Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00217532

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL22A-5p:  MIMAT0001574          DNM1L:  NM_012063     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-UL22A-5p	DNM1L
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001574	10059
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	DLP1//DRP1//DVLP//DYMPLE//EMPF//EMPF1//HDYNIV//OPA5

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	DNM1L	chr12:32881857(+) A-I      intronic chr12:32878722(+) A-I      intronic chr12:32878609(+) A-I      intronic chr12:32876457(+) A-I      intronic chr12:32868702(+) A-I      intronic chr12:32858040(+) A-I      intronic chr12:32865541(+) A-I      intronic chr12:32865554(+) A-I      intronic chr12:32899646(+) A-I      intronic chr12:32899652(+) A-I      intronic chr12:32899681(+) A-I      intronic chr12:32899692(+) A-I      intronic chr12:32899693(+) A-I      intronic chr12:32891822(+) A-I      intronic chr12:32853528(+) A-I      intronic chr12:32862125(+) A-I      intronic chr12:32868708(+) A-I      intronic chr12:32881917(+) A-I      intronic chr12:32879611(+) A-I      intronic chr12:32879610(+) A-I      intronic chr12:32879590(+) A-I      intronic chr12:32882001(+) A-I      intronic chr12:32879612(+) A-I      intronic chr12:32868570(+) A-I      intronic chr12:32867886(+) A-I      intronic chr12:32868545(+) A-I      intronic chr12:32871179(+) A-I      intronic chr12:32840511(+) A-I      intronic chr12:32842232(+) A-I      intronic chr12:32842311(+) A-I      intronic chr12:32842321(+) A-I      intronic chr12:32842336(+) A-I      intronic chr12:32842375(+) A-I      intronic chr12:32847200(+) A-I      intronic chr12:32847220(+) A-I      intronic chr12:32849615(+) A-I      intronic chr12:32849639(+) A-I      intronic chr12:32849733(+) A-I      intronic chr12:32849742(+) A-I      intronic chr12:32849756(+) A-I      intronic chr12:32849759(+) A-I      intronic chr12:32850043(+) A-I      intronic chr12:32852713(+) A-I      intronic chr12:32853091(+) A-I      intronic chr12:32853183(+) A-I      intronic chr12:32853193(+) A-I      intronic chr12:32853206(+) A-I      intronic chr12:32853243(+) A-I      intronic chr12:32853510(+) A-I      intronic chr12:32853540(+) A-I      intronic chr12:32853542(+) A-I      intronic chr12:32854736(+) A-I      intronic chr12:32854765(+) A-I      intronic chr12:32854766(+) A-I      intronic chr12:32854791(+) A-I      intronic chr12:32871310(+) A-I      intronic chr12:32854801(+) A-I      intronic chr12:32854836(+) A-I      intronic chr12:32854897(+) A-I      intronic chr12:32854953(+) A-I      intronic chr12:32840408(+) A-I      intronic chr12:32855061(+) A-I      intronic chr12:32900611(+) A-I      intronic chr12:32855083(+) A-I      intronic chr12:32900619(+) A-I      intronic chr12:32855089(+) A-I      intronic chr12:32855123(+) A-I      intronic chr12:32901235(+) A-I      intronic chr12:32855133(+) A-I      intronic chr12:32854726(+) A-I      intronic chr12:32855143(+) A-I      intronic chr12:32866713(+) A-I      intronic chr12:32867336(+) A-I      intronic chr12:32867466(+) A-I      intronic chr12:32867664(+) A-I      intronic chr12:32867674(+) A-I      intronic chr12:32867734(+) A-I      intronic chr12:32867739(+) A-I      intronic chr12:32849454(+) A-I      intronic chr12:32882133(+) A-I      intronic chr12:32855012(+) A-I      intronic chr12:32852599(+) A-I      intronic chr12:32841855(+) A-I      intronic chr12:32889277(+) A-I      intronic chr12:32858198(+) A-I      intronic chr12:32854992(+) A-I      intronic chr12:32867787(+) A-I      intronic chr12:32853158(+) A-I      intronic chr12:32837991(+) A-I      intronic chr12:32849408(+) A-I      intronic chr12:32834853(+) A-I      intronic chr12:32839195(+) A-I      intronic chr12:32864667(+) A-I      intronic chr12:32849953(+) A-I      intronic chr12:32881932(+) A-I      intronic chr12:32882060(+) A-I      intronic chr12:32897492(+) A-I      3'UTR chr12:32897468(+) A-I      3'UTR chr12:32897461(+) A-I      3'UTR chr12:32897392(+) A-I      3'UTR chr12:32897597(+) A-I      3'UTR chr12:32897575(+) A-I      3'UTR chr12:32897458(+) A-I      3'UTR chr12:32897419(+) A-I      3'UTR chr12:32897433(+) A-I      3'UTR chr12:32897496(+) A-I      3'UTR chr12:32897472(+) A-I      3'UTR chr12:32897596(+) A-I      3'UTR chr12:32871344(+) A-I      intronic chr12:32834400(+) A-I      intronic chr12:32871176(+) A-I      intronic chr12:32855021(+) A-I      intronic chr12:32865523(+) A-I      intronic chr12:32834323(+) A-I      intronic chr12:32853622(+) A-I      intronic chr12:32876466(+) A-I      intronic chr12:32871215(+) A-I      intronic chr12:32837925(+) A-I      intronic chr12:32854828(+) A-I      intronic chr12:32854991(+) A-I      intronic chr12:32849459(+) A-I      intronic chr12:32834848(+) A-I      intronic chr12:32849201(+) A-I      intronic chr12:32889037(+) A-I      intronic chr12:32834787(+) A-I      intronic chr12:32868506(+) A-I      intronic chr12:32876007(+) A-I      intronic chr12:32839085(+) A-I      intronic chr12:32854823(+) A-I      intronic chr12:32836579(+) A-I      intronic chr12:32868519(+) A-I      intronic chr12:32854748(+) A-I      intronic chr12:32849421(+) A-I      intronic chr12:32855015(+) A-I      intronic chr12:32854958(+) A-I      intronic chr12:32887663(+) A-I      intronic chr12:32878807(+) A-I      intronic chr12:32868507(+) A-I      intronic chr12:32850138(+) A-I      intronic chr12:32889171(+) A-I      intronic chr12:32876468(+) A-I      intronic chr12:32888586(+) A-I      intronic chr12:32871132(+) A-I      intronic chr12:32834807(+) A-I      intronic chr12:32853154(+) A-I      intronic chr12:32855025(+) A-I      intronic chr12:32878706(+) A-I      intronic chr12:32848553(+) A-I      intronic chr12:32854779(+) A-I      intronic chr12:32899613(+) A-I      intronic chr12:32878679(+) A-I      intronic chr12:32834791(+) A-I      intronic chr12:32854990(+) A-I      intronic chr12:32858041(+) A-I      intronic chr12:32868605(+) A-I      intronic chr12:32854788(+) A-I      intronic chr12:32854723(+) A-I      intronic chr12:32848462(+) A-I      intronic chr12:32864647(+) A-I      intronic chr12:32881968(+) A-I      intronic chr12:32868140(+) A-I      intronic chr12:32849261(+) A-I      intronic chr12:32834275(+) A-I      intronic chr12:32867823(+) A-I      intronic chr12:32854851(+) A-I      intronic chr12:32854680(+) A-I      intronic chr12:32854742(+) A-I      intronic chr12:32853490(+) A-I      intronic chr12:32866672(+) A-I      intronic chr12:32838412(+) A-I      intronic chr12:32869383(+) A-I      intronic chr12:32882200(+) A-I      intronic chr12:32865463(+) A-I      intronic chr12:32899644(+) A-I      intronic chr12:32848495(+) A-I      intronic chr12:32834320(+) A-I      intronic chr12:32849671(+) A-I      intronic chr12:32854787(+) A-I      intronic chr12:32899655(+) A-I      intronic chr12:32849700(+) A-I      intronic chr12:32850070(+) A-I      intronic chr12:32867671(+) A-I      intronic chr12:32867738(+) A-I      intronic chr12:32835115(+) A-I      intronic chr12:32858037(+) A-I      intronic chr12:32871145(+) A-I      intronic chr12:32854871(+) A-I      intronic chr12:32868932(+) A-I      intronic chr12:32887668(+) A-I      intronic chr12:32840400(+) A-I      intronic chr12:32854762(+) A-I      intronic chr12:32860693(+) A-I      intronic chr12:32857472(+) A-I      intronic chr12:32887664(+) A-I      intronic chr12:32840506(+) A-I      intronic chr12:32864756(+) A-I      intronic chr12:32871281(+) A-I      intronic chr12:32865533(+) A-I      intronic chr12:32853545(+) A-I      intronic chr12:32855047(+) A-I      intronic chr12:32868636(+) A-I      intronic chr12:32849638(+) A-I      intronic chr12:32867667(+) A-I      intronic chr12:32889080(+) A-I      intronic chr12:32834338(+) A-I      intronic chr12:32882291(+) A-I      intronic chr12:32882052(+) A-I      intronic chr12:32838003(+) A-I      intronic chr12:32841906(+) A-I      intronic chr12:32868555(+) A-I      intronic chr12:32854761(+) A-I      intronic chr12:32854827(+) A-I      intronic chr12:32857464(+) A-I      intronic chr12:32853504(+) A-I      intronic chr12:32897526(+) A-I      3'UTR chr12:32897486(+) A-I      3'UTR chr12:32897527(+) A-I      3'UTR chr12:32897428(+) A-I      3'UTR chr12:32897462(+) A-I      3'UTR chr12:32897393(+) A-I      3'UTR chr12:32897599(+) A-I      3'UTR chr12:32897495(+) A-I      3'UTR chr12:32897592(+) A-I      3'UTR chr12:32897384(+) A-I      3'UTR chr12:32897559(+) A-I      3'UTR chr12:32897452(+) A-I      3'UTR chr12:32897553(+) A-I      3'UTR chr12:32897536(+) A-I      3'UTR chr12:32897409(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	DNM1L	chr12:32850070(+) A-I intron -    22327324 chr12:32879829(+) A-I intron -    22327324 chr12:32879940(+) A-I intron -    22327324 chr12:32880193(+) A-I intron -    22327324 chr12:32865463(+) A-I intron -    21960545 chr12:32849201(+) A-G intron -    22484847 chr12:32850070(+) A-G intron -    22484847 chr12:32853622(+) A-G intron -    22484847 chr12:32868506(+) A-G intron -    22484847 chr12:32868507(+) A-G intron -    22484847 chr12:32878616(+) T-C intron -    22484847 chr12:32882595(+) T-C intron -    22484847 chr12:32882612(+) T-C intron -    22484847 chr12:32887498(+) T-C intron -    22484847 chr12:32894494(+) T-C intron -    22484847 chr12:32895203(+) T-C intron -    22484847 chr12:32896101(+) T-C intron -    22484847 chr12:32896102(+) T-C intron -    22484847 chr12:32897496(+) A-G intron -    22484847 chr12:32834275(+) A-G intron -    22484847 chr12:32837991(+) A-G intron -    22484847 chr12:32839085(+) A-G intron -    22484847 chr12:32839195(+) A-G intron -    22484847 chr12:32841855(+) A-G intron -    22484847 chr12:32849671(+) A-G intron -    22484847 chr12:32853154(+) A-G intron -    22484847 chr12:32853158(+) A-G intron -    22484847 chr12:32853490(+) A-G intron -    22484847 chr12:32853504(+) A-G intron -    22484847 chr12:32853545(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854742(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854748(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854761(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854762(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854779(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854787(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854788(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854823(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854827(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854828(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854851(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854991(+) A-G intron -    22484847 chr12:32854992(+) A-G intron -    22484847 chr12:32864684(+) T-C intron -    22484847 chr12:32866672(+) A-G intron -    22484847 chr12:32867667(+) A-G intron -    22484847 chr12:32867671(+) A-G intron -    22484847 chr12:32868555(+) A-G intron -    22484847 chr12:32868605(+) A-G intron -    22484847 chr12:32868636(+) A-G intron -    22484847 chr12:32871132(+) A-G intron -    22484847 chr12:32871145(+) A-G intron -    22484847 chr12:32871176(+) A-G intron -    22484847 chr12:32871281(+) A-G intron -    22484847 chr12:32871344(+) A-G intron -    22484847 chr12:32876554(+) T-G intron -    22484847 chr12:32881932(+) A-G intron -    22484847 chr12:32882052(+) A-G intron -    22484847 chr12:32882200(+) A-G intron -    22484847 chr12:32882495(+) T-C intron -    22484847 chr12:32883449(+) T-C intron -    22484847 chr12:32888618(+) T-C intron -    22484847 chr12:32888641(+) T-C intron -    22484847 chr12:32888650(+) T-C intron -    22484847 chr12:32889037(+) A-G intron -    22484847 chr12:32889267(+) T-C intron -    22484847 chr12:32894287(+) T-C intron -    22484847 chr12:32894348(+) T-C intron -    22484847 chr12:32894384(+) T-C intron -    22484847 chr12:32897485(+) T-C intron -    22484847 chr12:32897508(+) G-A intron -    22484847 chr12:32897608(+) T-C intron -    22484847 chr12:32897660(+) T-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	DNM1L	chr12:32832231-32832232(+) m6A 5'UTR       24284625//24981863 chr12:32832322-32832323(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//26404942 chr12:32832666-32832667(+) m6A exon//intron       24284625//24981863 chr12:32832699-32832700(+) m6A exon//intron       24284625//24981863 chr12:32832871-32832872(+) m6A exon//intron       - chr12:32854391-32854392(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863 chr12:32854428-32854429(+) m6A 5'UTR//CDS//exon//intron       24981863 chr12:32854477-32854478(+) m6A CDS//exon//intron       24981863 chr12:32861131-32861132(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863 chr12:32890081-32890082(+) Y 3'UTR//CDS//exon       26075521 chr12:32890941-32890942(+) m6A exon//intron       27773535 chr12:32892983-32892984(+) m6A exon//intron       27773535 chr12:32893038-32893039(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr12:32893072-32893073(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535 chr12:32896329-32896330(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863 chr12:32896349-32896350(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr12:32896365-32896366(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863 chr12:32896381-32896382(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863 chr12:32896423-32896424(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863 chr12:32896464-32896465(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863 chr12:32896475-32896476(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863 chr12:32896502-32896503(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863 chr12:32897637-32897638(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:32897663-32897664(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:32897696-32897697(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:32897704-32897705(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:32897742-32897743(+) m6A 3'UTR       24981863 chr12:32898289-32898290(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:32898340-32898341(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:32898353-32898354(+) m6A 3'UTR       27773535 chr12:32898392-32898393(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	DNM1L	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-UL22A-5p
Interactor2: DNM1L

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg