Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00217375

  Virus:  

Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hcmv-miR-UL22A-5p:  MIMAT0001574          RASGRF2:  NM_006909     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hcmv-miR-UL22A-5p	RASGRF2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0001574	5924
Organism	Human betaherpesvirus 5 (HHV-5)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	GRF2//RAS-GRF2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	RASGRF2	chr5:80458367(+) A-I      intronic chr5:80450193(+) A-I      intronic chr5:80274424(+) A-I      intronic chr5:80423649(+) A-I      intronic chr5:80423636(+) A-I      intronic chr5:80423623(+) A-I      intronic chr5:80423622(+) A-I      intronic chr5:80423262(+) A-I      intronic chr5:80412154(+) A-I      intronic chr5:80411995(+) A-I      intronic chr5:80392977(+) A-I      intronic chr5:80355608(+) A-I      intronic chr5:80354953(+) A-I      intronic chr5:80354948(+) A-I      intronic chr5:80353586(+) A-I      intronic chr5:80495488(+) A-I      intronic chr5:80495492(+) A-I      intronic chr5:80495502(+) A-I      intronic chr5:80427339(+) A-I      intronic chr5:80323985(+) A-I      intronic chr5:80323986(+) A-I      intronic chr5:80323998(+) A-I      intronic chr5:80324015(+) A-I      intronic chr5:80324016(+) A-I      intronic chr5:80276263(+) A-I      intronic chr5:80276272(+) A-I      intronic chr5:80314780(+) A-I      intronic chr5:80313801(+) A-I      intronic chr5:80313653(+) A-I      intronic chr5:80304099(+) A-I      intronic chr5:80427303(+) A-I      intronic chr5:80304087(+) A-I      intronic chr5:80290898(+) A-I      intronic chr5:80279905(+) A-I      intronic chr5:80279899(+) A-I      intronic chr5:80276275(+) A-I      intronic chr5:80276322(+) A-I      intronic chr5:80489907(+) A-I      intronic chr5:80489908(+) A-I      intronic chr5:80495521(+) A-I      intronic chr5:80489967(+) A-I      intronic chr5:80495483(+) A-I      intronic chr5:80495484(+) A-I      intronic chr5:80262969(+) A-I      intronic chr5:80263022(+) A-I      intronic chr5:80276249(+) A-I      intronic chr5:80489934(+) A-I      intronic chr5:80276258(+) A-I      intronic chr5:80496108(+) A-I      intronic chr5:80469129(+) A-I      intronic chr5:80469125(+) A-I      intronic chr5:80525840(+) A-I      3'UTR chr5:80525842(+) A-I      3'UTR chr5:80525233(+) A-I      3'UTR chr5:80525859(+) A-I      3'UTR chr5:80525232(+) A-I      3'UTR chr5:80525885(+) A-I      3'UTR chr5:80525238(+) A-I      3'UTR chr5:80525235(+) A-I      3'UTR chr5:80525245(+) A-I      3'UTR chr5:80525271(+) A-I      3'UTR chr5:80525837(+) A-I      3'UTR chr5:80313836(+) A-I      intronic chr5:80440861(+) A-I      intronic chr5:80355082(+) A-I      intronic chr5:80314894(+) A-I      intronic chr5:80416389(+) A-I      intronic chr5:80396000(+) A-I      intronic chr5:80489589(+) A-I      intronic chr5:80424802(+) A-I      intronic chr5:80313873(+) A-I      intronic chr5:80291576(+) A-I      intronic chr5:80357770(+) A-I      intronic chr5:80359249(+) A-I      intronic chr5:80304153(+) A-I      intronic chr5:80336030(+) A-I      intronic chr5:80305881(+) A-I      intronic chr5:80280951(+) A-I      intronic chr5:80357776(+) A-I      intronic chr5:80313869(+) A-I      intronic chr5:80280847(+) A-I      intronic chr5:80305907(+) A-I      intronic chr5:80431075(+) A-I      intronic chr5:80423655(+) A-I      intronic chr5:80489929(+) A-I      intronic chr5:80359320(+) A-I      intronic chr5:80354518(+) A-I      intronic chr5:80355607(+) A-I      intronic chr5:80424806(+) A-I      intronic chr5:80357610(+) A-I      intronic chr5:80420927(+) A-I      intronic chr5:80427198(+) A-I      intronic chr5:80290820(+) A-I      intronic chr5:80427388(+) A-I      intronic chr5:80273510(+) A-I      intronic chr5:80440852(+) A-I      intronic chr5:80357530(+) A-I      intronic chr5:80440804(+) A-I      intronic chr5:80292544(+) A-I      intronic chr5:80355410(+) A-I      intronic chr5:80423147(+) A-I      intronic chr5:80427210(+) A-I      intronic chr5:80292558(+) A-I      intronic chr5:80431054(+) A-I      intronic chr5:80453125(+) A-I      intronic chr5:80354472(+) A-I      intronic chr5:80313721(+) A-I      intronic chr5:80424843(+) A-I      intronic chr5:80354488(+) A-I      intronic chr5:80313863(+) A-I      intronic chr5:80280910(+) A-I      intronic chr5:80267484(+) A-I      intronic chr5:80423133(+) A-I      intronic chr5:80280843(+) A-I      intronic chr5:80489981(+) A-I      intronic chr5:80280946(+) A-I      intronic chr5:80395988(+) A-I      intronic chr5:80423110(+) A-I      intronic chr5:80336014(+) A-I      intronic chr5:80423117(+) A-I      intronic chr5:80398464(+) A-I      intronic chr5:80353632(+) A-I      intronic chr5:80450284(+) A-I      intronic chr5:80313807(+) A-I      intronic chr5:80357691(+) A-I      intronic chr5:80435319(+) A-I      intronic chr5:80313893(+) A-I      intronic chr5:80276203(+) A-I      intronic chr5:80423221(+) A-I      intronic chr5:80458426(+) A-I      intronic chr5:80354442(+) A-I      intronic chr5:80277478(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	RASGRF2	chr5:80312084(+) A-I intron -    15342557 chr5:80312690(+) A-I intron -    15342557 chr5:80312780(+) A-I intron -    15342557   //19478186 chr5:80313721(+) A-I intron -    15342557 chr5:80313807(+) A-I intron -    15342557 chr5:80313836(+) A-I intron -    15342557 chr5:80313863(+) A-I intron -    15342557 chr5:80313869(+) A-I intron -    15342557 chr5:80313877(+) A-I intron -    15342557 chr5:80313878(+) A-I intron -    15342557 chr5:80313893(+) A-I intron -    15342557 chr5:80313898(+) A-I intron -    15342557

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	RASGRF2	chr5:80366328-80366329(+) m6A CDS//exon       24981863 chr5:80383036-80383037(+) m6A exon//intron       25456834//24981863//22608085 chr5:80383060-80383061(+) m6A exon//intron       25456834//24981863//22608085 chr5:80383130-80383131(+) m6A exon//intron       25456834//24981863//22608085 chr5:80383161-80383162(+) m6A exon//intron       25456834//24981863//22608085 chr5:80383168-80383169(+) m6A exon//intron       25456834//24981863//22608085 chr5:80383186-80383187(+) m6A exon//intron       25456834//24981863//22608085 chr5:80383294-80383295(+) m6A exon//intron       24981863 chr5:80383404-80383405(+) m6A exon//intron       24981863//22608085 chr5:80383473-80383474(+) m6A exon//intron       24981863//22608085 chr5:80521636-80521637(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80521713-80521714(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085 chr5:80521718-80521719(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085 chr5:80521743-80521744(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085 chr5:80521764-80521765(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085 chr5:80521777-80521778(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085 chr5:80521899-80521900(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr5:80521921-80521922(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr5:80521929-80521930(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr5:80521948-80521949(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr5:80522283-80522284(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80522323-80522324(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80522396-80522397(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80522404-80522405(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523537-80523538(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523543-80523544(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523549-80523550(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523565-80523566(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523592-80523593(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523694-80523695(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523724-80523725(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523757-80523758(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523925-80523926(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523960-80523961(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80523968-80523969(+) m6A 3'UTR       25456834 chr5:80525685-80525686(+) m6A 3'UTR       27773535 chr5:80525699-80525700(+) m6A 3'UTR       27773535 chr5:80525706-80525707(+) m6A 3'UTR       27773535 chr5:80525875-80525876(+) m6A 3'UTR       27773535 chr5:80525889-80525890(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	RASGRF2	Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hcmv-miR-UL22A-5p
Interactor2: RASGRF2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	VmiReg