Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00238061

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US33-5p:  MIMAT0001584          PHAX:  NM_032177     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US33-5p	PHAX
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001584	51808
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	RNUXA

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	PHAX	chr5:125950601(+) A-I      intronic chr5:125944486(+) A-I      intronic chr5:125944887(+) A-I      intronic chr5:125944892(+) A-I      intronic chr5:125950635(+) A-I      intronic chr5:125951911(+) A-I      intronic chr5:125952357(+) A-I      intronic chr5:125952376(+) A-I      intronic chr5:125952418(+) A-I      intronic chr5:125954662(+) A-I      intronic chr5:125954828(+) A-I      intronic chr5:125955125(+) A-I      intronic chr5:125958168(+) A-I      intronic chr5:125958589(+) A-I      intronic chr5:125958608(+) A-I      intronic chr5:125958632(+) A-I      intronic chr5:125958669(+) A-I      intronic chr5:125958802(+) A-I      intronic chr5:125959936(+) A-I      intronic chr5:125959948(+) A-I      intronic chr5:125950717(+) A-I      intronic chr5:125944815(+) A-I      intronic chr5:125944521(+) A-I      intronic chr5:125949909(+) A-I      intronic chr5:125948786(+) A-I      intronic chr5:125948372(+) A-I      intronic chr5:125947268(+) A-I      intronic chr5:125948273(+) A-I      intronic chr5:125945032(+) A-I      intronic chr5:125944932(+) A-I      intronic chr5:125944927(+) A-I      intronic chr5:125937476(+) A-I      intronic chr5:125940074(+) A-I      intronic chr5:125940157(+) A-I      intronic chr5:125940472(+) A-I      intronic chr5:125941221(+) A-I      intronic chr5:125942078(+) A-I      intronic chr5:125948235(+) A-I      intronic chr5:125948246(+) A-I      intronic chr5:125948250(+) A-I      intronic chr5:125948272(+) A-I      intronic chr5:125944351(+) A-I      intronic chr5:125940632(+) A-I      intronic chr5:125955213(+) A-I      intronic chr5:125955223(+) A-I      intronic chr5:125944355(+) A-I      intronic chr5:125944896(+) A-I      intronic chr5:125937390(+) A-I      intronic chr5:125944365(+) A-I      intronic chr5:125944485(+) A-I      intronic chr5:125950034(+) A-I      intronic chr5:125950529(+) A-I      intronic chr5:125961542(+) A-I      3'UTR chr5:125961501(+) A-I      3'UTR chr5:125961493(+) A-I      3'UTR chr5:125961195(+) A-I      3'UTR chr5:125961090(+) A-I      3'UTR chr5:125961025(+) A-I      3'UTR chr5:125961222(+) A-I      3'UTR chr5:125961230(+) A-I      3'UTR chr5:125961241(+) A-I      3'UTR chr5:125961249(+) A-I      3'UTR chr5:125961277(+) A-I      3'UTR chr5:125961419(+) A-I      3'UTR chr5:125962278(+) A-I      3'UTR chr5:125961458(+) A-I      3'UTR chr5:125961498(+) A-I      3'UTR chr5:125961622(+) A-I      3'UTR chr5:125961683(+) A-I      3'UTR chr5:125961839(+) A-I      3'UTR chr5:125962087(+) A-I      3'UTR chr5:125962124(+) A-I      3'UTR chr5:125962126(+) A-I      3'UTR chr5:125962167(+) A-I      3'UTR chr5:125962219(+) A-I      3'UTR chr5:125962267(+) A-I      3'UTR chr5:125962276(+) A-I      3'UTR chr5:125962277(+) A-I      3'UTR chr5:125962282(+) A-I      3'UTR chr5:125962344(+) A-I      3'UTR chr5:125962606(+) A-I      3'UTR chr5:125961823(+) A-I      3'UTR chr5:125962591(+) A-I      3'UTR chr5:125961822(+) A-I      3'UTR chr5:125961679(+) A-I      3'UTR chr5:125962535(+) A-I      3'UTR chr5:125962518(+) A-I      3'UTR chr5:125961847(+) A-I      3'UTR chr5:125962149(+) A-I      3'UTR chr5:125962144(+) A-I      3'UTR chr5:125962133(+) A-I      3'UTR chr5:125961082(+) A-I      3'UTR chr5:125961055(+) A-I      3'UTR chr5:125961185(+) A-I      3'UTR chr5:125962115(+) A-I      3'UTR chr5:125962110(+) A-I      3'UTR chr5:125962109(+) A-I      3'UTR chr5:125962014(+) A-I      3'UTR chr5:125962100(+) A-I      3'UTR chr5:125961626(+) A-I      3'UTR chr5:125962076(+) A-I      3'UTR chr5:125961857(+) A-I      3'UTR chr5:125961838(+) A-I      3'UTR chr5:125962456(+) A-I      3'UTR chr5:125962446(+) A-I      3'UTR chr5:125962354(+) A-I      3'UTR chr5:125962350(+) A-I      3'UTR chr5:125961545(+) A-I      3'UTR chr5:125937878(+) A-I      intronic chr5:125958719(+) A-I      intronic chr5:125949209(+) A-I      intronic chr5:125949894(+) A-I      intronic chr5:125954760(+) A-I      intronic chr5:125958738(+) A-I      intronic chr5:125959840(+) A-I      intronic chr5:125952449(+) A-I      intronic chr5:125958675(+) A-I      intronic chr5:125937498(+) A-I      intronic chr5:125940219(+) A-I      intronic chr5:125955105(+) A-I      intronic chr5:125954804(+) A-I      intronic chr5:125955180(+) A-I      intronic chr5:125955147(+) A-I      intronic chr5:125955174(+) A-I      intronic chr5:125949568(+) A-I      intronic chr5:125958712(+) A-I      intronic chr5:125949327(+) A-I      intronic chr5:125956559(+) A-I      intronic chr5:125937913(+) A-I      intronic chr5:125961137(+) A-I      3'UTR chr5:125961093(+) A-I      3'UTR chr5:125961136(+) A-I      3'UTR chr5:125962482(+) A-I      3'UTR chr5:125961413(+) A-I      3'UTR chr5:125961011(+) A-I      3'UTR chr5:125961433(+) A-I      3'UTR chr5:125962031(+) A-I      3'UTR chr5:125962057(+) A-I      3'UTR chr5:125961577(+) A-I      3'UTR chr5:125961239(+) A-I      3'UTR chr5:125961532(+) A-I      3'UTR chr5:125961040(+) A-I      3'UTR chr5:125962553(+) A-I      3'UTR chr5:125961534(+) A-I      3'UTR chr5:125961168(+) A-I      3'UTR chr5:125962091(+) A-I      3'UTR chr5:125961088(+) A-I      3'UTR chr5:125962273(+) A-I      3'UTR chr5:125961548(+) A-I      3'UTR chr5:125961463(+) A-I      3'UTR chr5:125961843(+) A-I      3'UTR chr5:125961246(+) A-I      3'UTR chr5:125962308(+) A-I      3'UTR chr5:125961573(+) A-I      3'UTR chr5:125961649(+) A-I      3'UTR chr5:125962169(+) A-I      3'UTR chr5:125961034(+) A-I      3'UTR chr5:125962568(+) A-I      3'UTR chr5:125961129(+) A-I      3'UTR chr5:125961131(+) A-I      3'UTR chr5:125961634(+) A-I      3'UTR chr5:125962483(+) A-I      3'UTR chr5:125962464(+) A-I      3'UTR chr5:125961468(+) A-I      3'UTR chr5:125961810(+) A-I      3'UTR chr5:125962084(+) A-I      3'UTR chr5:125961598(+) A-I      3'UTR chr5:125961623(+) A-I      3'UTR chr5:125961509(+) A-I      3'UTR chr5:125962137(+) A-I      3'UTR chr5:125961510(+) A-I      3'UTR chr5:125961209(+) A-I      3'UTR chr5:125962268(+) A-I      3'UTR chr5:125962079(+) A-I      3'UTR chr5:125961133(+) A-I      3'UTR chr5:125962142(+) A-I      3'UTR chr5:125961667(+) A-I      3'UTR chr5:125961661(+) A-I      3'UTR chr5:125961146(+) A-I      3'UTR chr5:125961611(+) A-I      3'UTR chr5:125961554(+) A-I      3'UTR chr5:125961576(+) A-I      3'UTR chr5:125961610(+) A-I      3'UTR chr5:125962143(+) A-I      3'UTR chr5:125961124(+) A-I      3'UTR chr5:125961217(+) A-I      3'UTR chr5:125961455(+) A-I      3'UTR chr5:125962146(+) A-I      3'UTR chr5:125961138(+) A-I      3'UTR chr5:125962139(+) A-I      3'UTR chr5:125962220(+) A-I      3'UTR chr5:125962030(+) A-I      3'UTR chr5:125962136(+) A-I      3'UTR chr5:125961178(+) A-I      3'UTR chr5:125962176(+) A-I      3'UTR chr5:125961204(+) A-I      3'UTR chr5:125962528(+) A-I      3'UTR chr5:125961589(+) A-I      3'UTR chr5:125961210(+) A-I      3'UTR chr5:125961130(+) A-I      3'UTR chr5:125944922(+) A-I      intronic chr5:125958684(+) A-I      intronic chr5:125949844(+) A-I      intronic chr5:125954764(+) A-I      intronic chr5:125954694(+) A-I      intronic chr5:125940647(+) A-I      intronic chr5:125953682(+) A-I      intronic chr5:125952002(+) A-I      intronic chr5:125943134(+) A-I      intronic chr5:125938824(+) A-I      intronic chr5:125944507(+) A-I      intronic chr5:125958747(+) A-I      intronic chr5:125948763(+) A-I      intronic chr5:125953245(+) A-I      intronic chr5:125940914(+) A-I      intronic chr5:125958562(+) A-I      intronic chr5:125949922(+) A-I      intronic chr5:125951833(+) A-I      intronic chr5:125938810(+) A-I      intronic chr5:125953725(+) A-I      intronic chr5:125951982(+) A-I      intronic chr5:125945668(+) A-I      intronic chr5:125958563(+) A-I      intronic chr5:125958739(+) A-I      intronic chr5:125952422(+) A-I      intronic chr5:125955083(+) A-I      intronic chr5:125956611(+) A-I      intronic chr5:125959975(+) A-I      intronic chr5:125953720(+) A-I      intronic chr5:125944918(+) A-I      intronic chr5:125951846(+) A-I      intronic chr5:125955015(+) A-I      intronic chr5:125954902(+) A-I      intronic chr5:125955094(+) A-I      intronic chr5:125940714(+) A-I      intronic chr5:125946579(+) A-I      intronic chr5:125940069(+) A-I      intronic chr5:125955069(+) A-I      intronic chr5:125947376(+) A-I      intronic chr5:125946766(+) A-I      intronic chr5:125954893(+) A-I      intronic chr5:125940167(+) A-I      intronic chr5:125954744(+) A-I      intronic chr5:125948961(+) A-I      intronic chr5:125958781(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	PHAX	chr5:125961047(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125961079(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22327324 chr5:125961081(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125961127(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125961166(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125961168(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125961169(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125961468(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125961532(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125961534(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962057(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962079(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962084(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962130(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962137(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962139(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962145(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962146(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962175(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125962220(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr5:125961447(+) A-I intron -    21960545 chr5:125961494(+) A-I intron -    21960545 chr5:125940473(+) A-G intron -    22484847 chr5:125940647(+) A-G intron -    22484847 chr5:125940914(+) A-G intron -    22484847 chr5:125944918(+) A-G intron -    22484847 chr5:125944922(+) A-G intron -    22484847 chr5:125945013(+) A-G intron -    22484847 chr5:125949939(+) A-G intron -    22484847 chr5:125949950(+) T-C intron -    22484847 chr5:125950621(+) A-G intron -    22484847 chr5:125951833(+) A-G intron -    22484847 chr5:125951846(+) A-G intron -    22484847 chr5:125951865(+) A-G intron -    22484847 chr5:125953720(+) A-G intron -    22484847 chr5:125953725(+) A-G intron -    22484847 chr5:125954655(+) A-G intron -    22484847 chr5:125954694(+) A-G intron -    22484847 chr5:125954804(+) A-G intron -    22484847 chr5:125955015(+) A-G intron -    22484847 chr5:125955068(+) A-G intron -    22484847 chr5:125955083(+) A-G intron -    22484847 chr5:125955105(+) A-G intron -    22484847 chr5:125955147(+) A-G intron -    22484847 chr5:125955148(+) A-G intron -    22484847 chr5:125956559(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961011(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961040(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961047(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961079(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961127(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961130(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961146(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961166(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961169(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961204(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961209(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961210(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961239(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961246(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961433(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961447(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961455(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961463(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961468(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961509(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961510(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961532(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961534(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961548(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961554(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961623(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961649(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961810(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961816(+) A-G intron -    22484847 chr5:125961842(+) G-A intron -    22484847 chr5:125961843(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962022(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962030(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962079(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962084(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962085(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962086(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962142(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962175(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962176(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962308(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962482(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962528(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962553(+) A-G intron -    22484847 chr5:125962568(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	PHAX	chr5:125939301-125939302(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618 chr5:125939443-125939444(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr5:125939479-125939480(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr5:125939536-125939537(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125939563-125939564(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125939605-125939606(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125939615-125939616(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125939641-125939642(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125939679-125939680(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125939686-125939687(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125939778-125939779(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125939790-125939791(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125939805-125939806(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125944064-125944065(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125944075-125944076(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125944124-125944125(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr5:125944137-125944138(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//22608085 chr5:125944151-125944152(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863//22608085 chr5:125952959-125952960(+) m6A CDS//exon       27773535//22608085 chr5:125952993-125952994(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085 chr5:125953015-125953016(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085 chr5:125960285-125960286(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085 chr5:125960329-125960330(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr5:125960355-125960356(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085 chr5:125960407-125960408(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr5:125960463-125960464(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125960525-125960526(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125960558-125960559(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125960589-125960590(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125960627-125960628(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125960648-125960649(+) m6A 3'UTR//exon       24209618//24981863//27773535//22575960//22608085 chr5:125960699-125960700(+) m6A 3'UTR//exon       24209618//24981863//22608085 chr5:125962054-125962055(+) m6A 3'UTR       - chr5:125962109-125962110(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:125962229-125962230(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:125962252-125962253(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:125962349-125962350(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:125962523-125962524(+) m6A 3'UTR       24981863 chr5:125962592-125962593(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	PHAX	Exosome Blood     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US33-5p
Interactor2: PHAX

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda
Support Database	RepTar//VmiReg