Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00224252

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2494

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL148D:  MIMAT0001578          CROCC:  NM_014675     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-UL148D	CROCC
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001578	9696
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ROLT//TAX1BP2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	CROCC	chr1:17273300(+) A-I      Syn:Ala->Ala chr1:17273291(+) A-I      Syn:Gln->Gln chr1:17273464(+) A-I      NonSyn:Gln->Arg chr1:17289470(+) A-I      intronic chr1:17289476(+) A-I      intronic chr1:17285622(+) A-I      intronic chr1:17290701(+) A-I      intronic chr1:17289499(+) A-I      intronic chr1:17286602(+) A-I      intronic chr1:17286603(+) A-I      intronic chr1:17286606(+) A-I      intronic chr1:17286615(+) A-I      intronic chr1:17289421(+) A-I      intronic chr1:17283791(+) A-I      intronic chr1:17267241(+) A-I      intronic chr1:17285781(+) A-I      intronic chr1:17289467(+) A-I      intronic chr1:17285635(+) A-I      intronic chr1:17290719(+) A-I      intronic chr1:17289481(+) A-I      intronic chr1:17268545(+) A-I      intronic chr1:17291476(+) A-I      intronic chr1:17289486(+) A-I      intronic chr1:17289445(+) A-I      intronic chr1:17283737(+) A-I      intronic chr1:17289475(+) A-I      intronic chr1:17291533(+) A-I      intronic chr1:17274473(+) A-I      ncRNA chr1:17289422(+) A-I      intronic chr1:17274460(+) A-I      ncRNA chr1:17286597(+) A-I      intronic chr1:17283811(+) A-I      intronic chr1:17283798(+) A-I      intronic chr1:17283769(+) A-I      intronic chr1:17283787(+) A-I      intronic chr1:17283771(+) A-I      intronic chr1:17283744(+) A-I      intronic chr1:17283606(+) A-I      intronic chr1:17278930(+) A-I      intronic chr1:17278888(+) A-I      intronic chr1:17278886(+) A-I      intronic chr1:17278827(+) A-I      intronic chr1:17268647(+) A-I      intronic chr1:17291570(+) A-I      intronic chr1:17283993(+) A-I      intronic chr1:17278931(+) A-I      intronic chr1:17291494(+) A-I      intronic chr1:17260246(+) A-I      intronic chr1:17278929(+) A-I      intronic chr1:17255044(+) A-I      intronic chr1:17269483(+) A-I      intronic chr1:17278908(+) A-I      intronic chr1:17269577(+) A-I      intronic chr1:17277053(+) A-I      ncRNA chr1:17278900(+) A-I      intronic chr1:17261604(+) A-I      intronic chr1:17259586(+) A-I      intronic chr1:17258841(+) A-I      intronic chr1:17273853(+) A-I      ncRNA chr1:17289116(+) A-I      intronic chr1:17258798(+) A-I      intronic chr1:17274569(+) A-I      ncRNA chr1:17288616(+) A-I      intronic chr1:17255487(+) A-I      intronic chr1:17284002(+) A-I      intronic chr1:17255488(+) A-I      intronic chr1:17258788(+) A-I      intronic chr1:17283692(+) A-I      intronic chr1:17278892(+) A-I      intronic chr1:17278792(+) A-I      intronic chr1:17258847(+) A-I      intronic chr1:17278962(+) A-I      intronic chr1:17288915(+) A-I      intronic chr1:17278760(+) A-I      intronic chr1:17258796(+) A-I      intronic chr1:17285699(+) A-I      intronic chr1:17255144(+) A-I      intronic chr1:17289563(+) A-I      intronic chr1:17289567(+) A-I      intronic chr1:17278763(+) A-I      intronic chr1:17262126(+) A-I      intronic chr1:17268123(+) A-I      intronic chr1:17283743(+) A-I      intronic chr1:17255483(+) A-I      intronic chr1:17268432(+) A-I      intronic chr1:17267082(+) A-I      intronic chr1:17255151(+) A-I      intronic chr1:17268133(+) A-I      intronic chr1:17291468(+) A-I      intronic chr1:17283589(+) A-I      intronic chr1:17291491(+) A-I      intronic chr1:17278606(+) A-I      intronic chr1:17283854(+) A-I      intronic chr1:17259815(+) A-I      intronic chr1:17278970(+) A-I      intronic chr1:17278967(+) A-I      intronic chr1:17269339(+) A-I      intronic chr1:17284038(+) A-I      intronic chr1:17291385(+) A-I      intronic chr1:17259683(+) A-I      intronic chr1:17273914(+) A-I      intronic chr1:17269658(+) A-I      intronic chr1:17268417(+) A-I      intronic chr1:17285538(+) A-I      intronic chr1:17284067(+) A-I      intronic chr1:17283701(+) A-I      intronic chr1:17283607(+) A-I      intronic chr1:17268623(+) A-I      intronic chr1:17278473(+) A-I      intronic chr1:17255602(+) A-I      intronic chr1:17290371(+) A-I      intronic chr1:17255522(+) A-I      intronic chr1:17268706(+) A-I      intronic chr1:17266984(+) A-I      intronic chr1:17284012(+) A-I      intronic chr1:17291343(+) A-I      intronic chr1:17278550(+) A-I      intronic chr1:17255187(+) A-I      intronic chr1:17260314(+) A-I      intronic chr1:17289603(+) A-I      intronic chr1:17260190(+) A-I      intronic chr1:17268380(+) A-I      intronic chr1:17284137(+) A-I      intronic chr1:17278901(+) A-I      intronic chr1:17258684(+) A-I      intronic chr1:17259841(+) A-I      intronic chr1:17278568(+) A-I      intronic chr1:17278585(+) A-I      intronic chr1:17283668(+) A-I      intronic chr1:17288687(+) A-I      intronic chr1:17283859(+) A-I      intronic chr1:17288926(+) A-I      intronic chr1:17283755(+) A-I      intronic chr1:17255596(+) A-I      intronic chr1:17262902(+) A-I      intronic chr1:17284220(+) A-I      intronic chr1:17259541(+) A-I      intronic chr1:17278726(+) A-I      intronic chr1:17268125(+) A-I      intronic chr1:17259851(+) A-I      intronic chr1:17258356(+) A-I      intronic chr1:17284055(+) A-I      intronic chr1:17274414(+) A-I      intronic chr1:17289244(+) A-I      intronic chr1:17289558(+) A-I      intronic chr1:17273817(+) A-I      ncRNA chr1:17273833(+) A-I      ncRNA chr1:17274555(+) A-I      ncRNA chr1:17274434(+) A-I      ncRNA chr1:17274600(+) A-I      ncRNA chr1:17273771(+) A-I      ncRNA chr1:17274475(+) A-I      ncRNA chr1:17274463(+) A-I      ncRNA chr1:17273757(+) A-I      ncRNA chr1:17274598(+) A-I      ncRNA chr1:17273843(+) A-I      ncRNA chr1:17274556(+) A-I      ncRNA chr1:17274523(+) A-I      ncRNA chr1:17278829(+) A-I      intronic chr1:17278467(+) A-I      intronic chr1:17289145(+) A-I      intronic chr1:17283591(+) A-I      intronic chr1:17260924(+) A-I      intronic chr1:17288883(+) A-I      intronic chr1:17278526(+) A-I      intronic chr1:17258867(+) A-I      intronic chr1:17290696(+) A-I      intronic chr1:17258697(+) A-I      intronic chr1:17283831(+) A-I      intronic chr1:17255043(+) A-I      intronic chr1:17278912(+) A-I      intronic chr1:17283759(+) A-I      intronic chr1:17283835(+) A-I      intronic chr1:17268592(+) A-I      intronic chr1:17289557(+) A-I      intronic chr1:17283909(+) A-I      intronic chr1:17285657(+) A-I      intronic chr1:17290727(+) A-I      intronic chr1:17269854(+) A-I      intronic chr1:17278486(+) A-I      intronic chr1:17258542(+) A-I      intronic chr1:17269849(+) A-I      intronic chr1:17276917(+) A-I      intronic chr1:17278968(+) A-I      intronic chr1:17284140(+) A-I      intronic chr1:17268645(+) A-I      intronic chr1:17278451(+) A-I      intronic chr1:17266860(+) A-I      intronic chr1:17283740(+) A-I      intronic chr1:17261616(+) A-I      intronic chr1:17278656(+) A-I      intronic chr1:17267865(+) A-I      intronic chr1:17288699(+) A-I      intronic chr1:17278620(+) A-I      intronic chr1:17260328(+) A-I      intronic chr1:17283609(+) A-I      intronic chr1:17268106(+) A-I      intronic chr1:17284077(+) A-I      intronic chr1:17283539(+) A-I      intronic chr1:17278882(+) A-I      intronic chr1:17283611(+) A-I      intronic chr1:17269346(+) A-I      intronic chr1:17258338(+) A-I      intronic chr1:17259810(+) A-I      intronic chr1:17278587(+) A-I      intronic chr1:17259951(+) A-I      intronic chr1:17284090(+) A-I      intronic chr1:17259842(+) A-I      intronic chr1:17260136(+) A-I      intronic chr1:17283700(+) A-I      intronic chr1:17278642(+) A-I      intronic chr1:17278644(+) A-I      intronic chr1:17284123(+) A-I      intronic chr1:17289531(+) A-I      intronic chr1:17262938(+) A-I      intronic chr1:17274357(+) A-I      intronic chr1:17288958(+) A-I      intronic chr1:17259819(+) A-I      intronic chr1:17278725(+) A-I      intronic chr1:17284042(+) A-I      intronic chr1:17283720(+) A-I      intronic chr1:17283581(+) A-I      intronic chr1:17291398(+) A-I      intronic chr1:17283724(+) A-I      intronic chr1:17278442(+) A-I      intronic chr1:17290653(+) A-I      intronic chr1:17283617(+) A-I      intronic chr1:17283781(+) A-I      intronic chr1:17283621(+) A-I      intronic chr1:17288149(+) A-I      intronic chr1:17279037(+) A-I      intronic chr1:17284114(+) A-I      intronic chr1:17268767(+) A-I      intronic chr1:17269778(+) A-I      intronic chr1:17268104(+) A-I      intronic chr1:17260244(+) A-I      intronic chr1:17283753(+) A-I      intronic chr1:17258514(+) A-I      intronic chr1:17278889(+) A-I      intronic chr1:17258332(+) A-I      intronic chr1:17278828(+) A-I      intronic chr1:17274398(+) A-I      intronic chr1:17283822(+) A-I      intronic chr1:17283608(+) A-I      intronic chr1:17288950(+) A-I      intronic chr1:17289130(+) A-I      intronic chr1:17260241(+) A-I      intronic chr1:17259703(+) A-I      intronic chr1:17278487(+) A-I      intronic chr1:17259566(+) A-I      intronic chr1:17278826(+) A-I      intronic chr1:17278830(+) A-I      intronic chr1:17258391(+) A-I      intronic chr1:17291013(+) A-I      intronic chr1:17289501(+) A-I      intronic chr1:17283520(+) A-I      intronic chr1:17268689(+) A-I      intronic chr1:17289083(+) A-I      intronic chr1:17269617(+) A-I      intronic chr1:17288919(+) A-I      intronic chr1:17278406(+) A-I      intronic chr1:17290726(+) A-I      intronic chr1:17278516(+) A-I      intronic chr1:17260170(+) A-I      intronic chr1:17278565(+) A-I      intronic chr1:17290941(+) A-I      intronic chr1:17283509(+) A-I      intronic chr1:17269576(+) A-I      intronic chr1:17283827(+) A-I      intronic chr1:17290783(+) A-I      intronic chr1:17259809(+) A-I      intronic chr1:17289590(+) A-I      intronic chr1:17259883(+) A-I      intronic chr1:17268758(+) A-I      intronic chr1:17289284(+) A-I      intronic chr1:17269648(+) A-I      intronic chr1:17278621(+) A-I      intronic chr1:17268046(+) A-I      intronic chr1:17259806(+) A-I      intronic chr1:17268695(+) A-I      intronic chr1:17269682(+) A-I      intronic chr1:17278833(+) A-I      intronic chr1:17269769(+) A-I      intronic chr1:17278551(+) A-I      intronic chr1:17291102(+) A-I      intronic chr1:17291089(+) A-I      intronic chr1:17291023(+) A-I      intronic chr1:17289143(+) A-I      intronic chr1:17260200(+) A-I      intronic chr1:17278540(+) A-I      intronic chr1:17278466(+) A-I      intronic chr1:17260126(+) A-I      intronic chr1:17278794(+) A-I      intronic chr1:17289610(+) A-I      intronic chr1:17269777(+) A-I      intronic chr1:17258390(+) A-I      intronic chr1:17284216(+) A-I      intronic chr1:17284120(+) A-I      intronic chr1:17291520(+) A-I      intronic chr1:17268606(+) A-I      intronic chr1:17283741(+) A-I      intronic chr1:17259719(+) A-I      intronic chr1:17255210(+) A-I      intronic chr1:17283505(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	CROCC	chr1:17267556(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr1:17267584(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr1:17267608(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr1:17269849(+) A-I intron -    15342557 chr1:17269854(+) A-I intron -    15342557 chr1:17274463(+) A-I intron -    15258596 chr1:17274475(+) A-I intron -    15258596 chr1:17274523(+) A-I intron -    15258596 chr1:17276917(+) A-I intron -    15258596 chr1:17277053(+) A-I intron -    15258596 chr1:17277150(+) A-I intron -    15258596 chr1:17259719(+) A-G intron -    22484847 chr1:17278473(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	CROCC	chr1:17067014-17067015(+) Y intron       16381836 chr1:17067015-17067016(+) Y intron       16381836 chr1:17067079-17067080(+) Am intron       16381836 chr1:17188460-17188461(+) m5C intron       23604283 chr1:17188461-17188462(+) m5C intron       23604283 chr1:17188462-17188463(+) m5C intron       23604283 chr1:17188467-17188468(+) Y intron       25219674 chr1:17197584-17197585(+) m6A intron       24981863 chr1:17197631-17197632(+) m6A intron       24981863 chr1:17197636-17197637(+) m6A intron       24981863 chr1:17198145-17198146(+) m6A intron       24981863 chr1:17198153-17198154(+) m6A intron       24981863 chr1:17198222-17198223(+) m6A intron       25456834 chr1:17199230-17199231(+) m6A intron       25456834 chr1:17199282-17199283(+) m6A intron       25456834 chr1:17199722-17199723(+) m6A intron       25456834//24981863 chr1:17199751-17199752(+) m6A intron       25456834//24981863 chr1:17199910-17199911(+) m6A intron       25456834 chr1:17199968-17199969(+) m6A intron       25456834 chr1:17199991-17199992(+) m6A intron       25456834 chr1:17200206-17200207(+) Y intron       25192136 chr1:17200207-17200208(+) Y intron       25192136 chr1:17200224-17200225(+) m6A intron       25456834 chr1:17215853-17215854(+) m6A intron       24981863 chr1:17216179-17216180(+) m1G intron       23118484 chr1:17216180-17216181(+) m2G intron       23118484 chr1:17216186-17216187(+) D intron       23118484 chr1:17216190-17216191(+) D intron       23118484 chr1:17216191-17216192(+) acp3U intron       23118484 chr1:17216197-17216198(+) m2,2G intron       23118484 chr1:17216198-17216199(+) Y intron       23118484//26075521 chr1:17216199-17216200(+) Y intron       23118484 chr1:17216205-17216206(+) QtRNA intron       23118484 chr1:17216208-17216209(+) t6A intron       23118484 chr1:17216217-17216218(+) m7G intron       23118484 chr1:17216218-17216219(+) D intron       23118484 chr1:17216226-17216227(+) Y intron       23118484 chr1:17216229-17216230(+) m1A intron       23118484 chr1:17222478-17222479(+) Y intron       16381836 chr1:17222479-17222480(+) Y intron       16381836 chr1:17222543-17222544(+) Am intron       16381836 chr1:17256799-17256800(+) m6A CDS//exon       - chr1:17256962-17256963(+) m6A CDS//exon       - chr1:17256970-17256971(+) m6A CDS//exon       - chr1:17257006-17257007(+) m6A CDS//exon       - chr1:17257032-17257033(+) m6A CDS//exon       - chr1:17263133-17263134(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17263165-17263166(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17263197-17263198(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17263251-17263252(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17263292-17263293(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17263313-17263314(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17263346-17263347(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17264206-17264207(+) m6A CDS//exon       24981863 chr1:17264930-17264931(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17264957-17264958(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17264967-17264968(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17265416-17265417(+) m6A CDS//exon       - chr1:17265578-17265579(+) m6A CDS//exon       - chr1:17266419-17266420(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17266483-17266484(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17266503-17266504(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17266508-17266509(+) m6A CDS//exon//intron       - chr1:17267909-17267910(+) m6A exon//intron       - chr1:17270707-17270708(+) m6A CDS//exon       24209618 chr1:17271962-17271963(+) m6A CDS//exon       - chr1:17272823-17272824(+) m6A CDS//exon       - chr1:17272868-17272869(+) m6A CDS//exon       - chr1:17272883-17272884(+) m6A CDS//exon       - chr1:17274990-17274991(+) m6A CDS//exon//intron       24209618 chr1:17280847-17280848(+) m6A CDS//exon       - chr1:17281262-17281263(+) m6A CDS//exon       - chr1:17281337-17281338(+) m6A CDS       - chr1:17281355-17281356(+) m6A CDS       - chr1:17281821-17281822(+) m6A CDS       24209618 chr1:17282022-17282023(+) m1A CDS       26863196 chr1:17282511-17282512(+) m6A CDS       24284625//24209618 chr1:17282549-17282550(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834 chr1:17282582-17282583(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834 chr1:17285090-17285091(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834 chr1:17285099-17285100(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834 chr1:17285106-17285107(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834 chr1:17285182-17285183(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834 chr1:17287281-17287282(+) m6A CDS       - chr1:17287300-17287301(+) m6A CDS       - chr1:17287364-17287365(+) m6A CDS       - chr1:17292498-17292499(+) m6A CDS       25456834 chr1:17292505-17292506(+) m6A CDS       25456834 chr1:17292511-17292512(+) m6A CDS       25456834 chr1:17292557-17292558(+) m6A CDS//exon       24209618//25456834//24981863 chr1:17293004-17293005(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863 chr1:17294727-17294728(+) m6A CDS//exon       24209618 chr1:17294909-17294910(+) m6A CDS//exon       24284625 chr1:17295637-17295638(+) m6A CDS//intron       24284625 chr1:17295710-17295711(+) m6A CDS//intron       - chr1:17295773-17295774(+) m6A CDS//intron       - chr1:17295779-17295780(+) m6A CDS//intron       - chr1:17295813-17295814(+) m6A CDS//intron       - chr1:17296383-17296384(+) m6A CDS//exon//intron       24284625//24209618 chr1:17296787-17296788(+) m6A CDS//exon       24284625 chr1:17296916-17296917(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863 chr1:17296943-17296944(+) m6A CDS//exon       24209618//24981863 chr1:17297161-17297162(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863 chr1:17297197-17297198(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863 chr1:17297284-17297285(+) m6A exon//intron       25456834 chr1:17297442-17297443(+) m6A exon//intron       - chr1:17298076-17298077(+) m6A CDS       - chr1:17298962-17298963(+) m6A 3'UTR       25456834 chr1:17298979-17298980(+) m6A 3'UTR       25456834 chr1:17298989-17298990(+) m6A 3'UTR       25456834 chr1:17299002-17299003(+) m6A 3'UTR       25456834

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hcmv-miR-UL148D	Exosome K562 cells     24460325
	CROCC	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     -

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	hcmv-miR-UL148D	Crizotinib       11626560

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-UL148D
Interactor2: CROCC

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg