Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00237816

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US33-5p:           PUM2:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-US33-5p PUM2
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0001584 23369
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - PUMH2//PUML2

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR PUM2
chr2:20471147(-) A-I      intronic
chr2:20471137(-) A-I      intronic
chr2:20471257(-) A-I      intronic
chr2:20523061(-) A-I      intronic
chr2:20523036(-) A-I      intronic
chr2:20505054(-) A-I      intronic
chr2:20499181(-) A-I      intronic
chr2:20471171(-) A-I      intronic
chr2:20471252(-) A-I      intronic
chr2:20471158(-) A-I      intronic
chr2:20466980(-) A-I      intronic
chr2:20456572(-) A-I      intronic
chr2:20471196(-) A-I      intronic
chr2:20492151(-) A-I      intronic
chr2:20471254(-) A-I      intronic
chr2:20471253(-) A-I      intronic
chr2:20523097(-) A-I      intronic
chr2:20462236(-) A-I      intronic
chr2:20471198(-) A-I      intronic
chr2:20471251(-) A-I      intronic
chr2:20471250(-) A-I      intronic
chr2:20471225(-) A-I      intronic
chr2:20471772(-) A-I      intronic
chr2:20471728(-) A-I      intronic
chr2:20471647(-) A-I      intronic
chr2:20471364(-) A-I      intronic
chr2:20471356(-) A-I      intronic
chr2:20466852(-) A-I      intronic
chr2:20466876(-) A-I      intronic
chr2:20466912(-) A-I      intronic
chr2:20469090(-) A-I      intronic
chr2:20467000(-) A-I      intronic
chr2:20467019(-) A-I      intronic
chr2:20467024(-) A-I      intronic
chr2:20467051(-) A-I      intronic
chr2:20468138(-) A-I      intronic
chr2:20500085(-) A-I      intronic
chr2:20469134(-) A-I      intronic
chr2:20469143(-) A-I      intronic
chr2:20469100(-) A-I      intronic
chr2:20469094(-) A-I      intronic
chr2:20514904(-) A-I      intronic
chr2:20464931(-) A-I      intronic
chr2:20471270(-) A-I      intronic
chr2:20469067(-) A-I      intronic
chr2:20506480(-) A-I      intronic
chr2:20469059(-) A-I      intronic
chr2:20506930(-) A-I      intronic
chr2:20465969(-) A-I      intronic
chr2:20466200(-) A-I      intronic
chr2:20471302(-) A-I      intronic
chr2:20469212(-) A-I      intronic
chr2:20469183(-) A-I      intronic
chr2:20469171(-) A-I      intronic
chr2:20471203(-) A-I      intronic
chr2:20471190(-) A-I      intronic
chr2:20471180(-) A-I      intronic
chr2:20468293(-) A-I      intronic
chr2:20506441(-) A-I      intronic
chr2:20499366(-) A-I      intronic
chr2:20469073(-) A-I      intronic
chr2:20471213(-) A-I      intronic
chr2:20499343(-) A-I      intronic
chr2:20499342(-) A-I      intronic
chr2:20499307(-) A-I      intronic
chr2:20499294(-) A-I      intronic
chr2:20499289(-) A-I      intronic
chr2:20499285(-) A-I      intronic
chr2:20499281(-) A-I      intronic
chr2:20492645(-) A-I      intronic
chr2:20492641(-) A-I      intronic
chr2:20492584(-) A-I      intronic
chr2:20492568(-) A-I      intronic
chr2:20492336(-) A-I      intronic
chr2:20492326(-) A-I      intronic
chr2:20466841(-) A-I      intronic
chr2:20506961(-) A-I      intronic
chr2:20492256(-) A-I      intronic
chr2:20492189(-) A-I      intronic
chr2:20471838(-) A-I      intronic
chr2:20471820(-) A-I      intronic
chr2:20452014(-) A-I      intronic
chr2:20456705(-) A-I      intronic
chr2:20456729(-) A-I      intronic
chr2:20456803(-) A-I      intronic
chr2:20461803(-) A-I      intronic
chr2:20461815(-) A-I      intronic
chr2:20463986(-) A-I      intronic
chr2:20464869(-) A-I      intronic
chr2:20464926(-) A-I      intronic
chr2:20471242(-) A-I      intronic
chr2:20506437(-) A-I      intronic
chr2:20468297(-) A-I      intronic
chr2:20471911(-) A-I      intronic
chr2:20468360(-) A-I      intronic
chr2:20498537(-) A-I      intronic
chr2:20506533(-) A-I      intronic
chr2:20465995(-) A-I      intronic
chr2:20466928(-) A-I      intronic
chr2:20461716(-) A-I      intronic
chr2:20452104(-) A-I      intronic
chr2:20506507(-) A-I      intronic
chr2:20468161(-) A-I      intronic
chr2:20468348(-) A-I      intronic
chr2:20467029(-) A-I      intronic
chr2:20469167(-) A-I      intronic
chr2:20471771(-) A-I      intronic
chr2:20467060(-) A-I      intronic
chr2:20468155(-) A-I      intronic
chr2:20506894(-) A-I      intronic
chr2:20492564(-) A-I      intronic
chr2:20466851(-) A-I      intronic
chr2:20506584(-) A-I      intronic
chr2:20466149(-) A-I      intronic
chr2:20471167(-) A-I      intronic
chr2:20499274(-) A-I      intronic
chr2:20466988(-) A-I      intronic
chr2:20464913(-) A-I      intronic
chr2:20471661(-) A-I      intronic
chr2:20466948(-) A-I      intronic
chr2:20469126(-) A-I      intronic
chr2:20466204(-) A-I      intronic
chr2:20471189(-) A-I      intronic
chr2:20471798(-) A-I      intronic
chr2:20468296(-) A-I      intronic
chr2:20505080(-) A-I      intronic
chr2:20466092(-) A-I      intronic
chr2:20466995(-) A-I      intronic
chr2:20468255(-) A-I      intronic
chr2:20467059(-) A-I      intronic
chr2:20453397(-) A-I      intronic
chr2:20471808(-) A-I      intronic
chr2:20471782(-) A-I      intronic
chr2:20492302(-) A-I      intronic
chr2:20466990(-) A-I      intronic
chr2:20471245(-) A-I      intronic
chr2:20492252(-) A-I      intronic
chr2:20471879(-) A-I      intronic
chr2:20468129(-) A-I      intronic
chr2:20467014(-) A-I      intronic
chr2:20471675(-) A-I      intronic
chr2:20492649(-) A-I      intronic
chr2:20466076(-) A-I      intronic
chr2:20466144(-) A-I      intronic
chr2:20506475(-) A-I      intronic
chr2:20471715(-) A-I      intronic
chr2:20492200(-) A-I      intronic
chr2:20492379(-) A-I      intronic
chr2:20466011(-) A-I      intronic
chr2:20452090(-) A-I      intronic
chr2:20464930(-) A-I      intronic
chr2:20468267(-) A-I      intronic
chr2:20469035(-) A-I      intronic
chr2:20463827(-) A-I      intronic
chr2:20499403(-) A-I      intronic
chr2:20466160(-) A-I      intronic
chr2:20506467(-) A-I      intronic
chr2:20465959(-) A-I      intronic
chr2:20506561(-) A-I      intronic
chr2:20466082(-) A-I      intronic
chr2:20492527(-) A-I      intronic
chr2:20466074(-) A-I      intronic
chr2:20468322(-) A-I      intronic
chr2:20471757(-) A-I      intronic
chr2:20464846(-) A-I      intronic
chr2:20465958(-) A-I      intronic
chr2:20501473(-) A-I      intronic
chr2:20492660(-) A-I      intronic
chr2:20469182(-) A-I      intronic
chr2:20492191(-) A-I      intronic
chr2:20506641(-) A-I      intronic
chr2:20471866(-) A-I      intronic
chr2:20466159(-) A-I      intronic
chr2:20452103(-) A-I      intronic
chr2:20471347(-) A-I      intronic
chr2:20466095(-) A-I      intronic
chr2:20465960(-) A-I      intronic
chr2:20466012(-) A-I      intronic
chr2:20468352(-) A-I      intronic
chr2:20468257(-) A-I      intronic
chr2:20492350(-) A-I      intronic
chr2:20492529(-) A-I      intronic
chr2:20471148(-) A-I      intronic
chr2:20466199(-) A-I      intronic
chr2:20471243(-) A-I      intronic
chr2:20466880(-) A-I      intronic
chr2:20492628(-) A-I      intronic
chr2:20499280(-) A-I      intronic
chr2:20471663(-) A-I      intronic
chr2:20471239(-) A-I      intronic
chr2:20471844(-) A-I      intronic
chr2:20515539(-) A-I      intronic
chr2:20499272(-) A-I      intronic
chr2:20513699(-) A-I      intronic
chr2:20466921(-) A-I      intronic
chr2:20506784(-) A-I      intronic
chr2:20471910(-) A-I      intronic
chr2:20464891(-) A-I      intronic
chr2:20492580(-) A-I      intronic
chr2:20464843(-) A-I      intronic
chr2:20464901(-) A-I      intronic
chr2:20471195(-) A-I      intronic
chr2:20471837(-) A-I      intronic
chr2:20466168(-) A-I      intronic
chr2:20453091(-) A-I      intronic
chr2:20469157(-) A-I      intronic
chr2:20506484(-) A-I      intronic
chr2:20471288(-) A-I      intronic
chr2:20465982(-) A-I      intronic
chr2:20506877(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED PUM2
chr2:20450819(-) A-I exon 3'UTR    21960545   //22327324
chr2:20466011(-) A-I intron -    22327324
chr2:20466928(-) A-I intron -    22327324
chr2:20466948(-) A-I intron -    22327324
chr2:20492200(-) A-I intron -    22327324
chr2:20465958(-) A-I intron -    21960545
chr2:20468360(-) A-I intron -    21960545
chr2:20468373(-) A-I intron -    21960545
chr2:20471213(-) A-I intron -    21960545
chr2:20471348(-) A-I intron -    21960545
chr2:20471356(-) A-I intron -    21960545
chr2:20471856(-) A-I intron -    21960545
chr2:20514904(-) A-I intron -    21960545
chr2:20514912(-) A-I intron -    21960545
chr2:20453115(-) A-G intron -    22484847
chr2:20464891(-) A-G intron -    22484847
chr2:20464913(-) A-G intron -    22484847
chr2:20465982(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466011(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466012(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466074(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466076(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466082(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466143(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466144(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466159(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466199(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466248(-) T-A intron -    22484847
chr2:20466264(-) C-T intron -    22484847
chr2:20466886(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466921(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466928(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466932(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466948(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466988(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466990(-) A-G intron -    22484847
chr2:20466995(-) A-G intron -    22484847
chr2:20467014(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468155(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468181(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468255(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468257(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468267(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468279(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468292(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468296(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468322(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468348(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468360(-) A-G intron -    22484847
chr2:20468373(-) A-G intron -    22484847
chr2:20469126(-) A-G intron -    22484847
chr2:20469167(-) A-G intron -    22484847
chr2:20469182(-) A-G intron -    22484847
chr2:20469191(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471148(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471167(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471189(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471195(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471239(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471242(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471243(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471245(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471347(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471348(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471675(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471740(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471776(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471808(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471837(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471844(-) A-G intron -    22484847
chr2:20471910(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492200(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492288(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492350(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492520(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492527(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492564(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492580(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492628(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492636(-) A-G intron -    22484847
chr2:20492660(-) A-G intron -    22484847
chr2:20499208(-) A-G intron -    22484847
chr2:20499272(-) A-G intron -    22484847
chr2:20499274(-) A-G intron -    22484847
chr2:20499280(-) A-G intron -    22484847
chr2:20499403(-) A-G intron -    22484847
chr2:20499415(-) A-G intron -    22484847
chr2:20506507(-) A-G intron -    22484847
chr2:20506561(-) A-G intron -    22484847
chr2:20506584(-) A-G intron -    22484847
chr2:20506641(-) A-G intron -    22484847
chr2:20506784(-) A-G intron -    22484847
chr2:20506856(-) C-T intron -    22484847
chr2:20506877(-) A-G intron -    22484847
chr2:20515479(-) G-A intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase PUM2
chr2:20448890-20448891(-) m6A 3'UTR       -
chr2:20448895-20448896(-) m6A 3'UTR       -
chr2:20449597-20449598(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:20449736-20449737(-) m6A 3'UTR       27773535
chr2:20449743-20449744(-) m6A 3'UTR       24284625//27773535//22608085
chr2:20449893-20449894(-) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr2:20449957-20449958(-) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr2:20450024-20450025(-) m6A 3'UTR       27773535//22608085
chr2:20451128-20451129(-) m6A 3'UTR       24284625//27773535//22608085
chr2:20451232-20451233(-) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//27773535//22608085
chr2:20451274-20451275(-) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085
chr2:20451366-20451367(-) m6A CDS       24981863//26404942//27773535
chr2:20451378-20451379(-) m6A CDS       24981863//26404942//27773535
chr2:20451385-20451386(-) m6A CDS       27773535
chr2:20453612-20453613(-) m6A CDS       27773535
chr2:20453658-20453659(-) m6A CDS       27773535
chr2:20478404-20478405(-) m6A CDS//intron       -
chr2:20478412-20478413(-) m6A CDS//intron       -
chr2:20550037-20550038(-) m6A 5'UTR//intron       24209618
chr2:20550430-20550431(-) m6A 5'UTR//intron       24209618//24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate PUM2
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Ribosome HEK-293 cells     22199352
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-US33-5p
Interactor2: PUM2

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...