Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00237131

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US33-5p:  MIMAT0001584          REL:  NM_001291746     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US33-5p	REL
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001584	5966
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C-Rel//HIVEN86A

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	REL	chr2:61150099(+) A-I      3'UTR chr2:61150091(+) A-I      3'UTR chr2:61130648(+) A-I      intronic chr2:61150058(+) A-I      3'UTR chr2:61124929(+) A-I      intronic chr2:61124933(+) A-I      intronic chr2:61126493(+) A-I      intronic chr2:61131848(+) A-I      intronic chr2:61124906(+) A-I      intronic chr2:61150111(+) A-I      3'UTR chr2:61150108(+) A-I      3'UTR chr2:61131878(+) A-I      intronic chr2:61131823(+) A-I      intronic chr2:61150104(+) A-I      3'UTR chr2:61134943(+) A-I      intronic chr2:61134955(+) A-I      intronic chr2:61132331(+) A-I      intronic chr2:61134959(+) A-I      intronic chr2:61134962(+) A-I      intronic chr2:61135012(+) A-I      intronic chr2:61135038(+) A-I      intronic chr2:61136696(+) A-I      intronic chr2:61136827(+) A-I      intronic chr2:61136889(+) A-I      intronic chr2:61123284(+) A-I      intronic chr2:61132359(+) A-I      intronic chr2:61132396(+) A-I      intronic chr2:61132414(+) A-I      intronic chr2:61132481(+) A-I      intronic chr2:61134158(+) A-I      intronic chr2:61134159(+) A-I      intronic chr2:61134172(+) A-I      intronic chr2:61126349(+) A-I      intronic chr2:61126365(+) A-I      intronic chr2:61126366(+) A-I      intronic chr2:61126374(+) A-I      intronic chr2:61130664(+) A-I      intronic chr2:61143501(+) A-I      intronic chr2:61143442(+) A-I      intronic chr2:61134210(+) A-I      intronic chr2:61143402(+) A-I      intronic chr2:61143393(+) A-I      intronic chr2:61143371(+) A-I      intronic chr2:61143292(+) A-I      intronic chr2:61130798(+) A-I      intronic chr2:61130768(+) A-I      intronic chr2:61130635(+) A-I      intronic chr2:61134155(+) A-I      intronic chr2:61130866(+) A-I      intronic chr2:61126382(+) A-I      intronic chr2:61123224(+) A-I      intronic chr2:61131291(+) A-I      intronic chr2:61131377(+) A-I      intronic chr2:61131378(+) A-I      intronic chr2:61130895(+) A-I      intronic chr2:61131426(+) A-I      intronic chr2:61131443(+) A-I      intronic chr2:61131462(+) A-I      intronic chr2:61130901(+) A-I      intronic chr2:61134264(+) A-I      intronic chr2:61134648(+) A-I      intronic chr2:61134666(+) A-I      intronic chr2:61130926(+) A-I      intronic chr2:61130986(+) A-I      intronic chr2:61131011(+) A-I      intronic chr2:61134965(+) A-I      intronic chr2:61131063(+) A-I      intronic chr2:61131543(+) A-I      intronic chr2:61131577(+) A-I      intronic chr2:61131685(+) A-I      intronic chr2:61131702(+) A-I      intronic chr2:61131935(+) A-I      intronic chr2:61131966(+) A-I      intronic chr2:61132294(+) A-I      intronic chr2:61134676(+) A-I      intronic chr2:61132012(+) A-I      intronic chr2:61126467(+) A-I      intronic chr2:61127801(+) A-I      intronic chr2:61127843(+) A-I      intronic chr2:61134919(+) A-I      intronic chr2:61127864(+) A-I      intronic chr2:61130573(+) A-I      intronic chr2:61130602(+) A-I      intronic chr2:61130621(+) A-I      intronic chr2:61134710(+) A-I      intronic chr2:61136799(+) A-I      intronic chr2:61134194(+) A-I      intronic chr2:61143428(+) A-I      intronic chr2:61131283(+) A-I      intronic chr2:61143418(+) A-I      intronic chr2:61126422(+) A-I      intronic chr2:61134608(+) A-I      intronic chr2:61126477(+) A-I      intronic chr2:61126344(+) A-I      intronic chr2:61131374(+) A-I      intronic chr2:61131004(+) A-I      intronic chr2:61131768(+) A-I      intronic chr2:61126420(+) A-I      intronic chr2:61131282(+) A-I      intronic chr2:61124568(+) A-I      intronic chr2:61122538(+) A-I      intronic chr2:61136921(+) A-I      intronic chr2:61132436(+) A-I      intronic chr2:61127759(+) A-I      intronic chr2:61131837(+) A-I      intronic chr2:61134289(+) A-I      intronic chr2:61130871(+) A-I      intronic chr2:61136612(+) A-I      intronic chr2:61136689(+) A-I      intronic chr2:61130769(+) A-I      intronic chr2:61122417(+) A-I      intronic chr2:61136865(+) A-I      intronic chr2:61136871(+) A-I      intronic chr2:61126539(+) A-I      intronic chr2:61130638(+) A-I      intronic chr2:61127841(+) A-I      intronic chr2:61134580(+) A-I      intronic chr2:61131882(+) A-I      intronic chr2:61127800(+) A-I      intronic chr2:61122010(+) A-I      intronic chr2:61130583(+) A-I      intronic chr2:61123280(+) A-I      intronic chr2:61143299(+) A-I      intronic chr2:61131789(+) A-I      intronic chr2:61134654(+) A-I      intronic chr2:61149932(+) A-I      3'UTR chr2:61150032(+) A-I      3'UTR chr2:61150001(+) A-I      3'UTR chr2:61135088(+) A-I      intronic chr2:61134548(+) A-I      intronic chr2:61130888(+) A-I      intronic chr2:61130849(+) A-I      intronic chr2:61130733(+) A-I      intronic chr2:61123278(+) A-I      intronic chr2:61124930(+) A-I      intronic chr2:61134851(+) A-I      intronic chr2:61132347(+) A-I      intronic chr2:61136687(+) A-I      intronic chr2:61131337(+) A-I      intronic chr2:61131360(+) A-I      intronic chr2:61128391(+) A-I      intronic chr2:61131440(+) A-I      intronic chr2:61130700(+) A-I      intronic chr2:61142209(+) A-I      intronic chr2:61143495(+) A-I      intronic chr2:61131346(+) A-I      intronic chr2:61130918(+) A-I      intronic chr2:61131559(+) A-I      intronic chr2:61131914(+) A-I      intronic chr2:61124920(+) A-I      intronic chr2:61126499(+) A-I      intronic chr2:61126551(+) A-I      intronic chr2:61131918(+) A-I      intronic chr2:61126521(+) A-I      intronic chr2:61131274(+) A-I      intronic chr2:61122500(+) A-I      intronic chr2:61123300(+) A-I      intronic chr2:61124462(+) A-I      intronic chr2:61126363(+) A-I      intronic chr2:61126515(+) A-I      intronic chr2:61128347(+) A-I      intronic chr2:61131607(+) A-I      intronic chr2:61131352(+) A-I      intronic chr2:61131376(+) A-I      intronic chr2:61129846(+) A-I      intronic chr2:61131386(+) A-I      intronic chr2:61130928(+) A-I      intronic chr2:61131551(+) A-I      intronic chr2:61126512(+) A-I      intronic chr2:61131931(+) A-I      intronic chr2:61134504(+) A-I      intronic chr2:61126618(+) A-I      intronic chr2:61126392(+) A-I      intronic chr2:61122418(+) A-I      intronic chr2:61135018(+) A-I      intronic chr2:61130634(+) A-I      intronic chr2:61124468(+) A-I      intronic chr2:61136855(+) A-I      intronic chr2:61131326(+) A-I      intronic chr2:61134695(+) A-I      intronic chr2:61147356(+) A-I      intronic chr2:61142092(+) A-I      intronic chr2:61142173(+) A-I      intronic chr2:61142096(+) A-I      intronic chr2:61147407(+) A-I      intronic chr2:61127758(+) A-I      intronic chr2:61130692(+) A-I      intronic chr2:61136791(+) A-I      intronic chr2:61143386(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	REL	chr2:61131004(+) A-I intron -    22327324 chr2:61131838(+) A-I intron -    22327324 chr2:61131918(+) A-I intron -    21960545 chr2:61109708(+) G-A intron -    22484847 chr2:61109727(+) T-C intron -    22484847 chr2:61115173(+) T-C intron -    22484847 chr2:61122369(+) A-G intron -    22484847 chr2:61122417(+) A-G intron -    22484847 chr2:61122418(+) A-G intron -    22484847 chr2:61122497(+) T-A intron -    22484847 chr2:61122505(+) T-C intron -    22484847 chr2:61122525(+) A-G intron -    22484847 chr2:61123187(+) C-G intron -    22484847 chr2:61124450(+) C-T intron -    22484847 chr2:61124462(+) A-G intron -    22484847 chr2:61124491(+) G-A intron -    22484847 chr2:61124568(+) A-G intron -    22484847 chr2:61124629(+) T-G intron -    22484847 chr2:61124920(+) A-G intron -    22484847 chr2:61124930(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126363(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126445(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126477(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126512(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126515(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126521(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126534(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126539(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126551(+) A-G intron -    22484847 chr2:61126599(+) G-A intron -    22484847 chr2:61127758(+) A-G intron -    22484847 chr2:61127759(+) A-G intron -    22484847 chr2:61127765(+) T-C intron -    22484847 chr2:61127784(+) G-A intron -    22484847 chr2:61127841(+) A-G intron -    22484847 chr2:61128286(+) T-C intron -    22484847 chr2:61128347(+) A-G intron -    22484847 chr2:61128391(+) A-G intron -    22484847 chr2:61128394(+) A-G intron -    22484847 chr2:61129846(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130583(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130626(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130634(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130638(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130692(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130700(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130708(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130749(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130769(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130786(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130840(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130846(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130849(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130855(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130871(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130918(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130928(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130940(+) A-G intron -    22484847 chr2:61130942(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131004(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131274(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131326(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131337(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131346(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131349(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131352(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131360(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131374(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131383(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131386(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131416(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131422(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131440(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131522(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131551(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131559(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131607(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131837(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131838(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131882(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131931(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131971(+) A-G intron -    22484847 chr2:61131993(+) T-C intron -    22484847 chr2:61132347(+) A-G intron -    22484847 chr2:61132436(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134194(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134289(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134504(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134548(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134580(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134608(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134654(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134664(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134710(+) A-G intron -    22484847 chr2:61134832(+) C-T intron -    22484847 chr2:61135018(+) A-G intron -    22484847 chr2:61135034(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136612(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136616(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136687(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136689(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136791(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136799(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136850(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136855(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136865(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136871(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136885(+) A-G intron -    22484847 chr2:61136915(+) A-G intron -    22484847 chr2:61137896(+) G-A intron -    22484847 chr2:61142096(+) A-G intron -    22484847 chr2:61142173(+) A-G intron -    22484847 chr2:61142209(+) A-G intron -    22484847 chr2:61143299(+) A-G intron -    22484847 chr2:61143386(+) A-G intron -    22484847 chr2:61143418(+) A-G intron -    22484847 chr2:61143428(+) A-G intron -    22484847 chr2:61143495(+) A-G intron -    22484847 chr2:61146050(+) T-C intron -    22484847 chr2:61146117(+) A-G intron -    22484847 chr2:61147407(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	REL	chr2:61108817-61108818(+) m6A 5'UTR       24981863 chr2:61108837-61108838(+) m1A 5'UTR       26863196//26863410 chr2:61108866-61108867(+) m6A 5'UTR       - chr2:61118848-61118849(+) m6A CDS       - chr2:61118931-61118932(+) m6A CDS       24981863 chr2:61118942-61118943(+) m6A CDS       24981863 chr2:61121596-61121597(+) m6A CDS       26404942 chr2:61121625-61121626(+) m6A CDS       26404942 chr2:61121659-61121660(+) m6A CDS       26404942 chr2:61121671-61121672(+) m6A CDS       26404942 chr2:61144021-61144022(+) m6A CDS       26404942 chr2:61144063-61144064(+) m6A CDS       26404942 chr2:61144093-61144094(+) m6A CDS       26404942 chr2:61145652-61145653(+) m6A CDS       26404942 chr2:61145682-61145683(+) m6A CDS       26404942 chr2:61149086-61149087(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:61149112-61149113(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:61149334-61149335(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61149348-61149349(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61149371-61149372(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61149395-61149396(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61149404-61149405(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61149411-61149412(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//27773535//22575960//22608085 chr2:61149546-61149547(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//26404942//22608085 chr2:61149554-61149555(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:61149569-61149570(+) m6A CDS       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:61149817-61149818(+) m6A 3'UTR       26404942//22608085 chr2:61149849-61149850(+) m6A 3'UTR       26404942//22608085 chr2:61149886-61149887(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//22608085 chr2:61149965-61149966(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//22608085 chr2:61150748-61150749(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61150812-61150813(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61150993-61150994(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61151025-61151026(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61151895-61151896(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61152380-61152381(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61152397-61152398(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61152442-61152443(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61152482-61152483(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61152495-61152496(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61152535-61152536(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61152730-61152731(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61152751-61152752(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61152788-61152789(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61153249-61153250(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:61153344-61153345(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:61153379-61153380(+) m6A 3'UTR       - chr2:61153389-61153390(+) m6A 3'UTR       - chr2:61153539-61153540(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:61154892-61154893(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61154961-61154962(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61155080-61155081(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//22608085 chr2:61155086-61155087(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//22608085 chr2:61155126-61155127(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:61155154-61155155(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942//27773535//22608085 chr2:61155253-61155254(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:61155277-61155278(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22608085 chr2:61155328-61155329(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942 chr2:61155554-61155555(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61155582-61155583(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61155971-61155972(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61155999-61156000(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156015-61156016(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156094-61156095(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156100-61156101(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156302-61156303(+) m6A 3'UTR       - chr2:61156337-61156338(+) m6A 3'UTR       - chr2:61156359-61156360(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61156366-61156367(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61156417-61156418(+) m6A 3'UTR       24209618//24981863 chr2:61156470-61156471(+) m6A 3'UTR       24209618//24981863 chr2:61156494-61156495(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61156658-61156659(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156677-61156678(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156693-61156694(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156705-61156706(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156712-61156713(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156717-61156718(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156751-61156752(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156760-61156761(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156768-61156769(+) m6A 3'UTR       24284625 chr2:61156796-61156797(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr2:61157056-61157057(+) m6A 3'UTR       24981863//26404942 chr2:61157117-61157118(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:61157499-61157500(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61157778-61157779(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61157783-61157784(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61157805-61157806(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61157969-61157970(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61158009-61158010(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61158128-61158129(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61158157-61158158(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61158175-61158176(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61158242-61158243(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61158257-61158258(+) m6A 3'UTR       26404942 chr2:61158357-61158358(+) m6A 3'UTR       26404942//27773535 chr2:61158412-61158413(+) m6A 3'UTR       26404942

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	REL	Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     - Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US33-5p
Interactor2: REL

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg