Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00217754

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL22A-5p:           ZNHIT6:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hcmv-miR-UL22A-5p ZNHIT6
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0001574 54680
Organism Human betaherpesvirus 5 (HHV-5) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - BCD1//C1orf181//NY-BR-75

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ZNHIT6
chr1:86145388(-) A-I      intronic
chr1:86145396(-) A-I      intronic
chr1:86117156(-) A-I      3'UTR
chr1:86124040(-) A-I      intronic
chr1:86124023(-) A-I      intronic
chr1:86145826(-) A-I      intronic
chr1:86124017(-) A-I      intronic
chr1:86145721(-) A-I      intronic
chr1:86161597(-) A-I      intronic
chr1:86161595(-) A-I      intronic
chr1:86161591(-) A-I      intronic
chr1:86161476(-) A-I      intronic
chr1:86160945(-) A-I      intronic
chr1:86160904(-) A-I      intronic
chr1:86160865(-) A-I      intronic
chr1:86160764(-) A-I      intronic
chr1:86160690(-) A-I      intronic
chr1:86160304(-) A-I      intronic
chr1:86145492(-) A-I      intronic
chr1:86124467(-) A-I      intronic
chr1:86124329(-) A-I      intronic
chr1:86124159(-) A-I      intronic
chr1:86161662(-) A-I      intronic
chr1:86161635(-) A-I      intronic
chr1:86124123(-) A-I      intronic
chr1:86124119(-) A-I      intronic
chr1:86124108(-) A-I      intronic
chr1:86160241(-) A-I      intronic
chr1:86147839(-) A-I      intronic
chr1:86124091(-) A-I      intronic
chr1:86124090(-) A-I      intronic
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chr1:86147819(-) A-I      intronic
chr1:86147833(-) A-I      intronic
chr1:86145777(-) A-I      intronic
chr1:86124044(-) A-I      intronic
chr1:86117085(-) A-I      3'UTR
chr1:86117186(-) A-I      3'UTR
chr1:86117081(-) A-I      3'UTR
chr1:86131058(-) A-I      intronic
chr1:86124372(-) A-I      intronic
chr1:86124155(-) A-I      intronic
chr1:86124392(-) A-I      intronic
chr1:86145365(-) A-I      intronic
chr1:86145406(-) A-I      intronic
chr1:86156464(-) A-I      intronic
chr1:86119219(-) A-I      3'UTR
chr1:86131032(-) A-I      intronic
chr1:86145488(-) A-I      intronic
chr1:86124009(-) A-I      intronic
chr1:86145364(-) A-I      intronic
chr1:86119228(-) A-I      3'UTR
chr1:86124118(-) A-I      intronic
chr1:86117191(-) A-I      3'UTR
chr1:86159545(-) A-I      intronic
chr1:86124459(-) A-I      intronic
chr1:86137139(-) A-I      intronic
chr1:86130741(-) A-I      intronic
chr1:86161945(-) A-I      intronic
chr1:86160860(-) A-I      intronic
chr1:86137037(-) A-I      intronic
chr1:86124510(-) A-I      intronic
chr1:86119319(-) A-I      3'UTR
chr1:86117192(-) A-I      3'UTR
chr1:86151783(-) A-I      intronic
chr1:86160835(-) A-I      intronic
chr1:86131074(-) A-I      intronic
chr1:86145632(-) A-I      intronic
chr1:86160414(-) A-I      intronic
chr1:86145405(-) A-I      intronic
chr1:86162826(-) A-I      intronic
chr1:86124310(-) A-I      intronic
chr1:86145643(-) A-I      intronic
chr1:86145716(-) A-I      intronic
chr1:86124432(-) A-I      intronic
chr1:86145765(-) A-I      intronic
chr1:86124186(-) A-I      intronic
chr1:86145543(-) A-I      intronic
chr1:86151514(-) A-I      intronic
chr1:86125136(-) A-I      intronic
chr1:86161463(-) A-I      intronic
chr1:86145671(-) A-I      intronic
chr1:86160712(-) A-I      intronic
chr1:86124076(-) A-I      intronic
chr1:86124050(-) A-I      intronic
chr1:86145793(-) A-I      intronic
chr1:86119277(-) A-I      3'UTR
chr1:86124430(-) A-I      intronic
chr1:86119214(-) A-I      3'UTR
chr1:86125194(-) A-I      intronic
chr1:86152749(-) A-I      intronic
chr1:86145697(-) A-I      intronic
chr1:86124947(-) A-I      intronic
chr1:86160416(-) A-I      intronic
chr1:86160800(-) A-I      intronic
chr1:86117041(-) A-I      3'UTR
chr1:86124311(-) A-I      intronic
chr1:86130600(-) A-I      intronic
chr1:86124298(-) A-I      intronic
chr1:86152847(-) A-I      intronic
chr1:86131007(-) A-I      intronic
chr1:86130603(-) A-I      intronic
chr1:86137060(-) A-I      intronic
chr1:86124185(-) A-I      intronic
chr1:86145880(-) A-I      intronic
chr1:86166683(-) A-I      intronic
chr1:86131040(-) A-I      intronic
chr1:86124088(-) A-I      intronic
chr1:86124052(-) A-I      intronic
chr1:86160784(-) A-I      intronic
chr1:86155442(-) A-I      intronic
chr1:86137138(-) A-I      intronic
chr1:86124442(-) A-I      intronic
chr1:86152708(-) A-I      intronic
chr1:86145767(-) A-I      intronic
chr1:86160864(-) A-I      intronic
chr1:86145366(-) A-I      intronic
chr1:86160282(-) A-I      intronic
chr1:86160415(-) A-I      intronic
chr1:86145806(-) A-I      intronic
chr1:86145851(-) A-I      intronic
chr1:86124541(-) A-I      intronic
chr1:86151533(-) A-I      intronic
chr1:86124471(-) A-I      intronic
chr1:86145723(-) A-I      intronic
chr1:86145629(-) A-I      intronic
chr1:86130713(-) A-I      intronic
chr1:86133431(-) A-I      intronic
chr1:86124492(-) A-I      intronic
chr1:86151809(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ZNHIT6
chr1:86130459(-) T-A intron -    22484847
chr1:86117191(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr1:86117192(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr1:86119294(-) T-C exon 3'UTR    22484847
chr1:86124050(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124052(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124076(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124088(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124118(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124155(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124185(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124186(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124298(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124430(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124432(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124442(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124459(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124471(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124492(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124510(-) A-G intron -    22484847
chr1:86124541(-) A-G intron -    22484847
chr1:86130600(-) A-G intron -    22484847
chr1:86130603(-) A-G intron -    22484847
chr1:86130713(-) A-G intron -    22484847
chr1:86131058(-) A-G intron -    22484847
chr1:86137060(-) A-G intron -    22484847
chr1:86137138(-) A-G intron -    22484847
chr1:86137139(-) A-G intron -    22484847
chr1:86145488(-) A-G intron -    22484847
chr1:86145543(-) A-G intron -    22484847
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chr1:86145643(-) A-G intron -    22484847
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chr1:86145716(-) A-G intron -    22484847
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chr1:86145765(-) A-G intron -    22484847
chr1:86145767(-) A-G intron -    22484847
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chr1:86145806(-) A-G intron -    22484847
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chr1:86160835(-) A-G intron -    22484847
chr1:86160860(-) A-G intron -    22484847
chr1:86160864(-) A-G intron -    22484847
chr1:86166628(-) G-A intron -    22484847
chr1:86166683(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ZNHIT6
chr1:86118003-86118004(-) m6A 3'UTR       27773535
chr1:86118060-86118061(-) m6A 3'UTR       27773535
chr1:86118166-86118167(-) m6A 3'UTR       27773535
chr1:86118241-86118242(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr1:86118258-86118259(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr1:86118279-86118280(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr1:86118303-86118304(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr1:86118365-86118366(-) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr1:86118387-86118388(-) m6A 3'UTR       27773535//22608085
chr1:86146583-86146584(-) m6A CDS       24981863
chr1:86167895-86167896(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr1:86171778-86171779(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr1:86171809-86171810(-) m6A CDS       27773535
chr1:86171816-86171817(-) m6A CDS       27773535
chr1:86171979-86171980(-) m6A CDS       27773535
chr1:86172007-86172008(-) m6A CDS       27773535
chr1:86172019-86172020(-) m6A CDS       27773535
chr1:86172166-86172167(-) m1A CDS       26863196
chr1:86172182-86172183(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr1:86173325-86173326(-) m6A CDS       24209618//24981863//27773535
chr1:86173481-86173482(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//22575960//22608085
chr1:86173524-86173525(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//22575960//22608085
chr1:86173565-86173566(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085
chr1:86173673-86173674(-) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085
chr1:86173716-86173717(-) m6A CDS//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960//22608085
chr1:86173746-86173747(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//22608085
chr1:86173772-86173773(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//28052920//27773535//27371828//22608085
chr1:86173822-86173823(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22608085
chr1:86173863-86173864(-) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//27371828//22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ZNHIT6
Chromatin K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hcmv-miR-UL22A-5p
Interactor2: ZNHIT6

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//PITA//Targetscan
Support Database VmiReg

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