      intronic chr2:85457002(+) A-I      intronic chr2:85511318(+) A-I      intronic chr2:85457000(+) A-I      intronic chr2:85424404(+) A-I      intronic chr2:85424403(+) A-I      intronic chr2:85424391(+) A-I      intronic chr2:85424387(+) A-I      intronic chr2:85424373(+) A-I      intronic chr2:85526902(+) A-I      intronic chr2:85513799(+) A-I      intronic chr2:85513801(+) A-I      intronic chr2:85430654(+) A-I      intronic chr2:85375346(+) A-I      intronic chr2:85376787(+) A-I      intronic chr2:85513798(+) A-I      intronic chr2:85424372(+) A-I      intronic chr2:85457020(+) A-I      intronic chr2:85424358(+) A-I      intronic chr2:85457010(+) A-I      intronic chr2:85403601(+) A-I      intronic chr2:85424357(+) A-I      intronic chr2:85372171(+) A-I      intronic chr2:85372168(+) A-I      intronic chr2:85456982(+) A-I      intronic chr2:85456978(+) A-I      intronic chr2:85456977(+) A-I      intronic chr2:85456970(+) A-I      intronic chr2:85372110(+) A-I      intronic chr2:85372170(+) A-I      intronic chr2:85430663(+) A-I      intronic chr2:85372158(+) A-I      intronic chr2:85372140(+) A-I      intronic chr2:85372120(+) A-I      intronic chr2:85430705(+) A-I      intronic chr2:85430694(+) A-I      intronic chr2:85430649(+) A-I      intronic chr2:85430586(+) A-I      intronic chr2:85424413(+) A-I      intronic chr2:85424405(+) A-I      intronic chr2:85387522(+) A-I      intronic chr2:85379741(+) A-I      intronic chr2:85379723(+) A-I      intronic chr2:85376773(+) A-I      intronic chr2:85529104(+) A-I      intronic chr2:85529087(+) A-I      intronic chr2:85528977(+) A-I      intronic chr2:85526871(+) A-I      intronic chr2:85526867(+) A-I      intronic chr2:85526861(+) A-I      intronic chr2:85526848(+) A-I      intronic chr2:85525535(+) A-I      intronic chr2:85525526(+) A-I      intronic chr2:85525521(+) A-I      intronic chr2:85525462(+) A-I      intronic chr2:85525455(+) A-I      intronic chr2:85525198(+) A-I      intronic chr2:85525167(+) A-I      intronic chr2:85524801(+) A-I      intronic chr2:85524787(+) A-I      intronic chr2:85524785(+) A-I      intronic chr2:85524746(+) A-I      intronic chr2:85524738(+) A-I      intronic chr2:85522117(+) A-I      intronic chr2:85371669(+) A-I      intronic chr2:85371508(+) A-I      intronic chr2:85371475(+) A-I      intronic chr2:85367819(+) A-I      intronic chr2:85467662(+) A-I      intronic chr2:85367803(+) A-I      intronic chr2:85367802(+) A-I      intronic chr2:85366232(+) A-I      intronic chr2:85521421(+) A-I      intronic chr2:85522106(+) A-I      intronic chr2:85419542(+) A-I      intronic chr2:85428218(+) A-I      intronic chr2:85424294(+) A-I      intronic chr2:85420650(+) A-I      intronic chr2:85420617(+) A-I      intronic chr2:85420606(+) A-I      intronic chr2:85420561(+) A-I      intronic chr2:85420046(+) A-I      intronic chr2:85419898(+) A-I      intronic chr2:85419897(+) A-I      intronic chr2:85419690(+) A-I      intronic chr2:85419688(+) A-I      intronic chr2:85418833(+) A-I      intronic chr2:85418733(+) A-I      intronic chr2:85399817(+) A-I      intronic chr2:85399783(+) A-I      intronic chr2:85399758(+) A-I      intronic chr2:85394805(+) A-I      intronic chr2:85430611(+) A-I      intronic chr2:85430616(+) A-I      intronic chr2:85430648(+) A-I      intronic chr2:85430671(+) A-I      intronic chr2:85430672(+) A-I      intronic chr2:85430709(+) A-I      intronic chr2:85430754(+) A-I      intronic chr2:85430767(+) A-I      intronic chr2:85430772(+) A-I      intronic chr2:85439158(+) A-I      intronic chr2:85439165(+) A-I      intronic chr2:85445402(+) A-I      intronic chr2:85445418(+) A-I      intronic chr2:85445441(+) A-I      intronic chr2:85445579(+) A-I      intronic chr2:85445607(+) A-I      intronic chr2:85446774(+) A-I      intronic chr2:85449187(+) A-I      intronic chr2:85449210(+) A-I      intronic chr2:85449344(+) A-I      intronic chr2:85454845(+) A-I      intronic chr2:85455341(+) A-I      intronic chr2:85456965(+) A-I      intronic chr2:85456971(+) A-I      intronic chr2:85457618(+) A-I      intronic chr2:85457655(+) A-I      intronic chr2:85465966(+) A-I      intronic chr2:85466794(+) A-I      intronic chr2:85466949(+) A-I      intronic chr2:85466975(+) A-I      intronic chr2:85467001(+) A-I      intronic chr2:85513827(+) A-I      intronic chr2:85513838(+) A-I      intronic chr2:85521420(+) A-I      intronic chr2:85521433(+) A-I      intronic chr2:85521894(+) A-I      intronic chr2:85521946(+) A-I      intronic chr2:85523162(+) A-I      intronic chr2:85521996(+) A-I      intronic chr2:85468626(+) A-I      intronic chr2:85450253(+) A-I      intronic chr2:85429270(+) A-I      intronic chr2:85371952(+) A-I      intronic chr2:85419685(+) A-I      intronic chr2:85463196(+) A-I      intronic chr2:85418772(+) A-I      intronic chr2:85513567(+) A-I      intronic chr2:85420047(+) A-I      intronic chr2:85419703(+) A-I      intronic chr2:85513522(+) A-I      intronic chr2:85468631(+) A-I      intronic chr2:85407470(+) A-I      intronic chr2:85466069(+) A-I      intronic chr2:85449745(+) A-I      intronic chr2:85445509(+) A-I      intronic chr2:85429247(+) A-I      intronic chr2:85439011(+) A-I      intronic chr2:85419715(+) A-I      intronic chr2:85467633(+) A-I      intronic chr2:85420552(+) A-I      intronic chr2:85450397(+) A-I      intronic chr2:85533994(+) A-I      intronic chr2:85526939(+) A-I      intronic chr2:85446821(+) A-I      intronic chr2:85502971(+) A-I      intronic chr2:85367683(+) A-I      intronic chr2:85524797(+) A-I      intronic chr2:85450317(+) A-I      intronic chr2:85420086(+) A-I      intronic chr2:85419628(+) A-I      intronic chr2:85372097(+) A-I      intronic chr2:85449312(+) A-I      intronic chr2:85460568(+) A-I      intronic chr2:85449416(+) A-I      intronic chr2:85456415(+) A-I      intronic chr2:85467759(+) A-I      intronic chr2:85367767(+) A-I      intronic chr2:85430745(+) A-I      intronic chr2:85420094(+) A-I      intronic chr2:85369404(+) A-I      intronic chr2:85449306(+) A-I      intronic chr2:85430731(+) A-I      intronic chr2:85511407(+) A-I      intronic chr2:85367666(+) A-I      intronic chr2:85449353(+) A-I      intronic chr2:85419667(+) A-I      intronic chr2:85524792(+) A-I      intronic chr2:85420064(+) A-I      intronic chr2:85419538(+) A-I      intronic chr2:85420553(+) A-I      intronic chr2:85371622(+) A-I      intronic chr2:85420626(+) A-I      intronic chr2:85524828(+) A-I      intronic chr2:85419575(+) A-I      intronic chr2:85454847(+) A-I      intronic chr2:85524865(+) A-I      intronic chr2:85449207(+) A-I      intronic chr2:85420558(+) A-I      intronic chr2:85528183(+) A-I      intronic chr2:85446105(+) A-I      intronic chr2:85419936(+) A-I      intronic chr2:85423753(+) A-I      intronic chr2:85513957(+) A-I      intronic chr2:85525399(+) A-I      intronic chr2:85413207(+) A-I      intronic chr2:85419740(+) A-I      intronic chr2:85524840(+) A-I      intronic chr2:85372051(+) A-I      intronic chr2:85449343(+) A-I      intronic chr2:85460539(+) A-I      intronic chr2:85430847(+) A-I      intronic chr2:85521366(+) A-I      intronic chr2:85446172(+) A-I      intronic chr2:85420574(+) A-I      intronic chr2:85419865(+) A-I      intronic chr2:85521974(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TCF7L1	chr2:85516822(+) A-I intron -    15342557 chr2:85516856(+) A-I intron -    15342557 chr2:85516858(+) A-I intron -    15342557 chr2:85516934(+) A-I intron -    15342557 chr2:85516947(+) A-I intron -    15342557 chr2:85517124(+) A-I intron -    15342557 chr2:85517309(+) A-I intron -    15342557 chr2:85517366(+) A-I intron -    15342557 chr2:85517561(+) A-I intron -    15342557 chr2:85517579(+) A-I intron -    15342557 chr2:85518778(+) A-I intron -    15342557 chr2:85518869(+) A-I intron -    15342557 chr2:85518955(+) A-I intron -    15342557 chr2:85518962(+) A-I intron -    15342557 chr2:85518968(+) A-I intron -    15342557 chr2:85518981(+) A-I intron -    15342557 chr2:85519031(+) A-I intron -    15342557 chr2:85519038(+) A-I intron -    15342557 chr2:85519039(+) A-I intron -    15342557 chr2:85519081(+) A-I intron -    15342557

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TCF7L1	chr2:85360988-85360989(+) m6A CDS       - chr2:85361030-85361031(+) m6A CDS       - chr2:85361048-85361049(+) m6A CDS       - chr2:85361166-85361167(+) m6A CDS       - chr2:85533380-85533381(+) m1A CDS       26863196 chr2:85534806-85534807(+) m6A CDS       - chr2:85536247-85536248(+) m6A CDS       24981863 chr2:85536341-85536342(+) m6A CDS       25456834 chr2:85536348-85536349(+) m6A CDS       25456834 chr2:85536658-85536659(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:85536688-85536689(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:85536772-85536773(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:85536777-85536778(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:85536782-85536783(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:85536860-85536861(+) m6A 3'UTR       - chr2:85537134-85537135(+) m6A 3'UTR       - chr2:85537209-85537210(+) m6A 3'UTR       - chr2:85537308-85537309(+) m6A 3'UTR       - chr2:85537374-85537375(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	TCF7L1	Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US33-5p
Interactor2: TCF7L1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg