Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00218258

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL22A-3p:  MIMAT0001575          AP2A1:  NM_014203     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-UL22A-3p	AP2A1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001575	160
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ADTAA//AP2-ALPHA//CLAPA1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	AP2A1	chr19:50294648(+) A-I      intronic chr19:50308061(+) A-I      intronic chr19:50273229(+) A-I      intronic chr19:50280284(+) A-I      intronic chr19:50280285(+) A-I      intronic chr19:50280290(+) A-I      intronic chr19:50280300(+) A-I      intronic chr19:50281785(+) A-I      intronic chr19:50281790(+) A-I      intronic chr19:50281855(+) A-I      intronic chr19:50294599(+) A-I      intronic chr19:50294644(+) A-I      intronic chr19:50274292(+) A-I      intronic chr19:50274348(+) A-I      intronic chr19:50274384(+) A-I      intronic chr19:50274496(+) A-I      intronic chr19:50272346(+) A-I      intronic chr19:50274740(+) A-I      intronic chr19:50298640(+) A-I      intronic chr19:50274929(+) A-I      intronic chr19:50275241(+) A-I      intronic chr19:50275254(+) A-I      intronic chr19:50275803(+) A-I      intronic chr19:50275882(+) A-I      intronic chr19:50277924(+) A-I      intronic chr19:50281590(+) A-I      intronic chr19:50281585(+) A-I      intronic chr19:50273315(+) A-I      intronic chr19:50281111(+) A-I      intronic chr19:50273291(+) A-I      intronic chr19:50280741(+) A-I      intronic chr19:50280738(+) A-I      intronic chr19:50280378(+) A-I      intronic chr19:50280372(+) A-I      intronic chr19:50280276(+) A-I      intronic chr19:50280253(+) A-I      intronic chr19:50280226(+) A-I      intronic chr19:50278869(+) A-I      intronic chr19:50308329(+) A-I      intronic chr19:50308290(+) A-I      intronic chr19:50308281(+) A-I      intronic chr19:50278865(+) A-I      intronic chr19:50278711(+) A-I      intronic chr19:50278701(+) A-I      intronic chr19:50278689(+) A-I      intronic chr19:50278815(+) A-I      intronic chr19:50288905(+) A-I      intronic chr19:50288902(+) A-I      intronic chr19:50288900(+) A-I      intronic chr19:50278672(+) A-I      intronic chr19:50298677(+) A-I      intronic chr19:50278658(+) A-I      intronic chr19:50292641(+) A-I      intronic chr19:50292617(+) A-I      intronic chr19:50290874(+) A-I      intronic chr19:50289358(+) A-I      intronic chr19:50278652(+) A-I      intronic chr19:50282271(+) A-I      intronic chr19:50278641(+) A-I      intronic chr19:50272292(+) A-I      intronic chr19:50272342(+) A-I      intronic chr19:50278627(+) A-I      intronic chr19:50278448(+) A-I      intronic chr19:50278434(+) A-I      intronic chr19:50272387(+) A-I      intronic chr19:50272392(+) A-I      intronic chr19:50281004(+) A-I      intronic chr19:50286598(+) A-I      intronic chr19:50286536(+) A-I      intronic chr19:50282463(+) A-I      intronic chr19:50282369(+) A-I      intronic chr19:50282330(+) A-I      intronic chr19:50278899(+) A-I      intronic chr19:50282243(+) A-I      intronic chr19:50281795(+) A-I      intronic chr19:50281707(+) A-I      intronic chr19:50281615(+) A-I      intronic chr19:50281601(+) A-I      intronic chr19:50272400(+) A-I      intronic chr19:50272413(+) A-I      intronic chr19:50272416(+) A-I      intronic chr19:50272419(+) A-I      intronic chr19:50277925(+) A-I      intronic chr19:50272427(+) A-I      intronic chr19:50273219(+) A-I      intronic chr19:50273243(+) A-I      intronic chr19:50289022(+) A-I      intronic chr19:50273348(+) A-I      intronic chr19:50273354(+) A-I      intronic chr19:50273360(+) A-I      intronic chr19:50273387(+) A-I      intronic chr19:50274140(+) A-I      intronic chr19:50274226(+) A-I      intronic chr19:50278427(+) A-I      intronic chr19:50278764(+) A-I      intronic chr19:50278834(+) A-I      intronic chr19:50275365(+) A-I      intronic chr19:50278016(+) A-I      intronic chr19:50274766(+) A-I      intronic chr19:50308243(+) A-I      intronic chr19:50308208(+) A-I      intronic chr19:50286597(+) A-I      intronic chr19:50308293(+) A-I      intronic chr19:50274759(+) A-I      intronic chr19:50308191(+) A-I      intronic chr19:50275258(+) A-I      intronic chr19:50291409(+) A-I      intronic chr19:50272498(+) A-I      intronic chr19:50278752(+) A-I      intronic chr19:50308263(+) A-I      intronic chr19:50273226(+) A-I      intronic chr19:50297679(+) A-I      intronic chr19:50278013(+) A-I      intronic chr19:50278225(+) A-I      intronic chr19:50273155(+) A-I      intronic chr19:50280875(+) A-I      intronic chr19:50274486(+) A-I      intronic chr19:50278772(+) A-I      intronic chr19:50308264(+) A-I      intronic chr19:50278290(+) A-I      intronic chr19:50273278(+) A-I      intronic chr19:50280286(+) A-I      intronic chr19:50274376(+) A-I      intronic chr19:50308199(+) A-I      intronic chr19:50308303(+) A-I      intronic chr19:50280941(+) A-I      intronic chr19:50308215(+) A-I      intronic chr19:50281005(+) A-I      intronic chr19:50278807(+) A-I      intronic chr19:50287877(+) A-I      intronic chr19:50290274(+) A-I      intronic chr19:50274469(+) A-I      intronic chr19:50280308(+) A-I      intronic chr19:50272439(+) A-I      intronic chr19:50274479(+) A-I      intronic chr19:50281020(+) A-I      intronic chr19:50282875(+) A-I      intronic chr19:50272305(+) A-I      intronic chr19:50274795(+) A-I      intronic chr19:50291493(+) A-I      intronic chr19:50308289(+) A-I      intronic chr19:50272449(+) A-I      intronic chr19:50278405(+) A-I      intronic chr19:50284013(+) A-I      intronic chr19:50273403(+) A-I      intronic chr19:50275277(+) A-I      intronic chr19:50280939(+) A-I      intronic chr19:50273388(+) A-I      intronic chr19:50272499(+) A-I      intronic chr19:50308340(+) A-I      intronic chr19:50274189(+) A-I      intronic chr19:50275603(+) A-I      intronic chr19:50278755(+) A-I      intronic chr19:50280942(+) A-I      intronic chr19:50281578(+) A-I      intronic chr19:50277996(+) A-I      intronic chr19:50280349(+) A-I      intronic chr19:50275338(+) A-I      intronic chr19:50286576(+) A-I      intronic chr19:50272428(+) A-I      intronic chr19:50281039(+) A-I      intronic chr19:50274382(+) A-I      intronic chr19:50278256(+) A-I      intronic chr19:50280997(+) A-I      intronic chr19:50274289(+) A-I      intronic chr19:50280896(+) A-I      intronic chr19:50278895(+) A-I      intronic chr19:50280231(+) A-I      intronic chr19:50281684(+) A-I      intronic chr19:50278912(+) A-I      intronic chr19:50284090(+) A-I      intronic chr19:50286627(+) A-I      intronic chr19:50281729(+) A-I      intronic chr19:50291316(+) A-I      intronic chr19:50289389(+) A-I      intronic chr19:50291343(+) A-I      intronic chr19:50308059(+) A-I      intronic chr19:50278894(+) A-I      intronic chr19:50286637(+) A-I      intronic chr19:50273306(+) A-I      intronic chr19:50284058(+) A-I      intronic chr19:50278410(+) A-I      intronic chr19:50278665(+) A-I      intronic chr19:50273265(+) A-I      intronic chr19:50308100(+) A-I      intronic chr19:50278364(+) A-I      intronic chr19:50275370(+) A-I      intronic chr19:50280371(+) A-I      intronic chr19:50278078(+) A-I      intronic chr19:50274318(+) A-I      intronic chr19:50308187(+) A-I      intronic chr19:50308020(+) A-I      intronic chr19:50274248(+) A-I      intronic chr19:50275245(+) A-I      intronic chr19:50308112(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	AP2A1	chr19:50307345(+) A-I intron -    15342557 chr19:50307356(+) A-I intron -    15342557 chr19:50307373(+) A-I intron -    15342557   //21960545   //22327324 chr19:50307386(+) A-I intron -    15342557   //21960545 chr19:50307413(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr19:50307456(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr19:50307552(+) A-I intron -    15342557   //15258596 chr19:50308191(+) A-I intron -    15342557   //21960545   //22327324 chr19:50308199(+) A-I intron -    15342557 chr19:50308219(+) A-I intron -    15342557 chr19:50308263(+) A-I intron -    15342557 chr19:50308289(+) A-I intron -    15342557 chr19:50308340(+) A-I intron -    15342557   //21960545 chr19:50308303(+) A-I intron -    22327324 chr19:50307372(+) A-I intron -    21960545 chr19:50308264(+) A-I intron -    21960545 chr19:50307373(+) A-G intron -    21725310 chr19:50273278(+) A-G intron -    22484847 chr19:50278443(+) C-A intron -    22484847 chr19:50278894(+) A-G intron -    22484847 chr19:50278895(+) A-G intron -    22484847 chr19:50286597(+) A-G intron -    22484847 chr19:50286627(+) A-G intron -    22484847 chr19:50307386(+) A-G intron -    22484847 chr19:50307456(+) A-G intron -    22484847 chr19:50307544(+) A-G intron -    22484847 chr19:50307677(+) A-G intron -    22484847 chr19:50307719(+) A-G intron -    22484847 chr19:50307741(+) A-G intron -    22484847 chr19:50308191(+) A-G intron -    22484847 chr19:50308215(+) A-G intron -    22484847 chr19:50308264(+) A-G intron -    22484847 chr19:50308289(+) A-G intron -    22484847 chr19:50308303(+) A-G intron -    22484847 chr19:50308340(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	AP2A1	chr19:50270454-50270455(+) m6A CDS//exon       27773535 chr19:50285053-50285054(+) m6A CDS//exon       27773535 chr19:50285206-50285207(+) m6A CDS//exon       27773535 chr19:50285249-50285250(+) m6A CDS//exon//intron       27773535 chr19:50285815-50285816(+) m6A CDS//exon//intron       27773535 chr19:50285821-50285822(+) m6A CDS//exon//intron       27773535 chr19:50296296-50296297(+) m6A CDS//exon       24284625 chr19:50298917-50298918(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//22575960 chr19:50300782-50300783(+) m6A exon//intron       - chr19:50300805-50300806(+) m6A exon//intron       24284625 chr19:50302099-50302100(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625 chr19:50302180-50302181(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625 chr19:50302644-50302645(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625 chr19:50304245-50304246(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625 chr19:50304287-50304288(+) m6A CDS//exon//intron       24284625 chr19:50304302-50304303(+) m6A CDS//exon//intron       24284625 chr19:50304755-50304756(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr19:50304949-50304950(+) m6A exon//intron       - chr19:50305093-50305094(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625 chr19:50305322-50305323(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625 chr19:50305594-50305595(+) m6A exon//intron       25456834 chr19:50306296-50306297(+) m6A exon//intron       27773535 chr19:50306324-50306325(+) m6A exon//intron       27773535 chr19:50306409-50306410(+) Cm 3'UTR//CDS//exon       - chr19:50308796-50308797(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr19:50309111-50309112(+) m6A exon//intron       27773535 chr19:50309205-50309206(+) m6A exon//intron       27773535 chr19:50309403-50309404(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//27773535 chr19:50309412-50309413(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//27773535 chr19:50309427-50309428(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//27773535 chr19:50309453-50309454(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//27773535 chr19:50310022-50310023(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr19:50310065-50310066(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr19:50310091-50310092(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr19:50310113-50310114(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr19:50310139-50310140(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//25456834//24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	AP2A1	Chromatin K562 cells     - Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-UL22A-3p
Interactor2: AP2A1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg