Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00187206

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H20:  MIMAT0014702          SLC25A53:  NM_001012755     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H20	SLC25A53
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014702	401612
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	MCART6

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SLC25A53	chrX:103371134(-) A-I      intronic chrX:103371145(-) A-I      intronic chrX:103371250(-) A-I      intronic chrX:103393359(-) A-I      intronic chrX:103371255(-) A-I      intronic chrX:103371301(-) A-I      intronic chrX:103371320(-) A-I      intronic chrX:103372368(-) A-I      intronic chrX:103372429(-) A-I      intronic chrX:103372462(-) A-I      intronic chrX:103372467(-) A-I      intronic chrX:103370880(-) A-I      intronic chrX:103372484(-) A-I      intronic chrX:103372625(-) A-I      intronic chrX:103382855(-) A-I      intronic chrX:103393388(-) A-I      intronic chrX:103393407(-) A-I      intronic chrX:103393412(-) A-I      intronic chrX:103382886(-) A-I      intronic chrX:103389270(-) A-I      intronic chrX:103366661(-) A-I      intronic chrX:103386843(-) A-I      intronic chrX:103366644(-) A-I      intronic chrX:103369767(-) A-I      intronic chrX:103397283(-) A-I      intronic chrX:103369382(-) A-I      intronic chrX:103366748(-) A-I      intronic chrX:103397286(-) A-I      intronic chrX:103389299(-) A-I      intronic chrX:103382902(-) A-I      intronic chrX:103370754(-) A-I      intronic chrX:103382996(-) A-I      intronic chrX:103384968(-) A-I      intronic chrX:103384971(-) A-I      intronic chrX:103384974(-) A-I      intronic chrX:103384986(-) A-I      intronic chrX:103369786(-) A-I      intronic chrX:103384987(-) A-I      intronic chrX:103370852(-) A-I      intronic chrX:103386390(-) A-I      intronic chrX:103386449(-) A-I      intronic chrX:103386464(-) A-I      intronic chrX:103386831(-) A-I      intronic chrX:103386842(-) A-I      intronic chrX:103397386(-) A-I      intronic chrX:103370755(-) A-I      intronic chrX:103366700(-) A-I      intronic chrX:103397378(-) A-I      intronic chrX:103369780(-) A-I      intronic chrX:103370773(-) A-I      intronic chrX:103370897(-) A-I      intronic chrX:103369643(-) A-I      intronic chrX:103369650(-) A-I      intronic chrX:103369692(-) A-I      intronic chrX:103369649(-) A-I      intronic chrX:103386839(-) A-I      intronic chrX:103386840(-) A-I      intronic chrX:103369696(-) A-I      intronic chrX:103369701(-) A-I      intronic chrX:103369707(-) A-I      intronic chrX:103369710(-) A-I      intronic chrX:103370745(-) A-I      intronic chrX:103371284(-) A-I      intronic chrX:103371287(-) A-I      intronic chrX:103371296(-) A-I      intronic chrX:103371312(-) A-I      intronic chrX:103372480(-) A-I      intronic chrX:103384975(-) A-I      intronic chrX:103369638(-) A-I      intronic chrX:103369754(-) A-I      intronic chrX:103369633(-) A-I      intronic chrX:103369624(-) A-I      intronic chrX:103369389(-) A-I      intronic chrX:103369698(-) A-I      intronic chrX:103384983(-) A-I      intronic chrX:103369371(-) A-I      intronic chrX:103384984(-) A-I      intronic chrX:103386826(-) A-I      intronic chrX:103370911(-) A-I      intronic chrX:103369357(-) A-I      intronic chrX:103366724(-) A-I      intronic chrX:103366689(-) A-I      intronic chrX:103366658(-) A-I      intronic chrX:103369762(-) A-I      intronic chrX:103369433(-) A-I      intronic chrX:103371107(-) A-I      intronic chrX:103369772(-) A-I      intronic chrX:103371133(-) A-I      intronic chrX:103369656(-) A-I      intronic chrX:103369563(-) A-I      intronic chrX:103384858(-) A-I      intronic chrX:103369653(-) A-I      intronic chrX:103384945(-) A-I      intronic chrX:103394910(-) A-I      intronic chrX:103369743(-) A-I      intronic chrX:103383005(-) A-I      intronic chrX:103371215(-) A-I      intronic chrX:103397147(-) A-I      intronic chrX:103366745(-) A-I      intronic chrX:103369724(-) A-I      intronic chrX:103369746(-) A-I      intronic chrX:103370876(-) A-I      intronic chrX:103369596(-) A-I      intronic chrX:103370727(-) A-I      intronic chrX:103369660(-) A-I      intronic chrX:103369600(-) A-I      intronic chrX:103366708(-) A-I      intronic chrX:103347821(-) A-I      3'UTR chrX:103369432(-) A-I      intronic chrX:103384346(-) A-I      intronic chrX:103366707(-) A-I      intronic chrX:103366736(-) A-I      intronic chrX:103369733(-) A-I      intronic chrX:103366681(-) A-I      intronic chrX:103371288(-) A-I      intronic chrX:103386451(-) A-I      intronic chrX:103371157(-) A-I      intronic chrX:103371102(-) A-I      intronic chrX:103369377(-) A-I      intronic chrX:103382918(-) A-I      intronic chrX:103366713(-) A-I      intronic chrX:103384901(-) A-I      intronic chrX:103371251(-) A-I      intronic chrX:103399854(-) A-I      intronic chrX:103371171(-) A-I      intronic chrX:103369356(-) A-I      intronic chrX:103369595(-) A-I      intronic chrX:103369802(-) A-I      intronic chrX:103369666(-) A-I      intronic chrX:103369620(-) A-I      intronic chrX:103384939(-) A-I      intronic chrX:103370875(-) A-I      intronic chrX:103372402(-) A-I      intronic chrX:103384488(-) A-I      intronic chrX:103371139(-) A-I      intronic chrX:103369695(-) A-I      intronic chrX:103369723(-) A-I      intronic chrX:103366684(-) A-I      intronic chrX:103386844(-) A-I      intronic chrX:103371082(-) A-I      intronic chrX:103386818(-) A-I      intronic chrX:103371254(-) A-I      intronic chrX:103371213(-) A-I      intronic chrX:103370733(-) A-I      intronic chrX:103371197(-) A-I      intronic chrX:103366730(-) A-I      intronic chrX:103366694(-) A-I      intronic chrX:103370864(-) A-I      intronic chrX:103384839(-) A-I      intronic chrX:103369370(-) A-I      intronic chrX:103369665(-) A-I      intronic chrX:103371092(-) A-I      intronic chrX:103371120(-) A-I      intronic chrX:103384412(-) A-I      intronic chrX:103369327(-) A-I      intronic chrX:103369684(-) A-I      intronic chrX:103370802(-) A-I      intronic chrX:103371290(-) A-I      intronic chrX:103399925(-) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SLC25A53	chrX:103369563(-) A-I intron -    22028664 chrX:103369595(-) A-I intron -    22028664 chrX:103369596(-) A-I intron -    22028664 chrX:103369600(-) A-I intron -    22028664 chrX:103369620(-) A-I intron -    22028664 chrX:103369656(-) A-I intron -    22028664 chrX:103369660(-) A-I intron -    22028664 chrX:103369665(-) A-I intron -    22028664 chrX:103369666(-) A-I intron -    22028664 chrX:103371102(-) A-I intron -    21960545 chrX:103371469(-) A-G intron -    22484847 chrX:103366707(-) A-G intron -    22484847 chrX:103366708(-) A-G intron -    22484847 chrX:103366730(-) A-G intron -    22484847 chrX:103366745(-) A-G intron -    22484847 chrX:103366989(-) C-A intron -    22484847 chrX:103369323(-) A-G intron -    22484847 chrX:103369387(-) A-G intron -    22484847 chrX:103369395(-) A-G intron -    22484847 chrX:103369684(-) A-G intron -    22484847 chrX:103369803(-) A-G intron -    22484847 chrX:103369809(-) A-G intron -    22484847 chrX:103371171(-) A-G intron -    22484847 chrX:103371221(-) A-G intron -    22484847 chrX:103371251(-) A-G intron -    22484847 chrX:103383005(-) A-G intron -    22484847 chrX:103384858(-) A-G intron -    22484847 chrX:103384945(-) A-G intron -    22484847 chrX:103386818(-) A-G intron -    22484847 chrX:103386844(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SLC25A53	chrX:103345649-103345650(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103345662-103345663(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103345729-103345730(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103345735-103345736(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103346699-103346700(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103346733-103346734(-) m6A 3'UTR       25456834//22608085 chrX:103346849-103346850(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103346879-103346880(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103348369-103348370(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103348428-103348429(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103348448-103348449(-) m6A 3'UTR       25456834 chrX:103349161-103349162(-) m6A CDS       25456834 chrX:103349200-103349201(-) m6A CDS       25456834 chrX:103349273-103349274(-) m6A CDS       25456834 chrX:103349386-103349387(-) m6A CDS       24209618 chrX:103349595-103349596(-) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chrX:103349648-103349649(-) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chrX:103349663-103349664(-) m6A CDS       25456834//24981863//22608085 chrX:103349739-103349740(-) m6A CDS       22608085 chrX:103349926-103349927(-) m6A CDS       24981863 chrX:103375300-103375301(-) m6A exon//intron       24209618//24981863//27773535//22608085 chrX:103375434-103375435(-) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085 chrX:103375510-103375511(-) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085 chrX:103375539-103375540(-) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535//27371828//22608085 chrX:103375563-103375564(-) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chrX:103375689-103375690(-) m6A exon//intron       24284625//24981863//27773535//22608085 chrX:103375745-103375746(-) m6A exon//intron       24981863 chrX:103375846-103375847(-) m6A exon//intron       - chrX:103375901-103375902(-) m6A exon//intron       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	SLC25A53	Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H20
Interactor2: SLC25A53

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg