Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00217753

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL22A-5p:  MIMAT0001574          MAP10:  NM_019090     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-UL22A-5p	MAP10
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001574	54627
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	KIAA1383//MTR120

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	MAP10	chr1:232941244-232941245(+) m6A CDS       - chr1:232941437-232941438(+) m6A CDS       - chr1:232941708-232941709(+) m6A CDS       25456834//24981863 chr1:232941715-232941716(+) m6A CDS       25456834//24981863 chr1:232941825-232941826(+) m6A CDS       25456834//24981863 chr1:232941839-232941840(+) m6A CDS       25456834//24981863 chr1:232941993-232941994(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942072-232942073(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942080-232942081(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942133-232942134(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942277-232942278(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942335-232942336(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942344-232942345(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942349-232942350(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942479-232942480(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942597-232942598(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942609-232942610(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942706-232942707(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942760-232942761(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942775-232942776(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942826-232942827(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942844-232942845(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942925-232942926(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942968-232942969(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942973-232942974(+) m6A CDS       24981863 chr1:232942998-232942999(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943195-232943196(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943205-232943206(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943250-232943251(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943275-232943276(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943285-232943286(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943347-232943348(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943388-232943389(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943402-232943403(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943541-232943542(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943607-232943608(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr1:232943612-232943613(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr1:232943623-232943624(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr1:232943677-232943678(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr1:232943691-232943692(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr1:232943736-232943737(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943777-232943778(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943891-232943892(+) m6A CDS       24981863 chr1:232943932-232943933(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:232943942-232943943(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	MAP10	Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-UL22A-5p
Interactor2: MAP10

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	VmiReg