Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00230769

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US25-2-5p:  MIMAT0001582          PML:  NM_033244     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US25-2-5p	PML
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001582	5371
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	MYL//PP8675//RNF71//TRIM19

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	PML	chr15:74295589(+) A-I      intronic chr15:74295619(+) A-I      intronic chr15:74295620(+) A-I      intronic chr15:74295626(+) A-I      intronic chr15:74296482(+) A-I      intronic chr15:74296514(+) A-I      intronic chr15:74298714(+) A-I      intronic chr15:74298689(+) A-I      intronic chr15:74298687(+) A-I      intronic chr15:74298682(+) A-I      intronic chr15:74296832(+) A-I      intronic chr15:74301030(+) A-I      intronic chr15:74296826(+) A-I      intronic chr15:74302045(+) A-I      intronic chr15:74302052(+) A-I      intronic chr15:74306799(+) A-I      intronic chr15:74306944(+) A-I      intronic chr15:74306945(+) A-I      intronic chr15:74301005(+) A-I      intronic chr15:74306996(+) A-I      intronic chr15:74307035(+) A-I      intronic chr15:74321710(+) A-I      intronic chr15:74321858(+) A-I      intronic chr15:74321886(+) A-I      intronic chr15:74322879(+) A-I      intronic chr15:74323639(+) A-I      intronic chr15:74294251(+) A-I      intronic chr15:74295006(+) A-I      intronic chr15:74295234(+) A-I      intronic chr15:74323671(+) A-I      intronic chr15:74323679(+) A-I      intronic chr15:74323725(+) A-I      intronic chr15:74323732(+) A-I      intronic chr15:74292174(+) A-I      intronic chr15:74323740(+) A-I      intronic chr15:74295764(+) A-I      intronic chr15:74294124(+) A-I      intronic chr15:74294271(+) A-I      intronic chr15:74296845(+) A-I      intronic chr15:74294885(+) A-I      intronic chr15:74310261(+) A-I      intronic chr15:74298652(+) A-I      intronic chr15:74309787(+) A-I      intronic chr15:74306815(+) A-I      intronic chr15:74321854(+) A-I      intronic chr15:74306777(+) A-I      intronic chr15:74300933(+) A-I      intronic chr15:74302721(+) A-I      intronic chr15:74323680(+) A-I      intronic chr15:74308560(+) A-I      intronic chr15:74294290(+) A-I      intronic chr15:74307068(+) A-I      intronic chr15:74322944(+) A-I      intronic chr15:74323715(+) A-I      intronic chr15:74317202(+) A-I      Syn:Ala->Ala chr15:74295408(+) A-I      intronic chr15:74321834(+) A-I      intronic chr15:74322869(+) A-I      intronic chr15:74294194(+) A-I      intronic chr15:74295056(+) A-I      intronic chr15:74323714(+) A-I      intronic chr15:74302778(+) A-I      intronic chr15:74302019(+) A-I      intronic chr15:74309843(+) A-I      intronic chr15:74295291(+) A-I      intronic chr15:74294125(+) A-I      intronic chr15:74322883(+) A-I      intronic chr15:74309812(+) A-I      intronic chr15:74296502(+) A-I      intronic chr15:74321920(+) A-I      intronic chr15:74294846(+) A-I      intronic chr15:74322870(+) A-I      intronic chr15:74295289(+) A-I      intronic chr15:74293798(+) A-I      intronic chr15:74294158(+) A-I      intronic chr15:74302422(+) A-I      intronic chr15:74295416(+) A-I      intronic chr15:74293822(+) A-I      intronic chr15:74302424(+) A-I      intronic chr15:74295212(+) A-I      intronic chr15:74292830(+) A-I      intronic chr15:74295218(+) A-I      intronic chr15:74294224(+) A-I      intronic chr15:74296515(+) A-I      intronic chr15:74322911(+) A-I      intronic chr15:74302784(+) A-I      intronic chr15:74298476(+) A-I      intronic chr15:74321845(+) A-I      intronic chr15:74295233(+) A-I      intronic chr15:74302448(+) A-I      intronic chr15:74323741(+) A-I      intronic chr15:74295047(+) A-I      intronic chr15:74296778(+) A-I      intronic chr15:74322891(+) A-I      intronic chr15:74310680(+) A-I      intronic chr15:74295290(+) A-I      intronic chr15:74309828(+) A-I      intronic chr15:74295652(+) A-I      intronic chr15:74314373(+) A-I      intronic chr15:74293820(+) A-I      intronic chr15:74309835(+) A-I      intronic chr15:74302455(+) A-I      intronic chr15:74302051(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	PML	chr15:74317202(+) A-I exon CDS    19478186 chr15:74317854(+) A-I intron -    19478186 chr15:74317860(+) A-I intron -    19478186 chr15:74317861(+) A-I intron -    19478186 chr15:74319173(+) A-I intron -    22327324 chr15:74319236(+) A-I intron -    22327324 chr15:74319668(+) A-I intron -    21960545   //22327324 chr15:74319733(+) A-I intron -    22327324 chr15:74319734(+) A-I intron -    22327324 chr15:74319764(+) A-I intron -    22327324 chr15:74319794(+) A-I intron -    22327324 chr15:74319813(+) A-I intron -    22327324 chr15:74319851(+) A-I intron -    22327324 chr15:74319236(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr15:74337678(+) A-C intron -    21725310 chr15:74318562(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319173(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319268(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319638(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319668(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319728(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319732(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319733(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319734(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319764(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319770(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319773(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319786(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319794(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319813(+) A-G intron -    22484847 chr15:74319851(+) A-G intron -    22484847 chr15:74317854(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	PML	chr15:74287054-74287055(+) m6A 5'UTR       24981863 chr15:74287066-74287067(+) m6A 5'UTR       24981863 chr15:74287125-74287126(+) m6A 5'UTR       24284625//24209618//24981863 chr15:74287138-74287139(+) m6A 5'UTR       24284625//24209618//24981863 chr15:74287193-74287194(+) m6A CDS       24284625//24981863 chr15:74287234-74287235(+) m6A CDS       24284625//24981863 chr15:74290764-74290765(+) m6A CDS//exon       - chr15:74315388-74315389(+) m6A CDS//exon       - chr15:74315590-74315591(+) m6A CDS//exon       25456834//24981863 chr15:74315605-74315606(+) m6A CDS//exon       25456834//24981863 chr15:74315719-74315720(+) m6A CDS//exon//intron       - chr15:74317248-74317249(+) m6A CDS//exon       - chr15:74325541-74325542(+) m6A CDS//exon//intron       24209618 chr15:74325669-74325670(+) m6A CDS//intron       24284625//24209618 chr15:74326851-74326852(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       - chr15:74326866-74326867(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       - chr15:74326898-74326899(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834 chr15:74326957-74326958(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       25456834 chr15:74327016-74327017(+) m6A 3'UTR//intron       25456834 chr15:74327046-74327047(+) m6A 3'UTR//intron       25456834 chr15:74327455-74327456(+) m6A 3'UTR//intron       - chr15:74327530-74327531(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       - chr15:74327854-74327855(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:74327931-74327932(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr15:74328127-74328128(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr15:74328155-74328156(+) m6A 3'UTR//CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr15:74328445-74328446(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr15:74328461-74328462(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr15:74328548-74328549(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863 chr15:74328676-74328677(+) m6A 3'UTR//intron       24284625 chr15:74328691-74328692(+) m6A 3'UTR//intron       24284625 chr15:74328717-74328718(+) m6A 3'UTR//intron       - chr15:74328728-74328729(+) m6A 3'UTR//intron       - chr15:74336756-74336757(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863 chr15:74336777-74336778(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863 chr15:74336874-74336875(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:74336882-74336883(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:74336893-74336894(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:74336909-74336910(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960 chr15:74337824-74337825(+) m6A 3'UTR       25456834 chr15:74337829-74337830(+) m6A 3'UTR       25456834 chr15:74337927-74337928(+) m6A 3'UTR       25456834 chr15:74337933-74337934(+) m6A 3'UTR       25456834 chr15:74338532-74338533(+) m6A 3'UTR       - chr15:74338540-74338541(+) m6A 3'UTR       - chr15:74338574-74338575(+) m6A 3'UTR       - chr15:74338620-74338621(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hcmv-miR-US25-2-5p	Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
	PML	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US25-2-5p
Interactor2: PML

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Rep//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg