Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00229490

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US5-2-3p:  MIMAT0001580          EXOC1:  NM_001024924     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US5-2-3p	EXOC1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001580	55763
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	BM-102//SEC3//SEC3L1//SEC3P

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	EXOC1	chr4:56762544(+) A-I      intronic chr4:56762549(+) A-I      intronic chr4:56763846(+) A-I      intronic chr4:56764002(+) A-I      intronic chr4:56764211(+) A-I      intronic chr4:56764312(+) A-I      intronic chr4:56764343(+) A-I      intronic chr4:56764332(+) A-I      intronic chr4:56729166(+) A-I      intronic chr4:56729540(+) A-I      intronic chr4:56729735(+) A-I      intronic chr4:56757046(+) A-I      intronic chr4:56757081(+) A-I      intronic chr4:56760332(+) A-I      intronic chr4:56760333(+) A-I      intronic chr4:56760335(+) A-I      intronic chr4:56760344(+) A-I      intronic chr4:56760360(+) A-I      intronic chr4:56760368(+) A-I      intronic chr4:56760370(+) A-I      intronic chr4:56760432(+) A-I      intronic chr4:56760491(+) A-I      intronic chr4:56760925(+) A-I      intronic chr4:56761016(+) A-I      intronic chr4:56762390(+) A-I      intronic chr4:56762395(+) A-I      intronic chr4:56762396(+) A-I      intronic chr4:56762445(+) A-I      intronic chr4:56762455(+) A-I      intronic chr4:56764348(+) A-I      intronic chr4:56762457(+) A-I      intronic chr4:56762477(+) A-I      intronic chr4:56763386(+) A-I      intronic chr4:56729167(+) A-I      intronic chr4:56759338(+) A-I      intronic chr4:56760968(+) A-I      intronic chr4:56761065(+) A-I      intronic chr4:56760853(+) A-I      intronic chr4:56760962(+) A-I      intronic chr4:56729548(+) A-I      intronic chr4:56760440(+) A-I      intronic chr4:56759496(+) A-I      intronic chr4:56762337(+) A-I      intronic chr4:56760276(+) A-I      intronic chr4:56761022(+) A-I      intronic chr4:56760954(+) A-I      intronic chr4:56757055(+) A-I      intronic chr4:56760869(+) A-I      intronic chr4:56760241(+) A-I      intronic chr4:56760215(+) A-I      intronic chr4:56760307(+) A-I      intronic chr4:56762380(+) A-I      intronic chr4:56762545(+) A-I      intronic chr4:56760483(+) A-I      intronic chr4:56760281(+) A-I      intronic chr4:56760420(+) A-I      intronic chr4:56729670(+) A-I      intronic chr4:56760448(+) A-I      intronic chr4:56729703(+) A-I      intronic chr4:56752664(+) A-I      intronic chr4:56762339(+) A-I      intronic chr4:56760889(+) A-I      intronic chr4:56760941(+) A-I      intronic chr4:56760213(+) A-I      intronic chr4:56761010(+) A-I      intronic chr4:56760266(+) A-I      intronic chr4:56760330(+) A-I      intronic chr4:56760271(+) A-I      intronic chr4:56760357(+) A-I      intronic chr4:56761064(+) A-I      intronic chr4:56735441(+) A-I      intronic chr4:56759425(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	EXOC1	chr4:56760307(+) A-I intron -    15258596 chr4:56760330(+) A-I intron -    15258596 chr4:56760331(+) A-I intron -    15258596 chr4:56729131(+) A-G intron -    22484847 chr4:56729167(+) A-G intron -    22484847 chr4:56729703(+) A-G intron -    22484847 chr4:56757055(+) A-G intron -    22484847 chr4:56759333(+) A-G intron -    22484847 chr4:56759338(+) A-G intron -    22484847 chr4:56759425(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760213(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760215(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760266(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760276(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760281(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760307(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760357(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760420(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760888(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760889(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760918(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760954(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760962(+) A-G intron -    22484847 chr4:56760968(+) A-G intron -    22484847 chr4:56761008(+) A-G intron -    22484847 chr4:56761009(+) A-G intron -    22484847 chr4:56761010(+) A-G intron -    22484847 chr4:56761022(+) A-G intron -    22484847 chr4:56761065(+) A-G intron -    22484847 chr4:56762465(+) A-G intron -    22484847 chr4:56762545(+) A-G intron -    22484847 chr4:56763845(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	EXOC1	chr4:56719925-56719926(+) m6A 5'UTR       24981863 chr4:56770620-56770621(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr4:56770661-56770662(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr4:56770711-56770712(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr4:56770746-56770747(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr4:56770752-56770753(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	EXOC1	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US5-2-3p
Interactor2: EXOC1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg