Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00234919

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-2-3p:  MIMAT0001583          ATP8B2:  NM_001370597     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US25-2-3p	ATP8B2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001583	57198
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ATPID

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ATP8B2	chr1:154308426(+) A-I      intronic chr1:154308505(+) A-I      intronic chr1:154309119(+) A-I      intronic chr1:154319600(+) A-I      intronic chr1:154319613(+) A-I      intronic chr1:154319628(+) A-I      intronic chr1:154308417(+) A-I      intronic chr1:154308424(+) A-I      intronic chr1:154308388(+) A-I      intronic chr1:154320252(+) A-I      intronic chr1:154308338(+) A-I      intronic chr1:154309526(+) A-I      intronic chr1:154309410(+) A-I      intronic chr1:154308328(+) A-I      intronic chr1:154309537(+) A-I      intronic chr1:154308260(+) A-I      intronic chr1:154309536(+) A-I      intronic chr1:154320216(+) A-I      intronic chr1:154308305(+) A-I      intronic chr1:154319495(+) A-I      intronic chr1:154308312(+) A-I      intronic chr1:154320233(+) A-I      intronic chr1:154309105(+) A-I      intronic chr1:154319640(+) A-I      intronic chr1:154308313(+) A-I      intronic chr1:154308009(+) A-I      intronic chr1:154319476(+) A-I      intronic chr1:154320256(+) A-I      intronic chr1:154305695(+) A-I      intronic chr1:154308404(+) A-I      intronic chr1:154308463(+) A-I      intronic chr1:154308053(+) A-I      intronic chr1:154306373(+) A-I      intronic chr1:154309454(+) A-I      intronic chr1:154308506(+) A-I      intronic chr1:154305874(+) A-I      intronic chr1:154307986(+) A-I      intronic chr1:154309233(+) A-I      intronic chr1:154306211(+) A-I      intronic chr1:154319605(+) A-I      intronic chr1:154305824(+) A-I      intronic chr1:154305669(+) A-I      intronic chr1:154322636(+) A-I      3'UTR chr1:154307969(+) A-I      intronic chr1:154319392(+) A-I      intronic chr1:154309412(+) A-I      intronic chr1:154309173(+) A-I      intronic chr1:154308368(+) A-I      intronic chr1:154309371(+) A-I      intronic chr1:154320326(+) A-I      intronic chr1:154309405(+) A-I      intronic chr1:154309400(+) A-I      intronic chr1:154319505(+) A-I      intronic chr1:154307970(+) A-I      intronic chr1:154309397(+) A-I      intronic chr1:154308261(+) A-I      intronic chr1:154305865(+) A-I      intronic chr1:154319642(+) A-I      intronic chr1:154308150(+) A-I      intronic chr1:154309494(+) A-I      intronic chr1:154306185(+) A-I      intronic chr1:154308147(+) A-I      intronic chr1:154307958(+) A-I      intronic chr1:154309090(+) A-I      intronic chr1:154309245(+) A-I      intronic chr1:154307990(+) A-I      intronic chr1:154308421(+) A-I      intronic chr1:154305833(+) A-I      intronic chr1:154308064(+) A-I      intronic chr1:154305630(+) A-I      intronic chr1:154305686(+) A-I      intronic chr1:154308037(+) A-I      intronic chr1:154309375(+) A-I      intronic chr1:154307935(+) A-I      intronic chr1:154308238(+) A-I      intronic chr1:154308101(+) A-I      intronic chr1:154309121(+) A-I      intronic chr1:154305531(+) A-I      intronic chr1:154309232(+) A-I      intronic chr1:154305609(+) A-I      intronic chr1:154305547(+) A-I      intronic chr1:154305859(+) A-I      intronic chr1:154305610(+) A-I      intronic chr1:154309038(+) A-I      intronic chr1:154307968(+) A-I      intronic chr1:154309093(+) A-I      intronic chr1:154307890(+) A-I      intronic chr1:154308025(+) A-I      intronic chr1:154306244(+) A-I      intronic chr1:154305789(+) A-I      intronic chr1:154305530(+) A-I      intronic chr1:154308057(+) A-I      intronic chr1:154307931(+) A-I      intronic chr1:154308991(+) A-I      intronic chr1:154308151(+) A-I      intronic chr1:154306204(+) A-I      intronic chr1:154320367(+) A-I      intronic chr1:154305668(+) A-I      intronic chr1:154309210(+) A-I      intronic chr1:154309457(+) A-I      intronic chr1:154320264(+) A-I      intronic chr1:154308425(+) A-I      intronic chr1:154305600(+) A-I      intronic chr1:154305921(+) A-I      intronic chr1:154309207(+) A-I      intronic chr1:154309044(+) A-I      intronic chr1:154320255(+) A-I      intronic chr1:154308394(+) A-I      intronic chr1:154309195(+) A-I      intronic chr1:154308155(+) A-I      intronic chr1:154320154(+) A-I      intronic chr1:154308021(+) A-I      intronic chr1:154308456(+) A-I      intronic chr1:154309081(+) A-I      intronic chr1:154306250(+) A-I      intronic chr1:154308154(+) A-I      intronic chr1:154306363(+) A-I      intronic chr1:154305682(+) A-I      intronic chr1:154320159(+) A-I      intronic chr1:154307913(+) A-I      intronic chr1:154305608(+) A-I      intronic chr1:154309322(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ATP8B2	chr1:154308425(+) A-I intron -    22327324 chr1:154308021(+) A-I intron -    21960545 chr1:154308025(+) A-I intron -    21960545 chr1:154308147(+) A-I intron -    21960545 chr1:154306244(+) A-G intron -    22484847 chr1:154306250(+) A-G intron -    22484847 chr1:154307890(+) A-G intron -    22484847 chr1:154307968(+) A-G intron -    22484847 chr1:154307986(+) A-G intron -    22484847 chr1:154308057(+) A-G intron -    22484847 chr1:154308368(+) A-G intron -    22484847 chr1:154308394(+) A-G intron -    22484847 chr1:154308991(+) A-G intron -    22484847 chr1:154309207(+) A-G intron -    22484847 chr1:154319392(+) A-G intron -    22484847 chr1:154322555(+) C-T intron -    22484847 chr1:154322636(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ATP8B2	chr1:154313493-154313494(+) m6A CDS//exon       - chr1:154321457-154321458(+) m6A CDS//exon       24284625 chr1:154321658-154321659(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr1:154321671-154321672(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr1:154321711-154321712(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:154321746-154321747(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr1:154321851-154321852(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//22608085 chr1:154321863-154321864(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//22608085 chr1:154321870-154321871(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//22608085 chr1:154321880-154321881(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27371828//22608085 chr1:154321917-154321918(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr1:154321929-154321930(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr1:154322027-154322028(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618 chr1:154323384-154323385(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ATP8B2	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     -

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	hcmv-miR-US25-2-3p	Irinotecan       60838

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US25-2-3p
Interactor2: ATP8B2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg