Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00231719

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-2-5p:           ITCH:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-US25-2-5p ITCH
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0001582 83737
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - ADMFD//AIF4//AIP4//NAPP1

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ITCH
chr20:33056440(+) A-I      intronic
chr20:33056438(+) A-I      intronic
chr20:33038997(+) A-I      intronic
chr20:32964157(+) A-I      intronic
chr20:33075696(+) A-I      intronic
chr20:33074105(+) A-I      intronic
chr20:33055182(+) A-I      intronic
chr20:33055179(+) A-I      intronic
chr20:33084415(+) A-I      intronic
chr20:33091948(+) A-I      intronic
chr20:33091933(+) A-I      intronic
chr20:33091908(+) A-I      intronic
chr20:33039010(+) A-I      intronic
chr20:33073531(+) A-I      intronic
chr20:32965558(+) A-I      intronic
chr20:32965562(+) A-I      intronic
chr20:33039001(+) A-I      intronic
chr20:33084443(+) A-I      intronic
chr20:33084432(+) A-I      intronic
chr20:33074621(+) A-I      intronic
chr20:33084421(+) A-I      intronic
chr20:32965582(+) A-I      intronic
chr20:32966106(+) A-I      intronic
chr20:33074628(+) A-I      intronic
chr20:33074642(+) A-I      intronic
chr20:32966117(+) A-I      intronic
chr20:32966132(+) A-I      intronic
chr20:33084461(+) A-I      intronic
chr20:32966169(+) A-I      intronic
chr20:33006654(+) A-I      intronic
chr20:33084452(+) A-I      intronic
chr20:33063942(+) A-I      intronic
chr20:33084448(+) A-I      intronic
chr20:33063937(+) A-I      intronic
chr20:33063932(+) A-I      intronic
chr20:33006667(+) A-I      intronic
chr20:33038988(+) A-I      intronic
chr20:33071600(+) A-I      intronic
chr20:33073552(+) A-I      intronic
chr20:33063953(+) A-I      intronic
chr20:33057338(+) A-I      intronic
chr20:33057316(+) A-I      intronic
chr20:33056445(+) A-I      intronic
chr20:32964154(+) A-I      intronic
chr20:32966211(+) A-I      intronic
chr20:32966267(+) A-I      intronic
chr20:32967743(+) A-I      intronic
chr20:32967796(+) A-I      intronic
chr20:32967806(+) A-I      intronic
chr20:32977856(+) A-I      intronic
chr20:32978675(+) A-I      intronic
chr20:32967807(+) A-I      intronic
chr20:32967844(+) A-I      intronic
chr20:32969025(+) A-I      intronic
chr20:32969579(+) A-I      intronic
chr20:32969619(+) A-I      intronic
chr20:32969627(+) A-I      intronic
chr20:32971377(+) A-I      intronic
chr20:32971434(+) A-I      intronic
chr20:33074231(+) A-I      intronic
chr20:33074260(+) A-I      intronic
chr20:33074270(+) A-I      intronic
chr20:33074405(+) A-I      intronic
chr20:33074629(+) A-I      intronic
chr20:33074632(+) A-I      intronic
chr20:33074748(+) A-I      intronic
chr20:33074749(+) A-I      intronic
chr20:33074881(+) A-I      intronic
chr20:33074956(+) A-I      intronic
chr20:33074983(+) A-I      intronic
chr20:33075548(+) A-I      intronic
chr20:33075585(+) A-I      intronic
chr20:33075597(+) A-I      intronic
chr20:33075598(+) A-I      intronic
chr20:33075613(+) A-I      intronic
chr20:33075617(+) A-I      intronic
chr20:33075633(+) A-I      intronic
chr20:33075669(+) A-I      intronic
chr20:33075699(+) A-I      intronic
chr20:33076307(+) A-I      intronic
chr20:33076321(+) A-I      intronic
chr20:33076661(+) A-I      intronic
chr20:33076672(+) A-I      intronic
chr20:33076717(+) A-I      intronic
chr20:33082492(+) A-I      intronic
chr20:33083025(+) A-I      intronic
chr20:33084424(+) A-I      intronic
chr20:33084450(+) A-I      intronic
chr20:33084493(+) A-I      intronic
chr20:33084494(+) A-I      intronic
chr20:33084523(+) A-I      intronic
chr20:33084529(+) A-I      intronic
chr20:33084558(+) A-I      intronic
chr20:33084855(+) A-I      intronic
chr20:33084991(+) A-I      intronic
chr20:33085439(+) A-I      intronic
chr20:32972486(+) A-I      intronic
chr20:32972679(+) A-I      intronic
chr20:32974884(+) A-I      intronic
chr20:32974922(+) A-I      intronic
chr20:32974933(+) A-I      intronic
chr20:32974994(+) A-I      intronic
chr20:32975591(+) A-I      intronic
chr20:32975005(+) A-I      intronic
chr20:32975408(+) A-I      intronic
chr20:32978700(+) A-I      intronic
chr20:32980537(+) A-I      intronic
chr20:32975340(+) A-I      intronic
chr20:32975330(+) A-I      intronic
chr20:32975326(+) A-I      intronic
chr20:32975199(+) A-I      intronic
chr20:32981782(+) A-I      intronic
chr20:32981783(+) A-I      intronic
chr20:32981788(+) A-I      intronic
chr20:32981791(+) A-I      intronic
chr20:32981933(+) A-I      intronic
chr20:32984894(+) A-I      intronic
chr20:32985063(+) A-I      intronic
chr20:32987037(+) A-I      intronic
chr20:32987178(+) A-I      intronic
chr20:32987504(+) A-I      intronic
chr20:32988005(+) A-I      intronic
chr20:32988571(+) A-I      intronic
chr20:32988663(+) A-I      intronic
chr20:32988667(+) A-I      intronic
chr20:32988668(+) A-I      intronic
chr20:32988709(+) A-I      intronic
chr20:32988748(+) A-I      intronic
chr20:32992282(+) A-I      intronic
chr20:32992303(+) A-I      intronic
chr20:32993902(+) A-I      intronic
chr20:33006642(+) A-I      intronic
chr20:33006671(+) A-I      intronic
chr20:33006672(+) A-I      intronic
chr20:33008958(+) A-I      intronic
chr20:33009763(+) A-I      intronic
chr20:33009777(+) A-I      intronic
chr20:33010822(+) A-I      intronic
chr20:33010848(+) A-I      intronic
chr20:33014326(+) A-I      intronic
chr20:33014332(+) A-I      intronic
chr20:33014491(+) A-I      intronic
chr20:33015130(+) A-I      intronic
chr20:33015159(+) A-I      intronic
chr20:33015360(+) A-I      intronic
chr20:33018397(+) A-I      intronic
chr20:33018477(+) A-I      intronic
chr20:33018560(+) A-I      intronic
chr20:33018940(+) A-I      intronic
chr20:33018955(+) A-I      intronic
chr20:33019024(+) A-I      intronic
chr20:33019582(+) A-I      intronic
chr20:33019660(+) A-I      intronic
chr20:33019670(+) A-I      intronic
chr20:33019699(+) A-I      intronic
chr20:33019810(+) A-I      intronic
chr20:33020659(+) A-I      intronic
chr20:33021037(+) A-I      intronic
chr20:33021835(+) A-I      intronic
chr20:33021920(+) A-I      intronic
chr20:33022101(+) A-I      intronic
chr20:33024722(+) A-I      intronic
chr20:33024745(+) A-I      intronic
chr20:32994405(+) A-I      intronic
chr20:32994434(+) A-I      intronic
chr20:32995104(+) A-I      intronic
chr20:32975585(+) A-I      intronic
chr20:33015297(+) A-I      intronic
chr20:33050997(+) A-I      intronic
chr20:33050982(+) A-I      intronic
chr20:33050981(+) A-I      intronic
chr20:33050939(+) A-I      intronic
chr20:33024889(+) A-I      intronic
chr20:33025214(+) A-I      intronic
chr20:33025374(+) A-I      intronic
chr20:33025386(+) A-I      intronic
chr20:33028290(+) A-I      intronic
chr20:33028442(+) A-I      intronic
chr20:32959200(+) A-I      intronic
chr20:32959364(+) A-I      intronic
chr20:32959959(+) A-I      intronic
chr20:32959990(+) A-I      intronic
chr20:32959996(+) A-I      intronic
chr20:32960000(+) A-I      intronic
chr20:32960291(+) A-I      intronic
chr20:32960400(+) A-I      intronic
chr20:32961033(+) A-I      intronic
chr20:32961771(+) A-I      intronic
chr20:32961784(+) A-I      intronic
chr20:32961871(+) A-I      intronic
chr20:32964091(+) A-I      intronic
chr20:32965014(+) A-I      intronic
chr20:32965049(+) A-I      intronic
chr20:32995309(+) A-I      intronic
chr20:32995982(+) A-I      intronic
chr20:32965132(+) A-I      intronic
chr20:32965521(+) A-I      intronic
chr20:32966003(+) A-I      intronic
chr20:32995994(+) A-I      intronic
chr20:32997734(+) A-I      intronic
chr20:32999062(+) A-I      intronic
chr20:33000846(+) A-I      intronic
chr20:32975001(+) A-I      intronic
chr20:33042108(+) A-I      intronic
chr20:33042084(+) A-I      intronic
chr20:33042082(+) A-I      intronic
chr20:33042079(+) A-I      intronic
chr20:33041786(+) A-I      intronic
chr20:33041784(+) A-I      intronic
chr20:33041643(+) A-I      intronic
chr20:33050913(+) A-I      intronic
chr20:33044550(+) A-I      intronic
chr20:33044412(+) A-I      intronic
chr20:33044408(+) A-I      intronic
chr20:33042761(+) A-I      intronic
chr20:33042735(+) A-I      intronic
chr20:33042734(+) A-I      intronic
chr20:33042715(+) A-I      intronic
chr20:33041638(+) A-I      intronic
chr20:33041636(+) A-I      intronic
chr20:33041612(+) A-I      intronic
chr20:33041236(+) A-I      intronic
chr20:33039789(+) A-I      intronic
chr20:33039759(+) A-I      intronic
chr20:33039102(+) A-I      intronic
chr20:32952921(+) A-I      intronic
chr20:32953285(+) A-I      intronic
chr20:32953324(+) A-I      intronic
chr20:32953325(+) A-I      intronic
chr20:32953464(+) A-I      intronic
chr20:32953497(+) A-I      intronic
chr20:32954215(+) A-I      intronic
chr20:32955058(+) A-I      intronic
chr20:32955070(+) A-I      intronic
chr20:32958211(+) A-I      intronic
chr20:32958299(+) A-I      intronic
chr20:32958305(+) A-I      intronic
chr20:32958349(+) A-I      intronic
chr20:33028826(+) A-I      intronic
chr20:33028890(+) A-I      intronic
chr20:33028930(+) A-I      intronic
chr20:33028966(+) A-I      intronic
chr20:33029009(+) A-I      intronic
chr20:33029329(+) A-I      intronic
chr20:33031106(+) A-I      intronic
chr20:33042204(+) A-I      intronic
chr20:33042127(+) A-I      intronic
chr20:33042124(+) A-I      intronic
chr20:32977712(+) A-I      intronic
chr20:33029347(+) A-I      intronic
chr20:32977816(+) A-I      intronic
chr20:33038838(+) A-I      intronic
chr20:33032682(+) A-I      intronic
chr20:33001869(+) A-I      intronic
chr20:33002508(+) A-I      intronic
chr20:33002533(+) A-I      intronic
chr20:33003136(+) A-I      intronic
chr20:33003145(+) A-I      intronic
chr20:33003243(+) A-I      intronic
chr20:33003742(+) A-I      intronic
chr20:33003822(+) A-I      intronic
chr20:32977828(+) A-I      intronic
chr20:32966153(+) A-I      intronic
chr20:32966165(+) A-I      intronic
chr20:32966207(+) A-I      intronic
chr20:33004049(+) A-I      intronic
chr20:33004083(+) A-I      intronic
chr20:33004110(+) A-I      intronic
chr20:33004125(+) A-I      intronic
chr20:33004156(+) A-I      intronic
chr20:33032478(+) A-I      intronic
chr20:33032314(+) A-I      intronic
chr20:33004159(+) A-I      intronic
chr20:33032267(+) A-I      intronic
chr20:33032228(+) A-I      intronic
chr20:33004759(+) A-I      intronic
chr20:33006009(+) A-I      intronic
chr20:33006032(+) A-I      intronic
chr20:33051021(+) A-I      intronic
chr20:33051100(+) A-I      intronic
chr20:33051109(+) A-I      intronic
chr20:33052615(+) A-I      intronic
chr20:33052665(+) A-I      intronic
chr20:33055100(+) A-I      intronic
chr20:33055101(+) A-I      intronic
chr20:33055109(+) A-I      intronic
chr20:33055114(+) A-I      intronic
chr20:33055132(+) A-I      intronic
chr20:33055170(+) A-I      intronic
chr20:33055175(+) A-I      intronic
chr20:32977694(+) A-I      intronic
chr20:32976321(+) A-I      intronic
chr20:32976320(+) A-I      intronic
chr20:32976102(+) A-I      intronic
chr20:32975967(+) A-I      intronic
chr20:32975720(+) A-I      intronic
chr20:32975610(+) A-I      intronic
chr20:33055187(+) A-I      intronic
chr20:33055278(+) A-I      intronic
chr20:33055859(+) A-I      intronic
chr20:33055871(+) A-I      intronic
chr20:33055903(+) A-I      intronic
chr20:33055904(+) A-I      intronic
chr20:33055966(+) A-I      intronic
chr20:33055981(+) A-I      intronic
chr20:33056005(+) A-I      intronic
chr20:33056021(+) A-I      intronic
chr20:33056061(+) A-I      intronic
chr20:33056099(+) A-I      intronic
chr20:33057158(+) A-I      intronic
chr20:33057219(+) A-I      intronic
chr20:33057220(+) A-I      intronic
chr20:33057223(+) A-I      intronic
chr20:33057239(+) A-I      intronic
chr20:33057266(+) A-I      intronic
chr20:33057278(+) A-I      intronic
chr20:33057284(+) A-I      intronic
chr20:33057315(+) A-I      intronic
chr20:33069669(+) A-I      intronic
chr20:33069695(+) A-I      intronic
chr20:33069737(+) A-I      intronic
chr20:33073605(+) A-I      intronic
chr20:33073716(+) A-I      intronic
chr20:33073899(+) A-I      intronic
chr20:33073956(+) A-I      intronic
chr20:33073965(+) A-I      intronic
chr20:33074085(+) A-I      intronic
chr20:33074086(+) A-I      intronic
chr20:33074150(+) A-I      intronic
chr20:33074192(+) A-I      intronic
chr20:33074217(+) A-I      intronic
chr20:33005906(+) A-I      intronic
chr20:33018445(+) A-I      intronic
chr20:32982391(+) A-I      intronic
chr20:33073961(+) A-I      intronic
chr20:33052585(+) A-I      intronic
chr20:33056485(+) A-I      intronic
chr20:33018454(+) A-I      intronic
chr20:33057235(+) A-I      intronic
chr20:33055608(+) A-I      intronic
chr20:32959273(+) A-I      intronic
chr20:33074946(+) A-I      intronic
chr20:32987862(+) A-I      intronic
chr20:33073881(+) A-I      intronic
chr20:32959351(+) A-I      intronic
chr20:33076365(+) A-I      intronic
chr20:33018545(+) A-I      intronic
chr20:33075752(+) A-I      intronic
chr20:33048747(+) A-I      intronic
chr20:33020649(+) A-I      intronic
chr20:33025212(+) A-I      intronic
chr20:33044570(+) A-I      intronic
chr20:33023054(+) A-I      intronic
chr20:32997716(+) A-I      intronic
chr20:33056410(+) A-I      intronic
chr20:33052258(+) A-I      intronic
chr20:33023189(+) A-I      intronic
chr20:33069696(+) A-I      intronic
chr20:33018408(+) A-I      intronic
chr20:32957791(+) A-I      intronic
chr20:33058579(+) A-I      intronic
chr20:32974989(+) A-I      intronic
chr20:32968952(+) A-I      intronic
chr20:33021008(+) A-I      intronic
chr20:33028467(+) A-I      intronic
chr20:33091951(+) A-I      intronic
chr20:33005890(+) A-I      intronic
chr20:33015330(+) A-I      intronic
chr20:33039142(+) A-I      intronic
chr20:32978446(+) A-I      intronic
chr20:32969652(+) A-I      intronic
chr20:33009581(+) A-I      intronic
chr20:33044099(+) A-I      intronic
chr20:32965121(+) A-I      intronic
chr20:33001899(+) A-I      intronic
chr20:33003927(+) A-I      intronic
chr20:33055133(+) A-I      intronic
chr20:32953252(+) A-I      intronic
chr20:33005335(+) A-I      intronic
chr20:33085645(+) A-I      intronic
chr20:33016813(+) A-I      intronic
chr20:33021337(+) A-I      intronic
chr20:32958398(+) A-I      intronic
chr20:33005902(+) A-I      intronic
chr20:33083033(+) A-I      intronic
chr20:32982782(+) A-I      intronic
chr20:32961808(+) A-I      intronic
chr20:33024698(+) A-I      intronic
chr20:33084355(+) A-I      intronic
chr20:32975650(+) A-I      intronic
chr20:33016844(+) A-I      intronic
chr20:32976076(+) A-I      intronic
chr20:33005873(+) A-I      intronic
chr20:33055969(+) A-I      intronic
chr20:33043551(+) A-I      intronic
chr20:32957826(+) A-I      intronic
chr20:32965652(+) A-I      intronic
chr20:33001845(+) A-I      intronic
chr20:33038974(+) A-I      intronic
chr20:33085062(+) A-I      intronic
chr20:33075466(+) A-I      intronic
chr20:33019121(+) A-I      intronic
chr20:33055549(+) A-I      intronic
chr20:33073894(+) A-I      intronic
chr20:32975691(+) A-I      intronic
chr20:33042752(+) A-I      intronic
chr20:33018945(+) A-I      intronic
chr20:33038891(+) A-I      intronic
chr20:32975978(+) A-I      intronic
chr20:32999143(+) A-I      intronic
chr20:32987161(+) A-I      intronic
chr20:32965420(+) A-I      intronic
chr20:33003278(+) A-I      intronic
chr20:33015275(+) A-I      intronic
chr20:33076403(+) A-I      intronic
chr20:32964925(+) A-I      intronic
chr20:32998053(+) A-I      intronic
chr20:32966160(+) A-I      intronic
chr20:32962663(+) A-I      intronic
chr20:32964902(+) A-I      intronic
chr20:33009751(+) A-I      intronic
chr20:33074024(+) A-I      intronic
chr20:32967877(+) A-I      intronic
chr20:33076368(+) A-I      intronic
chr20:32965566(+) A-I      intronic
chr20:33056508(+) A-I      intronic
chr20:33032227(+) A-I      intronic
chr20:32953301(+) A-I      intronic
chr20:32958415(+) A-I      intronic
chr20:32953274(+) A-I      intronic
chr20:33024725(+) A-I      intronic
chr20:33076397(+) A-I      intronic
chr20:33020909(+) A-I      intronic
chr20:33075482(+) A-I      intronic
chr20:33056015(+) A-I      intronic
chr20:33006776(+) A-I      intronic
chr20:32958433(+) A-I      intronic
chr20:33024699(+) A-I      intronic
chr20:33028362(+) A-I      intronic
chr20:33076721(+) A-I      intronic
chr20:33074761(+) A-I      intronic
chr20:33040619(+) A-I      intronic
chr20:32954159(+) A-I      intronic
chr20:33073589(+) A-I      intronic
chr20:33015123(+) A-I      intronic
chr20:33039016(+) A-I      intronic
chr20:33076398(+) A-I      intronic
chr20:33050958(+) A-I      intronic
chr20:32993188(+) A-I      intronic
chr20:32978337(+) A-I      intronic
chr20:33029027(+) A-I      intronic
chr20:32974965(+) A-I      intronic
chr20:33055901(+) A-I      intronic
chr20:32964138(+) A-I      intronic
chr20:33074029(+) A-I      intronic
chr20:33021804(+) A-I      intronic
chr20:33021917(+) A-I      intronic
chr20:32965517(+) A-I      intronic
chr20:33075039(+) A-I      intronic
chr20:33075534(+) A-I      intronic
chr20:33085483(+) A-I      intronic
chr20:33002373(+) A-I      intronic
chr20:33040491(+) A-I      intronic
chr20:33085531(+) A-I      intronic
chr20:33006648(+) A-I      intronic
chr20:32961062(+) A-I      intronic
chr20:33056449(+) A-I      intronic
chr20:32952589(+) A-I      intronic
chr20:33018418(+) A-I      intronic
chr20:32964906(+) A-I      intronic
chr20:33003674(+) A-I      intronic
chr20:33085529(+) A-I      intronic
chr20:33003849(+) A-I      intronic
chr20:32966159(+) A-I      intronic
chr20:33082793(+) A-I      intronic
chr20:33055979(+) A-I      intronic
chr20:33028361(+) A-I      intronic
chr20:33084457(+) A-I      intronic
chr20:33004148(+) A-I      intronic
chr20:33041652(+) A-I      intronic
chr20:32957632(+) A-I      intronic
chr20:33057194(+) A-I      intronic
chr20:33003183(+) A-I      intronic
chr20:33038931(+) A-I      intronic
chr20:33020943(+) A-I      intronic
chr20:33021882(+) A-I      intronic
chr20:33018957(+) A-I      intronic
chr20:33020944(+) A-I      intronic
chr20:33049434(+) A-I      intronic
chr20:33057211(+) A-I      intronic
chr20:33001859(+) A-I      intronic
chr20:32953350(+) A-I      intronic
chr20:33069761(+) A-I      intronic
chr20:33019719(+) A-I      intronic
chr20:33085657(+) A-I      intronic
chr20:33052209(+) A-I      intronic
chr20:33075519(+) A-I      intronic
chr20:33022029(+) A-I      intronic
chr20:32960256(+) A-I      intronic
chr20:32965588(+) A-I      intronic
chr20:33032277(+) A-I      intronic
chr20:33055173(+) A-I      intronic
chr20:32957721(+) A-I      intronic
chr20:33073848(+) A-I      intronic
chr20:32975955(+) A-I      intronic
chr20:33073937(+) A-I      intronic
chr20:33055125(+) A-I      intronic
chr20:33040489(+) A-I      intronic
chr20:33021972(+) A-I      intronic
chr20:33002412(+) A-I      intronic
chr20:32967677(+) A-I      intronic
chr20:33055143(+) A-I      intronic
chr20:33057163(+) A-I      intronic
chr20:32988713(+) A-I      intronic
chr20:32982355(+) A-I      intronic
chr20:33083782(+) A-I      intronic
chr20:33005347(+) A-I      intronic
chr20:33076750(+) A-I      intronic
chr20:32999123(+) A-I      intronic
chr20:33055177(+) A-I      intronic
chr20:32963330(+) A-I      intronic
chr20:33073959(+) A-I      intronic
chr20:32963358(+) A-I      intronic
chr20:32958414(+) A-I      intronic
chr20:33002337(+) A-I      intronic
chr20:33021824(+) A-I      intronic
chr20:33021827(+) A-I      intronic
chr20:33056409(+) A-I      intronic
chr20:32975255(+) A-I      intronic
chr20:33002399(+) A-I      intronic
chr20:32953362(+) A-I      intronic
chr20:32974932(+) A-I      intronic
chr20:33073538(+) A-I      intronic
chr20:32976235(+) A-I      intronic
chr20:33073562(+) A-I      intronic
chr20:33048093(+) A-I      intronic
chr20:32965532(+) A-I      intronic
chr20:32992355(+) A-I      intronic
chr20:33091888(+) A-I      intronic
chr20:32965552(+) A-I      intronic
chr20:33084833(+) A-I      intronic
chr20:33029330(+) A-I      intronic
chr20:33091895(+) A-I      intronic
chr20:33084931(+) A-I      intronic
chr20:32965414(+) A-I      intronic
chr20:32965069(+) A-I      intronic
chr20:33043367(+) A-I      intronic
chr20:32953406(+) A-I      intronic
chr20:33056489(+) A-I      intronic
chr20:33024730(+) A-I      intronic
chr20:33029574(+) A-I      intronic
chr20:33083698(+) A-I      intronic
chr20:33018298(+) A-I      intronic
chr20:33005407(+) A-I      intronic
chr20:32959925(+) A-I      intronic
chr20:32964924(+) A-I      intronic
chr20:32967803(+) A-I      intronic
chr20:33058625(+) A-I      intronic
chr20:33074248(+) A-I      intronic
chr20:33040584(+) A-I      intronic
chr20:33073541(+) A-I      intronic
chr20:32998083(+) A-I      intronic
chr20:32982783(+) A-I      intronic
chr20:33056535(+) A-I      intronic
chr20:33006624(+) A-I      intronic
chr20:33018331(+) A-I      intronic
chr20:32975178(+) A-I      intronic
chr20:33032550(+) A-I      intronic
chr20:32999001(+) A-I      intronic
chr20:33073574(+) A-I      intronic
chr20:33041336(+) A-I      intronic
chr20:33048718(+) A-I      intronic
chr20:33021017(+) A-I      intronic
chr20:33041153(+) A-I      intronic
chr20:32975183(+) A-I      intronic
chr20:32958188(+) A-I      intronic
chr20:32969615(+) A-I      intronic
chr20:32978313(+) A-I      intronic
chr20:33056101(+) A-I      intronic
chr20:33075048(+) A-I      intronic
chr20:32959964(+) A-I      intronic
chr20:33020533(+) A-I      intronic
chr20:32962870(+) A-I      intronic
chr20:32997715(+) A-I      intronic
chr20:33032268(+) A-I      intronic
chr20:32965601(+) A-I      intronic
chr20:32995825(+) A-I      intronic
chr20:32966157(+) A-I      intronic
chr20:33055288(+) A-I      intronic
chr20:33073887(+) A-I      intronic
chr20:32997988(+) A-I      intronic
chr20:33004149(+) A-I      intronic
chr20:33003675(+) A-I      intronic
chr20:33031533(+) A-I      intronic
chr20:32986984(+) A-I      intronic
chr20:33052596(+) A-I      intronic
chr20:33052578(+) A-I      intronic
chr20:33075688(+) A-I      intronic
chr20:32953360(+) A-I      intronic
chr20:33021981(+) A-I      intronic
chr20:33005885(+) A-I      intronic
chr20:32988693(+) A-I      intronic
chr20:32963307(+) A-I      intronic
chr20:33011539(+) A-I      intronic
chr20:33084410(+) A-I      intronic
chr20:32966192(+) A-I      intronic
chr20:33014509(+) A-I      intronic
chr20:33057173(+) A-I      intronic
chr20:33019120(+) A-I      intronic
chr20:32958395(+) A-I      intronic
chr20:33084983(+) A-I      intronic
chr20:33019591(+) A-I      intronic
chr20:33084967(+) A-I      intronic
chr20:33021850(+) A-I      intronic
chr20:32975290(+) A-I      intronic
chr20:33084895(+) A-I      intronic
chr20:33005991(+) A-I      intronic
chr20:33074296(+) A-I      intronic
chr20:32960393(+) A-I      intronic
chr20:33041733(+) A-I      intronic
chr20:32960910(+) A-I      intronic
chr20:33032133(+) A-I      intronic
chr20:33032533(+) A-I      intronic
chr20:33019771(+) A-I      intronic
chr20:33005467(+) A-I      intronic
chr20:32961754(+) A-I      intronic
chr20:33051003(+) A-I      intronic
chr20:33038851(+) A-I      intronic
chr20:33075488(+) A-I      intronic
chr20:33084906(+) A-I      intronic
chr20:32963314(+) A-I      intronic
chr20:32974930(+) A-I      intronic
chr20:33091735(+) A-I      intronic
chr20:33018995(+) A-I      intronic
chr20:33018961(+) A-I      intronic
chr20:33002353(+) A-I      intronic
chr20:33005440(+) A-I      intronic
chr20:32955822(+) A-I      intronic
chr20:33032203(+) A-I      intronic
chr20:33042818(+) A-I      intronic
chr20:33055274(+) A-I      intronic
chr20:32975700(+) A-I      intronic
chr20:33021962(+) A-I      intronic
chr20:32998054(+) A-I      intronic
chr20:33040595(+) A-I      intronic
chr20:33002329(+) A-I      intronic
chr20:33056475(+) A-I      intronic
chr20:33075024(+) A-I      intronic
chr20:32959270(+) A-I      intronic
chr20:32985101(+) A-I      intronic
chr20:32952618(+) A-I      intronic
chr20:33028493(+) A-I      intronic
chr20:33002402(+) A-I      intronic
chr20:33041646(+) A-I      intronic
chr20:33043385(+) A-I      intronic
chr20:33091833(+) A-I      intronic
chr20:33076301(+) A-I      intronic
chr20:32997722(+) A-I      intronic
chr20:33044622(+) A-I      intronic
chr20:33076292(+) A-I      intronic
chr20:32984930(+) A-I      intronic
chr20:33006604(+) A-I      intronic
chr20:33024813(+) A-I      intronic
chr20:33009809(+) A-I      intronic
chr20:33003283(+) A-I      intronic
chr20:32958204(+) A-I      intronic
chr20:32966100(+) A-I      intronic
chr20:33029359(+) A-I      intronic
chr20:33085453(+) A-I      intronic
chr20:33076794(+) A-I      intronic
chr20:32987825(+) A-I      intronic
chr20:33009559(+) A-I      intronic
chr20:33023052(+) A-I      intronic
chr20:33024852(+) A-I      intronic
chr20:32954305(+) A-I      intronic
chr20:33032320(+) A-I      intronic
chr20:33028366(+) A-I      intronic
chr20:32958419(+) A-I      intronic
chr20:32998063(+) A-I      intronic
chr20:33005092(+) A-I      intronic
chr20:33085513(+) A-I      intronic
chr20:32984454(+) A-I      intronic
chr20:33036051(+) A-I      intronic
chr20:33019038(+) A-I      intronic
chr20:33024787(+) A-I      intronic
chr20:33021936(+) A-I      intronic
chr20:33003155(+) A-I      intronic
chr20:33022074(+) A-I      intronic
chr20:32967842(+) A-I      intronic
chr20:33075664(+) A-I      intronic
chr20:32960969(+) A-I      intronic
chr20:33023039(+) A-I      intronic
chr20:33021404(+) A-I      intronic
chr20:33075689(+) A-I      intronic
chr20:33073906(+) A-I      intronic
chr20:33024746(+) A-I      intronic
chr20:33018963(+) A-I      intronic
chr20:33005847(+) A-I      intronic
chr20:33019154(+) A-I      intronic
chr20:33075489(+) A-I      intronic
chr20:33069736(+) A-I      intronic
chr20:33075733(+) A-I      intronic
chr20:33019703(+) A-I      intronic
chr20:33041281(+) A-I      intronic
chr20:32959893(+) A-I      intronic
chr20:32987848(+) A-I      intronic
chr20:33018360(+) A-I      intronic
chr20:32969547(+) A-I      intronic
chr20:32969595(+) A-I      intronic
chr20:32952786(+) A-I      intronic
chr20:33055547(+) A-I      intronic
chr20:33003174(+) A-I      intronic
chr20:32981863(+) A-I      intronic
chr20:32960460(+) A-I      intronic
chr20:33084905(+) A-I      intronic
chr20:32970329(+) A-I      intronic
chr20:33024894(+) A-I      intronic
chr20:33084982(+) A-I      intronic
chr20:32973066(+) A-I      intronic
chr20:33019729(+) A-I      intronic
chr20:32972730(+) A-I      intronic
chr20:33065188(+) A-I      intronic
chr20:33023087(+) A-I      intronic
chr20:32978293(+) A-I      intronic
chr20:33007384(+) A-I      intronic
chr20:33041678(+) A-I      intronic
chr20:33073905(+) A-I      intronic
chr20:33041305(+) A-I      intronic
chr20:33005086(+) A-I      intronic
chr20:32965524(+) A-I      intronic
chr20:33057233(+) A-I      intronic
chr20:33076789(+) A-I      intronic
chr20:32974988(+) A-I      intronic
chr20:32966115(+) A-I      intronic
chr20:32978436(+) A-I      intronic
chr20:33073696(+) A-I      intronic
chr20:33044589(+) A-I      intronic
chr20:33073945(+) A-I      intronic
chr20:33075008(+) A-I      intronic
chr20:33020528(+) A-I      intronic
chr20:32963585(+) A-I      intronic
chr20:33019098(+) A-I      intronic
chr20:32999057(+) A-I      intronic
chr20:33075665(+) A-I      intronic
chr20:32987906(+) A-I      intronic
chr20:33041322(+) A-I      intronic
chr20:32988800(+) A-I      intronic
chr20:33040561(+) A-I      intronic
chr20:33029299(+) A-I      intronic
chr20:33041341(+) A-I      intronic
chr20:32988785(+) A-I      intronic
chr20:33018339(+) A-I      intronic
chr20:33075091(+) A-I      intronic
chr20:32992849(+) A-I      intronic
chr20:33014698(+) A-I      intronic
chr20:33075719(+) A-I      intronic
chr20:33056046(+) A-I      intronic
chr20:32966091(+) A-I      intronic
chr20:33049435(+) A-I      intronic
chr20:33074897(+) A-I      intronic
chr20:33085401(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ITCH
chr20:33024852(+) A-I intron -    22327324
chr20:33018331(+) A-I intron -    21960545
chr20:33018418(+) A-I intron -    21960545
chr20:33020528(+) A-I intron -    21960545
chr20:33073848(+) A-I intron -    21960545
chr20:32958308(+) A-G intron -    22484847
chr20:32958414(+) A-G intron -    22484847
chr20:32958415(+) A-G intron -    22484847
chr20:32962956(+) T-C intron -    22484847
chr20:32964148(+) A-G intron -    22484847
chr20:32967842(+) A-G intron -    22484847
chr20:32967877(+) A-G intron -    22484847
chr20:32974988(+) A-G intron -    22484847
chr20:32975255(+) A-G intron -    22484847
chr20:33006668(+) A-G intron -    22484847
chr20:33018339(+) A-G intron -    22484847
chr20:33018460(+) A-G intron -    22484847
chr20:33018463(+) A-G intron -    22484847
chr20:33019021(+) A-G intron -    22484847
chr20:33019154(+) A-G intron -    22484847
chr20:33021377(+) A-G intron -    22484847
chr20:33021404(+) A-G intron -    22484847
chr20:33024730(+) A-G intron -    22484847
chr20:33024852(+) A-G intron -    22484847
chr20:33024919(+) A-G intron -    22484847
chr20:33032203(+) A-G intron -    22484847
chr20:33038851(+) A-G intron -    22484847
chr20:33040489(+) A-G intron -    22484847
chr20:33055079(+) A-G intron -    22484847
chr20:33055133(+) A-G intron -    22484847
chr20:33055171(+) A-G intron -    22484847
chr20:33075488(+) A-G intron -    22484847
chr20:33075489(+) A-G intron -    22484847
chr20:33075624(+) A-G intron -    22484847
chr20:33076733(+) A-G intron -    22484847
chr20:33076842(+) T-C intron -    22484847
chr20:33084905(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ITCH
chr20:32951101-32951102(+) m6A 5'UTR//exon       24981863
chr20:32951125-32951126(+) m6A 5'UTR//exon       24981863
chr20:32957230-32957231(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863
chr20:32957260-32957261(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863
chr20:32957269-32957270(+) m6A 5'UTR//exon       24981863
chr20:33026431-33026432(+) m6A CDS       -
chr20:33030029-33030030(+) m6A CDS       -
chr20:33030073-33030074(+) m6A CDS       -
chr20:33077109-33077110(+) m6A CDS       27773535
chr20:33095513-33095514(+) m6A CDS       24981863
chr20:33095575-33095576(+) m6A CDS       24981863
chr20:33095589-33095590(+) m6A CDS       24284625//24981863
chr20:33095608-33095609(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863
chr20:33095631-33095632(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863
chr20:33095684-33095685(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hcmv-miR-US25-2-5p
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
ITCH
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-US25-2-5p
Interactor2: ITCH

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...