Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00228243

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.9512

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-US5-2-3p:  MIMAT0001580          CDC42:  NM_001791     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-US5-2-3p	CDC42
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001580	998
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CDC42Hs//G25K//TKS

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CDC42	chr1:22402808(+) A-I      intronic chr1:22400276(+) A-I      intronic chr1:22388306(+) A-I      intronic chr1:22392393(+) A-I      intronic chr1:22400308(+) A-I      intronic chr1:22392800(+) A-I      intronic chr1:22392809(+) A-I      intronic chr1:22392818(+) A-I      intronic chr1:22386649(+) A-I      intronic chr1:22399881(+) A-I      intronic chr1:22386673(+) A-I      intronic chr1:22399879(+) A-I      intronic chr1:22399865(+) A-I      intronic chr1:22393445(+) A-I      intronic chr1:22386640(+) A-I      intronic chr1:22400246(+) A-I      intronic chr1:22391274(+) A-I      intronic chr1:22382122(+) A-I      intronic chr1:22381653(+) A-I      intronic chr1:22392819(+) A-I      intronic chr1:22386682(+) A-I      intronic chr1:22402757(+) A-I      intronic chr1:22388293(+) A-I      intronic chr1:22392404(+) A-I      intronic chr1:22386743(+) A-I      intronic chr1:22388249(+) A-I      intronic chr1:22400264(+) A-I      intronic chr1:22400250(+) A-I      intronic chr1:22400224(+) A-I      intronic chr1:22400210(+) A-I      intronic chr1:22405690(+) A-I      intronic chr1:22388590(+) A-I      intronic chr1:22393380(+) A-I      intronic chr1:22390452(+) A-I      intronic chr1:22386633(+) A-I      intronic chr1:22405798(+) A-I      intronic chr1:22394047(+) A-I      intronic chr1:22398660(+) A-I      intronic chr1:22396520(+) A-I      intronic chr1:22400706(+) A-I      5'UTR chr1:22384994(+) A-I      intronic chr1:22390362(+) A-I      intronic chr1:22388546(+) A-I      intronic chr1:22387636(+) A-I      intronic chr1:22394072(+) A-I      intronic chr1:22393397(+) A-I      intronic chr1:22405867(+) A-I      intronic chr1:22388087(+) A-I      intronic chr1:22387644(+) A-I      intronic chr1:22388612(+) A-I      intronic chr1:22393476(+) A-I      intronic chr1:22388555(+) A-I      intronic chr1:22398644(+) A-I      intronic chr1:22405868(+) A-I      intronic chr1:22394035(+) A-I      intronic chr1:22405884(+) A-I      intronic chr1:22409429(+) A-I      intronic chr1:22409473(+) A-I      intronic chr1:22399982(+) A-I      intronic chr1:22409608(+) A-I      intronic chr1:22388166(+) A-I      intronic chr1:22393453(+) A-I      intronic chr1:22400711(+) A-I      5'UTR chr1:22394039(+) A-I      intronic chr1:22396519(+) A-I      intronic chr1:22390331(+) A-I      intronic chr1:22394018(+) A-I      intronic chr1:22392780(+) A-I      intronic chr1:22387794(+) A-I      intronic chr1:22409635(+) A-I      intronic chr1:22393952(+) A-I      intronic chr1:22388594(+) A-I      intronic chr1:22393396(+) A-I      intronic chr1:22387754(+) A-I      intronic chr1:22409909(+) A-I      intronic chr1:22398708(+) A-I      intronic chr1:22400736(+) A-I      intronic chr1:22398720(+) A-I      intronic chr1:22398726(+) A-I      intronic chr1:22400751(+) A-I      intronic chr1:22385276(+) A-I      intronic chr1:22393392(+) A-I      intronic chr1:22388595(+) A-I      intronic chr1:22387626(+) A-I      intronic chr1:22391200(+) A-I      intronic chr1:22399810(+) A-I      intronic chr1:22393318(+) A-I      intronic chr1:22385076(+) A-I      intronic chr1:22410039(+) A-I      intronic chr1:22385408(+) A-I      intronic chr1:22402767(+) A-I      intronic chr1:22400313(+) A-I      intronic chr1:22411515(+) A-I      intronic chr1:22387781(+) A-I      intronic chr1:22400731(+) A-I      intronic chr1:22388203(+) A-I      intronic chr1:22387916(+) A-I      intronic chr1:22388076(+) A-I      intronic chr1:22386787(+) A-I      intronic chr1:22399820(+) A-I      intronic chr1:22411518(+) A-I      intronic chr1:22400327(+) A-I      intronic chr1:22386763(+) A-I      intronic chr1:22388276(+) A-I      intronic chr1:22387685(+) A-I      intronic chr1:22386752(+) A-I      intronic chr1:22399880(+) A-I      intronic chr1:22411524(+) A-I      intronic chr1:22393373(+) A-I      intronic chr1:22411618(+) A-I      intronic chr1:22402689(+) A-I      intronic chr1:22393395(+) A-I      intronic chr1:22385075(+) A-I      intronic chr1:22387751(+) A-I      intronic chr1:22388283(+) A-I      intronic chr1:22403456(+) A-I      intronic chr1:22386720(+) A-I      intronic chr1:22403510(+) A-I      intronic chr1:22393953(+) A-I      intronic chr1:22387714(+) A-I      intronic chr1:22388328(+) A-I      intronic chr1:22411621(+) A-I      intronic chr1:22388511(+) A-I      intronic chr1:22386298(+) A-I      intronic chr1:22396503(+) A-I      intronic chr1:22411645(+) A-I      intronic chr1:22401175(+) A-I      intronic chr1:22399885(+) A-I      intronic chr1:22399928(+) A-I      intronic chr1:22386588(+) A-I      intronic chr1:22391206(+) A-I      intronic chr1:22386700(+) A-I      intronic chr1:22394027(+) A-I      intronic chr1:22388532(+) A-I      intronic chr1:22386704(+) A-I      intronic chr1:22387716(+) A-I      intronic chr1:22396515(+) A-I      intronic chr1:22399934(+) A-I      intronic chr1:22398655(+) A-I      intronic chr1:22387780(+) A-I      intronic chr1:22398684(+) A-I      intronic chr1:22398695(+) A-I      intronic chr1:22393466(+) A-I      intronic chr1:22386203(+) A-I      intronic chr1:22392739(+) A-I      intronic chr1:22388649(+) A-I      intronic chr1:22388629(+) A-I      intronic chr1:22385056(+) A-I      intronic chr1:22391198(+) A-I      intronic chr1:22389130(+) A-I      intronic chr1:22400800(+) A-I      intronic chr1:22393468(+) A-I      intronic chr1:22393401(+) A-I      intronic chr1:22385541(+) A-I      intronic chr1:22400783(+) A-I      intronic chr1:22400756(+) A-I      intronic chr1:22387758(+) A-I      intronic chr1:22390293(+) A-I      intronic chr1:22392436(+) A-I      intronic chr1:22392757(+) A-I      intronic chr1:22382217(+) A-I      intronic chr1:22391270(+) A-I      intronic chr1:22387645(+) A-I      intronic chr1:22399987(+) A-I      intronic chr1:22392770(+) A-I      intronic chr1:22399984(+) A-I      intronic chr1:22400754(+) A-I      intronic chr1:22402853(+) A-I      intronic chr1:22389122(+) A-I      intronic chr1:22390343(+) A-I      intronic chr1:22393370(+) A-I      intronic chr1:22402697(+) A-I      intronic chr1:22386220(+) A-I      intronic chr1:22394003(+) A-I      intronic chr1:22388140(+) A-I      intronic chr1:22388315(+) A-I      intronic chr1:22393310(+) A-I      intronic chr1:22385388(+) A-I      intronic chr1:22398772(+) A-I      intronic chr1:22402824(+) A-I      intronic chr1:22390449(+) A-I      intronic chr1:22409603(+) A-I      intronic chr1:22410023(+) A-I      intronic chr1:22380821(+) A-I      intronic chr1:22409987(+) A-I      intronic chr1:22398730(+) A-I      intronic chr1:22380783(+) A-I      intronic chr1:22389144(+) A-I      intronic chr1:22391350(+) A-I      intronic chr1:22393425(+) A-I      intronic chr1:22387628(+) A-I      intronic chr1:22396502(+) A-I      intronic chr1:22400674(+) A-I      5'UTR chr1:22386313(+) A-I      intronic chr1:22400849(+) A-I      intronic chr1:22400021(+) A-I      intronic chr1:22390314(+) A-I      intronic chr1:22387650(+) A-I      intronic chr1:22393371(+) A-I      intronic chr1:22385592(+) A-I      intronic chr1:22385094(+) A-I      intronic chr1:22381708(+) A-I      intronic chr1:22380788(+) A-I      intronic chr1:22403551(+) A-I      intronic chr1:22388664(+) A-I      intronic chr1:22380883(+) A-I      intronic chr1:22392813(+) A-I      intronic chr1:22388690(+) A-I      intronic chr1:22391402(+) A-I      intronic chr1:22396455(+) A-I      intronic chr1:22400669(+) A-I      5'UTR chr1:22391370(+) A-I      intronic chr1:22392812(+) A-I      intronic chr1:22386776(+) A-I      intronic chr1:22382257(+) A-I      intronic chr1:22403432(+) A-I      intronic chr1:22400379(+) A-I      intronic chr1:22401181(+) A-I      intronic chr1:22401187(+) A-I      intronic chr1:22399944(+) A-I      intronic chr1:22400687(+) A-I      5'UTR chr1:22386659(+) A-I      intronic chr1:22403590(+) A-I      intronic chr1:22386751(+) A-I      intronic chr1:22399882(+) A-I      intronic chr1:22393909(+) A-I      intronic chr1:22386320(+) A-I      intronic chr1:22389121(+) A-I      intronic chr1:22402698(+) A-I      intronic chr1:22394012(+) A-I      intronic chr1:22399774(+) A-I      intronic chr1:22400418(+) A-I      intronic chr1:22400768(+) A-I      intronic chr1:22401148(+) A-I      intronic chr1:22402892(+) A-I      intronic chr1:22390804(+) A-I      intronic chr1:22382148(+) A-I      intronic chr1:22403462(+) A-I      intronic chr1:22402691(+) A-I      intronic chr1:22392329(+) A-I      intronic chr1:22400247(+) A-I      intronic chr1:22387846(+) A-I      intronic chr1:22400218(+) A-I      intronic chr1:22403440(+) A-I      intronic chr1:22388568(+) A-I      intronic chr1:22400597(+) A-I      5'UTR chr1:22388463(+) A-I      intronic chr1:22399912(+) A-I      intronic chr1:22409466(+) A-I      intronic chr1:22394499(+) A-I      intronic chr1:22392381(+) A-I      intronic chr1:22389203(+) A-I      intronic chr1:22386579(+) A-I      intronic chr1:22394025(+) A-I      intronic chr1:22394077(+) A-I      intronic chr1:22388626(+) A-I      intronic chr1:22385158(+) A-I      intronic chr1:22400670(+) A-I      5'UTR chr1:22385434(+) A-I      intronic chr1:22400709(+) A-I      5'UTR chr1:22392843(+) A-I      intronic chr1:22393285(+) A-I      intronic chr1:22403637(+) A-I      intronic chr1:22386311(+) A-I      intronic chr1:22398864(+) A-I      intronic chr1:22385425(+) A-I      intronic chr1:22396543(+) A-I      intronic chr1:22382165(+) A-I      intronic chr1:22388512(+) A-I      intronic chr1:22402795(+) A-I      intronic chr1:22400776(+) A-I      intronic chr1:22402712(+) A-I      intronic chr1:22400019(+) A-I      intronic chr1:22393501(+) A-I      intronic chr1:22399843(+) A-I      intronic chr1:22385473(+) A-I      intronic chr1:22409867(+) A-I      intronic chr1:22402831(+) A-I      intronic chr1:22384356(+) A-I      intronic chr1:22386772(+) A-I      intronic chr1:22393928(+) A-I      intronic chr1:22388316(+) A-I      intronic chr1:22383958(+) A-I      intronic chr1:22390829(+) A-I      intronic chr1:22402733(+) A-I      intronic chr1:22390965(+) A-I      intronic chr1:22380809(+) A-I      intronic chr1:22398866(+) A-I      intronic chr1:22409871(+) A-I      intronic chr1:22399752(+) A-I      intronic chr1:22397074(+) A-I      intronic chr1:22386725(+) A-I      intronic chr1:22394257(+) A-I      intronic chr1:22402836(+) A-I      intronic chr1:22391379(+) A-I      intronic chr1:22403550(+) A-I      intronic chr1:22393436(+) A-I      intronic chr1:22388691(+) A-I      intronic chr1:22403534(+) A-I      intronic chr1:22386634(+) A-I      intronic chr1:22391273(+) A-I      intronic chr1:22385554(+) A-I      intronic chr1:22392747(+) A-I      intronic chr1:22403496(+) A-I      intronic chr1:22399921(+) A-I      intronic chr1:22387880(+) A-I      intronic chr1:22409840(+) A-I      intronic chr1:22402896(+) A-I      intronic chr1:22409472(+) A-I      intronic chr1:22394476(+) A-I      intronic chr1:22401122(+) A-I      intronic chr1:22393427(+) A-I      intronic chr1:22390903(+) A-I      intronic chr1:22394550(+) A-I      intronic chr1:22386299(+) A-I      intronic chr1:22388535(+) A-I      intronic chr1:22402703(+) A-I      intronic chr1:22385528(+) A-I      intronic chr1:22386711(+) A-I      intronic chr1:22390393(+) A-I      intronic chr1:22391311(+) A-I      intronic chr1:22397744(+) A-I      intronic chr1:22393435(+) A-I      intronic chr1:22388558(+) A-I      intronic chr1:22380838(+) A-I      intronic chr1:22402752(+) A-I      intronic chr1:22392335(+) A-I      intronic chr1:22402830(+) A-I      intronic chr1:22393973(+) A-I      intronic chr1:22402862(+) A-I      intronic chr1:22394503(+) A-I      intronic chr1:22398797(+) A-I      intronic chr1:22402798(+) A-I      intronic chr1:22388453(+) A-I      intronic chr1:22382014(+) A-I      intronic chr1:22412392(+) A-I      intronic chr1:22388289(+) A-I      intronic chr1:22399911(+) A-I      intronic chr1:22400843(+) A-I      intronic chr1:22392369(+) A-I      intronic chr1:22409940(+) A-I      intronic chr1:22388609(+) A-I      intronic chr1:22385453(+) A-I      intronic chr1:22399876(+) A-I      intronic chr1:22382052(+) A-I      intronic chr1:22386166(+) A-I      intronic chr1:22385155(+) A-I      intronic chr1:22385327(+) A-I      intronic chr1:22402899(+) A-I      intronic chr1:22400038(+) A-I      intronic chr1:22389140(+) A-I      intronic chr1:22402751(+) A-I      intronic chr1:22390422(+) A-I      intronic chr1:22403518(+) A-I      intronic chr1:22403538(+) A-I      intronic chr1:22390265(+) A-I      intronic chr1:22388638(+) A-I      intronic chr1:22403599(+) A-I      intronic chr1:22390475(+) A-I      intronic chr1:22390238(+) A-I      intronic chr1:22393302(+) A-I      intronic chr1:22409949(+) A-I      intronic chr1:22407408(+) A-I      intronic chr1:22390886(+) A-I      intronic chr1:22385409(+) A-I      intronic chr1:22403436(+) A-I      intronic chr1:22400312(+) A-I      intronic chr1:22382112(+) A-I      intronic chr1:22394516(+) A-I      intronic chr1:22385212(+) A-I      intronic chr1:22393342(+) A-I      intronic chr1:22403594(+) A-I      intronic chr1:22409943(+) A-I      intronic chr1:22385115(+) A-I      intronic chr1:22403441(+) A-I      intronic chr1:22407402(+) A-I      intronic chr1:22409648(+) A-I      intronic chr1:22409946(+) A-I      intronic chr1:22402872(+) A-I      intronic chr1:22409554(+) A-I      intronic chr1:22385093(+) A-I      intronic chr1:22394074(+) A-I      intronic chr1:22385437(+) A-I      intronic chr1:22407409(+) A-I      intronic chr1:22402857(+) A-I      intronic chr1:22400229(+) A-I      intronic chr1:22409563(+) A-I      intronic chr1:22399775(+) A-I      intronic chr1:22386271(+) A-I      intronic chr1:22412364(+) A-I      intronic chr1:22388703(+) A-I      intronic chr1:22400382(+) A-I      intronic chr1:22392774(+) A-I      intronic chr1:22393884(+) A-I      intronic chr1:22392777(+) A-I      intronic chr1:22390353(+) A-I      intronic chr1:22393301(+) A-I      intronic chr1:22402792(+) A-I      intronic chr1:22391353(+) A-I      intronic chr1:22398804(+) A-I      intronic chr1:22403409(+) A-I      intronic chr1:22396420(+) A-I      intronic chr1:22402863(+) A-I      intronic chr1:22402883(+) A-I      intronic chr1:22400277(+) A-I      intronic chr1:22386658(+) A-I      intronic chr1:22397676(+) A-I      intronic chr1:22392450(+) A-I      intronic chr1:22400630(+) A-I      5'UTR chr1:22400406(+) A-I      intronic chr1:22392391(+) A-I      intronic chr1:22392352(+) A-I      intronic chr1:22382031(+) A-I      intronic chr1:22380808(+) A-I      intronic chr1:22386657(+) A-I      intronic chr1:22392433(+) A-I      intronic chr1:22393409(+) A-I      intronic chr1:22388506(+) A-I      intronic chr1:22399977(+) A-I      intronic chr1:22381707(+) A-I      intronic chr1:22386217(+) A-I      intronic chr1:22396516(+) A-I      intronic chr1:22398801(+) A-I      intronic chr1:22388176(+) A-I      intronic chr1:22391309(+) A-I      intronic chr1:22396442(+) A-I      intronic chr1:22389103(+) A-I      intronic chr1:22387891(+) A-I      intronic chr1:22400621(+) A-I      5'UTR chr1:22400341(+) A-I      intronic chr1:22390288(+) A-I      intronic chr1:22391359(+) A-I      intronic chr1:22401095(+) A-I      intronic chr1:22399759(+) A-I      intronic chr1:22385235(+) A-I      intronic chr1:22386580(+) A-I      intronic chr1:22380826(+) A-I      intronic chr1:22403569(+) A-I      intronic chr1:22402724(+) A-I      intronic chr1:22401110(+) A-I      intronic chr1:22386688(+) A-I      intronic chr1:22385387(+) A-I      intronic chr1:22403486(+) A-I      intronic chr1:22388202(+) A-I      intronic chr1:22386610(+) A-I      intronic chr1:22400699(+) A-I      5'UTR chr1:22410004(+) A-I      intronic chr1:22385553(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CDC42	chr1:22402831(+) A-I intron -    22327324 chr1:22385554(+) A-I intron -    21960545 chr1:22392812(+) A-I intron -    21960545 chr1:22392813(+) A-I intron -    21960545 chr1:22401148(+) A-I intron -    21960545 chr1:22402795(+) A-I intron -    21960545 chr1:22418284(+) G-T intron -    21725310 chr1:22380783(+) A-G intron -    22484847 chr1:22380838(+) A-G intron -    22484847 chr1:22380883(+) A-G intron -    22484847 chr1:22381708(+) A-G intron -    22484847 chr1:22382014(+) A-G intron -    22484847 chr1:22382031(+) A-G intron -    22484847 chr1:22384993(+) G-T intron -    22484847 chr1:22385093(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385094(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385101(+) G-A intron -    22484847 chr1:22385155(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385212(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385235(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385253(+) T-A intron -    22484847 chr1:22385388(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385409(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385425(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385453(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385528(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385553(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385554(+) A-G intron -    22484847 chr1:22385592(+) A-G intron -    22484847 chr1:22386154(+) A-G intron -    22484847 chr1:22386163(+) A-G intron -    22484847 chr1:22386166(+) A-G intron -    22484847 chr1:22386320(+) A-G intron -    22484847 chr1:22386658(+) A-G intron -    22484847 chr1:22386711(+) A-G intron -    22484847 chr1:22386725(+) A-G intron -    22484847 chr1:22386751(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388140(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388202(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388463(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388506(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388512(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388535(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388558(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388568(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388609(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388626(+) A-G intron -    22484847 chr1:22388691(+) A-G intron -    22484847 chr1:22389121(+) A-G intron -    22484847 chr1:22389122(+) A-G intron -    22484847 chr1:22390265(+) A-G intron -    22484847 chr1:22390288(+) A-G intron -    22484847 chr1:22390393(+) A-G intron -    22484847 chr1:22390449(+) A-G intron -    22484847 chr1:22390475(+) A-G intron -    22484847 chr1:22390804(+) A-G intron -    22484847 chr1:22390886(+) A-G intron -    22484847 chr1:22390965(+) A-G intron -    22484847 chr1:22391184(+) C-T intron -    22484847 chr1:22391273(+) A-G intron -    22484847 chr1:22391309(+) A-G intron -    22484847 chr1:22391350(+) A-G intron -    22484847 chr1:22391353(+) A-G intron -    22484847 chr1:22391359(+) A-G intron -    22484847 chr1:22391370(+) A-G intron -    22484847 chr1:22391402(+) A-G intron -    22484847 chr1:22392329(+) A-G intron -    22484847 chr1:22392391(+) A-G intron -    22484847 chr1:22392735(+) G-A intron -    22484847 chr1:22392747(+) A-G intron -    22484847 chr1:22392774(+) A-G intron -    22484847 chr1:22392812(+) A-G intron -    22484847 chr1:22393371(+) A-G intron -    22484847 chr1:22393409(+) A-G intron -    22484847 chr1:22393425(+) A-G intron -    22484847 chr1:22393427(+) A-G intron -    22484847 chr1:22393928(+) A-G intron -    22484847 chr1:22394499(+) A-G intron -    22484847 chr1:22394550(+) A-G intron -    22484847 chr1:22396502(+) A-G intron -    22484847 chr1:22396516(+) A-G intron -    22484847 chr1:22397074(+) A-G intron -    22484847 chr1:22397539(+) C-T intron -    22484847 chr1:22397555(+) G-T intron -    22484847 chr1:22397556(+) A-T intron -    22484847 chr1:22397676(+) A-G intron -    22484847 chr1:22397744(+) A-G intron -    22484847 chr1:22398730(+) A-G intron -    22484847 chr1:22398797(+) A-G intron -    22484847 chr1:22398801(+) A-G intron -    22484847 chr1:22398864(+) A-G intron -    22484847 chr1:22399752(+) A-G intron -    22484847 chr1:22399775(+) A-G intron -    22484847 chr1:22399843(+) A-G intron -    22484847 chr1:22399911(+) A-G intron -    22484847 chr1:22399912(+) A-G intron -    22484847 chr1:22400019(+) A-G intron -    22484847 chr1:22400021(+) A-G intron -    22484847 chr1:22400247(+) A-G intron -    22484847 chr1:22400277(+) A-G intron -    22484847 chr1:22400341(+) A-G intron -    22484847 chr1:22400382(+) A-G intron -    22484847 chr1:22400597(+) A-G exon 5'UTR    22484847 chr1:22400621(+) A-G exon 5'UTR    22484847 chr1:22400669(+) A-G exon 5'UTR    22484847 chr1:22400670(+) A-G exon 5'UTR    22484847 chr1:22400709(+) A-G exon 5'UTR    22484847 chr1:22400768(+) A-G intron -    22484847 chr1:22400776(+) A-G intron -    22484847 chr1:22400849(+) A-G intron -    22484847 chr1:22401095(+) A-G intron -    22484847 chr1:22401148(+) A-G intron -    22484847 chr1:22401181(+) A-G intron -    22484847 chr1:22401187(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402691(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402697(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402698(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402703(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402712(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402733(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402751(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402752(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402792(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402824(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402830(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402831(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402836(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402853(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402857(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402862(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402863(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402883(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402892(+) A-G intron -    22484847 chr1:22402896(+) A-G intron -    22484847 chr1:22403436(+) A-G intron -    22484847 chr1:22403440(+) A-G intron -    22484847 chr1:22403518(+) A-G intron -    22484847 chr1:22403538(+) A-G intron -    22484847 chr1:22403550(+) A-G intron -    22484847 chr1:22403590(+) A-G intron -    22484847 chr1:22403594(+) A-G intron -    22484847 chr1:22407402(+) A-G intron -    22484847 chr1:22407408(+) A-G intron -    22484847 chr1:22407409(+) A-G intron -    22484847 chr1:22409466(+) A-G intron -    22484847 chr1:22409472(+) A-G intron -    22484847 chr1:22409554(+) A-G intron -    22484847 chr1:22409867(+) A-G intron -    22484847 chr1:22409871(+) A-G intron -    22484847 chr1:22409940(+) A-G intron -    22484847 chr1:22409943(+) A-G intron -    22484847 chr1:22410023(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CDC42	chr1:22379194-22379195(+) m6A 5'UTR       24981863//22608085 chr1:22400705-22400706(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr1:22404959-22404960(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr1:22404977-22404978(+) m6A CDS//exon       24981863 chr1:22405037-22405038(+) Y CDS//exon       26075521 chr1:22418978-22418979(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22418988-22418989(+) Y 3'UTR       26075521 chr1:22419018-22419019(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22419111-22419112(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22419129-22419130(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22419172-22419173(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22419223-22419224(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22419236-22419237(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22419331-22419332(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22419361-22419362(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22419418-22419419(+) m6A 3'UTR       27773535 chr1:22419428-22419429(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	CDC42	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus HCC cell line (HepG2)     - Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-US5-2-3p
Interactor2: CDC42

Evidence Support:

Strong-Evidence	Luciferase reporter assay//Western blot
Weak-Evidence	RIP-Chip
Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg

References:

PMID	24629342	Target region	None
Source	VmiReg	Interactor1 expression	None
Tissue or cell line	293T cells	Interactor2 expression	None
Description	We find that HCMV miRs UL112-1,US5-1, and US5-2 target multiple components of the host secretory pathway, including VAMP3, RAB5C, RAB11A, SNAP23, and CDC42.