Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00203325

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H5:  MIMAT0015650          MGAT3:  NM_002409     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H5	MGAT3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0015650	4248
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	GNT-III//GNT3

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MGAT3	chr22:39882741(+) A-I      intronic chr22:39882740(+) A-I      intronic chr22:39882715(+) A-I      intronic chr22:39880477(+) A-I      intronic chr22:39878033(+) A-I      intronic chr22:39880421(+) A-I      intronic chr22:39880953(+) A-I      intronic chr22:39880869(+) A-I      intronic chr22:39877975(+) A-I      intronic chr22:39863785(+) A-I      intronic chr22:39861816(+) A-I      intronic chr22:39880861(+) A-I      intronic chr22:39882647(+) A-I      intronic chr22:39882537(+) A-I      intronic chr22:39882350(+) A-I      intronic chr22:39882311(+) A-I      intronic chr22:39860913(+) A-I      intronic chr22:39860911(+) A-I      intronic chr22:39860885(+) A-I      intronic chr22:39859721(+) A-I      intronic chr22:39858166(+) A-I      intronic chr22:39858024(+) A-I      intronic chr22:39858006(+) A-I      intronic chr22:39879250(+) A-I      intronic chr22:39857981(+) A-I      intronic chr22:39856723(+) A-I      intronic chr22:39856625(+) A-I      intronic chr22:39880587(+) A-I      intronic chr22:39880578(+) A-I      intronic chr22:39882232(+) A-I      intronic chr22:39880567(+) A-I      intronic chr22:39880544(+) A-I      intronic chr22:39880527(+) A-I      intronic chr22:39882252(+) A-I      intronic chr22:39879387(+) A-I      intronic chr22:39879335(+) A-I      intronic chr22:39879275(+) A-I      intronic chr22:39879245(+) A-I      intronic chr22:39878202(+) A-I      intronic chr22:39878179(+) A-I      intronic chr22:39880783(+) A-I      intronic chr22:39880973(+) A-I      intronic chr22:39881759(+) A-I      intronic chr22:39880775(+) A-I      intronic chr22:39856656(+) A-I      intronic chr22:39877980(+) A-I      intronic chr22:39856547(+) A-I      intronic chr22:39855208(+) A-I      intronic chr22:39861759(+) A-I      intronic chr22:39880857(+) A-I      intronic chr22:39881605(+) A-I      intronic chr22:39880806(+) A-I      intronic chr22:39882678(+) A-I      intronic chr22:39882359(+) A-I      intronic chr22:39880888(+) A-I      intronic chr22:39859845(+) A-I      intronic chr22:39860781(+) A-I      intronic chr22:39857962(+) A-I      intronic chr22:39882289(+) A-I      intronic chr22:39880433(+) A-I      intronic chr22:39879447(+) A-I      intronic chr22:39858090(+) A-I      intronic chr22:39859810(+) A-I      intronic chr22:39858046(+) A-I      intronic chr22:39877988(+) A-I      intronic chr22:39880652(+) A-I      intronic chr22:39861751(+) A-I      intronic chr22:39859800(+) A-I      intronic chr22:39880812(+) A-I      intronic chr22:39882635(+) A-I      intronic chr22:39880992(+) A-I      intronic chr22:39882256(+) A-I      intronic chr22:39856643(+) A-I      intronic chr22:39879222(+) A-I      intronic chr22:39860882(+) A-I      intronic chr22:39879352(+) A-I      intronic chr22:39880504(+) A-I      intronic chr22:39859922(+) A-I      intronic chr22:39858178(+) A-I      intronic chr22:39881715(+) A-I      intronic chr22:39882422(+) A-I      intronic chr22:39881676(+) A-I      intronic chr22:39858036(+) A-I      intronic chr22:39879238(+) A-I      intronic chr22:39860945(+) A-I      intronic chr22:39859840(+) A-I      intronic chr22:39859735(+) A-I      intronic chr22:39881706(+) A-I      intronic chr22:39857987(+) A-I      intronic chr22:39879391(+) A-I      intronic chr22:39882598(+) A-I      intronic chr22:39859908(+) A-I      intronic chr22:39880517(+) A-I      intronic chr22:39880561(+) A-I      intronic chr22:39880639(+) A-I      intronic chr22:39861735(+) A-I      intronic chr22:39856548(+) A-I      intronic chr22:39881675(+) A-I      intronic chr22:39858126(+) A-I      intronic chr22:39861889(+) A-I      intronic chr22:39858048(+) A-I      intronic chr22:39881714(+) A-I      intronic chr22:39880887(+) A-I      intronic chr22:39878084(+) A-I      intronic chr22:39858007(+) A-I      intronic chr22:39856554(+) A-I      intronic chr22:39881643(+) A-I      intronic chr22:39882645(+) A-I      intronic chr22:39879338(+) A-I      intronic chr22:39860811(+) A-I      intronic chr22:39861882(+) A-I      intronic chr22:39880478(+) A-I      intronic chr22:39880495(+) A-I      intronic chr22:39880770(+) A-I      intronic chr22:39880807(+) A-I      intronic chr22:39861826(+) A-I      intronic chr22:39875102(+) A-I      intronic chr22:39860967(+) A-I      intronic chr22:39880409(+) A-I      intronic chr22:39859883(+) A-I      intronic chr22:39881625(+) A-I      intronic chr22:39882333(+) A-I      intronic chr22:39858087(+) A-I      intronic chr22:39881646(+) A-I      intronic chr22:39882233(+) A-I      intronic chr22:39882209(+) A-I      intronic chr22:39880897(+) A-I      intronic chr22:39880798(+) A-I      intronic chr22:39882347(+) A-I      intronic chr22:39880431(+) A-I      intronic chr22:39882410(+) A-I      intronic chr22:39861760(+) A-I      intronic chr22:39858127(+) A-I      intronic chr22:39879267(+) A-I      intronic chr22:39878071(+) A-I      intronic chr22:39857933(+) A-I      intronic chr22:39857931(+) A-I      intronic chr22:39880915(+) A-I      intronic chr22:39879400(+) A-I      intronic chr22:39860895(+) A-I      intronic chr22:39856747(+) A-I      intronic chr22:39859731(+) A-I      intronic chr22:39880458(+) A-I      intronic chr22:39878062(+) A-I      intronic chr22:39880957(+) A-I      intronic chr22:39879361(+) A-I      intronic chr22:39878076(+) A-I      intronic chr22:39881649(+) A-I      intronic chr22:39881541(+) A-I      intronic chr22:39856647(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	MGAT3	chr22:39861750(+) A-I intron -    22327324 chr22:39880807(+) A-I intron -    22327324 chr22:39881605(+) A-I intron -    22327324 chr22:39861750(+) A-G intron -    22484847 chr22:39880409(+) A-G intron -    22484847 chr22:39880431(+) A-G intron -    22484847 chr22:39880495(+) A-G intron -    22484847 chr22:39880561(+) A-G intron -    22484847 chr22:39880806(+) A-G intron -    22484847 chr22:39880807(+) A-G intron -    22484847 chr22:39880887(+) A-G intron -    22484847 chr22:39880915(+) A-G intron -    22484847 chr22:39882253(+) A-G intron -    22484847 chr22:39882648(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	MGAT3	chr22:39873654-39873655(+) m6A 5'UTR//intron       - chr22:39873662-39873663(+) m6A 5'UTR//intron       - chr22:39883433-39883434(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085 chr22:39883462-39883463(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085 chr22:39883506-39883507(+) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chr22:39883641-39883642(+) m6A CDS       25456834//22608085 chr22:39883659-39883660(+) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chr22:39883708-39883709(+) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chr22:39883888-39883889(+) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chr22:39884175-39884176(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr22:39884360-39884361(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960//22608085 chr22:39884454-39884455(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960//22608085 chr22:39884530-39884531(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960//22608085 chr22:39884541-39884542(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960//22608085 chr22:39884694-39884695(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960//22608085 chr22:39884703-39884704(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960//22608085 chr22:39884709-39884710(+) m6A CDS       25456834//24981863//22575960//22608085 chr22:39884778-39884779(+) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chr22:39884820-39884821(+) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chr22:39884847-39884848(+) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chr22:39884932-39884933(+) m6A CDS       25456834//22608085 chr22:39885202-39885203(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085 chr22:39885380-39885381(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:39885397-39885398(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:39885445-39885446(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr22:39885542-39885543(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr22:39885547-39885548(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr22:39885569-39885570(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:39885574-39885575(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:39885658-39885659(+) m6A 3'UTR       22608085 chr22:39885687-39885688(+) m6A 3'UTR       22608085 chr22:39885733-39885734(+) m6A 3'UTR       27371828//22608085 chr22:39885808-39885809(+) m6A 3'UTR       25456834//27371828//27773536//22608085 chr22:39885981-39885982(+) m6A 3'UTR       22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	MGAT3	Chromatin K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H5
Interactor2: MGAT3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg