Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00228394

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US5-2-3p:           GTF2B:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-US5-2-3p GTF2B
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0001580 2959
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - TF2B//TFIIB

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR GTF2B
chr1:89349889(-) A-I      intronic
chr1:89320314(-) A-I      intronic
chr1:89349893(-) A-I      intronic
chr1:89349899(-) A-I      intronic
chr1:89350930(-) A-I      intronic
chr1:89349906(-) A-I      intronic
chr1:89321804(-) A-I      intronic
chr1:89321805(-) A-I      intronic
chr1:89321809(-) A-I      intronic
chr1:89322623(-) A-I      intronic
chr1:89322661(-) A-I      intronic
chr1:89322677(-) A-I      intronic
chr1:89322685(-) A-I      intronic
chr1:89323887(-) A-I      intronic
chr1:89328116(-) A-I      intronic
chr1:89320349(-) A-I      intronic
chr1:89321787(-) A-I      intronic
chr1:89349879(-) A-I      intronic
chr1:89349884(-) A-I      intronic
chr1:89350965(-) A-I      intronic
chr1:89323847(-) A-I      intronic
chr1:89323902(-) A-I      intronic
chr1:89324718(-) A-I      intronic
chr1:89324679(-) A-I      intronic
chr1:89324613(-) A-I      intronic
chr1:89324605(-) A-I      intronic
chr1:89323911(-) A-I      intronic
chr1:89323413(-) A-I      intronic
chr1:89324733(-) A-I      intronic
chr1:89337705(-) A-I      intronic
chr1:89337683(-) A-I      intronic
chr1:89337529(-) A-I      intronic
chr1:89331968(-) A-I      intronic
chr1:89331862(-) A-I      intronic
chr1:89338122(-) A-I      intronic
chr1:89331458(-) A-I      intronic
chr1:89331364(-) A-I      intronic
chr1:89337643(-) A-I      intronic
chr1:89329272(-) A-I      intronic
chr1:89320198(-) A-I      intronic
chr1:89338920(-) A-I      intronic
chr1:89338906(-) A-I      intronic
chr1:89328125(-) A-I      intronic
chr1:89339078(-) A-I      intronic
chr1:89342351(-) A-I      intronic
chr1:89346431(-) A-I      intronic
chr1:89346623(-) A-I      intronic
chr1:89346666(-) A-I      intronic
chr1:89347898(-) A-I      intronic
chr1:89347906(-) A-I      intronic
chr1:89347910(-) A-I      intronic
chr1:89349843(-) A-I      intronic
chr1:89349890(-) A-I      intronic
chr1:89349982(-) A-I      intronic
chr1:89350956(-) A-I      intronic
chr1:89329267(-) A-I      intronic
chr1:89351040(-) A-I      intronic
chr1:89351047(-) A-I      intronic
chr1:89351333(-) A-I      intronic
chr1:89351407(-) A-I      intronic
chr1:89352678(-) A-I      intronic
chr1:89352766(-) A-I      intronic
chr1:89352771(-) A-I      intronic
chr1:89352799(-) A-I      intronic
chr1:89352897(-) A-I      intronic
chr1:89355611(-) A-I      intronic
chr1:89327953(-) A-I      intronic
chr1:89329192(-) A-I      intronic
chr1:89320216(-) A-I      intronic
chr1:89320221(-) A-I      intronic
chr1:89320238(-) A-I      intronic
chr1:89320271(-) A-I      intronic
chr1:89320474(-) A-I      intronic
chr1:89323903(-) A-I      intronic
chr1:89325466(-) A-I      intronic
chr1:89325371(-) A-I      intronic
chr1:89325356(-) A-I      intronic
chr1:89325353(-) A-I      intronic
chr1:89321517(-) A-I      intronic
chr1:89325327(-) A-I      intronic
chr1:89325316(-) A-I      intronic
chr1:89328445(-) A-I      intronic
chr1:89328459(-) A-I      intronic
chr1:89328501(-) A-I      intronic
chr1:89328539(-) A-I      intronic
chr1:89319306(-) A-I      intronic
chr1:89319329(-) A-I      intronic
chr1:89319405(-) A-I      intronic
chr1:89328585(-) A-I      intronic
chr1:89328599(-) A-I      intronic
chr1:89329124(-) A-I      intronic
chr1:89328168(-) A-I      intronic
chr1:89321860(-) A-I      intronic
chr1:89322660(-) A-I      intronic
chr1:89329155(-) A-I      intronic
chr1:89329138(-) A-I      intronic
chr1:89324764(-) A-I      intronic
chr1:89324752(-) A-I      intronic
chr1:89324744(-) A-I      intronic
chr1:89320197(-) A-I      intronic
chr1:89325436(-) A-I      intronic
chr1:89322663(-) A-I      intronic
chr1:89322666(-) A-I      intronic
chr1:89352713(-) A-I      intronic
chr1:89352698(-) A-I      intronic
chr1:89332364(-) A-I      intronic
chr1:89339161(-) A-I      intronic
chr1:89324689(-) A-I      intronic
chr1:89347936(-) A-I      intronic
chr1:89349783(-) A-I      intronic
chr1:89340087(-) A-I      intronic
chr1:89322759(-) A-I      intronic
chr1:89328590(-) A-I      intronic
chr1:89349331(-) A-I      intronic
chr1:89331810(-) A-I      intronic
chr1:89329289(-) A-I      intronic
chr1:89349848(-) A-I      intronic
chr1:89334557(-) A-I      intronic
chr1:89325397(-) A-I      intronic
chr1:89340245(-) A-I      intronic
chr1:89328529(-) A-I      intronic
chr1:89321144(-) A-I      intronic
chr1:89321770(-) A-I      intronic
chr1:89327983(-) A-I      intronic
chr1:89349787(-) A-I      intronic
chr1:89327303(-) A-I      intronic
chr1:89345536(-) A-I      intronic
chr1:89322662(-) A-I      intronic
chr1:89337934(-) A-I      intronic
chr1:89332176(-) A-I      intronic
chr1:89324816(-) A-I      intronic
chr1:89351239(-) A-I      intronic
chr1:89338997(-) A-I      intronic
chr1:89350887(-) A-I      intronic
chr1:89328053(-) A-I      intronic
chr1:89325274(-) A-I      intronic
chr1:89332363(-) A-I      intronic
chr1:89321866(-) A-I      intronic
chr1:89343841(-) A-I      intronic
chr1:89338028(-) A-I      intronic
chr1:89320283(-) A-I      intronic
chr1:89337619(-) A-I      intronic
chr1:89321164(-) A-I      intronic
chr1:89343943(-) A-I      intronic
chr1:89325473(-) A-I      intronic
chr1:89321542(-) A-I      intronic
chr1:89320373(-) A-I      intronic
chr1:89322622(-) A-I      intronic
chr1:89332287(-) A-I      intronic
chr1:89352699(-) A-I      intronic
chr1:89335784(-) A-I      intronic
chr1:89349141(-) A-I      intronic
chr1:89337971(-) A-I      intronic
chr1:89320258(-) A-I      intronic
chr1:89340149(-) A-I      intronic
chr1:89352694(-) A-I      intronic
chr1:89349200(-) A-I      intronic
chr1:89320372(-) A-I      intronic
chr1:89328520(-) A-I      intronic
chr1:89346609(-) A-I      intronic
chr1:89325443(-) A-I      intronic
chr1:89328068(-) A-I      intronic
chr1:89322717(-) A-I      intronic
chr1:89321748(-) A-I      intronic
chr1:89331937(-) A-I      intronic
chr1:89321947(-) A-I      intronic
chr1:89322721(-) A-I      intronic
chr1:89346481(-) A-I      intronic
chr1:89321534(-) A-I      intronic
chr1:89324769(-) A-I      intronic
chr1:89327325(-) A-I      intronic
chr1:89328296(-) A-I      intronic
chr1:89349981(-) A-I      intronic
chr1:89321501(-) A-I      intronic
chr1:89329132(-) A-I      intronic
chr1:89338936(-) A-I      intronic
chr1:89321205(-) A-I      intronic
chr1:89320451(-) A-I      intronic
chr1:89332158(-) A-I      intronic
chr1:89331801(-) A-I      intronic
chr1:89324821(-) A-I      intronic
chr1:89329166(-) A-I      intronic
chr1:89323637(-) A-I      intronic
chr1:89321232(-) A-I      intronic
chr1:89345191(-) A-I      intronic
chr1:89337449(-) A-I      intronic
chr1:89335814(-) A-I      intronic
chr1:89331969(-) A-I      intronic
chr1:89328117(-) A-I      intronic
chr1:89320194(-) A-I      intronic
chr1:89320215(-) A-I      intronic
chr1:89323961(-) A-I      intronic
chr1:89352834(-) A-I      intronic
chr1:89321915(-) A-I      intronic
chr1:89352740(-) A-I      intronic
chr1:89331873(-) A-I      intronic
chr1:89331955(-) A-I      intronic
chr1:89320358(-) A-I      intronic
chr1:89322727(-) A-I      intronic
chr1:89352853(-) A-I      intronic
chr1:89349215(-) A-I      intronic
chr1:89349875(-) A-I      intronic
chr1:89321831(-) A-I      intronic
chr1:89350950(-) A-I      intronic
chr1:89325513(-) A-I      intronic
chr1:89336677(-) A-I      intronic
chr1:89324828(-) A-I      intronic
chr1:89331853(-) A-I      intronic
chr1:89319404(-) A-I      intronic
chr1:89321840(-) A-I      intronic
chr1:89335779(-) A-I      intronic
chr1:89338096(-) A-I      intronic
chr1:89323611(-) A-I      intronic
chr1:89321907(-) A-I      intronic
chr1:89332279(-) A-I      intronic
chr1:89328286(-) A-I      intronic
chr1:89349319(-) A-I      intronic
chr1:89338059(-) A-I      intronic
chr1:89337504(-) A-I      intronic
chr1:89349248(-) A-I      intronic
chr1:89327433(-) A-I      intronic
chr1:89328184(-) A-I      intronic
chr1:89335804(-) A-I      intronic
chr1:89332183(-) A-I      intronic
chr1:89337974(-) A-I      intronic
chr1:89320354(-) A-I      intronic
chr1:89352896(-) A-I      intronic
chr1:89340100(-) A-I      intronic
chr1:89322757(-) A-I      intronic
chr1:89332164(-) A-I      intronic
chr1:89324778(-) A-I      intronic
chr1:89335492(-) A-I      intronic
chr1:89323419(-) A-I      intronic
chr1:89327463(-) A-I      intronic
chr1:89331794(-) A-I      intronic
chr1:89325351(-) A-I      intronic
chr1:89351373(-) A-I      intronic
chr1:89349849(-) A-I      intronic
chr1:89349225(-) A-I      intronic
chr1:89339157(-) A-I      intronic
chr1:89328112(-) A-I      intronic
chr1:89337505(-) A-I      intronic
chr1:89337511(-) A-I      intronic
chr1:89320357(-) A-I      intronic
chr1:89320355(-) A-I      intronic
chr1:89331865(-) A-I      intronic
chr1:89349887(-) A-I      intronic
chr1:89327403(-) A-I      intronic
chr1:89346442(-) A-I      intronic
chr1:89328519(-) A-I      intronic
chr1:89352875(-) A-I      intronic
chr1:89322756(-) A-I      intronic
chr1:89327176(-) A-I      intronic
chr1:89325472(-) A-I      intronic
chr1:89335474(-) A-I      intronic
chr1:89349180(-) A-I      intronic
chr1:89320352(-) A-I      intronic
chr1:89351001(-) A-I      intronic
chr1:89325347(-) A-I      intronic
chr1:89320343(-) A-I      intronic
chr1:89331788(-) A-I      intronic
chr1:89337609(-) A-I      intronic
chr1:89349778(-) A-I      intronic
chr1:89349929(-) A-I      intronic
chr1:89336786(-) A-I      intronic
chr1:89328130(-) A-I      intronic
chr1:89352739(-) A-I      intronic
chr1:89327393(-) A-I      intronic
chr1:89328591(-) A-I      intronic
chr1:89321174(-) A-I      intronic
chr1:89321121(-) A-I      intronic
chr1:89331800(-) A-I      intronic
chr1:89352852(-) A-I      intronic
chr1:89332208(-) A-I      intronic
chr1:89331451(-) A-I      intronic
chr1:89321204(-) A-I      intronic
chr1:89325268(-) A-I      intronic
chr1:89331990(-) A-I      intronic
chr1:89347931(-) A-I      intronic
chr1:89349808(-) A-I      intronic
chr1:89343430(-) A-I      intronic
chr1:89346489(-) A-I      intronic
chr1:89337579(-) A-I      intronic
chr1:89338875(-) A-I      intronic
chr1:89332294(-) A-I      intronic
chr1:89323928(-) A-I      intronic
chr1:89349807(-) A-I      intronic
chr1:89323533(-) A-I      intronic
chr1:89334431(-) A-I      intronic
chr1:89332207(-) A-I      intronic
chr1:89351174(-) A-I      intronic
chr1:89328052(-) A-I      intronic
chr1:89321141(-) A-I      intronic
chr1:89347796(-) A-I      intronic
chr1:89347821(-) A-I      intronic
chr1:89350857(-) A-I      intronic
chr1:89335595(-) A-I      intronic
chr1:89345151(-) A-I      intronic
chr1:89338027(-) A-I      intronic
chr1:89320395(-) A-I      intronic
chr1:89320356(-) A-I      intronic
chr1:89339154(-) A-I      intronic
chr1:89338940(-) A-I      intronic
chr1:89352883(-) A-I      intronic
chr1:89325407(-) A-I      intronic
chr1:89325395(-) A-I      intronic
chr1:89343951(-) A-I      intronic
chr1:89321678(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED GTF2B
chr1:89319404(-) A-G intron -    22484847
chr1:89320194(-) A-G intron -    22484847
chr1:89320343(-) A-G intron -    22484847
chr1:89320354(-) A-G intron -    22484847
chr1:89320355(-) A-G intron -    22484847
chr1:89320356(-) A-G intron -    22484847
chr1:89320357(-) A-G intron -    22484847
chr1:89321232(-) A-G intron -    22484847
chr1:89321831(-) A-G intron -    22484847
chr1:89321907(-) A-G intron -    22484847
chr1:89322622(-) A-G intron -    22484847
chr1:89322662(-) A-G intron -    22484847
chr1:89322663(-) A-G intron -    22484847
chr1:89322666(-) A-G intron -    22484847
chr1:89322757(-) A-G intron -    22484847
chr1:89322759(-) A-G intron -    22484847
chr1:89324689(-) A-G intron -    22484847
chr1:89324778(-) A-G intron -    22484847
chr1:89324828(-) A-G intron -    22484847
chr1:89325268(-) A-G intron -    22484847
chr1:89325347(-) A-G intron -    22484847
chr1:89325351(-) A-G intron -    22484847
chr1:89325395(-) A-G intron -    22484847
chr1:89325397(-) A-G intron -    22484847
chr1:89325407(-) A-G intron -    22484847
chr1:89325443(-) A-G intron -    22484847
chr1:89325472(-) A-G intron -    22484847
chr1:89325513(-) A-G intron -    22484847
chr1:89328117(-) A-G intron -    22484847
chr1:89328296(-) A-G intron -    22484847
chr1:89331788(-) A-G intron -    22484847
chr1:89331794(-) A-G intron -    22484847
chr1:89331800(-) A-G intron -    22484847
chr1:89331853(-) A-G intron -    22484847
chr1:89331865(-) A-G intron -    22484847
chr1:89331873(-) A-G intron -    22484847
chr1:89331937(-) A-G intron -    22484847
chr1:89331955(-) A-G intron -    22484847
chr1:89332208(-) A-G intron -    22484847
chr1:89332279(-) A-G intron -    22484847
chr1:89332287(-) A-G intron -    22484847
chr1:89332363(-) A-G intron -    22484847
chr1:89332364(-) A-G intron -    22484847
chr1:89336677(-) A-G intron -    22484847
chr1:89337579(-) A-G intron -    22484847
chr1:89337609(-) A-G intron -    22484847
chr1:89337619(-) A-G intron -    22484847
chr1:89337934(-) A-G intron -    22484847
chr1:89338027(-) A-G intron -    22484847
chr1:89339154(-) A-G intron -    22484847
chr1:89339157(-) A-G intron -    22484847
chr1:89339161(-) A-G intron -    22484847
chr1:89343943(-) A-G intron -    22484847
chr1:89343951(-) A-G intron -    22484847
chr1:89345191(-) A-G intron -    22484847
chr1:89345536(-) A-G intron -    22484847
chr1:89347796(-) A-G intron -    22484847
chr1:89347821(-) A-G intron -    22484847
chr1:89347931(-) A-G intron -    22484847
chr1:89349968(-) C-G intron -    22484847
chr1:89350950(-) A-G intron -    22484847
chr1:89351174(-) A-G intron -    22484847
chr1:89351239(-) A-G intron -    22484847
chr1:89351373(-) A-G intron -    22484847
chr1:89352694(-) A-G intron -    22484847
chr1:89352698(-) A-G intron -    22484847
chr1:89352740(-) A-G intron -    22484847
chr1:89352834(-) A-G intron -    22484847
chr1:89352852(-) A-G intron -    22484847
chr1:89352853(-) A-G intron -    22484847
chr1:89352883(-) A-G intron -    22484847
chr1:89352896(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase GTF2B
chr1:89318793-89318794(-) m6A 3'UTR       24284625//26404942
chr1:89318800-89318801(-) m6A 3'UTR       24284625//26404942
chr1:89318859-89318860(-) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942
chr1:89318914-89318915(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//26404942
chr1:89318938-89318939(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//26404942
chr1:89318976-89318977(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr1:89318988-89318989(-) m6A 3'UTR//CDS       24981863
chr1:89357271-89357272(-) m6A 5'UTR//exon//intron       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate GTF2B
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-US5-2-3p
Interactor2: GTF2B

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...