Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00237721

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US33-5p:           VPS45:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-US33-5p VPS45
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0001584 11311
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - H1//H1VPS45//SCN5//VPS45A//VPS45B//VPS54A//VSP45//VSP45A

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR VPS45
chr1:150081295(+) A-I      ncRNA
chr1:150076870(+) A-I      intronic
chr1:150073925(+) A-I      intronic
chr1:150073935(+) A-I      intronic
chr1:150074769(+) A-I      intronic
chr1:150073890(+) A-I      intronic
chr1:150076480(+) A-I      intronic
chr1:150071421(+) A-I      intronic
chr1:150074753(+) A-I      intronic
chr1:150074777(+) A-I      intronic
chr1:150073924(+) A-I      intronic
chr1:150081319(+) A-I      ncRNA
chr1:150108603(+) A-I      intronic
chr1:150076990(+) A-I      intronic
chr1:150109154(+) A-I      intronic
chr1:150074775(+) A-I      intronic
chr1:150108556(+) A-I      intronic
chr1:150111786(+) A-I      intronic
chr1:150111735(+) A-I      intronic
chr1:150109938(+) A-I      intronic
chr1:150108614(+) A-I      intronic
chr1:150073891(+) A-I      intronic
chr1:150108579(+) A-I      intronic
chr1:150108571(+) A-I      intronic
chr1:150108568(+) A-I      intronic
chr1:150108567(+) A-I      intronic
chr1:150073968(+) A-I      intronic
chr1:150069678(+) A-I      intronic
chr1:150076950(+) A-I      intronic
chr1:150077150(+) A-I      intronic
chr1:150074773(+) A-I      intronic
chr1:150074807(+) A-I      intronic
chr1:150076552(+) A-I      intronic
chr1:150108566(+) A-I      intronic
chr1:150077170(+) A-I      intronic
chr1:150108560(+) A-I      intronic
chr1:150077130(+) A-I      intronic
chr1:150074781(+) A-I      intronic
chr1:150074768(+) A-I      intronic
chr1:150101015(+) A-I      intronic
chr1:150115504(+) A-I      intronic
chr1:150115490(+) A-I      intronic
chr1:150101785(+) A-I      intronic
chr1:150098460(+) A-I      intronic
chr1:150114972(+) A-I      intronic
chr1:150098428(+) A-I      intronic
chr1:150101925(+) A-I      intronic
chr1:150101939(+) A-I      intronic
chr1:150098415(+) A-I      intronic
chr1:150101978(+) A-I      intronic
chr1:150101984(+) A-I      intronic
chr1:150112330(+) A-I      intronic
chr1:150102103(+) A-I      intronic
chr1:150112199(+) A-I      intronic
chr1:150102121(+) A-I      intronic
chr1:150102473(+) A-I      intronic
chr1:150112183(+) A-I      intronic
chr1:150108263(+) A-I      intronic
chr1:150111768(+) A-I      intronic
chr1:150097978(+) A-I      intronic
chr1:150109306(+) A-I      intronic
chr1:150097892(+) A-I      intronic
chr1:150097887(+) A-I      intronic
chr1:150103499(+) A-I      intronic
chr1:150103502(+) A-I      intronic
chr1:150103504(+) A-I      intronic
chr1:150099613(+) A-I      intronic
chr1:150096947(+) A-I      intronic
chr1:150103513(+) A-I      intronic
chr1:150103880(+) A-I      intronic
chr1:150103913(+) A-I      intronic
chr1:150096713(+) A-I      intronic
chr1:150109262(+) A-I      intronic
chr1:150103927(+) A-I      intronic
chr1:150103948(+) A-I      intronic
chr1:150108330(+) A-I      intronic
chr1:150096522(+) A-I      intronic
chr1:150096487(+) A-I      intronic
chr1:150107463(+) A-I      intronic
chr1:150096484(+) A-I      intronic
chr1:150096407(+) A-I      intronic
chr1:150107535(+) A-I      intronic
chr1:150107616(+) A-I      intronic
chr1:150107649(+) A-I      intronic
chr1:150109208(+) A-I      intronic
chr1:150114946(+) A-I      intronic
chr1:150107656(+) A-I      intronic
chr1:150099538(+) A-I      intronic
chr1:150096402(+) A-I      intronic
chr1:150096391(+) A-I      intronic
chr1:150096316(+) A-I      intronic
chr1:150089143(+) A-I      intronic
chr1:150089142(+) A-I      intronic
chr1:150089137(+) A-I      intronic
chr1:150089049(+) A-I      intronic
chr1:150086784(+) A-I      intronic
chr1:150086779(+) A-I      intronic
chr1:150086758(+) A-I      intronic
chr1:150086757(+) A-I      intronic
chr1:150086735(+) A-I      intronic
chr1:150086417(+) A-I      intronic
chr1:150086402(+) A-I      intronic
chr1:150085965(+) A-I      intronic
chr1:150069635(+) A-I      intronic
chr1:150085913(+) A-I      intronic
chr1:150085890(+) A-I      intronic
chr1:150085825(+) A-I      intronic
chr1:150085824(+) A-I      intronic
chr1:150069710(+) A-I      intronic
chr1:150069714(+) A-I      intronic
chr1:150073644(+) A-I      intronic
chr1:150085786(+) A-I      intronic
chr1:150107966(+) A-I      intronic
chr1:150085778(+) A-I      intronic
chr1:150069974(+) A-I      intronic
chr1:150081272(+) A-I      intronic
chr1:150069978(+) A-I      intronic
chr1:150081245(+) A-I      intronic
chr1:150107980(+) A-I      intronic
chr1:150079947(+) A-I      intronic
chr1:150079936(+) A-I      intronic
chr1:150079829(+) A-I      intronic
chr1:150070136(+) A-I      intronic
chr1:150079750(+) A-I      intronic
chr1:150076907(+) A-I      intronic
chr1:150076763(+) A-I      intronic
chr1:150108200(+) A-I      intronic
chr1:150073639(+) A-I      intronic
chr1:150112197(+) A-I      intronic
chr1:150070160(+) A-I      intronic
chr1:150070171(+) A-I      intronic
chr1:150073622(+) A-I      intronic
chr1:150090816(+) A-I      intronic
chr1:150044497(+) A-I      intronic
chr1:150046186(+) A-I      intronic
chr1:150046198(+) A-I      intronic
chr1:150074538(+) A-I      intronic
chr1:150067578(+) A-I      intronic
chr1:150074520(+) A-I      intronic
chr1:150071861(+) A-I      intronic
chr1:150067592(+) A-I      intronic
chr1:150069317(+) A-I      intronic
chr1:150070173(+) A-I      intronic
chr1:150074479(+) A-I      intronic
chr1:150074464(+) A-I      intronic
chr1:150074080(+) A-I      intronic
chr1:150073654(+) A-I      intronic
chr1:150101804(+) A-I      intronic
chr1:150089198(+) A-I      intronic
chr1:150074580(+) A-I      intronic
chr1:150089204(+) A-I      intronic
chr1:150071432(+) A-I      intronic
chr1:150090786(+) A-I      intronic
chr1:150071511(+) A-I      intronic
chr1:150089699(+) A-I      intronic
chr1:150089800(+) A-I      intronic
chr1:150071757(+) A-I      intronic
chr1:150089835(+) A-I      intronic
chr1:150089897(+) A-I      intronic
chr1:150090627(+) A-I      intronic
chr1:150090653(+) A-I      intronic
chr1:150090721(+) A-I      intronic
chr1:150090746(+) A-I      intronic
chr1:150099635(+) A-I      intronic
chr1:150098559(+) A-I      intronic
chr1:150100171(+) A-I      intronic
chr1:150098544(+) A-I      intronic
chr1:150098536(+) A-I      intronic
chr1:150100225(+) A-I      intronic
chr1:150098525(+) A-I      intronic
chr1:150108643(+) A-I      intronic
chr1:150100312(+) A-I      intronic
chr1:150100336(+) A-I      intronic
chr1:150098519(+) A-I      intronic
chr1:150098513(+) A-I      intronic
chr1:150090784(+) A-I      intronic
chr1:150098474(+) A-I      intronic
chr1:150090767(+) A-I      intronic
chr1:150100953(+) A-I      intronic
chr1:150098461(+) A-I      intronic
chr1:150100998(+) A-I      intronic
chr1:150090759(+) A-I      intronic
chr1:150101002(+) A-I      intronic
chr1:150081354(+) A-I      ncRNA
chr1:150101012(+) A-I      intronic
chr1:150089362(+) A-I      intronic
chr1:150073720(+) A-I      intronic
chr1:150096479(+) A-I      intronic
chr1:150097899(+) A-I      intronic
chr1:150098835(+) A-I      intronic
chr1:150115012(+) A-I      intronic
chr1:150076989(+) A-I      intronic
chr1:150081249(+) A-I      intronic
chr1:150071450(+) A-I      intronic
chr1:150070024(+) A-I      intronic
chr1:150067632(+) A-I      intronic
chr1:150071504(+) A-I      intronic
chr1:150115611(+) A-I      intronic
chr1:150052366(+) A-I      intronic
chr1:150103917(+) A-I      intronic
chr1:150108290(+) A-I      intronic
chr1:150071375(+) A-I      intronic
chr1:150093234(+) A-I      intronic
chr1:150090327(+) A-I      intronic
chr1:150081196(+) A-I      intronic
chr1:150115645(+) A-I      intronic
chr1:150109140(+) A-I      intronic
chr1:150096324(+) A-I      intronic
chr1:150074094(+) A-I      intronic
chr1:150096400(+) A-I      intronic
chr1:150103508(+) A-I      intronic
chr1:150096376(+) A-I      intronic
chr1:150069438(+) A-I      intronic
chr1:150109298(+) A-I      intronic
chr1:150079839(+) A-I      intronic
chr1:150102434(+) A-I      intronic
chr1:150094861(+) A-I      intronic
chr1:150069784(+) A-I      intronic
chr1:150076891(+) A-I      intronic
chr1:150089239(+) A-I      intronic
chr1:150098919(+) A-I      intronic
chr1:150086511(+) A-I      intronic
chr1:150098062(+) A-I      intronic
chr1:150051702(+) A-I      intronic
chr1:150089043(+) A-I      intronic
chr1:150051592(+) A-I      intronic
chr1:150098889(+) A-I      intronic
chr1:150071445(+) A-I      intronic
chr1:150102516(+) A-I      intronic
chr1:150069567(+) A-I      intronic
chr1:150103946(+) A-I      intronic
chr1:150094402(+) A-I      intronic
chr1:150094360(+) A-I      intronic
chr1:150101772(+) A-I      intronic
chr1:150099648(+) A-I      intronic
chr1:150100896(+) A-I      intronic
chr1:150103586(+) A-I      intronic
chr1:150115607(+) A-I      intronic
chr1:150108667(+) A-I      intronic
chr1:150073663(+) A-I      intronic
chr1:150108176(+) A-I      intronic
chr1:150108289(+) A-I      intronic
chr1:150096480(+) A-I      intronic
chr1:150098888(+) A-I      intronic
chr1:150076967(+) A-I      intronic
chr1:150067693(+) A-I      intronic
chr1:150079972(+) A-I      intronic
chr1:150044604(+) A-I      intronic
chr1:150114936(+) A-I      intronic
chr1:150096731(+) A-I      intronic
chr1:150070141(+) A-I      intronic
chr1:150112127(+) A-I      intronic
chr1:150089163(+) A-I      intronic
chr1:150102116(+) A-I      intronic
chr1:150108062(+) A-I      intronic
chr1:150074097(+) A-I      intronic
chr1:150103556(+) A-I      intronic
chr1:150076928(+) A-I      intronic
chr1:150086436(+) A-I      intronic
chr1:150076777(+) A-I      intronic
chr1:150081199(+) A-I      intronic
chr1:150101924(+) A-I      intronic
chr1:150086478(+) A-I      intronic
chr1:150079904(+) A-I      intronic
chr1:150097992(+) A-I      intronic
chr1:150115548(+) A-I      intronic
chr1:150051551(+) A-I      intronic
chr1:150071343(+) A-I      intronic
chr1:150109930(+) A-I      intronic
chr1:150096401(+) A-I      intronic
chr1:150089883(+) A-I      intronic
chr1:150114907(+) A-I      intronic
chr1:150074495(+) A-I      intronic
chr1:150071756(+) A-I      intronic
chr1:150109956(+) A-I      intronic
chr1:150105456(+) A-I      intronic
chr1:150108555(+) A-I      intronic
chr1:150076908(+) A-I      intronic
chr1:150071548(+) A-I      intronic
chr1:150102219(+) A-I      intronic
chr1:150071825(+) A-I      intronic
chr1:150109178(+) A-I      intronic
chr1:150074539(+) A-I      intronic
chr1:150109245(+) A-I      intronic
chr1:150054508(+) A-I      intronic
chr1:150076968(+) A-I      intronic
chr1:150103454(+) A-I      intronic
chr1:150096416(+) A-I      intronic
chr1:150081325(+) A-I      ncRNA
chr1:150081345(+) A-I      ncRNA
chr1:150081328(+) A-I      ncRNA
chr1:150081379(+) A-I      ncRNA
chr1:150081380(+) A-I      ncRNA
chr1:150081342(+) A-I      ncRNA
chr1:150081365(+) A-I      ncRNA
chr1:150081307(+) A-I      ncRNA
chr1:150081384(+) A-I      ncRNA
chr1:150081407(+) A-I      ncRNA
chr1:150077183(+) A-I      intronic
chr1:150054500(+) A-I      intronic
chr1:150103543(+) A-I      intronic
chr1:150073885(+) A-I      intronic
chr1:150111857(+) A-I      intronic
chr1:150100952(+) A-I      intronic
chr1:150099596(+) A-I      intronic
chr1:150077141(+) A-I      intronic
chr1:150109337(+) A-I      intronic
chr1:150101870(+) A-I      intronic
chr1:150089385(+) A-I      intronic
chr1:150076381(+) A-I      intronic
chr1:150096392(+) A-I      intronic
chr1:150102629(+) A-I      intronic
chr1:150071395(+) A-I      intronic
chr1:150096377(+) A-I      intronic
chr1:150109895(+) A-I      intronic
chr1:150069290(+) A-I      intronic
chr1:150096811(+) A-I      intronic
chr1:150073854(+) A-I      intronic
chr1:150070151(+) A-I      intronic
chr1:150115602(+) A-I      intronic
chr1:150094359(+) A-I      intronic
chr1:150071415(+) A-I      intronic
chr1:150046368(+) A-I      intronic
chr1:150073929(+) A-I      intronic
chr1:150071360(+) A-I      intronic
chr1:150111781(+) A-I      intronic
chr1:150107877(+) A-I      intronic
chr1:150102213(+) A-I      intronic
chr1:150070081(+) A-I      intronic
chr1:150074762(+) A-I      intronic
chr1:150099634(+) A-I      intronic
chr1:150102599(+) A-I      intronic
chr1:150089169(+) A-I      intronic
chr1:150090624(+) A-I      intronic
chr1:150109200(+) A-I      intronic
chr1:150097882(+) A-I      intronic
chr1:150093235(+) A-I      intronic
chr1:150107872(+) A-I      intronic
chr1:150099598(+) A-I      intronic
chr1:150102582(+) A-I      intronic
chr1:150052356(+) A-I      intronic
chr1:150080023(+) A-I      intronic
chr1:150073892(+) A-I      intronic
chr1:150086751(+) A-I      intronic
chr1:150090801(+) A-I      intronic
chr1:150076839(+) A-I      intronic
chr1:150070113(+) A-I      intronic
chr1:150074763(+) A-I      intronic
chr1:150073595(+) A-I      intronic
chr1:150100153(+) A-I      intronic
chr1:150079917(+) A-I      intronic
chr1:150077108(+) A-I      intronic
chr1:150114908(+) A-I      intronic
chr1:150090707(+) A-I      intronic
chr1:150100242(+) A-I      intronic
chr1:150115512(+) A-I      intronic
chr1:150109097(+) A-I      intronic
chr1:150107986(+) A-I      intronic
chr1:150076384(+) A-I      intronic
chr1:150079811(+) A-I      intronic
chr1:150071815(+) A-I      intronic
chr1:150104000(+) A-I      intronic
chr1:150074671(+) A-I      intronic
chr1:150094161(+) A-I      intronic
chr1:150115678(+) A-I      intronic
chr1:150051728(+) A-I      intronic
chr1:150074672(+) A-I      intronic
chr1:150074512(+) A-I      intronic
chr1:150115112(+) A-I      intronic
chr1:150102104(+) A-I      intronic
chr1:150089079(+) A-I      intronic
chr1:150115543(+) A-I      intronic
chr1:150074714(+) A-I      intronic
chr1:150099586(+) A-I      intronic
chr1:150098611(+) A-I      intronic
chr1:150076515(+) A-I      intronic
chr1:150098358(+) A-I      intronic
chr1:150101850(+) A-I      intronic
chr1:150094967(+) A-I      intronic
chr1:150074458(+) A-I      intronic
chr1:150073689(+) A-I      intronic
chr1:150071396(+) A-I      intronic
chr1:150086862(+) A-I      intronic
chr1:150086504(+) A-I      intronic
chr1:150103922(+) A-I      intronic
chr1:150109297(+) A-I      intronic
chr1:150103544(+) A-I      intronic
chr1:150103972(+) A-I      intronic
chr1:150054477(+) A-I      intronic
chr1:150071793(+) A-I      intronic
chr1:150086780(+) A-I      intronic
chr1:150103598(+) A-I      intronic
chr1:150074892(+) A-I      intronic
chr1:150050719(+) A-I      intronic
chr1:150076844(+) A-I      intronic
chr1:150103712(+) A-I      intronic
chr1:150076470(+) A-I      intronic
chr1:150103941(+) A-I      intronic
chr1:150090215(+) A-I      intronic
chr1:150070134(+) A-I      intronic
chr1:150114947(+) A-I      intronic
chr1:150089475(+) A-I      intronic
chr1:150115698(+) A-I      intronic
chr1:150112247(+) A-I      intronic
chr1:150100165(+) A-I      intronic
chr1:150076830(+) A-I      intronic
chr1:150074718(+) A-I      intronic
chr1:150051585(+) A-I      intronic
chr1:150102527(+) A-I      intronic
chr1:150107983(+) A-I      intronic
chr1:150089921(+) A-I      intronic
chr1:150115014(+) A-I      intronic
chr1:150114874(+) A-I      intronic
chr1:150108342(+) A-I      intronic
chr1:150044475(+) A-I      intronic
chr1:150067633(+) A-I      intronic
chr1:150103377(+) A-I      intronic
chr1:150076846(+) A-I      intronic
chr1:150109912(+) A-I      intronic
chr1:150112258(+) A-I      intronic
chr1:150081239(+) A-I      intronic
chr1:150096566(+) A-I      intronic
chr1:150094263(+) A-I      intronic
chr1:150108620(+) A-I      intronic
chr1:150050729(+) A-I      intronic
chr1:150077154(+) A-I      intronic
chr1:150077158(+) A-I      intronic
chr1:150114960(+) A-I      intronic
chr1:150101860(+) A-I      intronic
chr1:150076927(+) A-I      intronic
chr1:150051623(+) A-I      intronic
chr1:150071411(+) A-I      intronic
chr1:150096471(+) A-I      intronic
chr1:150070097(+) A-I      intronic
chr1:150079876(+) A-I      intronic
chr1:150069305(+) A-I      intronic
chr1:150107553(+) A-I      intronic
chr1:150074089(+) A-I      intronic
chr1:150102129(+) A-I      intronic
chr1:150055654(+) A-I      intronic
chr1:150100248(+) A-I      intronic
chr1:150107573(+) A-I      intronic
chr1:150076568(+) A-I      intronic
chr1:150077102(+) A-I      intronic
chr1:150100240(+) A-I      intronic
chr1:150099539(+) A-I      intronic
chr1:150107939(+) A-I      intronic
chr1:150109876(+) A-I      intronic
chr1:150111835(+) A-I      intronic
chr1:150109084(+) A-I      intronic
chr1:150107929(+) A-I      intronic
chr1:150074158(+) A-I      intronic
chr1:150080758(+) A-I      intronic
chr1:150079748(+) A-I      intronic
chr1:150115672(+) A-I      intronic
chr1:150096782(+) A-I      intronic
chr1:150115632(+) A-I      intronic
chr1:150109259(+) A-I      intronic
chr1:150115513(+) A-I      intronic
chr1:150069809(+) A-I      intronic
chr1:150071779(+) A-I      intronic
chr1:150115496(+) A-I      intronic
chr1:150089479(+) A-I      intronic
chr1:150076981(+) A-I      intronic
chr1:150071447(+) A-I      intronic
chr1:150108607(+) A-I      intronic
chr1:150096772(+) A-I      intronic
chr1:150074891(+) A-I      intronic
chr1:150074738(+) A-I      intronic
chr1:150100328(+) A-I      intronic
chr1:150098599(+) A-I      intronic
chr1:150076363(+) A-I      intronic
chr1:150074712(+) A-I      intronic
chr1:150114900(+) A-I      intronic
chr1:150093225(+) A-I      intronic
chr1:150107498(+) A-I      intronic
chr1:150067492(+) A-I      intronic
chr1:150115617(+) A-I      intronic
chr1:150090249(+) A-I      intronic
chr1:150094230(+) A-I      intronic
chr1:150098904(+) A-I      intronic
chr1:150093253(+) A-I      intronic
chr1:150115592(+) A-I      intronic
chr1:150074609(+) A-I      intronic
chr1:150103511(+) A-I      intronic
chr1:150098903(+) A-I      intronic
chr1:150103735(+) A-I      intronic
chr1:150085733(+) A-I      intronic
chr1:150103464(+) A-I      intronic
chr1:150051761(+) A-I      intronic
chr1:150052372(+) A-I      intronic
chr1:150108245(+) A-I      intronic
chr1:150102234(+) A-I      intronic
chr1:150115591(+) A-I      intronic
chr1:150094931(+) A-I      intronic
chr1:150089384(+) A-I      intronic
chr1:150115539(+) A-I      intronic
chr1:150077129(+) A-I      intronic
chr1:150073675(+) A-I      intronic
chr1:150112122(+) A-I      intronic
chr1:150079940(+) A-I      intronic
chr1:150096885(+) A-I      intronic
chr1:150079894(+) A-I      intronic
chr1:150079810(+) A-I      intronic
chr1:150071517(+) A-I      intronic
chr1:150112268(+) A-I      intronic
chr1:150107517(+) A-I      intronic
chr1:150073899(+) A-I      intronic
chr1:150074088(+) A-I      intronic
chr1:150112159(+) A-I      intronic
chr1:150081246(+) A-I      intronic
chr1:150067663(+) A-I      intronic
chr1:150096789(+) A-I      intronic
chr1:150108663(+) A-I      intronic
chr1:150115655(+) A-I      intronic
chr1:150096325(+) A-I      intronic
chr1:150102567(+) A-I      intronic
chr1:150079778(+) A-I      intronic
chr1:150103426(+) A-I      intronic
chr1:150109292(+) A-I      intronic
chr1:150115005(+) A-I      intronic
chr1:150071494(+) A-I      intronic
chr1:150097913(+) A-I      intronic
chr1:150098598(+) A-I      intronic
chr1:150099602(+) A-I      intronic
chr1:150108195(+) A-I      intronic
chr1:150081275(+) A-I      intronic
chr1:150076871(+) A-I      intronic
chr1:150071397(+) A-I      intronic
chr1:150112241(+) A-I      intronic
chr1:150108625(+) A-I      intronic
chr1:150073664(+) A-I      intronic
chr1:150105455(+) A-I      intronic
chr1:150096744(+) A-I      intronic
chr1:150098522(+) A-I      intronic
chr1:150108260(+) A-I      intronic
chr1:150100291(+) A-I      intronic
chr1:150079908(+) A-I      intronic
chr1:150069805(+) A-I      intronic
chr1:150076374(+) A-I      intronic
chr1:150108611(+) A-I      intronic
chr1:150114943(+) A-I      intronic
chr1:150114942(+) A-I      intronic
chr1:150081189(+) A-I      intronic
chr1:150100359(+) A-I      intronic
chr1:150108678(+) A-I      intronic
chr1:150051562(+) A-I      intronic
chr1:150061691(+) A-I      intronic
chr1:150109172(+) A-I      intronic
chr1:150073586(+) A-I      intronic
chr1:150115536(+) A-I      intronic
chr1:150074815(+) A-I      intronic
chr1:150103435(+) A-I      intronic
chr1:150076541(+) A-I      intronic
chr1:150076969(+) A-I      intronic
chr1:150097977(+) A-I      intronic
chr1:150116394(+) A-I      intronic
chr1:150109881(+) A-I      intronic
chr1:150071527(+) A-I      intronic
chr1:150076524(+) A-I      intronic
chr1:150101888(+) A-I      intronic
chr1:150100149(+) A-I      intronic
chr1:150096758(+) A-I      intronic
chr1:150099687(+) A-I      intronic
chr1:150111743(+) A-I      intronic
chr1:150115646(+) A-I      intronic
chr1:150111751(+) A-I      intronic
chr1:150096558(+) A-I      intronic
chr1:150098970(+) A-I      intronic
chr1:150103732(+) A-I      intronic
chr1:150099651(+) A-I      intronic
chr1:150074459(+) A-I      intronic
chr1:150076583(+) A-I      intronic
chr1:150076905(+) A-I      intronic
chr1:150050628(+) A-I      intronic
chr1:150096797(+) A-I      intronic
chr1:150109188(+) A-I      intronic
chr1:150109325(+) A-I      intronic
chr1:150105665(+) A-I      intronic
chr1:150100406(+) A-I      intronic
chr1:150071770(+) A-I      intronic
chr1:150073587(+) A-I      intronic
chr1:150071398(+) A-I      intronic
chr1:150097861(+) A-I      intronic
chr1:150096396(+) A-I      intronic
chr1:150089172(+) A-I      intronic
chr1:150071574(+) A-I      intronic
chr1:150089301(+) A-I      intronic
chr1:150115620(+) A-I      intronic
chr1:150107965(+) A-I      intronic
chr1:150069700(+) A-I      intronic
chr1:150071380(+) A-I      intronic
chr1:150098021(+) A-I      intronic
chr1:150109821(+) A-I      intronic
chr1:150076364(+) A-I      intronic
chr1:150070078(+) A-I      intronic
chr1:150074737(+) A-I      intronic
chr1:150071456(+) A-I      intronic
chr1:150102533(+) A-I      intronic
chr1:150102137(+) A-I      intronic
chr1:150069645(+) A-I      intronic
chr1:150085777(+) A-I      intronic
chr1:150071549(+) A-I      intronic
chr1:150107501(+) A-I      intronic
chr1:150107851(+) A-I      intronic
chr1:150094252(+) A-I      intronic
chr1:150108668(+) A-I      intronic
chr1:150069327(+) A-I      intronic
chr1:150112303(+) A-I      intronic
chr1:150103932(+) A-I      intronic
chr1:150076758(+) A-I      intronic
chr1:150090118(+) A-I      intronic
chr1:150103956(+) A-I      intronic
chr1:150076391(+) A-I      intronic
chr1:150099633(+) A-I      intronic
chr1:150081285(+) A-I      intronic
chr1:150100329(+) A-I      intronic
chr1:150086429(+) A-I      intronic
chr1:150107563(+) A-I      intronic
chr1:150099622(+) A-I      intronic
chr1:150074736(+) A-I      intronic
chr1:150079921(+) A-I      intronic
chr1:150044603(+) A-I      intronic
chr1:150102483(+) A-I      intronic
chr1:150105447(+) A-I      intronic
chr1:150107610(+) A-I      intronic
chr1:150076377(+) A-I      intronic
chr1:150108074(+) A-I      intronic
chr1:150074382(+) A-I      intronic
chr1:150115637(+) A-I      intronic
chr1:150102055(+) A-I      intronic
chr1:150077153(+) A-I      intronic
chr1:150076447(+) A-I      intronic
chr1:150071526(+) A-I      intronic
chr1:150067703(+) A-I      intronic
chr1:150074804(+) A-I      intronic
chr1:150094253(+) A-I      intronic
chr1:150114924(+) A-I      intronic
chr1:150079779(+) A-I      intronic
chr1:150086894(+) A-I      intronic
chr1:150046335(+) A-I      intronic
chr1:150090698(+) A-I      intronic
chr1:150069564(+) A-I      intronic
chr1:150090162(+) A-I      intronic
chr1:150076987(+) A-I      intronic
chr1:150109970(+) A-I      intronic
chr1:150076834(+) A-I      intronic
chr1:150070091(+) A-I      intronic
chr1:150076446(+) A-I      intronic
chr1:150108351(+) A-I      intronic
chr1:150115701(+) A-I      intronic
chr1:150070077(+) A-I      intronic
chr1:150103425(+) A-I      intronic
chr1:150076852(+) A-I      intronic
chr1:150103569(+) A-I      intronic
chr1:150086841(+) A-I      intronic
chr1:150115656(+) A-I      intronic
chr1:150071564(+) A-I      intronic
chr1:150103517(+) A-I      intronic
chr1:150101926(+) A-I      intronic
chr1:150114968(+) A-I      intronic
chr1:150090282(+) A-I      intronic
chr1:150079854(+) A-I      intronic
chr1:150076942(+) A-I      intronic
chr1:150076376(+) A-I      intronic
chr1:150086442(+) A-I      intronic
chr1:150097877(+) A-I      intronic
chr1:150108597(+) A-I      intronic
chr1:150115687(+) A-I      intronic
chr1:150076499(+) A-I      intronic
chr1:150069844(+) A-I      intronic
chr1:150086989(+) A-I      intronic
chr1:150074179(+) A-I      intronic
chr1:150100224(+) A-I      intronic
chr1:150108177(+) A-I      intronic
chr1:150114866(+) A-I      intronic
chr1:150081207(+) A-I      intronic
chr1:150095042(+) A-I      intronic
chr1:150109092(+) A-I      intronic
chr1:150107541(+) A-I      intronic
chr1:150081263(+) A-I      intronic
chr1:150079787(+) A-I      intronic
chr1:150108598(+) A-I      intronic
chr1:150073693(+) A-I      intronic
chr1:150090205(+) A-I      intronic
chr1:150054509(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED VPS45
chr1:150071395(+) A-I intron -    15545495
chr1:150071396(+) A-I intron -    15545495
chr1:150071398(+) A-I intron -    15545495
chr1:150071415(+) A-I intron -    15545495   //22327324
chr1:150071456(+) A-I intron -    15545495
chr1:150071494(+) A-I intron -    15545495
chr1:150074714(+) A-I intron -    22327324
chr1:150074804(+) A-I intron -    21960545   //22327324
chr1:150074892(+) A-I intron -    22327324
chr1:150076446(+) A-I intron -    21960545   //22327324
chr1:150076470(+) A-I intron -    22327324
chr1:150076758(+) A-I intron -    22327324
chr1:150081199(+) A-I intron -    22327324
chr1:150081380(+) A-I intron -    22327324
chr1:150065928(+) A-I intron -    21960545
chr1:150074672(+) A-I intron -    21960545
chr1:150076646(+) A-I intron -    21960545
chr1:150077183(+) A-I intron -    21960545
chr1:150098970(+) A-I intron -    21960545
chr1:150103712(+) A-I intron -    21960545
chr1:150114866(+) A-I intron -    21960545
chr1:150114874(+) A-I intron -    21960545
chr1:150074714(+) A-G intron -    22484847
chr1:150074738(+) A-G intron -    22484847
chr1:150074762(+) A-G intron -    22484847
chr1:150074892(+) A-G intron -    22484847
chr1:150076446(+) A-G intron -    22484847
chr1:150076541(+) A-G intron -    22484847
chr1:150076583(+) A-G intron -    22484847
chr1:150077154(+) A-G intron -    22484847
chr1:150077158(+) A-G intron -    22484847
chr1:150077183(+) A-G intron -    22484847
chr1:150046335(+) A-G intron -    22484847
chr1:150051551(+) A-G intron -    22484847
chr1:150051585(+) A-G intron -    22484847
chr1:150051592(+) A-G intron -    22484847
chr1:150051702(+) A-G intron -    22484847
chr1:150051728(+) A-G intron -    22484847
chr1:150067492(+) A-G intron -    22484847
chr1:150069290(+) A-G intron -    22484847
chr1:150069305(+) A-G intron -    22484847
chr1:150069564(+) A-G intron -    22484847
chr1:150069645(+) A-G intron -    22484847
chr1:150069700(+) A-G intron -    22484847
chr1:150070024(+) A-G intron -    22484847
chr1:150070077(+) A-G intron -    22484847
chr1:150070141(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071395(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071396(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071397(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071398(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071411(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071415(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071456(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071494(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071504(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071548(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071756(+) A-G intron -    22484847
chr1:150071815(+) A-G intron -    22484847
chr1:150073201(+) T-C intron -    22484847
chr1:150073595(+) A-G intron -    22484847
chr1:150074179(+) A-G intron -    22484847
chr1:150074539(+) A-G intron -    22484847
chr1:150074671(+) A-G intron -    22484847
chr1:150076758(+) A-G intron -    22484847
chr1:150076777(+) A-G intron -    22484847
chr1:150076908(+) A-G intron -    22484847
chr1:150076967(+) A-G intron -    22484847
chr1:150079787(+) A-G intron -    22484847
chr1:150079839(+) A-G intron -    22484847
chr1:150079866(+) G-T intron -    22484847
chr1:150079894(+) A-G intron -    22484847
chr1:150079904(+) A-G intron -    22484847
chr1:150079908(+) A-G intron -    22484847
chr1:150079917(+) A-G intron -    22484847
chr1:150079940(+) A-G intron -    22484847
chr1:150079972(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081196(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081199(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081207(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081239(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081246(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081263(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081307(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081325(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081328(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081345(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081354(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081365(+) A-G intron -    22484847
chr1:150081380(+) A-G intron -    22484847
chr1:150089079(+) A-G intron -    22484847
chr1:150089385(+) A-G intron -    22484847
chr1:150090624(+) A-G intron -    22484847
chr1:150094230(+) A-G intron -    22484847
chr1:150094252(+) A-G intron -    22484847
chr1:150094253(+) A-G intron -    22484847
chr1:150094263(+) A-G intron -    22484847
chr1:150094360(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096325(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096376(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096377(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096392(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096396(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096400(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096401(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096471(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096479(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096480(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096744(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096758(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096789(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096797(+) A-G intron -    22484847
chr1:150096832(+) T-C intron -    22484847
chr1:150096885(+) A-G intron -    22484847
chr1:150097861(+) A-G intron -    22484847
chr1:150097882(+) A-G intron -    22484847
chr1:150097899(+) A-G intron -    22484847
chr1:150097977(+) A-G intron -    22484847
chr1:150098358(+) A-G intron -    22484847
chr1:150098522(+) A-G intron -    22484847
chr1:150098598(+) A-G intron -    22484847
chr1:150098599(+) A-G intron -    22484847
chr1:150098611(+) A-G intron -    22484847
chr1:150098888(+) A-G intron -    22484847
chr1:150098889(+) A-G intron -    22484847
chr1:150099596(+) A-G intron -    22484847
chr1:150099633(+) A-G intron -    22484847
chr1:150099687(+) A-G intron -    22484847
chr1:150100149(+) A-G intron -    22484847
chr1:150100165(+) A-G intron -    22484847
chr1:150100224(+) A-G intron -    22484847
chr1:150100240(+) A-G intron -    22484847
chr1:150100242(+) A-G intron -    22484847
chr1:150100248(+) A-G intron -    22484847
chr1:150100291(+) A-G intron -    22484847
chr1:150100896(+) A-G intron -    22484847
chr1:150100952(+) A-G intron -    22484847
chr1:150101772(+) A-G intron -    22484847
chr1:150101924(+) A-G intron -    22484847
chr1:150101926(+) A-G intron -    22484847
chr1:150102055(+) A-G intron -    22484847
chr1:150102104(+) A-G intron -    22484847
chr1:150102483(+) A-G intron -    22484847
chr1:150102516(+) A-G intron -    22484847
chr1:150102567(+) A-G intron -    22484847
chr1:150102582(+) A-G intron -    22484847
chr1:150102599(+) A-G intron -    22484847
chr1:150103426(+) A-G intron -    22484847
chr1:150103517(+) A-G intron -    22484847
chr1:150103544(+) A-G intron -    22484847
chr1:150103917(+) A-G intron -    22484847
chr1:150103922(+) A-G intron -    22484847
chr1:150103946(+) A-G intron -    22484847
chr1:150103956(+) A-G intron -    22484847
chr1:150107851(+) A-G intron -    22484847
chr1:150107872(+) A-G intron -    22484847
chr1:150108176(+) A-G intron -    22484847
chr1:150108195(+) A-G intron -    22484847
chr1:150109084(+) A-G intron -    22484847
chr1:150109092(+) A-G intron -    22484847
chr1:150109097(+) A-G intron -    22484847
chr1:150109188(+) A-G intron -    22484847
chr1:150109245(+) A-G intron -    22484847
chr1:150109259(+) A-G intron -    22484847
chr1:150109895(+) A-G intron -    22484847
chr1:150109930(+) A-G intron -    22484847
chr1:150109956(+) A-G intron -    22484847
chr1:150112127(+) A-G intron -    22484847
chr1:150112241(+) A-G intron -    22484847
chr1:150112258(+) A-G intron -    22484847
chr1:150112268(+) A-G intron -    22484847
chr1:150114866(+) A-G intron -    22484847
chr1:150114874(+) A-G intron -    22484847
chr1:150114900(+) A-G intron -    22484847
chr1:150114908(+) A-G intron -    22484847
chr1:150114943(+) A-G intron -    22484847
chr1:150115012(+) A-G intron -    22484847
chr1:150115070(+) A-G intron -    22484847
chr1:150115512(+) A-G intron -    22484847
chr1:150115539(+) A-G intron -    22484847
chr1:150115592(+) A-G intron -    22484847
chr1:150115637(+) A-G intron -    22484847
chr1:150115646(+) A-G intron -    22484847
chr1:150115687(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase VPS45
chr1:150039537-150039538(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22608085
chr1:150039764-150039765(+) m6A 5'UTR//intron       25456834//24981863//22608085
chr1:150039794-150039795(+) m6A 5'UTR//intron       25456834//24981863//22608085
chr1:150039835-150039836(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863//22608085
chr1:150039848-150039849(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863//22608085
chr1:150039963-150039964(+) m6A 5'UTR//CDS//exon//intron       24981863//22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate VPS45
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Exosome Blood     -
Membrane K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-US33-5p
Interactor2: VPS45

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...