Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00233760

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-2-3p:  MIMAT0001583          UST:  NM_005715     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US25-2-3p	UST
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001583	10090
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	2OST

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	UST	chr6:149287249(+) A-I      intronic chr6:149287266(+) A-I      intronic chr6:149166183(+) A-I      intronic chr6:149375030(+) A-I      intronic chr6:149102130(+) A-I      intronic chr6:149237715(+) A-I      intronic chr6:149237840(+) A-I      intronic chr6:149237860(+) A-I      intronic chr6:149238896(+) A-I      intronic chr6:149231415(+) A-I      intronic chr6:149231456(+) A-I      intronic chr6:149233274(+) A-I      intronic chr6:149233288(+) A-I      intronic chr6:149267471(+) A-I      intronic chr6:149095921(+) A-I      intronic chr6:149093724(+) A-I      intronic chr6:149364494(+) A-I      intronic chr6:149267500(+) A-I      intronic chr6:149267540(+) A-I      intronic chr6:149281254(+) A-I      intronic chr6:149281311(+) A-I      intronic chr6:149287088(+) A-I      intronic chr6:149287104(+) A-I      intronic chr6:149288053(+) A-I      intronic chr6:149298654(+) A-I      intronic chr6:149298676(+) A-I      intronic chr6:149298767(+) A-I      intronic chr6:149298777(+) A-I      intronic chr6:149298794(+) A-I      intronic chr6:149298799(+) A-I      intronic chr6:149298809(+) A-I      intronic chr6:149298816(+) A-I      intronic chr6:149302058(+) A-I      intronic chr6:149302123(+) A-I      intronic chr6:149303283(+) A-I      intronic chr6:149303299(+) A-I      intronic chr6:149303374(+) A-I      intronic chr6:149303376(+) A-I      intronic chr6:149303457(+) A-I      intronic chr6:149303518(+) A-I      intronic chr6:149317538(+) A-I      intronic chr6:149349145(+) A-I      intronic chr6:149349119(+) A-I      intronic chr6:149349109(+) A-I      intronic chr6:149349105(+) A-I      intronic chr6:149349079(+) A-I      intronic chr6:149303435(+) A-I      intronic chr6:149301985(+) A-I      intronic chr6:149288126(+) A-I      intronic chr6:149281249(+) A-I      intronic chr6:149278832(+) A-I      intronic chr6:149278767(+) A-I      intronic chr6:149094499(+) A-I      intronic chr6:149094382(+) A-I      intronic chr6:149177230(+) A-I      intronic chr6:149360614(+) A-I      intronic chr6:149331998(+) A-I      intronic chr6:149377380(+) A-I      intronic chr6:149364515(+) A-I      intronic chr6:149331973(+) A-I      intronic chr6:149364509(+) A-I      intronic chr6:149177211(+) A-I      intronic chr6:149154583(+) A-I      intronic chr6:149154555(+) A-I      intronic chr6:149154390(+) A-I      intronic chr6:149154352(+) A-I      intronic chr6:149154346(+) A-I      intronic chr6:149142359(+) A-I      intronic chr6:149142290(+) A-I      intronic chr6:149142247(+) A-I      intronic chr6:149142235(+) A-I      intronic chr6:149142232(+) A-I      intronic chr6:149215094(+) A-I      intronic chr6:149142231(+) A-I      intronic chr6:149142223(+) A-I      intronic chr6:149142205(+) A-I      intronic chr6:149141846(+) A-I      intronic chr6:149118065(+) A-I      intronic chr6:149118064(+) A-I      intronic chr6:149317539(+) A-I      intronic chr6:149331870(+) A-I      intronic chr6:149331877(+) A-I      intronic chr6:149117582(+) A-I      intronic chr6:149117545(+) A-I      intronic chr6:149117544(+) A-I      intronic chr6:149117537(+) A-I      intronic chr6:149110725(+) A-I      intronic chr6:149110717(+) A-I      intronic chr6:149096117(+) A-I      intronic chr6:149096109(+) A-I      intronic chr6:149095994(+) A-I      intronic chr6:149118056(+) A-I      intronic chr6:149117649(+) A-I      intronic chr6:149117645(+) A-I      intronic chr6:149117640(+) A-I      intronic chr6:149117583(+) A-I      intronic chr6:149095993(+) A-I      intronic chr6:149095959(+) A-I      intronic chr6:149095940(+) A-I      intronic chr6:149095922(+) A-I      intronic chr6:149332786(+) A-I      intronic chr6:149152880(+) A-I      intronic chr6:149302137(+) A-I      intronic chr6:149288038(+) A-I      intronic chr6:149302047(+) A-I      intronic chr6:149155742(+) A-I      intronic chr6:149287280(+) A-I      intronic chr6:149094446(+) A-I      intronic chr6:149233171(+) A-I      intronic chr6:149287145(+) A-I      intronic chr6:149287256(+) A-I      intronic chr6:149201203(+) A-I      intronic chr6:149118370(+) A-I      intronic chr6:149148608(+) A-I      intronic chr6:149117639(+) A-I      intronic chr6:149142210(+) A-I      intronic chr6:149303471(+) A-I      intronic chr6:149287105(+) A-I      intronic chr6:149281314(+) A-I      intronic chr6:149153245(+) A-I      intronic chr6:149093780(+) A-I      intronic chr6:149288074(+) A-I      intronic chr6:149301925(+) A-I      intronic chr6:149117995(+) A-I      intronic chr6:149094518(+) A-I      intronic chr6:149223699(+) A-I      intronic chr6:149153252(+) A-I      intronic chr6:149142307(+) A-I      intronic chr6:149118136(+) A-I      intronic chr6:149148497(+) A-I      intronic chr6:149395791(+) A-I      3'UTR chr6:149302135(+) A-I      intronic chr6:149152820(+) A-I      intronic chr6:149153256(+) A-I      intronic chr6:149142267(+) A-I      intronic chr6:149142245(+) A-I      intronic chr6:149287213(+) A-I      intronic chr6:149278823(+) A-I      intronic chr6:149298632(+) A-I      intronic chr6:149154480(+) A-I      intronic chr6:149309524(+) A-I      intronic chr6:149154476(+) A-I      intronic chr6:149287335(+) A-I      intronic chr6:149288083(+) A-I      intronic chr6:149303364(+) A-I      intronic chr6:149153216(+) A-I      intronic chr6:149155728(+) A-I      intronic chr6:149106216(+) A-I      intronic chr6:149287272(+) A-I      intronic chr6:149315382(+) A-I      intronic chr6:149106257(+) A-I      intronic chr6:149106269(+) A-I      intronic chr6:149309559(+) A-I      intronic chr6:149287959(+) A-I      intronic chr6:149331909(+) A-I      intronic chr6:149152806(+) A-I      intronic chr6:149287131(+) A-I      intronic chr6:149364404(+) A-I      intronic chr6:149117653(+) A-I      intronic chr6:149148573(+) A-I      intronic chr6:149331915(+) A-I      intronic chr6:149303335(+) A-I      intronic chr6:149094526(+) A-I      intronic chr6:149287221(+) A-I      intronic chr6:149343615(+) A-I      intronic chr6:149347428(+) A-I      intronic chr6:149278648(+) A-I      intronic chr6:149093622(+) A-I      intronic chr6:149267562(+) A-I      intronic chr6:149364293(+) A-I      intronic chr6:149267607(+) A-I      intronic chr6:149231498(+) A-I      intronic chr6:149075149(+) A-I      intronic chr6:149331908(+) A-I      intronic chr6:149093698(+) A-I      intronic chr6:149346869(+) A-I      intronic chr6:149287096(+) A-I      intronic chr6:149093795(+) A-I      intronic chr6:149287935(+) A-I      intronic chr6:149288148(+) A-I      intronic chr6:149094340(+) A-I      intronic chr6:149287972(+) A-I      intronic chr6:149309511(+) A-I      intronic chr6:149233168(+) A-I      intronic chr6:149155709(+) A-I      intronic chr6:149148763(+) A-I      intronic chr6:149142199(+) A-I      intronic chr6:149093639(+) A-I      intronic chr6:149098855(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	UST	chr6:149351560(+) A-I intron -    22327324 chr6:149084542(+) A-G intron -    22484847 chr6:149093622(+) A-G intron -    22484847 chr6:149093623(+) A-G intron -    22484847 chr6:149093638(+) A-G intron -    22484847 chr6:149093639(+) A-G intron -    22484847 chr6:149093659(+) A-G intron -    22484847 chr6:149093740(+) A-G intron -    22484847 chr6:149093780(+) A-G intron -    22484847 chr6:149094446(+) A-G intron -    22484847 chr6:149094518(+) A-G intron -    22484847 chr6:149094526(+) A-G intron -    22484847 chr6:149094547(+) A-G intron -    22484847 chr6:149117995(+) A-G intron -    22484847 chr6:149118008(+) A-G intron -    22484847 chr6:149118292(+) A-G intron -    22484847 chr6:149118306(+) A-G intron -    22484847 chr6:149142199(+) A-G intron -    22484847 chr6:149142206(+) A-G intron -    22484847 chr6:149142210(+) A-G intron -    22484847 chr6:149142245(+) A-G intron -    22484847 chr6:149142267(+) A-G intron -    22484847 chr6:149142307(+) A-G intron -    22484847 chr6:149152806(+) A-G intron -    22484847 chr6:149153209(+) A-G intron -    22484847 chr6:149153216(+) A-G intron -    22484847 chr6:149153245(+) A-G intron -    22484847 chr6:149153256(+) A-G intron -    22484847 chr6:149231377(+) A-G intron -    22484847 chr6:149231394(+) A-G intron -    22484847 chr6:149231496(+) A-G intron -    22484847 chr6:149231498(+) A-G intron -    22484847 chr6:149233168(+) A-G intron -    22484847 chr6:149233171(+) A-G intron -    22484847 chr6:149287105(+) A-G intron -    22484847 chr6:149287131(+) A-G intron -    22484847 chr6:149287213(+) A-G intron -    22484847 chr6:149287280(+) A-G intron -    22484847 chr6:149287335(+) A-G intron -    22484847 chr6:149287935(+) A-G intron -    22484847 chr6:149287959(+) A-G intron -    22484847 chr6:149287972(+) A-G intron -    22484847 chr6:149287973(+) A-G intron -    22484847 chr6:149302047(+) A-G intron -    22484847 chr6:149303335(+) A-G intron -    22484847 chr6:149303364(+) A-G intron -    22484847 chr6:149303471(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	UST	chr6:149068572-149068573(+) m1A CDS       26863196 chr6:149068705-149068706(+) m6A CDS       24284625 chr6:149394986-149394987(+) m6A CDS//exon       24284625 chr6:149395009-149395010(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863 chr6:149395119-149395120(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27371828//22608085 chr6:149395183-149395184(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:149395209-149395210(+) m6A CDS//exon       24284625//25456834//24981863//22608085 chr6:149395329-149395330(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr6:149395360-149395361(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr6:149395365-149395366(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085 chr6:149396535-149396536(+) m6A 3'UTR       24981863 chr6:149396553-149396554(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr6:149396566-149396567(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr6:149396597-149396598(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr6:149396603-149396604(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr6:149396967-149396968(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr6:149397009-149397010(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr6:149397054-149397055(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr6:149397087-149397088(+) m6A 3'UTR       24284625//22608085 chr6:149397172-149397173(+) m6A 3'UTR       24284625 chr6:149397301-149397302(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr6:149397346-149397347(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr6:149397368-149397369(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085 chr6:149397380-149397381(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	UST	Exosome Blood     - Nucleus HeLa-S3 cells     -

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	hcmv-miR-US25-2-3p	Irinotecan       60838

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US25-2-3p
Interactor2: UST

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	VmiReg