Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00189856

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H22:  MIMAT0014704          NPM2:  NM_001286681     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H22	NPM2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014704	10361
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	NPM2	chr8:21892859(+) A-I      intronic chr8:21892924(+) A-I      intronic chr8:21893249(+) A-I      intronic chr8:21893266(+) A-I      intronic chr8:21893280(+) A-I      intronic chr8:21893764(+) A-I      intronic chr8:21892549(+) A-I      intronic chr8:21892537(+) A-I      intronic chr8:21893662(+) A-I      intronic chr8:21893207(+) A-I      intronic chr8:21893359(+) A-I      intronic chr8:21893350(+) A-I      intronic chr8:21893653(+) A-I      intronic chr8:21893050(+) A-I      intronic chr8:21892399(+) A-I      intronic chr8:21893333(+) A-I      intronic chr8:21892404(+) A-I      intronic chr8:21892914(+) A-I      intronic chr8:21892950(+) A-I      intronic chr8:21892472(+) A-I      intronic chr8:21892918(+) A-I      intronic chr8:21892888(+) A-I      intronic chr8:21893023(+) A-I      intronic chr8:21893019(+) A-I      intronic chr8:21892461(+) A-I      intronic chr8:21893712(+) A-I      intronic chr8:21893171(+) A-I      intronic chr8:21892559(+) A-I      intronic chr8:21893714(+) A-I      intronic chr8:21893675(+) A-I      intronic chr8:21892519(+) A-I      intronic chr8:21893263(+) A-I      intronic chr8:21892465(+) A-I      intronic chr8:21892958(+) A-I      intronic chr8:21893243(+) A-I      intronic chr8:21892951(+) A-I      intronic chr8:21892473(+) A-I      intronic chr8:21893685(+) A-I      intronic chr8:21892564(+) A-I      intronic chr8:21892506(+) A-I      intronic chr8:21893037(+) A-I      intronic chr8:21892502(+) A-I      intronic chr8:21892957(+) A-I      intronic chr8:21893666(+) A-I      intronic chr8:21892409(+) A-I      intronic chr8:21892510(+) A-I      intronic chr8:21892848(+) A-I      intronic chr8:21893006(+) A-I      intronic chr8:21892911(+) A-I      intronic chr8:21893363(+) A-I      intronic chr8:21892897(+) A-I      intronic chr8:21893323(+) A-I      intronic chr8:21892458(+) A-I      intronic chr8:21892846(+) A-I      intronic chr8:21893329(+) A-I      intronic chr8:21892968(+) A-I      intronic chr8:21893212(+) A-I      intronic chr8:21892523(+) A-I      intronic chr8:21892468(+) A-I      intronic chr8:21892497(+) A-I      intronic chr8:21892849(+) A-I      intronic chr8:21892469(+) A-I      intronic chr8:21893378(+) A-I      intronic chr8:21892841(+) A-I      intronic chr8:21893198(+) A-I      intronic chr8:21892974(+) A-I      intronic chr8:21893005(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	NPM2	chr8:21892385(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892399(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892454(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892458(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892469(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892473(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892497(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892502(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892506(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892510(+) A-I intron -    15342557   //22327324 chr8:21892523(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892848(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892849(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892897(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892902(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892910(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892914(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892918(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892950(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892951(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892957(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892958(+) A-I intron -    15342557 chr8:21893020(+) A-I intron -    15342557 chr8:21893023(+) A-I intron -    15342557 chr8:21893062(+) A-I intron -    15342557 chr8:21893324(+) A-I intron -    15342557 chr8:21893680(+) A-I intron -    15342557 chr8:21893685(+) A-I intron -    15342557 chr8:21892385(+) A-G intron -    22484847 chr8:21892404(+) A-G intron -    22484847 chr8:21892409(+) A-G intron -    22484847 chr8:21892472(+) A-G intron -    22484847 chr8:21892510(+) A-G intron -    22484847 chr8:21892519(+) A-G intron -    22484847 chr8:21892848(+) A-G intron -    22484847 chr8:21892902(+) A-G intron -    22484847 chr8:21892918(+) A-G intron -    22484847 chr8:21893363(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	NPM2	chr8:21891655-21891656(+) m1A CDS//exon//intron       26863196 chr8:21891740-21891741(+) m6A CDS//exon//intron       27773535 chr8:21892042-21892043(+) m1A CDS//exon       26863196

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	NPM2	Exosome Blood     - Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H22
Interactor2: NPM2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//RNAHybrid
Support Database	VmiReg