Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00186268

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H20:  MIMAT0014702          ZNF280C:  NM_017666     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H20	ZNF280C
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014702	55609
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	SUHW3//ZNF633//ZPET

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ZNF280C	chrX:129340545(-) A-I      intronic chrX:129342755(-) A-I      intronic chrX:129348033(-) A-I      intronic chrX:129362546(-) A-I      intronic chrX:129375542(-) A-I      intronic chrX:129375686(-) A-I      intronic chrX:129376117(-) A-I      intronic chrX:129390820(-) A-I      intronic chrX:129390609(-) A-I      intronic chrX:129376175(-) A-I      intronic chrX:129376652(-) A-I      intronic chrX:129376804(-) A-I      intronic chrX:129377278(-) A-I      intronic chrX:129377340(-) A-I      intronic chrX:129377448(-) A-I      intronic chrX:129381247(-) A-I      intronic chrX:129381349(-) A-I      intronic chrX:129389746(-) A-I      intronic chrX:129389805(-) A-I      intronic chrX:129389847(-) A-I      intronic chrX:129389993(-) A-I      intronic chrX:129377270(-) A-I      intronic chrX:129339668(-) A-I      intronic chrX:129339670(-) A-I      intronic chrX:129339741(-) A-I      intronic chrX:129340501(-) A-I      intronic chrX:129340509(-) A-I      intronic chrX:129337441(-) A-I      3'UTR chrX:129337386(-) A-I      3'UTR chrX:129337372(-) A-I      3'UTR chrX:129337446(-) A-I      3'UTR chrX:129340505(-) A-I      intronic chrX:129375529(-) A-I      intronic chrX:129339708(-) A-I      intronic chrX:129376020(-) A-I      intronic chrX:129381221(-) A-I      intronic chrX:129376154(-) A-I      intronic chrX:129389877(-) A-I      intronic chrX:129376165(-) A-I      intronic chrX:129340612(-) A-I      intronic chrX:129339704(-) A-I      intronic chrX:129339596(-) A-I      intronic chrX:129337499(-) A-I      3'UTR chrX:129337374(-) A-I      3'UTR chrX:129337529(-) A-I      3'UTR chrX:129375704(-) A-I      intronic chrX:129375697(-) A-I      intronic chrX:129341470(-) A-I      intronic chrX:129381237(-) A-I      intronic chrX:129379822(-) A-I      intronic chrX:129339781(-) A-I      intronic chrX:129339608(-) A-I      intronic chrX:129390637(-) A-I      intronic chrX:129339776(-) A-I      intronic chrX:129369450(-) A-I      intronic chrX:129389813(-) A-I      intronic chrX:129390610(-) A-I      intronic chrX:129339715(-) A-I      intronic chrX:129389872(-) A-I      intronic chrX:129362671(-) A-I      intronic chrX:129347973(-) A-I      intronic chrX:129339731(-) A-I      intronic chrX:129340513(-) A-I      intronic chrX:129379828(-) A-I      intronic chrX:129340615(-) A-I      intronic chrX:129381175(-) A-I      intronic chrX:129339780(-) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ZNF280C	chrX:129386562(-) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ZNF280C	chrX:129336764-129336765(-) m6A 3'UTR       27773535 chrX:129337150-129337151(-) m6A 3'UTR       27773535 chrX:129337158-129337159(-) m6A 3'UTR       27773535 chrX:129337194-129337195(-) m6A 3'UTR       27773535 chrX:129337458-129337459(-) m6A 3'UTR       - chrX:129363045-129363046(-) m6A CDS       27773535 chrX:129363063-129363064(-) m6A CDS       27773535 chrX:129363077-129363078(-) m6A CDS       27773535 chrX:129363089-129363090(-) m6A CDS       27773535 chrX:129363099-129363100(-) m6A CDS       27773535 chrX:129373578-129373579(-) m6A CDS       27773535 chrX:129377539-129377540(-) m6A CDS       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ZNF280C	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H20
Interactor2: ZNF280C

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg